More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_3656 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_3656  tRNA modification GTPase TrmE  100 
 
 
460 aa  922    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1989  tRNA modification GTPase TrmE  76.87 
 
 
463 aa  692    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.858955 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0569  tRNA modification GTPase TrmE  73.3 
 
 
458 aa  673    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4203  tRNA modification GTPase TrmE  75.59 
 
 
460 aa  684    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4774  tRNA modification GTPase TrmE  71.21 
 
 
467 aa  660    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.149576 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1908  tRNA modification GTPase TrmE  74.46 
 
 
464 aa  676    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.991823  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4164  tRNA modification GTPase TrmE  75.81 
 
 
460 aa  688    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1582  tRNA modification GTPase TrmE  70.68 
 
 
462 aa  623  1e-177  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1556  tRNA modification GTPase TrmE  48.15 
 
 
464 aa  434  1e-120  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2453  tRNA modification GTPase TrmE  53.36 
 
 
450 aa  432  1e-120  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02641  tRNA modification GTPase TrmE  48.37 
 
 
464 aa  434  1e-120  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_49818  predicted protein  51.75 
 
 
525 aa  431  1e-119  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2136  tRNA modification GTPase TrmE  50.67 
 
 
451 aa  415  9.999999999999999e-116  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02071  tRNA modification GTPase TrmE  47.48 
 
 
455 aa  415  9.999999999999999e-116  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.828373  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3429  tRNA modification GTPase TrmE  45.67 
 
 
461 aa  404  1e-111  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000224644  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27541  tRNA modification GTPase TrmE  51.67 
 
 
465 aa  405  1e-111  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3557  tRNA modification GTPase TrmE  45.02 
 
 
462 aa  386  1e-106  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2365  tRNA modification GTPase TrmE  42.06 
 
 
459 aa  387  1e-106  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3324  tRNA modification GTPase TrmE  42.92 
 
 
461 aa  383  1e-105  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4365  tRNA modification GTPase TrmE  43.38 
 
 
461 aa  379  1e-104  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5277  tRNA modification GTPase TrmE  42.76 
 
 
458 aa  380  1e-104  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5635  tRNA modification GTPase TrmE  43.36 
 
 
458 aa  377  1e-103  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5337  tRNA modification GTPase TrmE  42.89 
 
 
458 aa  375  1e-103  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5165  tRNA modification GTPase TrmE  42.89 
 
 
458 aa  375  1e-103  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5181  tRNA modification GTPase TrmE  42.89 
 
 
458 aa  376  1e-103  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0853003  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5594  tRNA modification GTPase TrmE  42.89 
 
 
458 aa  375  1e-103  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0320926 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5324  tRNA modification GTPase TrmE  42.95 
 
 
458 aa  377  1e-103  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0322996 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5611  tRNA modification GTPase TrmE  42.95 
 
 
458 aa  375  1e-103  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.292564  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5734  tRNA modification GTPase TrmE  42.89 
 
 
458 aa  375  1e-103  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5671  tRNA modification GTPase TrmE  42.89 
 
 
458 aa  377  1e-103  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4024  tRNA modification GTPase TrmE  41.89 
 
 
458 aa  375  1e-102  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1895  tRNA modification GTPase TrmE  44.42 
 
 
461 aa  373  1e-102  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  1.51566e-21 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02181  tRNA modification GTPase TrmE  38.01 
 
 
461 aa  369  1e-101  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23560  tRNA modification GTPase TrmE  41.34 
 
 
463 aa  368  1e-100  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.690968  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2930  tRNA modification GTPase TrmE  40.78 
 
 
458 aa  363  2e-99  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.137366  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2519  tRNA modification GTPase TrmE  45.45 
 
 
462 aa  362  1e-98  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00190608 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1940  tRNA modification GTPase TrmE  41.87 
 
 
462 aa  359  7e-98  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000114309  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3486  tRNA modification GTPase TrmE  40.3 
 
 
460 aa  357  2.9999999999999997e-97  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2233  tRNA modification GTPase TrmE  43.91 
 
 
461 aa  357  3.9999999999999996e-97  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2409  tRNA modification GTPase TrmE  40.82 
 
 
460 aa  356  5.999999999999999e-97  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.605137  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02091  tRNA modification GTPase TrmE  37.75 
 
 
460 aa  354  1e-96  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.146144  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02071  tRNA modification GTPase TrmE  37.98 
 
 
460 aa  352  8.999999999999999e-96  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.214831  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0191  tRNA modification GTPase TrmE  38.2 
 
 
460 aa  351  1e-95  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.377202  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2669  tRNA modification GTPase TrmE  41.77 
 
 
458 aa  350  2e-95  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2992  tRNA modification GTPase TrmE  41.77 
 
 
458 aa  350  4e-95  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0003  tRNA modification GTPase TrmE  38.13 
 
 
459 aa  348  1e-94  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000387737  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3142  tRNA modification GTPase TrmE  43.23 
 
 
461 aa  343  2.9999999999999997e-93  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.108144  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2791  tRNA modification GTPase TrmE  39.18 
 
 
459 aa  343  4e-93  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2734  tRNA modification GTPase TrmE  39.18 
 
 
459 aa  343  4e-93  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0992  tRNA modification GTPase TrmE  40.61 
 
 
456 aa  341  2e-92  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00719085  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0977  tRNA modification GTPase TrmE  41.23 
 
 
447 aa  338  1.9999999999999998e-91  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000239803  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3941  tRNA modification GTPase TrmE  39.39 
 
 
458 aa  337  1.9999999999999998e-91  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4428  tRNA modification GTPase TrmE  41.23 
 
 
455 aa  337  2.9999999999999997e-91  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0876  tRNA modification GTPase TrmE  39.48 
 
 
458 aa  335  7.999999999999999e-91  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000254143  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3465  tRNA modification GTPase TrmE  41.61 
 
 
456 aa  335  1e-90  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4957  tRNA modification GTPase TrmE  42.48 
 
 
459 aa  333  3e-90  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000028541  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2572  GTPase  40.47 
 
 
459 aa  333  3e-90  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.329632  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2547  tRNA modification GTPase TrmE  41.23 
 
 
455 aa  333  3e-90  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3441  tRNA modification GTPase TrmE  44.3 
 
 
454 aa  333  3e-90  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4058  tRNA modification GTPase TrmE  41.21 
 
 
455 aa  333  4e-90  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.239105  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4148  tRNA modification GTPase TrmE  41 
 
 
455 aa  330  4e-89  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3641  tRNA modification GTPase TrmE  43.01 
 
 
460 aa  327  2.0000000000000001e-88  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2889  tRNA modification GTPase TrmE  42.22 
 
 
464 aa  325  1e-87  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1733  tRNA modification GTPase TrmE  36.52 
 
 
452 aa  323  4e-87  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000059641  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2945  tRNA modification GTPase TrmE  42.33 
 
 
465 aa  323  5e-87  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0139032  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0643  tRNA modification GTPase TrmE  46.72 
 
 
452 aa  321  1.9999999999999998e-86  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.461676 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0657  tRNA modification GTPase TrmE  38.38 
 
 
450 aa  315  1.9999999999999998e-84  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0097  tRNA modification GTPase TrmE  38.15 
 
 
455 aa  313  3.9999999999999997e-84  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3622  tRNA modification GTPase TrmE  42.76 
 
 
456 aa  310  2e-83  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0375  tRNA modification GTPase TrmE  37.47 
 
 
459 aa  309  6.999999999999999e-83  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2758  tRNA modification GTPase TrmE  37.17 
 
 
455 aa  307  3e-82  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.294935  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0681  tRNA modification GTPase TrmE  38.38 
 
 
450 aa  306  5.0000000000000004e-82  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.570227  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4729  tRNA modification GTPase TrmE  39.19 
 
 
454 aa  305  1.0000000000000001e-81  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.622363  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3560  tRNA modification GTPase TrmE  39.52 
 
 
457 aa  304  2.0000000000000002e-81  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1201  hypothetical protein  39.7 
 
 
455 aa  304  3.0000000000000004e-81  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00128445 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3161  tRNA modification GTPase TrmE  41.81 
 
 
471 aa  302  8.000000000000001e-81  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.258894  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1430  tRNA modification GTPase TrmE  38.29 
 
 
461 aa  301  2e-80  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.299442  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4133  tRNA modification GTPase TrmE  37.63 
 
 
456 aa  301  2e-80  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2760  tRNA modification GTPase TrmE  41.74 
 
 
462 aa  294  2e-78  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.4484  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1734  tRNA modification GTPase TrmE  39.91 
 
 
437 aa  293  5e-78  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2137  tRNA modification GTPase TrmE  37.55 
 
 
461 aa  291  2e-77  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.075642 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2316  tRNA modification GTPase TrmE  38.7 
 
 
456 aa  290  5.0000000000000004e-77  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.64098  normal  0.135497 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1336  tRNA modification GTPase TrmE  36.24 
 
 
441 aa  288  1e-76  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2254  tRNA modification GTPase TrmE  41.01 
 
 
436 aa  287  2e-76  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.9716  normal  0.222751 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0104  tRNA modification GTPase TrmE  39.38 
 
 
462 aa  288  2e-76  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1409  tRNA modification GTPase TrmE  33.98 
 
 
452 aa  287  2.9999999999999996e-76  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12578  putative tRNA modification GTPase  36.81 
 
 
469 aa  286  4e-76  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3159  tRNA modification GTPase TrmE  41.4 
 
 
457 aa  286  4e-76  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2195  tRNA modification GTPase TrmE  38.82 
 
 
475 aa  285  9e-76  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3279  tRNA modification GTPase TrmE  36.54 
 
 
458 aa  283  7.000000000000001e-75  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.768989 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0199  tRNA modification GTPase TrmE  37.76 
 
 
473 aa  280  3e-74  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4200  tRNA modification GTPase TrmE  39.22 
 
 
448 aa  279  6e-74  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0153583 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2124  tRNA modification GTPase TrmE  38.76 
 
 
452 aa  279  8e-74  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2030  tRNA modification GTPase TrmE  36.38 
 
 
460 aa  278  1e-73  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.312338  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5611  tRNA modification GTPase TrmE  39.96 
 
 
456 aa  278  2e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5133  tRNA modification GTPase TrmE  39.31 
 
 
456 aa  277  3e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1904  tRNA modification GTPase TrmE  38.59 
 
 
472 aa  276  5e-73  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0089  tRNA modification GTPase TrmE  36.82 
 
 
455 aa  275  1.0000000000000001e-72  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2775  tRNA modification GTPase TrmE  38.38 
 
 
452 aa  275  1.0000000000000001e-72  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0248  tRNA modification GTPase TrmE  35.82 
 
 
473 aa  275  2.0000000000000002e-72  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>