More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_12578 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_12578  putative tRNA modification GTPase  100 
 
 		 469 aa  938    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2707  tRNA modification GTPase TrmE  70.75 
 
 		 466 aa  646    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.622975  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1904  tRNA modification GTPase TrmE  57.51 
 
 		 472 aa  530  1e-149  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2030  tRNA modification GTPase TrmE  54.18 
 
 		 460 aa  505  9.999999999999999e-143  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.312338  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1430  tRNA modification GTPase TrmE  53 
 
 		 461 aa  474  1e-132  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.299442  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3279  tRNA modification GTPase TrmE  51.18 
 
 		 458 aa  460  9.999999999999999e-129  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.768989 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2316  tRNA modification GTPase TrmE  54.58 
 
 		 456 aa  461  9.999999999999999e-129  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.64098  normal  0.135497 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0089  tRNA modification GTPase TrmE  50.21 
 
 		 455 aa  442  1e-123  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1201  hypothetical protein  48.73 
 
 		 455 aa  435  1e-121  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00128445 
 
 
-
 
NC_002950  PG0876  tRNA modification GTPase TrmE  47.77 
 
 		 518 aa  416  9.999999999999999e-116  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.588217 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2992  tRNA modification GTPase TrmE  44.12 
 
 		 458 aa  366  1e-100  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2669  tRNA modification GTPase TrmE  44.12 
 
 		 458 aa  366  1e-100  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0248  tRNA modification GTPase TrmE  40 
 
 		 473 aa  348  1e-94  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4957  tRNA modification GTPase TrmE  39.02 
 
 		 459 aa  342  8e-93  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000028541  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0217  tRNA modification GTPase TrmE  39.23 
 
 		 476 aa  340  2.9999999999999998e-92  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0500389  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0100  tRNA modification GTPase TrmE  40.47 
 
 		 473 aa  340  2.9999999999999998e-92  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.651435  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2760  tRNA modification GTPase TrmE  41.26 
 
 		 462 aa  338  1.9999999999999998e-91  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.4484  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2025  tRNA modification GTPase TrmE  39.19 
 
 		 473 aa  337  1.9999999999999998e-91  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.208875 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0153  tRNA modification GTPase TrmE  41.15 
 
 		 475 aa  335  1e-90  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23560  tRNA modification GTPase TrmE  38.64 
 
 		 463 aa  332  7.000000000000001e-90  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.690968  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2373  tRNA modification GTPase TrmE  40.21 
 
 		 473 aa  331  2e-89  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3324  tRNA modification GTPase TrmE  38.2 
 
 		 461 aa  328  2.0000000000000001e-88  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2365  tRNA modification GTPase TrmE  38.77 
 
 		 459 aa  324  2e-87  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0992  tRNA modification GTPase TrmE  38.68 
 
 		 456 aa  323  5e-87  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00719085  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3429  tRNA modification GTPase TrmE  38.14 
 
 		 461 aa  320  3e-86  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000224644  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2519  tRNA modification GTPase TrmE  40.34 
 
 		 462 aa  319  5e-86  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00190608 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0657  tRNA modification GTPase TrmE  40.72 
 
 		 450 aa  319  6e-86  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4024  tRNA modification GTPase TrmE  37.74 
 
 		 458 aa  318  9e-86  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2779  tRNA modification GTPase TrmE  39.36 
 
 		 473 aa  318  1e-85  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0097  tRNA modification GTPase TrmE  38.89 
 
 		 455 aa  318  1e-85  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2409  tRNA modification GTPase TrmE  37.61 
 
 		 460 aa  317  2e-85  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.605137  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5277  tRNA modification GTPase TrmE  37.95 
 
 		 458 aa  316  5e-85  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2758  tRNA modification GTPase TrmE  39.61 
 
 		 455 aa  316  7e-85  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.294935  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5635  tRNA modification GTPase TrmE  37.53 
 
 		 458 aa  315  9.999999999999999e-85  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5671  tRNA modification GTPase TrmE  37.53 
 
 		 458 aa  315  9.999999999999999e-85  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0681  tRNA modification GTPase TrmE  40.94 
 
 		 450 aa  315  9.999999999999999e-85  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.570227  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5337  tRNA modification GTPase TrmE  37.31 
 
 		 458 aa  314  1.9999999999999998e-84  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5165  tRNA modification GTPase TrmE  37.31 
 
 		 458 aa  314  1.9999999999999998e-84  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5594  tRNA modification GTPase TrmE  37.31 
 
 		 458 aa  314  1.9999999999999998e-84  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0320926 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5734  tRNA modification GTPase TrmE  37.31 
 
 		 458 aa  314  1.9999999999999998e-84  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5181  tRNA modification GTPase TrmE  37.31 
 
 		 458 aa  313  2.9999999999999996e-84  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0853003  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5324  tRNA modification GTPase TrmE  37.1 
 
 		 458 aa  313  5.999999999999999e-84  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0322996 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1895  tRNA modification GTPase TrmE  37 
 
 		 461 aa  311  1e-83  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.51566e-21 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2547  tRNA modification GTPase TrmE  37.39 
 
 		 455 aa  311  2e-83  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3557  tRNA modification GTPase TrmE  39.07 
 
 		 462 aa  310  2e-83  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2930  tRNA modification GTPase TrmE  38 
 
 		 458 aa  310  2.9999999999999997e-83  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.137366  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4428  tRNA modification GTPase TrmE  37.63 
 
 		 455 aa  310  4e-83  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5611  tRNA modification GTPase TrmE  37.1 
 
 		 458 aa  310  4e-83  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.292564  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0876  tRNA modification GTPase TrmE  36.31 
 
 		 458 aa  308  1.0000000000000001e-82  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000254143  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4365  tRNA modification GTPase TrmE  38.35 
 
 		 461 aa  307  3e-82  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4148  tRNA modification GTPase TrmE  37.42 
 
 		 455 aa  306  4.0000000000000004e-82  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3441  tRNA modification GTPase TrmE  38.09 
 
 		 454 aa  306  5.0000000000000004e-82  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3465  tRNA modification GTPase TrmE  36.58 
 
 		 456 aa  303  4.0000000000000003e-81  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4058  tRNA modification GTPase TrmE  37 
 
 		 455 aa  302  8.000000000000001e-81  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.239105  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1989  tRNA modification GTPase TrmE  37.13 
 
 		 463 aa  301  1e-80  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.858955 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3941  tRNA modification GTPase TrmE  37.74 
 
 		 458 aa  301  1e-80  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3142  tRNA modification GTPase TrmE  37.23 
 
 		 461 aa  301  2e-80  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.108144  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1908  tRNA modification GTPase TrmE  37.71 
 
 		 464 aa  301  2e-80  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.991823  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3641  tRNA modification GTPase TrmE  36.08 
 
 		 460 aa  300  3e-80  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1940  tRNA modification GTPase TrmE  37.37 
 
 		 462 aa  300  5e-80  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000114309  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4133  tRNA modification GTPase TrmE  40.3 
 
 		 456 aa  299  7e-80  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0003  tRNA modification GTPase TrmE  35.81 
 
 		 459 aa  299  9e-80  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000387737  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0070  tRNA modification GTPase TrmE  36.81 
 
 		 444 aa  298  1e-79  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.868206  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3486  tRNA modification GTPase TrmE  36.71 
 
 		 460 aa  297  2e-79  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1260  tRNA modification GTPase TrmE  36.29 
 
 		 449 aa  295  1e-78  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0569  tRNA modification GTPase TrmE  36.17 
 
 		 458 aa  295  1e-78  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1733  tRNA modification GTPase TrmE  36.48 
 
 		 452 aa  295  2e-78  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000059641  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3560  tRNA modification GTPase TrmE  35.94 
 
 		 457 aa  293  4e-78  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2233  tRNA modification GTPase TrmE  38.74 
 
 		 461 aa  293  6e-78  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1556  tRNA modification GTPase TrmE  37.89 
 
 		 464 aa  291  2e-77  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4904  tRNA modification GTPase TrmE  35.86 
 
 		 478 aa  290  4e-77  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.586964 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2734  tRNA modification GTPase TrmE  35.82 
 
 		 459 aa  290  5.0000000000000004e-77  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2791  tRNA modification GTPase TrmE  35.82 
 
 		 459 aa  290  5.0000000000000004e-77  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02641  tRNA modification GTPase TrmE  37.68 
 
 		 464 aa  288  1e-76  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4774  tRNA modification GTPase TrmE  35.85 
 
 		 467 aa  288  2e-76  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.149576 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4164  tRNA modification GTPase TrmE  35.21 
 
 		 460 aa  286  5e-76  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4203  tRNA modification GTPase TrmE  35 
 
 		 460 aa  284  2.0000000000000002e-75  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2945  tRNA modification GTPase TrmE  36.03 
 
 		 465 aa  284  3.0000000000000004e-75  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0139032  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1582  tRNA modification GTPase TrmE  36.31 
 
 		 462 aa  283  3.0000000000000004e-75  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3622  tRNA modification GTPase TrmE  38.87 
 
 		 456 aa  283  4.0000000000000003e-75  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73400  tRNA modification GTPase TrmE  36.67 
 
 		 455 aa  283  5.000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000503354  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4729  tRNA modification GTPase TrmE  34.89 
 
 		 454 aa  281  1e-74  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.622363  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2410  tRNA modification GTPase TrmE  38.69 
 
 		 448 aa  281  2e-74  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.749558  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1783  tRNA modification GTPase TrmE  37.15 
 
 		 454 aa  281  2e-74  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.028326  normal  0.377376 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1734  tRNA modification GTPase TrmE  36.09 
 
 		 437 aa  280  6e-74  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0977  tRNA modification GTPase TrmE  37.69 
 
 		 447 aa  278  1e-73  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000239803  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4112  tRNA modification GTPase TrmE  35.88 
 
 		 478 aa  278  1e-73  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.712648  normal  0.105122 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0375  tRNA modification GTPase TrmE  40.13 
 
 		 459 aa  278  2e-73  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4241  tRNA modification GTPase TrmE  37.14 
 
 		 469 aa  278  2e-73  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.207719  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3774  tRNA modification GTPase TrmE  36.25 
 
 		 466 aa  277  3e-73  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0161001  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3984  tRNA modification GTPase TrmE  36.17 
 
 		 464 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3656  tRNA modification GTPase TrmE  36.81 
 
 		 460 aa  275  1.0000000000000001e-72  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4200  tRNA modification GTPase TrmE  37.31 
 
 		 448 aa  274  2.0000000000000002e-72  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0153583 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0884  tRNA modification GTPase TrmE  36.6 
 
 		 452 aa  275  2.0000000000000002e-72  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3097  tRNA modification GTPase TrmE  36.76 
 
 		 464 aa  275  2.0000000000000002e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.151562  normal  0.0117151 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0645  tRNA modification GTPase TrmE  35.31 
 
 		 449 aa  274  3e-72  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4089  tRNA modification GTPase TrmE  36.62 
 
 		 448 aa  274  3e-72  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02181  tRNA modification GTPase TrmE  37.21 
 
 		 461 aa  273  6e-72  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0001  tRNA modification GTPase TrmE  35.74 
 
 		 453 aa  273  7e-72  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.201746  hitchhiker  0.00000000323985 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2254  tRNA modification GTPase TrmE  34.39 
 
 		 436 aa  272  9e-72  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.9716  normal  0.222751 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>