More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_1625 on replicon NC_009802
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009802  CCC13826_1625  tRNA modification GTPase TrmE  100 
 
 		 441 aa  879    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.834042  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1833  tRNA modification GTPase TrmE  70.45 
 
 		 444 aa  614  1e-175  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0555  tRNA modification GTPase TrmE  61.73 
 
 		 438 aa  513  1e-144  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0654  tRNA modification GTPase TrmE  58.37 
 
 		 466 aa  508  9.999999999999999e-143  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0979  tRNA modification GTPase TrmE  59.73 
 
 		 442 aa  503  1e-141  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.523955  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1036  tRNA modification GTPase TrmE  59.28 
 
 		 442 aa  498  1e-140  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.788526  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0825  tRNA modification GTPase TrmE  58.37 
 
 		 442 aa  486  1e-136  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0548  tRNA modification GTPase TrmE  57.24 
 
 		 442 aa  469  1.0000000000000001e-131  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0526  tRNA modification GTPase TrmE  51.34 
 
 		 446 aa  428  1e-118  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2992  tRNA modification GTPase TrmE  38.31 
 
 		 458 aa  288  2e-76  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2669  tRNA modification GTPase TrmE  38.31 
 
 		 458 aa  288  2e-76  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2547  tRNA modification GTPase TrmE  40.83 
 
 		 455 aa  286  5e-76  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1940  tRNA modification GTPase TrmE  35.84 
 
 		 462 aa  268  2e-70  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000114309  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0992  tRNA modification GTPase TrmE  37.86 
 
 		 456 aa  266  4e-70  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00719085  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0657  tRNA modification GTPase TrmE  37.93 
 
 		 450 aa  265  1e-69  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4024  tRNA modification GTPase TrmE  35.28 
 
 		 458 aa  263  4e-69  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4200  tRNA modification GTPase TrmE  36.73 
 
 		 448 aa  262  8.999999999999999e-69  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0153583 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0199  tRNA modification GTPase TrmE  37.39 
 
 		 473 aa  262  1e-68  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2124  tRNA modification GTPase TrmE  37.39 
 
 		 452 aa  262  1e-68  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0680  tRNA modification GTPase TrmE  37.53 
 
 		 438 aa  260  4e-68  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.00000000000180906  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3324  tRNA modification GTPase TrmE  36.92 
 
 		 461 aa  260  4e-68  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2195  tRNA modification GTPase TrmE  36.54 
 
 		 475 aa  259  5.0000000000000005e-68  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3441  tRNA modification GTPase TrmE  34.99 
 
 		 454 aa  259  5.0000000000000005e-68  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0645  tRNA modification GTPase TrmE  35.6 
 
 		 449 aa  259  7e-68  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0876  tRNA modification GTPase TrmE  36.8 
 
 		 458 aa  259  9e-68  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000254143  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5742  tRNA modification GTPase TrmE  36.4 
 
 		 456 aa  259  9e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.206283  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0005  tRNA modification GTPase TrmE  38.24 
 
 		 456 aa  258  2e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.273487  hitchhiker  0.00022418 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0977  tRNA modification GTPase TrmE  39.57 
 
 		 447 aa  258  2e-67  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000239803  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5308  tRNA modification GTPase TrmE  38.24 
 
 		 456 aa  258  2e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.832252  normal  0.0803697 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5443  tRNA modification GTPase TrmE  37.5 
 
 		 456 aa  257  3e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3560  tRNA modification GTPase TrmE  35.37 
 
 		 457 aa  256  4e-67  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4619  tRNA modification GTPase TrmE  36.62 
 
 		 455 aa  256  6e-67  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5133  tRNA modification GTPase TrmE  36.18 
 
 		 456 aa  256  7e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4428  tRNA modification GTPase TrmE  33.99 
 
 		 455 aa  254  1.0000000000000001e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0884  tRNA modification GTPase TrmE  35.81 
 
 		 452 aa  254  1.0000000000000001e-66  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2519  tRNA modification GTPase TrmE  36.73 
 
 		 462 aa  254  3e-66  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00190608 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2930  tRNA modification GTPase TrmE  34.86 
 
 		 458 aa  254  3e-66  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.137366  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5611  tRNA modification GTPase TrmE  36.52 
 
 		 456 aa  253  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1409  tRNA modification GTPase TrmE  35.53 
 
 		 452 aa  253  4.0000000000000004e-66  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5277  tRNA modification GTPase TrmE  33.98 
 
 		 458 aa  252  9.000000000000001e-66  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1336  tRNA modification GTPase TrmE  35.03 
 
 		 441 aa  252  9.000000000000001e-66  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5594  tRNA modification GTPase TrmE  35.28 
 
 		 458 aa  252  1e-65  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0320926 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5337  tRNA modification GTPase TrmE  35.28 
 
 		 458 aa  252  1e-65  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5165  tRNA modification GTPase TrmE  35.28 
 
 		 458 aa  252  1e-65  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5181  tRNA modification GTPase TrmE  35.28 
 
 		 458 aa  252  1e-65  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0853003  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2929  tRNA modification GTPase TrmE  36 
 
 		 446 aa  251  1e-65  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2945  tRNA modification GTPase TrmE  37.01 
 
 		 465 aa  252  1e-65  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0139032  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5734  tRNA modification GTPase TrmE  35.28 
 
 		 458 aa  252  1e-65  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5212  tRNA modification GTPase TrmE  37.14 
 
 		 456 aa  251  1e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0681  tRNA modification GTPase TrmE  37.74 
 
 		 450 aa  251  1e-65  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.570227  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5635  tRNA modification GTPase TrmE  35.06 
 
 		 458 aa  251  2e-65  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5671  tRNA modification GTPase TrmE  35.06 
 
 		 458 aa  251  2e-65  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3465  tRNA modification GTPase TrmE  35.53 
 
 		 456 aa  250  3e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3073  tRNA modification GTPase TrmE  36.22 
 
 		 446 aa  250  3e-65  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2758  tRNA modification GTPase TrmE  36.03 
 
 		 455 aa  250  3e-65  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.294935  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5324  tRNA modification GTPase TrmE  35.06 
 
 		 458 aa  250  4e-65  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0322996 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5611  tRNA modification GTPase TrmE  35.28 
 
 		 458 aa  250  4e-65  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.292564  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4058  tRNA modification GTPase TrmE  34.57 
 
 		 455 aa  249  5e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.239105  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52440  tRNA modification GTPase TrmE  35.9 
 
 		 455 aa  249  7e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3941  tRNA modification GTPase TrmE  34.06 
 
 		 458 aa  249  8e-65  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4013  tRNA modification GTPase TrmE  36.8 
 
 		 456 aa  249  9e-65  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.205295  normal  0.289015 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4148  tRNA modification GTPase TrmE  34.79 
 
 		 455 aa  249  9e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04098  tRNA modification GTPase  36.75 
 
 		 462 aa  248  1e-64  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73400  tRNA modification GTPase TrmE  35.15 
 
 		 455 aa  248  1e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000503354  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1895  tRNA modification GTPase TrmE  34.34 
 
 		 461 aa  248  1e-64  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.51566e-21 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0248  tRNA modification GTPase TrmE  34.48 
 
 		 473 aa  248  2e-64  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0003  tRNA modification GTPase TrmE  37.2 
 
 		 457 aa  246  4e-64  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3894  tRNA modification GTPase TrmE  37.2 
 
 		 456 aa  247  4e-64  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3429  tRNA modification GTPase TrmE  33.83 
 
 		 461 aa  246  4.9999999999999997e-64  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000224644  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0876  tRNA modification GTPase TrmE  36.11 
 
 		 518 aa  246  6e-64  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.588217 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4089  tRNA modification GTPase TrmE  36.36 
 
 		 448 aa  246  6e-64  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3038  tRNA modification GTPase TrmE  37.2 
 
 		 448 aa  245  9.999999999999999e-64  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.38062  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4957  tRNA modification GTPase TrmE  34.11 
 
 		 459 aa  244  1.9999999999999999e-63  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000028541  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4031  tRNA modification GTPase TrmE  37.37 
 
 		 453 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.608873  hitchhiker  0.001302 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1582  tRNA modification GTPase TrmE  35.79 
 
 		 462 aa  243  3.9999999999999997e-63  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3984  tRNA modification GTPase TrmE  34.9 
 
 		 464 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1430  tRNA modification GTPase TrmE  35.59 
 
 		 461 aa  243  5e-63  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.299442  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0005  tRNA modification GTPase TrmE  37.15 
 
 		 453 aa  243  5e-63  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.135343  hitchhiker  0.00000014804 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3939  tRNA modification GTPase TrmE  37.15 
 
 		 453 aa  243  6e-63  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000114268 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3486  tRNA modification GTPase TrmE  35.05 
 
 		 460 aa  242  7.999999999999999e-63  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2373  tRNA modification GTPase TrmE  34.62 
 
 		 473 aa  242  7.999999999999999e-63  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0003  tRNA modification GTPase TrmE  34.19 
 
 		 459 aa  241  1e-62  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000387737  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0100  tRNA modification GTPase TrmE  35.05 
 
 		 473 aa  242  1e-62  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.651435  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4484  tRNA modification GTPase TrmE  36.44 
 
 		 459 aa  241  1e-62  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000179125 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3612  tRNA modification GTPase TrmE  36.62 
 
 		 455 aa  241  2e-62  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4263  tRNA modification GTPase TrmE  35.29 
 
 		 454 aa  241  2e-62  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.226045  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3774  tRNA modification GTPase TrmE  36.32 
 
 		 466 aa  241  2e-62  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0161001  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_4001  tRNA modification GTPase TrmE  36.64 
 
 		 453 aa  240  4e-62  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.73411  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4378  tRNA modification GTPase TrmE  36.21 
 
 		 453 aa  240  4e-62  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0292979  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0008  tRNA modification GTPase TrmE  35.71 
 
 		 453 aa  240  4e-62  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.185087  hitchhiker  0.000721309 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0569  tRNA modification GTPase TrmE  34.5 
 
 		 458 aa  239  5.999999999999999e-62  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23560  tRNA modification GTPase TrmE  34.49 
 
 		 463 aa  239  5.999999999999999e-62  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.690968  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3865  tRNA modification GTPase TrmE  36.29 
 
 		 453 aa  239  5.999999999999999e-62  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000363316 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1989  tRNA modification GTPase TrmE  33.69 
 
 		 463 aa  239  6.999999999999999e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.858955 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4520  tRNA modification GTPase TrmE  36.21 
 
 		 453 aa  239  6.999999999999999e-62  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.30842  hitchhiker  0.000795549 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4324  tRNA modification GTPase TrmE  36.21 
 
 		 453 aa  239  6.999999999999999e-62  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0616134  unclonable  0.00000000000430527 
 
 
-
 
NC_002620  TC0070  tRNA modification GTPase TrmE  35.68 
 
 		 444 aa  238  1e-61  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.868206  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3086  tRNA modification GTPase TrmE  35.68 
 
 		 458 aa  238  1e-61  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.924716  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0132  tRNA modification GTPase TrmE  36.56 
 
 		 452 aa  238  1e-61  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.849325  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4379  tRNA modification GTPase TrmE  36.21 
 
 		 479 aa  238  2e-61  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000434128  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>