More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SAG0876 on replicon NC_004116
Organism: Streptococcus agalactiae 2603V/R



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004116  SAG0876  tRNA modification GTPase TrmE  100 
 
 		 458 aa  917    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000254143  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2547  tRNA modification GTPase TrmE  73.42 
 
 		 455 aa  686    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0992  tRNA modification GTPase TrmE  86.03 
 
 		 456 aa  808    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00719085  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1940  tRNA modification GTPase TrmE  63.97 
 
 		 462 aa  604  1.0000000000000001e-171  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000114309  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4024  tRNA modification GTPase TrmE  62.53 
 
 		 458 aa  590  1e-167  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0003  tRNA modification GTPase TrmE  60.65 
 
 		 459 aa  575  1.0000000000000001e-163  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000387737  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5277  tRNA modification GTPase TrmE  60.57 
 
 		 458 aa  577  1.0000000000000001e-163  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5181  tRNA modification GTPase TrmE  60.35 
 
 		 458 aa  574  1.0000000000000001e-163  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0853003  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5324  tRNA modification GTPase TrmE  61.22 
 
 		 458 aa  577  1.0000000000000001e-163  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0322996 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5611  tRNA modification GTPase TrmE  61.22 
 
 		 458 aa  575  1.0000000000000001e-163  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.292564  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5594  tRNA modification GTPase TrmE  60.35 
 
 		 458 aa  574  1.0000000000000001e-162  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0320926 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5635  tRNA modification GTPase TrmE  60.13 
 
 		 458 aa  572  1.0000000000000001e-162  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5337  tRNA modification GTPase TrmE  60.35 
 
 		 458 aa  574  1.0000000000000001e-162  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5165  tRNA modification GTPase TrmE  60.35 
 
 		 458 aa  574  1.0000000000000001e-162  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5734  tRNA modification GTPase TrmE  60.35 
 
 		 458 aa  574  1.0000000000000001e-162  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3429  tRNA modification GTPase TrmE  61.04 
 
 		 461 aa  572  1.0000000000000001e-162  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000224644  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5671  tRNA modification GTPase TrmE  60.35 
 
 		 458 aa  573  1.0000000000000001e-162  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3557  tRNA modification GTPase TrmE  60.61 
 
 		 462 aa  548  1e-155  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2734  tRNA modification GTPase TrmE  59.57 
 
 		 459 aa  546  1e-154  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2791  tRNA modification GTPase TrmE  59.57 
 
 		 459 aa  546  1e-154  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1895  tRNA modification GTPase TrmE  58.08 
 
 		 461 aa  532  1e-150  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.51566e-21 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2409  tRNA modification GTPase TrmE  50.43 
 
 		 460 aa  442  1e-123  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.605137  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2365  tRNA modification GTPase TrmE  47.7 
 
 		 459 aa  444  1e-123  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2992  tRNA modification GTPase TrmE  48.91 
 
 		 458 aa  432  1e-120  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2669  tRNA modification GTPase TrmE  48.91 
 
 		 458 aa  431  1e-119  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3324  tRNA modification GTPase TrmE  47.39 
 
 		 461 aa  429  1e-119  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4365  tRNA modification GTPase TrmE  47.39 
 
 		 461 aa  416  9.999999999999999e-116  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3486  tRNA modification GTPase TrmE  46.51 
 
 		 460 aa  418  9.999999999999999e-116  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2930  tRNA modification GTPase TrmE  44.76 
 
 		 458 aa  408  1e-113  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.137366  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23560  tRNA modification GTPase TrmE  44.01 
 
 		 463 aa  402  1e-111  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.690968  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4428  tRNA modification GTPase TrmE  44.03 
 
 		 455 aa  391  1e-107  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3465  tRNA modification GTPase TrmE  44.18 
 
 		 456 aa  388  1e-106  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4148  tRNA modification GTPase TrmE  45.13 
 
 		 455 aa  385  1e-106  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2945  tRNA modification GTPase TrmE  44.66 
 
 		 465 aa  386  1e-106  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0139032  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0097  tRNA modification GTPase TrmE  46.62 
 
 		 455 aa  383  1e-105  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3941  tRNA modification GTPase TrmE  45.1 
 
 		 458 aa  382  1e-105  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4058  tRNA modification GTPase TrmE  44.69 
 
 		 455 aa  380  1e-104  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.239105  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2233  tRNA modification GTPase TrmE  45.75 
 
 		 461 aa  379  1e-104  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3560  tRNA modification GTPase TrmE  43.39 
 
 		 457 aa  372  1e-102  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2519  tRNA modification GTPase TrmE  42.42 
 
 		 462 aa  369  1e-101  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00190608 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1733  tRNA modification GTPase TrmE  42.95 
 
 		 452 aa  370  1e-101  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000059641  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3441  tRNA modification GTPase TrmE  42.01 
 
 		 454 aa  361  1e-98  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2758  tRNA modification GTPase TrmE  44.01 
 
 		 455 aa  357  1.9999999999999998e-97  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.294935  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4133  tRNA modification GTPase TrmE  46.07 
 
 		 456 aa  356  5e-97  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3641  tRNA modification GTPase TrmE  41.3 
 
 		 460 aa  350  2e-95  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3142  tRNA modification GTPase TrmE  44.08 
 
 		 461 aa  349  5e-95  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.108144  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2572  GTPase  42.13 
 
 		 459 aa  348  9e-95  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.329632  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1989  tRNA modification GTPase TrmE  41.27 
 
 		 463 aa  341  1e-92  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.858955 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1908  tRNA modification GTPase TrmE  41.18 
 
 		 464 aa  339  5e-92  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.991823  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4957  tRNA modification GTPase TrmE  42.76 
 
 		 459 aa  339  5.9999999999999996e-92  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000028541  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4164  tRNA modification GTPase TrmE  39.91 
 
 		 460 aa  338  9e-92  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0569  tRNA modification GTPase TrmE  39.74 
 
 		 458 aa  336  5e-91  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4203  tRNA modification GTPase TrmE  39.69 
 
 		 460 aa  336  5.999999999999999e-91  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0657  tRNA modification GTPase TrmE  40.87 
 
 		 450 aa  335  1e-90  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3622  tRNA modification GTPase TrmE  42.16 
 
 		 456 aa  335  1e-90  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0089  tRNA modification GTPase TrmE  40.04 
 
 		 455 aa  333  4e-90  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1582  tRNA modification GTPase TrmE  39.87 
 
 		 462 aa  332  7.000000000000001e-90  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0681  tRNA modification GTPase TrmE  41.81 
 
 		 450 aa  331  2e-89  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.570227  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4774  tRNA modification GTPase TrmE  38.74 
 
 		 467 aa  331  2e-89  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.149576 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0643  tRNA modification GTPase TrmE  44.74 
 
 		 452 aa  327  3e-88  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.461676 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2137  tRNA modification GTPase TrmE  38.2 
 
 		 461 aa  325  1e-87  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.075642 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3656  tRNA modification GTPase TrmE  39.48 
 
 		 460 aa  324  2e-87  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0977  tRNA modification GTPase TrmE  39.29 
 
 		 447 aa  323  4e-87  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000239803  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2030  tRNA modification GTPase TrmE  38.11 
 
 		 460 aa  319  5e-86  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.312338  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0819  tRNA modification GTPase TrmE  38.55 
 
 		 452 aa  316  7e-85  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3161  tRNA modification GTPase TrmE  41.08 
 
 		 471 aa  315  9e-85  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.258894  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1430  tRNA modification GTPase TrmE  36.58 
 
 		 461 aa  314  1.9999999999999998e-84  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.299442  normal  1 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf755  tRNA modification GTPase TrmE  39.56 
 
 		 442 aa  314  1.9999999999999998e-84  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1201  hypothetical protein  37.8 
 
 		 455 aa  313  4.999999999999999e-84  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00128445 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2889  tRNA modification GTPase TrmE  41.06 
 
 		 464 aa  312  9e-84  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2316  tRNA modification GTPase TrmE  40.09 
 
 		 456 aa  311  2e-83  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.64098  normal  0.135497 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4729  tRNA modification GTPase TrmE  38.38 
 
 		 454 aa  310  2e-83  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.622363  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1556  tRNA modification GTPase TrmE  36.5 
 
 		 464 aa  309  5.9999999999999995e-83  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02641  tRNA modification GTPase TrmE  36.24 
 
 		 464 aa  309  6.999999999999999e-83  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12578  putative tRNA modification GTPase  36.31 
 
 		 469 aa  308  1.0000000000000001e-82  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2254  tRNA modification GTPase TrmE  40.13 
 
 		 436 aa  307  2.0000000000000002e-82  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.9716  normal  0.222751 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2707  tRNA modification GTPase TrmE  37.1 
 
 		 466 aa  306  7e-82  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.622975  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1904  tRNA modification GTPase TrmE  36.89 
 
 		 472 aa  305  1.0000000000000001e-81  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl014  tRNA modification GTPase TrmE  37.53 
 
 		 452 aa  304  3.0000000000000004e-81  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2599  tRNA modification GTPase TrmE  38.06 
 
 		 470 aa  303  3.0000000000000004e-81  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.652843  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3279  tRNA modification GTPase TrmE  36.38 
 
 		 458 aa  301  2e-80  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.768989 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2453  tRNA modification GTPase TrmE  38.43 
 
 		 450 aa  301  2e-80  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2392  tRNA modification GTPase TrmE  37.53 
 
 		 468 aa  301  2e-80  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0118764  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0876  tRNA modification GTPase TrmE  38.2 
 
 		 518 aa  300  4e-80  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.588217 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2136  tRNA modification GTPase TrmE  38.2 
 
 		 451 aa  298  2e-79  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1409  tRNA modification GTPase TrmE  38.96 
 
 		 452 aa  297  3e-79  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1336  tRNA modification GTPase TrmE  38.23 
 
 		 441 aa  296  5e-79  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0248  tRNA modification GTPase TrmE  36.04 
 
 		 473 aa  295  1e-78  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2373  tRNA modification GTPase TrmE  37.5 
 
 		 473 aa  295  2e-78  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02071  tRNA modification GTPase TrmE  36.61 
 
 		 460 aa  293  3e-78  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.214831  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02091  tRNA modification GTPase TrmE  36.83 
 
 		 460 aa  293  3e-78  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.146144  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0070  tRNA modification GTPase TrmE  36.56 
 
 		 444 aa  293  6e-78  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.868206  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5742  tRNA modification GTPase TrmE  38.03 
 
 		 456 aa  293  6e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.206283  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1734  tRNA modification GTPase TrmE  37.83 
 
 		 437 aa  291  1e-77  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2025  tRNA modification GTPase TrmE  38.09 
 
 		 473 aa  291  2e-77  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.208875 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52440  tRNA modification GTPase TrmE  38.91 
 
 		 455 aa  290  5.0000000000000004e-77  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0375  tRNA modification GTPase TrmE  37.69 
 
 		 459 aa  289  6e-77  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0886  tRNA modification GTPase TrmE  37.21 
 
 		 478 aa  287  2e-76  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00940326 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5133  tRNA modification GTPase TrmE  37.61 
 
 		 456 aa  286  5e-76  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_49818  predicted protein  36.6 
 
 		 525 aa  286  7e-76  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>