More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_2760 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_2760  tRNA modification GTPase TrmE  100 
 
 		 462 aa  902    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.4484  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3279  tRNA modification GTPase TrmE  49.78 
 
 		 458 aa  406  1.0000000000000001e-112  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.768989 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2030  tRNA modification GTPase TrmE  44.64 
 
 		 460 aa  395  1e-109  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.312338  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1430  tRNA modification GTPase TrmE  45.43 
 
 		 461 aa  396  1e-109  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.299442  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1201  hypothetical protein  45.42 
 
 		 455 aa  393  1e-108  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00128445 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2316  tRNA modification GTPase TrmE  44.81 
 
 		 456 aa  379  1e-104  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.64098  normal  0.135497 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2707  tRNA modification GTPase TrmE  41.63 
 
 		 466 aa  378  1e-103  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.622975  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1904  tRNA modification GTPase TrmE  42.61 
 
 		 472 aa  374  1e-102  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0089  tRNA modification GTPase TrmE  43.72 
 
 		 455 aa  368  1e-100  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0248  tRNA modification GTPase TrmE  44.87 
 
 		 473 aa  361  1e-98  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12578  putative tRNA modification GTPase  41.26 
 
 		 469 aa  360  2e-98  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0217  tRNA modification GTPase TrmE  43.83 
 
 		 476 aa  349  6e-95  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0500389  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2519  tRNA modification GTPase TrmE  44.89 
 
 		 462 aa  345  8.999999999999999e-94  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00190608 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2025  tRNA modification GTPase TrmE  43.66 
 
 		 473 aa  337  2.9999999999999997e-91  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.208875 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0153  tRNA modification GTPase TrmE  45.7 
 
 		 475 aa  336  5.999999999999999e-91  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2373  tRNA modification GTPase TrmE  44.44 
 
 		 473 aa  331  1e-89  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3429  tRNA modification GTPase TrmE  39.61 
 
 		 461 aa  328  1.0000000000000001e-88  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000224644  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0876  tRNA modification GTPase TrmE  43.79 
 
 		 518 aa  328  2.0000000000000001e-88  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.588217 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2779  tRNA modification GTPase TrmE  43.99 
 
 		 473 aa  327  4.0000000000000003e-88  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0100  tRNA modification GTPase TrmE  42.7 
 
 		 473 aa  325  9e-88  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.651435  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0003  tRNA modification GTPase TrmE  37.82 
 
 		 459 aa  324  2e-87  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000387737  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2409  tRNA modification GTPase TrmE  37.85 
 
 		 460 aa  324  2e-87  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.605137  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23560  tRNA modification GTPase TrmE  36.56 
 
 		 463 aa  324  2e-87  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.690968  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2365  tRNA modification GTPase TrmE  37.2 
 
 		 459 aa  322  9.000000000000001e-87  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4024  tRNA modification GTPase TrmE  38.79 
 
 		 458 aa  322  9.999999999999999e-87  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3142  tRNA modification GTPase TrmE  41.92 
 
 		 461 aa  318  1e-85  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.108144  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5181  tRNA modification GTPase TrmE  38.15 
 
 		 458 aa  316  5e-85  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0853003  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5671  tRNA modification GTPase TrmE  37.9 
 
 		 458 aa  316  5e-85  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5594  tRNA modification GTPase TrmE  38.15 
 
 		 458 aa  315  7e-85  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0320926 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5635  tRNA modification GTPase TrmE  37.9 
 
 		 458 aa  316  7e-85  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5337  tRNA modification GTPase TrmE  38.15 
 
 		 458 aa  315  7e-85  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5165  tRNA modification GTPase TrmE  38.15 
 
 		 458 aa  315  7e-85  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5734  tRNA modification GTPase TrmE  38.15 
 
 		 458 aa  315  7e-85  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3557  tRNA modification GTPase TrmE  41.54 
 
 		 462 aa  315  8e-85  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5324  tRNA modification GTPase TrmE  37.93 
 
 		 458 aa  315  9.999999999999999e-85  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0322996 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1940  tRNA modification GTPase TrmE  38.06 
 
 		 462 aa  313  2.9999999999999996e-84  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000114309  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2195  tRNA modification GTPase TrmE  41.52 
 
 		 475 aa  313  4.999999999999999e-84  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1989  tRNA modification GTPase TrmE  40.65 
 
 		 463 aa  313  5.999999999999999e-84  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.858955 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2547  tRNA modification GTPase TrmE  39.28 
 
 		 455 aa  312  7.999999999999999e-84  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5611  tRNA modification GTPase TrmE  37.72 
 
 		 458 aa  311  1e-83  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.292564  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2930  tRNA modification GTPase TrmE  37.07 
 
 		 458 aa  311  1e-83  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.137366  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1908  tRNA modification GTPase TrmE  39.87 
 
 		 464 aa  311  2e-83  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.991823  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2734  tRNA modification GTPase TrmE  36.97 
 
 		 459 aa  310  2.9999999999999997e-83  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2791  tRNA modification GTPase TrmE  36.97 
 
 		 459 aa  310  2.9999999999999997e-83  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5277  tRNA modification GTPase TrmE  38.03 
 
 		 458 aa  309  5e-83  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1895  tRNA modification GTPase TrmE  34.49 
 
 		 461 aa  308  1.0000000000000001e-82  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.51566e-21 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3324  tRNA modification GTPase TrmE  35.97 
 
 		 461 aa  308  2.0000000000000002e-82  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0657  tRNA modification GTPase TrmE  39.96 
 
 		 450 aa  307  2.0000000000000002e-82  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4365  tRNA modification GTPase TrmE  37.5 
 
 		 461 aa  307  2.0000000000000002e-82  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2669  tRNA modification GTPase TrmE  37.63 
 
 		 458 aa  306  6e-82  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4058  tRNA modification GTPase TrmE  39.57 
 
 		 455 aa  306  7e-82  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.239105  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2992  tRNA modification GTPase TrmE  37.63 
 
 		 458 aa  305  9.000000000000001e-82  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0977  tRNA modification GTPase TrmE  37.47 
 
 		 447 aa  305  1.0000000000000001e-81  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000239803  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4428  tRNA modification GTPase TrmE  39.35 
 
 		 455 aa  303  4.0000000000000003e-81  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4148  tRNA modification GTPase TrmE  39.78 
 
 		 455 aa  303  4.0000000000000003e-81  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0681  tRNA modification GTPase TrmE  39.96 
 
 		 450 aa  303  6.000000000000001e-81  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.570227  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5742  tRNA modification GTPase TrmE  42.83 
 
 		 456 aa  302  6.000000000000001e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.206283  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0876  tRNA modification GTPase TrmE  37.96 
 
 		 458 aa  302  1e-80  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000254143  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3941  tRNA modification GTPase TrmE  36.5 
 
 		 458 aa  301  1e-80  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5133  tRNA modification GTPase TrmE  42.17 
 
 		 456 aa  301  2e-80  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3641  tRNA modification GTPase TrmE  44.11 
 
 		 460 aa  301  2e-80  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0097  tRNA modification GTPase TrmE  37.04 
 
 		 455 aa  301  2e-80  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0070  tRNA modification GTPase TrmE  39.65 
 
 		 444 aa  300  3e-80  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.868206  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3465  tRNA modification GTPase TrmE  41.3 
 
 		 456 aa  300  3e-80  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5611  tRNA modification GTPase TrmE  42.61 
 
 		 456 aa  300  3e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3656  tRNA modification GTPase TrmE  41.74 
 
 		 460 aa  300  3e-80  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1336  tRNA modification GTPase TrmE  36.09 
 
 		 441 aa  298  1e-79  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2929  tRNA modification GTPase TrmE  39.43 
 
 		 446 aa  297  2e-79  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4203  tRNA modification GTPase TrmE  39.48 
 
 		 460 aa  297  2e-79  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0569  tRNA modification GTPase TrmE  38.01 
 
 		 458 aa  297  3e-79  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1582  tRNA modification GTPase TrmE  41.24 
 
 		 462 aa  297  3e-79  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2775  tRNA modification GTPase TrmE  42.31 
 
 		 452 aa  297  3e-79  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4164  tRNA modification GTPase TrmE  39.48 
 
 		 460 aa  297  3e-79  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4310  tRNA modification GTPase TrmE  40.35 
 
 		 460 aa  297  3e-79  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.671502  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5443  tRNA modification GTPase TrmE  42.58 
 
 		 456 aa  296  5e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04098  tRNA modification GTPase  40.6 
 
 		 462 aa  295  9e-79  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3073  tRNA modification GTPase TrmE  39.22 
 
 		 446 aa  295  1e-78  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73400  tRNA modification GTPase TrmE  42.09 
 
 		 455 aa  295  1e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000503354  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2124  tRNA modification GTPase TrmE  38.73 
 
 		 452 aa  294  2e-78  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3441  tRNA modification GTPase TrmE  40.31 
 
 		 454 aa  294  2e-78  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02641  tRNA modification GTPase TrmE  34.98 
 
 		 464 aa  295  2e-78  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0199  tRNA modification GTPase TrmE  38.73 
 
 		 473 aa  293  3e-78  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4774  tRNA modification GTPase TrmE  38.51 
 
 		 467 aa  294  3e-78  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.149576 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0992  tRNA modification GTPase TrmE  36.62 
 
 		 456 aa  293  3e-78  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00719085  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4619  tRNA modification GTPase TrmE  42.58 
 
 		 455 aa  293  4e-78  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0005  tRNA modification GTPase TrmE  42.14 
 
 		 456 aa  293  5e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.273487  hitchhiker  0.00022418 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5308  tRNA modification GTPase TrmE  42.14 
 
 		 456 aa  293  5e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.832252  normal  0.0803697 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3560  tRNA modification GTPase TrmE  40.52 
 
 		 457 aa  293  5e-78  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3486  tRNA modification GTPase TrmE  33.97 
 
 		 460 aa  293  5e-78  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2233  tRNA modification GTPase TrmE  42.52 
 
 		 461 aa  292  7e-78  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1409  tRNA modification GTPase TrmE  34.99 
 
 		 452 aa  292  1e-77  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5212  tRNA modification GTPase TrmE  41.7 
 
 		 456 aa  290  4e-77  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1556  tRNA modification GTPase TrmE  34.55 
 
 		 464 aa  290  5.0000000000000004e-77  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52440  tRNA modification GTPase TrmE  43.25 
 
 		 455 aa  290  5.0000000000000004e-77  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2572  GTPase  37.04 
 
 		 459 aa  289  6e-77  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.329632  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3086  tRNA modification GTPase TrmE  42.52 
 
 		 458 aa  289  7e-77  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.924716  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3317  tRNA modification GTPase TrmE  44.76 
 
 		 446 aa  287  2e-76  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0375  tRNA modification GTPase TrmE  35.95 
 
 		 459 aa  288  2e-76  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf755  tRNA modification GTPase TrmE  35.5 
 
 		 442 aa  287  2.9999999999999996e-76  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4013  tRNA modification GTPase TrmE  39.09 
 
 		 456 aa  285  8e-76  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.205295  normal  0.289015 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>