More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_0680 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011126  HY04AAS1_0680  tRNA modification GTPase TrmE  100 
 
 		 438 aa  880    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.00000000000180906  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0977  tRNA modification GTPase TrmE  42.51 
 
 		 447 aa  325  9e-88  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000239803  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23560  tRNA modification GTPase TrmE  37.34 
 
 		 463 aa  289  7e-77  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.690968  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0657  tRNA modification GTPase TrmE  38.83 
 
 		 450 aa  285  9e-76  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2758  tRNA modification GTPase TrmE  37.75 
 
 		 455 aa  283  4.0000000000000003e-75  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.294935  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3038  tRNA modification GTPase TrmE  35.73 
 
 		 448 aa  282  9e-75  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.38062  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0681  tRNA modification GTPase TrmE  38.61 
 
 		 450 aa  280  3e-74  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.570227  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4058  tRNA modification GTPase TrmE  36.42 
 
 		 455 aa  280  4e-74  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.239105  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03590  tRNA modification GTPase  36.98 
 
 		 454 aa  279  6e-74  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3920  tRNA modification GTPase TrmE  36.98 
 
 		 454 aa  279  6e-74  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.189642  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4148  tRNA modification GTPase TrmE  37.09 
 
 		 455 aa  279  6e-74  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03534  hypothetical protein  36.98 
 
 		 454 aa  279  6e-74  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.948294  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4070  tRNA modification GTPase TrmE  37.47 
 
 		 467 aa  279  7e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.125734  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4177  tRNA modification GTPase TrmE  37.47 
 
 		 467 aa  279  7e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.357651  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4234  tRNA modification GTPase TrmE  37.47 
 
 		 467 aa  279  7e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4055  tRNA modification GTPase TrmE  37.47 
 
 		 454 aa  279  9e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.765231  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4127  tRNA modification GTPase TrmE  37.47 
 
 		 454 aa  279  9e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.357729  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4260  tRNA modification GTPase TrmE  36.76 
 
 		 454 aa  278  1e-73  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4219  tRNA modification GTPase TrmE  36.76 
 
 		 454 aa  278  1e-73  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.99545  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4288  tRNA modification GTPase TrmE  36.76 
 
 		 454 aa  278  1e-73  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5136  tRNA modification GTPase TrmE  36.54 
 
 		 454 aa  276  4e-73  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.041745  normal  0.0619684 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4216  tRNA modification GTPase TrmE  36.76 
 
 		 454 aa  276  5e-73  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.021791  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4073  tRNA modification GTPase TrmE  36.54 
 
 		 454 aa  276  7e-73  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.420944  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0375  tRNA modification GTPase TrmE  38.95 
 
 		 459 aa  273  3e-72  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1409  tRNA modification GTPase TrmE  36.93 
 
 		 452 aa  273  6e-72  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4183  tRNA modification GTPase TrmE  35.67 
 
 		 454 aa  272  7e-72  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000380111  normal  0.0649437 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0992  tRNA modification GTPase TrmE  35.92 
 
 		 456 aa  272  7e-72  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00719085  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4158  tRNA modification GTPase TrmE  35.67 
 
 		 454 aa  272  8.000000000000001e-72  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000196641  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0314  tRNA modification GTPase TrmE  33.33 
 
 		 450 aa  272  9e-72  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00576337  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4428  tRNA modification GTPase TrmE  34.64 
 
 		 455 aa  272  1e-71  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4245  tRNA modification GTPase TrmE  35.45 
 
 		 454 aa  271  2e-71  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00411948  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2254  tRNA modification GTPase TrmE  33.86 
 
 		 436 aa  270  4e-71  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.9716  normal  0.222751 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0027  tRNA modification GTPase TrmE  35.01 
 
 		 454 aa  269  7e-71  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.151422 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4148  tRNA modification GTPase TrmE  36.11 
 
 		 454 aa  269  7e-71  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.421634  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1430  tRNA modification GTPase TrmE  36.73 
 
 		 461 aa  268  1e-70  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.299442  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2992  tRNA modification GTPase TrmE  36.84 
 
 		 458 aa  268  1e-70  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3324  tRNA modification GTPase TrmE  36.74 
 
 		 461 aa  268  2e-70  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2669  tRNA modification GTPase TrmE  36.84 
 
 		 458 aa  267  2.9999999999999995e-70  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3560  tRNA modification GTPase TrmE  34.51 
 
 		 457 aa  266  5e-70  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2124  tRNA modification GTPase TrmE  36.59 
 
 		 452 aa  266  7e-70  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4292  tRNA modification GTPase TrmE  35.51 
 
 		 454 aa  265  1e-69  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.10556  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0199  tRNA modification GTPase TrmE  36.59 
 
 		 473 aa  265  1e-69  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4164  tRNA modification GTPase TrmE  34.65 
 
 		 460 aa  264  2e-69  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0248  tRNA modification GTPase TrmE  33.91 
 
 		 473 aa  263  3e-69  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1940  tRNA modification GTPase TrmE  33.7 
 
 		 462 aa  263  4e-69  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000114309  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4203  tRNA modification GTPase TrmE  34.65 
 
 		 460 aa  263  4e-69  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1989  tRNA modification GTPase TrmE  34.2 
 
 		 463 aa  263  4e-69  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.858955 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4615  tRNA modification GTPase TrmE  35.01 
 
 		 454 aa  263  4e-69  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.394021  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3142  tRNA modification GTPase TrmE  35.76 
 
 		 461 aa  262  6.999999999999999e-69  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.108144  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1908  tRNA modification GTPase TrmE  35.65 
 
 		 464 aa  262  8e-69  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.991823  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4263  tRNA modification GTPase TrmE  34.79 
 
 		 454 aa  259  7e-68  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.226045  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1895  tRNA modification GTPase TrmE  35.02 
 
 		 461 aa  259  8e-68  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.51566e-21 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1201  hypothetical protein  35.7 
 
 		 455 aa  259  9e-68  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00128445 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3086  tRNA modification GTPase TrmE  33.48 
 
 		 458 aa  258  2e-67  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.924716  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3429  tRNA modification GTPase TrmE  33.55 
 
 		 461 aa  256  4e-67  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000224644  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4034  tRNA modification GTPase TrmE  34.36 
 
 		 453 aa  257  4e-67  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.461545  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0884  tRNA modification GTPase TrmE  36.64 
 
 		 452 aa  256  5e-67  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4365  tRNA modification GTPase TrmE  34.54 
 
 		 461 aa  256  6e-67  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4729  tRNA modification GTPase TrmE  33.84 
 
 		 454 aa  256  7e-67  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.622363  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3317  tRNA modification GTPase TrmE  33.56 
 
 		 446 aa  256  7e-67  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2930  tRNA modification GTPase TrmE  33.62 
 
 		 458 aa  255  9e-67  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.137366  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2409  tRNA modification GTPase TrmE  35.04 
 
 		 460 aa  255  1.0000000000000001e-66  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.605137  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2519  tRNA modification GTPase TrmE  35.12 
 
 		 462 aa  255  1.0000000000000001e-66  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00190608 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0569  tRNA modification GTPase TrmE  33.19 
 
 		 458 aa  254  2.0000000000000002e-66  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2547  tRNA modification GTPase TrmE  34.44 
 
 		 455 aa  254  2.0000000000000002e-66  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0089  tRNA modification GTPase TrmE  34.23 
 
 		 455 aa  254  3e-66  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0217  tRNA modification GTPase TrmE  33.69 
 
 		 476 aa  253  3e-66  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0500389  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5324  tRNA modification GTPase TrmE  32.75 
 
 		 458 aa  254  3e-66  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0322996 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1625  tRNA modification GTPase TrmE  37.53 
 
 		 441 aa  253  6e-66  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.834042  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5611  tRNA modification GTPase TrmE  32.97 
 
 		 458 aa  252  8.000000000000001e-66  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.292564  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0548  tRNA modification GTPase TrmE  38.13 
 
 		 442 aa  252  8.000000000000001e-66  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3465  tRNA modification GTPase TrmE  33.77 
 
 		 456 aa  252  9.000000000000001e-66  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0097  tRNA modification GTPase TrmE  37.82 
 
 		 455 aa  252  9.000000000000001e-66  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5277  tRNA modification GTPase TrmE  32.9 
 
 		 458 aa  252  1e-65  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5635  tRNA modification GTPase TrmE  32.97 
 
 		 458 aa  251  2e-65  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5337  tRNA modification GTPase TrmE  32.53 
 
 		 458 aa  251  2e-65  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5165  tRNA modification GTPase TrmE  32.53 
 
 		 458 aa  251  2e-65  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5181  tRNA modification GTPase TrmE  32.53 
 
 		 458 aa  251  2e-65  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0853003  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5734  tRNA modification GTPase TrmE  32.53 
 
 		 458 aa  251  2e-65  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0526  tRNA modification GTPase TrmE  35.04 
 
 		 446 aa  251  2e-65  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5671  tRNA modification GTPase TrmE  32.53 
 
 		 458 aa  251  2e-65  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5594  tRNA modification GTPase TrmE  32.53 
 
 		 458 aa  251  2e-65  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0320926 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2945  tRNA modification GTPase TrmE  33.55 
 
 		 465 aa  250  3e-65  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0139032  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4619  tRNA modification GTPase TrmE  32.96 
 
 		 455 aa  250  3e-65  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3612  tRNA modification GTPase TrmE  35.24 
 
 		 455 aa  250  3e-65  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2734  tRNA modification GTPase TrmE  32.9 
 
 		 459 aa  249  5e-65  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4013  tRNA modification GTPase TrmE  33.48 
 
 		 456 aa  249  5e-65  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.205295  normal  0.289015 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2791  tRNA modification GTPase TrmE  32.9 
 
 		 459 aa  249  5e-65  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4774  tRNA modification GTPase TrmE  34.2 
 
 		 467 aa  249  5e-65  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.149576 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3315  tRNA modification GTPase TrmE  34.29 
 
 		 458 aa  249  7e-65  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1734  tRNA modification GTPase TrmE  34 
 
 		 437 aa  249  7e-65  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1336  tRNA modification GTPase TrmE  35.25 
 
 		 441 aa  249  7e-65  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0876  tRNA modification GTPase TrmE  33.33 
 
 		 458 aa  249  9e-65  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000254143  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3441  tRNA modification GTPase TrmE  33.41 
 
 		 454 aa  248  1e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0645  tRNA modification GTPase TrmE  34.86 
 
 		 449 aa  248  1e-64  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2775  tRNA modification GTPase TrmE  34.44 
 
 		 452 aa  248  2e-64  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0153  tRNA modification GTPase TrmE  35.13 
 
 		 475 aa  247  3e-64  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0132  tRNA modification GTPase TrmE  34.07 
 
 		 452 aa  247  3e-64  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.849325  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3622  tRNA modification GTPase TrmE  37.23 
 
 		 456 aa  247  4e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0002  tRNA modification GTPase TrmE  35.29 
 
 		 455 aa  246  6e-64  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>