More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_0645 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010655  Amuc_0645  tRNA modification GTPase TrmE  100 
 
 		 449 aa  906    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2930  tRNA modification GTPase TrmE  43.23 
 
 		 458 aa  355  7.999999999999999e-97  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.137366  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4058  tRNA modification GTPase TrmE  41.85 
 
 		 455 aa  328  2.0000000000000001e-88  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.239105  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4148  tRNA modification GTPase TrmE  42.2 
 
 		 455 aa  327  4.0000000000000003e-88  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3465  tRNA modification GTPase TrmE  41.72 
 
 		 456 aa  326  5e-88  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2409  tRNA modification GTPase TrmE  40.52 
 
 		 460 aa  325  7e-88  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.605137  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3142  tRNA modification GTPase TrmE  42.79 
 
 		 461 aa  319  7e-86  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.108144  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2365  tRNA modification GTPase TrmE  40.56 
 
 		 459 aa  317  2e-85  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2519  tRNA modification GTPase TrmE  42.98 
 
 		 462 aa  318  2e-85  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00190608 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2669  tRNA modification GTPase TrmE  38.82 
 
 		 458 aa  315  9.999999999999999e-85  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2124  tRNA modification GTPase TrmE  40.87 
 
 		 452 aa  314  1.9999999999999998e-84  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2992  tRNA modification GTPase TrmE  38.82 
 
 		 458 aa  314  2.9999999999999996e-84  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3560  tRNA modification GTPase TrmE  40.31 
 
 		 457 aa  313  3.9999999999999997e-84  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0199  tRNA modification GTPase TrmE  40.87 
 
 		 473 aa  313  4.999999999999999e-84  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2945  tRNA modification GTPase TrmE  40.43 
 
 		 465 aa  311  2e-83  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0139032  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0884  tRNA modification GTPase TrmE  43.2 
 
 		 452 aa  308  1.0000000000000001e-82  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0977  tRNA modification GTPase TrmE  39.11 
 
 		 447 aa  308  2.0000000000000002e-82  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000239803  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0681  tRNA modification GTPase TrmE  40.88 
 
 		 450 aa  307  2.0000000000000002e-82  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.570227  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1940  tRNA modification GTPase TrmE  39.04 
 
 		 462 aa  308  2.0000000000000002e-82  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000114309  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0657  tRNA modification GTPase TrmE  41.1 
 
 		 450 aa  305  1.0000000000000001e-81  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2515  tRNA modification GTPase TrmE  40.43 
 
 		 464 aa  303  3.0000000000000004e-81  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000310293  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3324  tRNA modification GTPase TrmE  38.18 
 
 		 461 aa  303  4.0000000000000003e-81  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0005  tRNA modification GTPase TrmE  41.44 
 
 		 481 aa  301  1e-80  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.75194  normal  0.209412 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0027  tRNA modification GTPase TrmE  40.74 
 
 		 454 aa  301  2e-80  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.151422 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3279  tRNA modification GTPase TrmE  38.48 
 
 		 458 aa  299  6e-80  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.768989 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3865  tRNA modification GTPase TrmE  40.17 
 
 		 453 aa  299  7e-80  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000363316 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2547  tRNA modification GTPase TrmE  39.56 
 
 		 455 aa  299  7e-80  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03590  tRNA modification GTPase  39.96 
 
 		 454 aa  298  1e-79  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23560  tRNA modification GTPase TrmE  36.76 
 
 		 463 aa  298  1e-79  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.690968  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03534  hypothetical protein  39.96 
 
 		 454 aa  298  1e-79  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.948294  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0526  tRNA modification GTPase TrmE  37.8 
 
 		 446 aa  298  1e-79  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3920  tRNA modification GTPase TrmE  39.96 
 
 		 454 aa  298  1e-79  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.189642  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4292  tRNA modification GTPase TrmE  39.61 
 
 		 454 aa  298  1e-79  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.10556  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4031  tRNA modification GTPase TrmE  39.3 
 
 		 453 aa  298  1e-79  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.608873  hitchhiker  0.001302 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4484  tRNA modification GTPase TrmE  40.52 
 
 		 459 aa  298  1e-79  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000179125 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4260  tRNA modification GTPase TrmE  39.96 
 
 		 454 aa  297  2e-79  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4073  tRNA modification GTPase TrmE  39.96 
 
 		 454 aa  298  2e-79  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.420944  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5136  tRNA modification GTPase TrmE  39.96 
 
 		 454 aa  298  2e-79  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.041745  normal  0.0619684 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4034  tRNA modification GTPase TrmE  40.61 
 
 		 453 aa  298  2e-79  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.461545  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4288  tRNA modification GTPase TrmE  39.96 
 
 		 454 aa  297  2e-79  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4428  tRNA modification GTPase TrmE  39.56 
 
 		 455 aa  298  2e-79  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4219  tRNA modification GTPase TrmE  39.96 
 
 		 454 aa  297  2e-79  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.99545  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4055  tRNA modification GTPase TrmE  40 
 
 		 454 aa  297  3e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.765231  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3941  tRNA modification GTPase TrmE  39.74 
 
 		 458 aa  297  3e-79  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4127  tRNA modification GTPase TrmE  40 
 
 		 454 aa  297  3e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.357729  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3939  tRNA modification GTPase TrmE  39.3 
 
 		 453 aa  297  3e-79  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000114268 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0005  tRNA modification GTPase TrmE  39.3 
 
 		 453 aa  297  3e-79  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.135343  hitchhiker  0.00000014804 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0001  tRNA modification GTPase TrmE  39.65 
 
 		 453 aa  296  4e-79  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.201746  hitchhiker  0.00000000323985 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4234  tRNA modification GTPase TrmE  40 
 
 		 467 aa  296  4e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3429  tRNA modification GTPase TrmE  37.99 
 
 		 461 aa  296  4e-79  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000224644  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4070  tRNA modification GTPase TrmE  40 
 
 		 467 aa  296  4e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.125734  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4177  tRNA modification GTPase TrmE  40 
 
 		 467 aa  296  4e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.357651  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0002  tRNA modification GTPase TrmE  39.4 
 
 		 455 aa  296  5e-79  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002017  GTPase and tRNA-U34 5-formylation enzyme TrmE  39.57 
 
 		 453 aa  296  6e-79  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0189213  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4041  tRNA modification GTPase TrmE  41.3 
 
 		 449 aa  296  7e-79  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.934487  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4615  tRNA modification GTPase TrmE  39.39 
 
 		 454 aa  295  1e-78  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.394021  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0132  tRNA modification GTPase TrmE  38.73 
 
 		 452 aa  295  1e-78  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.849325  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4148  tRNA modification GTPase TrmE  39.74 
 
 		 454 aa  295  1e-78  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.421634  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4216  tRNA modification GTPase TrmE  39.74 
 
 		 454 aa  295  1e-78  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.021791  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3755  tRNA modification GTPase TrmE  41.81 
 
 		 481 aa  294  2e-78  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4928  tRNA modification GTPase TrmE  38.86 
 
 		 453 aa  294  2e-78  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0035842  hitchhiker  0.00000248868 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0003  tRNA modification GTPase TrmE  39.3 
 
 		 457 aa  295  2e-78  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3622  tRNA modification GTPase TrmE  43.7 
 
 		 456 aa  294  2e-78  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00435  tRNA modification GTPase TrmE  39.74 
 
 		 453 aa  293  3e-78  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3456  tRNA modification GTPase TrmE  41.36 
 
 		 481 aa  293  3e-78  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0992  tRNA modification GTPase TrmE  38.22 
 
 		 456 aa  293  3e-78  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00719085  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3038  tRNA modification GTPase TrmE  41.79 
 
 		 448 aa  293  5e-78  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.38062  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3086  tRNA modification GTPase TrmE  40.57 
 
 		 458 aa  292  7e-78  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.924716  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1895  tRNA modification GTPase TrmE  37.5 
 
 		 461 aa  292  8e-78  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.51566e-21 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3317  tRNA modification GTPase TrmE  41.98 
 
 		 446 aa  292  9e-78  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2233  tRNA modification GTPase TrmE  44.91 
 
 		 461 aa  292  9e-78  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_4001  tRNA modification GTPase TrmE  39.74 
 
 		 453 aa  292  9e-78  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.73411  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0097  tRNA modification GTPase TrmE  37.09 
 
 		 455 aa  292  1e-77  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1783  tRNA modification GTPase TrmE  38.79 
 
 		 454 aa  291  1e-77  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.028326  normal  0.377376 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4520  tRNA modification GTPase TrmE  39.3 
 
 		 453 aa  292  1e-77  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.30842  hitchhiker  0.000795549 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3152  tRNA modification GTPase TrmE  41.03 
 
 		 464 aa  292  1e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000246642 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4324  tRNA modification GTPase TrmE  39.3 
 
 		 453 aa  292  1e-77  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0616134  unclonable  0.00000000000430527 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4378  tRNA modification GTPase TrmE  39.3 
 
 		 453 aa  291  1e-77  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0292979  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03489  tRNA modification GTPase TrmE  42.76 
 
 		 446 aa  291  1e-77  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3774  tRNA modification GTPase TrmE  40.17 
 
 		 466 aa  291  1e-77  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0161001  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2881  tRNA modification GTPase TrmE  42.35 
 
 		 444 aa  291  1e-77  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.470737  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1733  tRNA modification GTPase TrmE  37.04 
 
 		 452 aa  291  2e-77  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000059641  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4365  tRNA modification GTPase TrmE  35.79 
 
 		 461 aa  291  2e-77  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2030  tRNA modification GTPase TrmE  37.47 
 
 		 460 aa  291  2e-77  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.312338  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3486  tRNA modification GTPase TrmE  37.58 
 
 		 460 aa  290  3e-77  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4241  tRNA modification GTPase TrmE  38.43 
 
 		 469 aa  290  3e-77  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.207719  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2757  tRNA modification GTPase TrmE  40.35 
 
 		 446 aa  290  3e-77  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1430  tRNA modification GTPase TrmE  38.44 
 
 		 461 aa  290  3e-77  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.299442  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5277  tRNA modification GTPase TrmE  37.99 
 
 		 458 aa  290  4e-77  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1409  tRNA modification GTPase TrmE  37.04 
 
 		 452 aa  289  5.0000000000000004e-77  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4024  tRNA modification GTPase TrmE  37.94 
 
 		 458 aa  290  5.0000000000000004e-77  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4013  tRNA modification GTPase TrmE  38.63 
 
 		 456 aa  289  6e-77  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.205295  normal  0.289015 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12578  putative tRNA modification GTPase  36.25 
 
 		 469 aa  289  6e-77  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4263  tRNA modification GTPase TrmE  39.17 
 
 		 454 aa  289  6e-77  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.226045  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5133  tRNA modification GTPase TrmE  39.4 
 
 		 456 aa  289  7e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4379  tRNA modification GTPase TrmE  39.08 
 
 		 479 aa  288  1e-76  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000434128  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0876  tRNA modification GTPase TrmE  37.11 
 
 		 458 aa  287  2e-76  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000254143  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5611  tRNA modification GTPase TrmE  39.53 
 
 		 456 aa  288  2e-76  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4158  tRNA modification GTPase TrmE  38.95 
 
 		 454 aa  287  2e-76  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000196641  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4183  tRNA modification GTPase TrmE  38.95 
 
 		 454 aa  288  2e-76  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000380111  normal  0.0649437 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>