More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_2599 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_2599  tRNA modification GTPase TrmE  100 
 
 		 470 aa  932    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.652843  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3429  tRNA modification GTPase TrmE  41.76 
 
 		 461 aa  367  1e-100  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000224644  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4428  tRNA modification GTPase TrmE  43.35 
 
 		 455 aa  361  2e-98  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4058  tRNA modification GTPase TrmE  43.86 
 
 		 455 aa  351  1e-95  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.239105  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3465  tRNA modification GTPase TrmE  43.23 
 
 		 456 aa  349  6e-95  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2519  tRNA modification GTPase TrmE  43.9 
 
 		 462 aa  346  5e-94  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00190608 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4148  tRNA modification GTPase TrmE  43.43 
 
 		 455 aa  343  5e-93  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2930  tRNA modification GTPase TrmE  38.92 
 
 		 458 aa  342  9e-93  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.137366  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1895  tRNA modification GTPase TrmE  38.19 
 
 		 461 aa  340  4e-92  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.51566e-21 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2409  tRNA modification GTPase TrmE  39.57 
 
 		 460 aa  339  8e-92  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.605137  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0003  tRNA modification GTPase TrmE  37.15 
 
 		 459 aa  337  2.9999999999999997e-91  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000387737  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2365  tRNA modification GTPase TrmE  39.52 
 
 		 459 aa  336  3.9999999999999995e-91  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1940  tRNA modification GTPase TrmE  38.15 
 
 		 462 aa  335  1e-90  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000114309  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4365  tRNA modification GTPase TrmE  39.19 
 
 		 461 aa  333  5e-90  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3324  tRNA modification GTPase TrmE  38.89 
 
 		 461 aa  332  9e-90  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3557  tRNA modification GTPase TrmE  41.54 
 
 		 462 aa  332  9e-90  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3486  tRNA modification GTPase TrmE  37.58 
 
 		 460 aa  331  2e-89  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3560  tRNA modification GTPase TrmE  42.06 
 
 		 457 aa  331  2e-89  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0876  tRNA modification GTPase TrmE  38.06 
 
 		 458 aa  330  4e-89  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000254143  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0992  tRNA modification GTPase TrmE  39.14 
 
 		 456 aa  330  5.0000000000000004e-89  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00719085  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23560  tRNA modification GTPase TrmE  36.71 
 
 		 463 aa  326  6e-88  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.690968  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2137  tRNA modification GTPase TrmE  40.64 
 
 		 461 aa  325  8.000000000000001e-88  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.075642 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3641  tRNA modification GTPase TrmE  40.9 
 
 		 460 aa  323  6e-87  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4024  tRNA modification GTPase TrmE  36.85 
 
 		 458 aa  322  8e-87  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2791  tRNA modification GTPase TrmE  36.93 
 
 		 459 aa  321  1.9999999999999998e-86  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2734  tRNA modification GTPase TrmE  36.93 
 
 		 459 aa  321  1.9999999999999998e-86  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3941  tRNA modification GTPase TrmE  37.85 
 
 		 458 aa  320  3e-86  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2233  tRNA modification GTPase TrmE  44.84 
 
 		 461 aa  317  4e-85  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5324  tRNA modification GTPase TrmE  36.42 
 
 		 458 aa  316  5e-85  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0322996 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0657  tRNA modification GTPase TrmE  38.88 
 
 		 450 aa  315  8e-85  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5635  tRNA modification GTPase TrmE  36.42 
 
 		 458 aa  315  9.999999999999999e-85  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5337  tRNA modification GTPase TrmE  36.21 
 
 		 458 aa  315  9.999999999999999e-85  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5165  tRNA modification GTPase TrmE  36.21 
 
 		 458 aa  315  9.999999999999999e-85  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5734  tRNA modification GTPase TrmE  36.21 
 
 		 458 aa  315  9.999999999999999e-85  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5594  tRNA modification GTPase TrmE  36.21 
 
 		 458 aa  315  9.999999999999999e-85  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0320926 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5181  tRNA modification GTPase TrmE  36.21 
 
 		 458 aa  314  1.9999999999999998e-84  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0853003  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4164  tRNA modification GTPase TrmE  38.99 
 
 		 460 aa  314  1.9999999999999998e-84  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4203  tRNA modification GTPase TrmE  38.99 
 
 		 460 aa  314  1.9999999999999998e-84  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5671  tRNA modification GTPase TrmE  36.21 
 
 		 458 aa  314  1.9999999999999998e-84  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5611  tRNA modification GTPase TrmE  36.21 
 
 		 458 aa  314  2.9999999999999996e-84  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.292564  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5277  tRNA modification GTPase TrmE  36.42 
 
 		 458 aa  313  2.9999999999999996e-84  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0681  tRNA modification GTPase TrmE  39.09 
 
 		 450 aa  313  4.999999999999999e-84  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.570227  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4729  tRNA modification GTPase TrmE  39.91 
 
 		 454 aa  307  2.0000000000000002e-82  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.622363  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3622  tRNA modification GTPase TrmE  44.02 
 
 		 456 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1582  tRNA modification GTPase TrmE  40.63 
 
 		 462 aa  306  7e-82  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2669  tRNA modification GTPase TrmE  36.97 
 
 		 458 aa  304  3.0000000000000004e-81  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0097  tRNA modification GTPase TrmE  36.34 
 
 		 455 aa  303  5.000000000000001e-81  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2547  tRNA modification GTPase TrmE  36.4 
 
 		 455 aa  303  5.000000000000001e-81  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1989  tRNA modification GTPase TrmE  38.12 
 
 		 463 aa  303  6.000000000000001e-81  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.858955 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2992  tRNA modification GTPase TrmE  36.97 
 
 		 458 aa  303  6.000000000000001e-81  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0569  tRNA modification GTPase TrmE  38.33 
 
 		 458 aa  301  1e-80  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2945  tRNA modification GTPase TrmE  41.08 
 
 		 465 aa  301  2e-80  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0139032  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2758  tRNA modification GTPase TrmE  37.04 
 
 		 455 aa  298  2e-79  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.294935  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3142  tRNA modification GTPase TrmE  39.35 
 
 		 461 aa  298  2e-79  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.108144  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4774  tRNA modification GTPase TrmE  38.84 
 
 		 467 aa  298  2e-79  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.149576 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1908  tRNA modification GTPase TrmE  37.68 
 
 		 464 aa  294  2e-78  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.991823  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4957  tRNA modification GTPase TrmE  37.89 
 
 		 459 aa  292  7e-78  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000028541  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2572  GTPase  38.82 
 
 		 459 aa  291  1e-77  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.329632  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2392  tRNA modification GTPase TrmE  40.66 
 
 		 468 aa  291  2e-77  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0118764  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1733  tRNA modification GTPase TrmE  34.47 
 
 		 452 aa  290  5.0000000000000004e-77  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000059641  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0643  tRNA modification GTPase TrmE  43.1 
 
 		 452 aa  288  2e-76  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.461676 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1409  tRNA modification GTPase TrmE  33.97 
 
 		 452 aa  284  2.0000000000000002e-75  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0104  tRNA modification GTPase TrmE  38.44 
 
 		 462 aa  284  3.0000000000000004e-75  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3656  tRNA modification GTPase TrmE  37.95 
 
 		 460 aa  283  4.0000000000000003e-75  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3441  tRNA modification GTPase TrmE  39.01 
 
 		 454 aa  275  1.0000000000000001e-72  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0089  tRNA modification GTPase TrmE  37.04 
 
 		 455 aa  272  1e-71  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4133  tRNA modification GTPase TrmE  36.91 
 
 		 456 aa  271  2e-71  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2707  tRNA modification GTPase TrmE  35.36 
 
 		 466 aa  270  5e-71  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.622975  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3159  tRNA modification GTPase TrmE  37.82 
 
 		 457 aa  270  5e-71  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1336  tRNA modification GTPase TrmE  34.77 
 
 		 441 aa  270  5.9999999999999995e-71  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3279  tRNA modification GTPase TrmE  38.1 
 
 		 458 aa  267  2.9999999999999995e-70  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.768989 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0248  tRNA modification GTPase TrmE  36.34 
 
 		 473 aa  266  4e-70  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02181  tRNA modification GTPase TrmE  32.14 
 
 		 461 aa  266  5.999999999999999e-70  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02091  tRNA modification GTPase TrmE  32.46 
 
 		 460 aa  265  1e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.146144  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2025  tRNA modification GTPase TrmE  36.92 
 
 		 473 aa  264  2e-69  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.208875 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2453  tRNA modification GTPase TrmE  38.66 
 
 		 450 aa  264  2e-69  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2410  tRNA modification GTPase TrmE  39.07 
 
 		 448 aa  263  4.999999999999999e-69  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.749558  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02071  tRNA modification GTPase TrmE  32.68 
 
 		 460 aa  262  8e-69  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.214831  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3894  tRNA modification GTPase TrmE  36.23 
 
 		 456 aa  261  2e-68  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0886  tRNA modification GTPase TrmE  40.12 
 
 		 478 aa  260  3e-68  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00940326 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0217  tRNA modification GTPase TrmE  36.38 
 
 		 476 aa  260  3e-68  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0500389  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02071  tRNA modification GTPase TrmE  37.21 
 
 		 455 aa  259  5.0000000000000005e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.828373  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0977  tRNA modification GTPase TrmE  36.13 
 
 		 447 aa  260  5.0000000000000005e-68  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000239803  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1965  tRNA modification GTPase TrmE  37.39 
 
 		 468 aa  259  6e-68  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf755  tRNA modification GTPase TrmE  34.33 
 
 		 442 aa  259  7e-68  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1556  tRNA modification GTPase TrmE  35.62 
 
 		 464 aa  259  8e-68  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0375  tRNA modification GTPase TrmE  33.69 
 
 		 459 aa  258  1e-67  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02641  tRNA modification GTPase TrmE  36.06 
 
 		 464 aa  258  1e-67  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3984  tRNA modification GTPase TrmE  41.04 
 
 		 464 aa  258  2e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1430  tRNA modification GTPase TrmE  33.54 
 
 		 461 aa  256  5e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.299442  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1904  tRNA modification GTPase TrmE  35.65 
 
 		 472 aa  256  5e-67  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0191  tRNA modification GTPase TrmE  32.89 
 
 		 460 aa  256  6e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.377202  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2760  tRNA modification GTPase TrmE  38.35 
 
 		 462 aa  256  7e-67  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.4484  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12578  putative tRNA modification GTPase  34.5 
 
 		 469 aa  255  1.0000000000000001e-66  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27541  tRNA modification GTPase TrmE  38.68 
 
 		 465 aa  255  1.0000000000000001e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0526  tRNA modification GTPase TrmE  34.52 
 
 		 446 aa  255  1.0000000000000001e-66  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2124  tRNA modification GTPase TrmE  35.32 
 
 		 452 aa  254  3e-66  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0199  tRNA modification GTPase TrmE  35.32 
 
 		 473 aa  253  4.0000000000000004e-66  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2030  tRNA modification GTPase TrmE  36.19 
 
 		 460 aa  253  5.000000000000001e-66  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.312338  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4469  tRNA modification GTPase TrmE  39.09 
 
 		 464 aa  253  6e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0533201 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>