More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MARTH_orf755 on replicon NC_011025
Organism: Mycoplasma arthritidis 158L3-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011025  MARTH_orf755  tRNA modification GTPase TrmE  100 
 
 
442 aa  875    Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1940  tRNA modification GTPase TrmE  40.31 
 
 
462 aa  327  2.0000000000000001e-88  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000114309  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3429  tRNA modification GTPase TrmE  38.92 
 
 
461 aa  326  5e-88  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000224644  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5277  tRNA modification GTPase TrmE  40.52 
 
 
458 aa  325  9e-88  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4024  tRNA modification GTPase TrmE  39.83 
 
 
458 aa  324  2e-87  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5337  tRNA modification GTPase TrmE  40.09 
 
 
458 aa  323  4e-87  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5165  tRNA modification GTPase TrmE  40.09 
 
 
458 aa  323  4e-87  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5734  tRNA modification GTPase TrmE  40.09 
 
 
458 aa  323  4e-87  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5594  tRNA modification GTPase TrmE  40.09 
 
 
458 aa  323  4e-87  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0320926 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5181  tRNA modification GTPase TrmE  40.09 
 
 
458 aa  323  5e-87  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0853003  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5635  tRNA modification GTPase TrmE  40.09 
 
 
458 aa  322  6e-87  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5611  tRNA modification GTPase TrmE  40.09 
 
 
458 aa  322  7e-87  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.292564  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5324  tRNA modification GTPase TrmE  40.09 
 
 
458 aa  322  7e-87  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0322996 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5671  tRNA modification GTPase TrmE  40.09 
 
 
458 aa  322  8e-87  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0876  tRNA modification GTPase TrmE  39.56 
 
 
458 aa  314  1.9999999999999998e-84  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000254143  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2547  tRNA modification GTPase TrmE  38.22 
 
 
455 aa  305  9.000000000000001e-82  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0992  tRNA modification GTPase TrmE  38.8 
 
 
456 aa  305  1.0000000000000001e-81  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00719085  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3557  tRNA modification GTPase TrmE  37.01 
 
 
462 aa  299  7e-80  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1895  tRNA modification GTPase TrmE  39.04 
 
 
461 aa  298  1e-79  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  1.51566e-21 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0018  tRNA modification GTPase TrmE  39.28 
 
 
438 aa  297  2e-79  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0003  tRNA modification GTPase TrmE  36.96 
 
 
459 aa  296  6e-79  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000387737  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2365  tRNA modification GTPase TrmE  39.39 
 
 
459 aa  285  1.0000000000000001e-75  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1409  tRNA modification GTPase TrmE  38.73 
 
 
452 aa  284  2.0000000000000002e-75  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2791  tRNA modification GTPase TrmE  36.11 
 
 
459 aa  284  2.0000000000000002e-75  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2734  tRNA modification GTPase TrmE  36.11 
 
 
459 aa  284  2.0000000000000002e-75  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl014  tRNA modification GTPase TrmE  38.8 
 
 
452 aa  280  4e-74  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2669  tRNA modification GTPase TrmE  38.51 
 
 
458 aa  280  5e-74  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0375  tRNA modification GTPase TrmE  40.62 
 
 
459 aa  279  8e-74  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2992  tRNA modification GTPase TrmE  38.51 
 
 
458 aa  278  9e-74  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0819  tRNA modification GTPase TrmE  37.39 
 
 
452 aa  278  1e-73  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0657  tRNA modification GTPase TrmE  37.12 
 
 
450 aa  277  2e-73  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1336  tRNA modification GTPase TrmE  39.6 
 
 
441 aa  274  2.0000000000000002e-72  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2409  tRNA modification GTPase TrmE  37.63 
 
 
460 aa  272  8.000000000000001e-72  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.605137  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0681  tRNA modification GTPase TrmE  36.92 
 
 
450 aa  270  2.9999999999999997e-71  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.570227  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3324  tRNA modification GTPase TrmE  36.85 
 
 
461 aa  269  5.9999999999999995e-71  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2707  tRNA modification GTPase TrmE  39.06 
 
 
466 aa  267  2.9999999999999995e-70  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.622975  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2760  tRNA modification GTPase TrmE  35.5 
 
 
462 aa  266  4e-70  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.4484  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02181  tRNA modification GTPase TrmE  37.22 
 
 
461 aa  266  7e-70  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3486  tRNA modification GTPase TrmE  37.34 
 
 
460 aa  265  1e-69  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2519  tRNA modification GTPase TrmE  35.29 
 
 
462 aa  263  4e-69  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00190608 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23560  tRNA modification GTPase TrmE  35.06 
 
 
463 aa  263  6e-69  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.690968  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0097  tRNA modification GTPase TrmE  37.69 
 
 
455 aa  263  6e-69  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2945  tRNA modification GTPase TrmE  35.51 
 
 
465 aa  262  8.999999999999999e-69  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0139032  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2930  tRNA modification GTPase TrmE  36.88 
 
 
458 aa  262  1e-68  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.137366  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3279  tRNA modification GTPase TrmE  34.43 
 
 
458 aa  261  1e-68  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.768989 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1733  tRNA modification GTPase TrmE  35.03 
 
 
452 aa  259  7e-68  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000059641  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0526  tRNA modification GTPase TrmE  37.97 
 
 
446 aa  259  8e-68  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2572  GTPase  36.17 
 
 
459 aa  258  1e-67  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.329632  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02071  tRNA modification GTPase TrmE  37.5 
 
 
460 aa  257  3e-67  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.214831  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1430  tRNA modification GTPase TrmE  35.59 
 
 
461 aa  257  4e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.299442  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4365  tRNA modification GTPase TrmE  37.72 
 
 
461 aa  256  5e-67  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12578  putative tRNA modification GTPase  37.23 
 
 
469 aa  256  8e-67  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1904  tRNA modification GTPase TrmE  34.4 
 
 
472 aa  255  1.0000000000000001e-66  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2233  tRNA modification GTPase TrmE  34.77 
 
 
461 aa  253  4.0000000000000004e-66  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02091  tRNA modification GTPase TrmE  36.82 
 
 
460 aa  252  8.000000000000001e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.146144  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3465  tRNA modification GTPase TrmE  33.41 
 
 
456 aa  251  3e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1989  tRNA modification GTPase TrmE  32.39 
 
 
463 aa  250  3e-65  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.858955 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0089  tRNA modification GTPase TrmE  35.27 
 
 
455 aa  248  1e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4164  tRNA modification GTPase TrmE  31.44 
 
 
460 aa  247  3e-64  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1201  hypothetical protein  37.14 
 
 
455 aa  247  3e-64  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00128445 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2599  tRNA modification GTPase TrmE  34.33 
 
 
470 aa  247  4e-64  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.652843  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4203  tRNA modification GTPase TrmE  31.44 
 
 
460 aa  246  4.9999999999999997e-64  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2316  tRNA modification GTPase TrmE  35.96 
 
 
456 aa  246  6e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.64098  normal  0.135497 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2030  tRNA modification GTPase TrmE  34.07 
 
 
460 aa  246  6.999999999999999e-64  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.312338  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0191  tRNA modification GTPase TrmE  37.05 
 
 
460 aa  246  8e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.377202  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3941  tRNA modification GTPase TrmE  34.9 
 
 
458 aa  244  1.9999999999999999e-63  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4957  tRNA modification GTPase TrmE  33.26 
 
 
459 aa  244  1.9999999999999999e-63  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000028541  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1582  tRNA modification GTPase TrmE  33.91 
 
 
462 aa  244  3e-63  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1833  tRNA modification GTPase TrmE  35.63 
 
 
444 aa  243  7e-63  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0248  tRNA modification GTPase TrmE  32.98 
 
 
473 aa  241  2e-62  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0569  tRNA modification GTPase TrmE  31.14 
 
 
458 aa  241  2e-62  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1908  tRNA modification GTPase TrmE  31.88 
 
 
464 aa  241  2e-62  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.991823  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0977  tRNA modification GTPase TrmE  37.67 
 
 
447 aa  240  2.9999999999999997e-62  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000239803  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0070  tRNA modification GTPase TrmE  36.14 
 
 
444 aa  240  4e-62  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.868206  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3441  tRNA modification GTPase TrmE  31.22 
 
 
454 aa  239  6.999999999999999e-62  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1556  tRNA modification GTPase TrmE  36.78 
 
 
464 aa  238  1e-61  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3317  tRNA modification GTPase TrmE  32.28 
 
 
446 aa  238  1e-61  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3656  tRNA modification GTPase TrmE  30.07 
 
 
460 aa  237  2e-61  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02641  tRNA modification GTPase TrmE  36.56 
 
 
464 aa  237  2e-61  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2453  tRNA modification GTPase TrmE  32.87 
 
 
450 aa  235  1.0000000000000001e-60  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0217  tRNA modification GTPase TrmE  32.83 
 
 
476 aa  233  5e-60  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0500389  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4729  tRNA modification GTPase TrmE  32.89 
 
 
454 aa  233  6e-60  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.622363  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2758  tRNA modification GTPase TrmE  35.5 
 
 
455 aa  233  7.000000000000001e-60  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.294935  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02071  tRNA modification GTPase TrmE  36.38 
 
 
455 aa  233  7.000000000000001e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.828373  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4148  tRNA modification GTPase TrmE  32.89 
 
 
455 aa  231  1e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0876  tRNA modification GTPase TrmE  32.07 
 
 
518 aa  231  2e-59  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.588217 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4774  tRNA modification GTPase TrmE  31.02 
 
 
467 aa  231  2e-59  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.149576 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4133  tRNA modification GTPase TrmE  36.44 
 
 
456 aa  231  2e-59  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0645  tRNA modification GTPase TrmE  33.56 
 
 
449 aa  230  3e-59  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1625  tRNA modification GTPase TrmE  35.04 
 
 
441 aa  228  1e-58  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.834042  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4058  tRNA modification GTPase TrmE  32.67 
 
 
455 aa  228  1e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.239105  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3560  tRNA modification GTPase TrmE  32.53 
 
 
457 aa  227  3e-58  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0680  tRNA modification GTPase TrmE  34.22 
 
 
438 aa  227  3e-58  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.00000000000180906  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2373  tRNA modification GTPase TrmE  32.98 
 
 
473 aa  226  7e-58  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3142  tRNA modification GTPase TrmE  30.8 
 
 
461 aa  223  6e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.108144  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4428  tRNA modification GTPase TrmE  31.87 
 
 
455 aa  223  6e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0179  tRNA modification GTPase TrmE  33.54 
 
 
464 aa  223  7e-57  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2889  tRNA modification GTPase TrmE  31.56 
 
 
464 aa  222  9.999999999999999e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2195  tRNA modification GTPase TrmE  30.96 
 
 
475 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3472  tRNA modification GTPase TrmE  33.63 
 
 
442 aa  221  1.9999999999999999e-56  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>