More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfl014 on replicon NC_006055
Organism: Mesoplasma florum L1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006055  Mfl014  tRNA modification GTPase TrmE  100 
 
 		 452 aa  889    Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0819  tRNA modification GTPase TrmE  66.44 
 
 		 452 aa  595  1e-169  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3429  tRNA modification GTPase TrmE  37.2 
 
 		 461 aa  336  5e-91  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000224644  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1940  tRNA modification GTPase TrmE  38.48 
 
 		 462 aa  332  6e-90  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000114309  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5277  tRNA modification GTPase TrmE  38.11 
 
 		 458 aa  325  7e-88  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2547  tRNA modification GTPase TrmE  39.33 
 
 		 455 aa  325  7e-88  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0657  tRNA modification GTPase TrmE  40.96 
 
 		 450 aa  324  2e-87  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0018  tRNA modification GTPase TrmE  41.16 
 
 		 438 aa  322  9.000000000000001e-87  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5635  tRNA modification GTPase TrmE  37.67 
 
 		 458 aa  321  1.9999999999999998e-86  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5337  tRNA modification GTPase TrmE  37.67 
 
 		 458 aa  321  1.9999999999999998e-86  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5165  tRNA modification GTPase TrmE  37.67 
 
 		 458 aa  321  1.9999999999999998e-86  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5181  tRNA modification GTPase TrmE  37.67 
 
 		 458 aa  321  1.9999999999999998e-86  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0853003  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0681  tRNA modification GTPase TrmE  41.39 
 
 		 450 aa  321  1.9999999999999998e-86  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.570227  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5734  tRNA modification GTPase TrmE  37.67 
 
 		 458 aa  321  1.9999999999999998e-86  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5594  tRNA modification GTPase TrmE  37.67 
 
 		 458 aa  321  1.9999999999999998e-86  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0320926 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5671  tRNA modification GTPase TrmE  37.67 
 
 		 458 aa  321  1.9999999999999998e-86  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5324  tRNA modification GTPase TrmE  37.44 
 
 		 458 aa  320  3e-86  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0322996 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3557  tRNA modification GTPase TrmE  37.55 
 
 		 462 aa  320  3.9999999999999996e-86  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4024  tRNA modification GTPase TrmE  36.78 
 
 		 458 aa  319  5e-86  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5611  tRNA modification GTPase TrmE  37.44 
 
 		 458 aa  318  1e-85  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.292564  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0003  tRNA modification GTPase TrmE  36.48 
 
 		 459 aa  316  6e-85  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000387737  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0992  tRNA modification GTPase TrmE  37.69 
 
 		 456 aa  313  3.9999999999999997e-84  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00719085  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1336  tRNA modification GTPase TrmE  41.29 
 
 		 441 aa  311  2e-83  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2791  tRNA modification GTPase TrmE  36.11 
 
 		 459 aa  305  8.000000000000001e-82  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2734  tRNA modification GTPase TrmE  36.11 
 
 		 459 aa  305  8.000000000000001e-82  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0876  tRNA modification GTPase TrmE  37.53 
 
 		 458 aa  304  3.0000000000000004e-81  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000254143  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1409  tRNA modification GTPase TrmE  41.01 
 
 		 452 aa  302  6.000000000000001e-81  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1895  tRNA modification GTPase TrmE  37.89 
 
 		 461 aa  302  8.000000000000001e-81  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.51566e-21 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2365  tRNA modification GTPase TrmE  37.55 
 
 		 459 aa  298  1e-79  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23560  tRNA modification GTPase TrmE  38.23 
 
 		 463 aa  298  1e-79  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.690968  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3941  tRNA modification GTPase TrmE  38.02 
 
 		 458 aa  295  8e-79  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3324  tRNA modification GTPase TrmE  37.15 
 
 		 461 aa  295  1e-78  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0097  tRNA modification GTPase TrmE  40.26 
 
 		 455 aa  293  5e-78  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2992  tRNA modification GTPase TrmE  36.56 
 
 		 458 aa  290  3e-77  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2669  tRNA modification GTPase TrmE  36.56 
 
 		 458 aa  290  3e-77  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1733  tRNA modification GTPase TrmE  37.28 
 
 		 452 aa  286  4e-76  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000059641  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4133  tRNA modification GTPase TrmE  39.65 
 
 		 456 aa  286  5e-76  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2409  tRNA modification GTPase TrmE  37.72 
 
 		 460 aa  285  8e-76  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.605137  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2758  tRNA modification GTPase TrmE  38.11 
 
 		 455 aa  281  1e-74  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.294935  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf755  tRNA modification GTPase TrmE  38.8 
 
 		 442 aa  280  4e-74  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2519  tRNA modification GTPase TrmE  34.76 
 
 		 462 aa  280  5e-74  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00190608 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2930  tRNA modification GTPase TrmE  34.87 
 
 		 458 aa  279  8e-74  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.137366  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2233  tRNA modification GTPase TrmE  34.92 
 
 		 461 aa  276  4e-73  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0977  tRNA modification GTPase TrmE  39.87 
 
 		 447 aa  275  1.0000000000000001e-72  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000239803  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3486  tRNA modification GTPase TrmE  36.64 
 
 		 460 aa  275  1.0000000000000001e-72  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1908  tRNA modification GTPase TrmE  34.91 
 
 		 464 aa  275  2.0000000000000002e-72  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.991823  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0375  tRNA modification GTPase TrmE  37.83 
 
 		 459 aa  275  2.0000000000000002e-72  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2945  tRNA modification GTPase TrmE  35 
 
 		 465 aa  273  6e-72  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0139032  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4365  tRNA modification GTPase TrmE  35.13 
 
 		 461 aa  270  2.9999999999999997e-71  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4957  tRNA modification GTPase TrmE  34.76 
 
 		 459 aa  269  5.9999999999999995e-71  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000028541  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2572  GTPase  35.12 
 
 		 459 aa  267  2.9999999999999995e-70  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.329632  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3441  tRNA modification GTPase TrmE  32.82 
 
 		 454 aa  265  2e-69  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3279  tRNA modification GTPase TrmE  32.68 
 
 		 458 aa  264  3e-69  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.768989 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1989  tRNA modification GTPase TrmE  34.12 
 
 		 463 aa  263  6e-69  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.858955 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4164  tRNA modification GTPase TrmE  34.34 
 
 		 460 aa  262  8.999999999999999e-69  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4203  tRNA modification GTPase TrmE  34.13 
 
 		 460 aa  260  3e-68  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0248  tRNA modification GTPase TrmE  31.83 
 
 		 473 aa  259  5.0000000000000005e-68  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1430  tRNA modification GTPase TrmE  33.33 
 
 		 461 aa  259  7e-68  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.299442  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3560  tRNA modification GTPase TrmE  33.62 
 
 		 457 aa  258  1e-67  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4428  tRNA modification GTPase TrmE  34.03 
 
 		 455 aa  258  1e-67  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1582  tRNA modification GTPase TrmE  33.19 
 
 		 462 aa  256  4e-67  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3465  tRNA modification GTPase TrmE  33.41 
 
 		 456 aa  256  5e-67  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2030  tRNA modification GTPase TrmE  33.85 
 
 		 460 aa  255  1.0000000000000001e-66  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.312338  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4774  tRNA modification GTPase TrmE  33.55 
 
 		 467 aa  255  1.0000000000000001e-66  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.149576 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0089  tRNA modification GTPase TrmE  33.41 
 
 		 455 aa  253  7e-66  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3656  tRNA modification GTPase TrmE  33.48 
 
 		 460 aa  251  2e-65  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0569  tRNA modification GTPase TrmE  31.97 
 
 		 458 aa  251  2e-65  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12578  putative tRNA modification GTPase  32.7 
 
 		 469 aa  251  2e-65  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02181  tRNA modification GTPase TrmE  32.53 
 
 		 461 aa  246  8e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2025  tRNA modification GTPase TrmE  30.37 
 
 		 473 aa  246  9e-64  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.208875 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0526  tRNA modification GTPase TrmE  34.86 
 
 		 446 aa  244  1.9999999999999999e-63  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0876  tRNA modification GTPase TrmE  31.92 
 
 		 518 aa  243  5e-63  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.588217 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02071  tRNA modification GTPase TrmE  35.32 
 
 		 460 aa  242  7.999999999999999e-63  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.214831  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02641  tRNA modification GTPase TrmE  34.83 
 
 		 464 aa  240  2.9999999999999997e-62  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1201  hypothetical protein  33.05 
 
 		 455 aa  240  4e-62  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00128445 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02091  tRNA modification GTPase TrmE  35.32 
 
 		 460 aa  240  4e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.146144  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0104  tRNA modification GTPase TrmE  31.21 
 
 		 462 aa  239  5e-62  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02071  tRNA modification GTPase TrmE  35.29 
 
 		 455 aa  239  5.999999999999999e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.828373  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1556  tRNA modification GTPase TrmE  35.47 
 
 		 464 aa  239  1e-61  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4148  tRNA modification GTPase TrmE  32.34 
 
 		 455 aa  238  2e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2707  tRNA modification GTPase TrmE  35.15 
 
 		 466 aa  238  2e-61  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.622975  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2137  tRNA modification GTPase TrmE  28.17 
 
 		 461 aa  238  2e-61  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.075642 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0645  tRNA modification GTPase TrmE  31.66 
 
 		 449 aa  237  3e-61  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3142  tRNA modification GTPase TrmE  31.03 
 
 		 461 aa  237  3e-61  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.108144  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4729  tRNA modification GTPase TrmE  33.62 
 
 		 454 aa  237  3e-61  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.622363  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0191  tRNA modification GTPase TrmE  35 
 
 		 460 aa  236  5.0000000000000005e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.377202  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0217  tRNA modification GTPase TrmE  29.35 
 
 		 476 aa  236  5.0000000000000005e-61  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0500389  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2180  tRNA modification GTPase TrmE  32.84 
 
 		 472 aa  236  6e-61  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4058  tRNA modification GTPase TrmE  31.97 
 
 		 455 aa  236  9e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.239105  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3159  tRNA modification GTPase TrmE  31.97 
 
 		 457 aa  234  3e-60  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2599  tRNA modification GTPase TrmE  31.48 
 
 		 470 aa  233  4.0000000000000004e-60  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.652843  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3622  tRNA modification GTPase TrmE  32.91 
 
 		 456 aa  233  6e-60  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0117  tRNA modification GTPase TrmE  33.62 
 
 		 455 aa  229  1e-58  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2316  tRNA modification GTPase TrmE  32.97 
 
 		 456 aa  228  2e-58  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.64098  normal  0.135497 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2392  tRNA modification GTPase TrmE  29.72 
 
 		 468 aa  228  2e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0118764  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1904  tRNA modification GTPase TrmE  32.48 
 
 		 472 aa  228  2e-58  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2136  tRNA modification GTPase TrmE  31.47 
 
 		 451 aa  227  3e-58  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2373  tRNA modification GTPase TrmE  30.89 
 
 		 473 aa  226  7e-58  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0886  tRNA modification GTPase TrmE  28.78 
 
 		 478 aa  226  8e-58  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00940326 
 
 
-
 
NC_002620  TC0070  tRNA modification GTPase TrmE  31.79 
 
 		 444 aa  226  9e-58  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.868206  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>