More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_1733 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013171  Apre_1733  tRNA modification GTPase TrmE  100 
 
 
452 aa  899    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000059641  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3429  tRNA modification GTPase TrmE  45.47 
 
 
461 aa  420  1e-116  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000224644  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2669  tRNA modification GTPase TrmE  48.03 
 
 
458 aa  404  1e-111  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3557  tRNA modification GTPase TrmE  45.22 
 
 
462 aa  400  9.999999999999999e-111  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2992  tRNA modification GTPase TrmE  47.81 
 
 
458 aa  401  9.999999999999999e-111  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5277  tRNA modification GTPase TrmE  43.75 
 
 
458 aa  386  1e-106  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4024  tRNA modification GTPase TrmE  43.1 
 
 
458 aa  385  1e-106  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5635  tRNA modification GTPase TrmE  43.75 
 
 
458 aa  383  1e-105  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5337  tRNA modification GTPase TrmE  43.75 
 
 
458 aa  384  1e-105  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5165  tRNA modification GTPase TrmE  43.75 
 
 
458 aa  384  1e-105  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5181  tRNA modification GTPase TrmE  43.75 
 
 
458 aa  385  1e-105  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0853003  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5324  tRNA modification GTPase TrmE  43.32 
 
 
458 aa  383  1e-105  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0322996 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5594  tRNA modification GTPase TrmE  43.75 
 
 
458 aa  384  1e-105  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0320926 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5734  tRNA modification GTPase TrmE  43.75 
 
 
458 aa  384  1e-105  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5671  tRNA modification GTPase TrmE  43.75 
 
 
458 aa  383  1e-105  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2365  tRNA modification GTPase TrmE  44.57 
 
 
459 aa  380  1e-104  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2409  tRNA modification GTPase TrmE  47.05 
 
 
460 aa  380  1e-104  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.605137  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5611  tRNA modification GTPase TrmE  43.32 
 
 
458 aa  381  1e-104  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.292564  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0003  tRNA modification GTPase TrmE  41.92 
 
 
459 aa  377  1e-103  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000387737  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1940  tRNA modification GTPase TrmE  44.52 
 
 
462 aa  377  1e-103  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000114309  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0876  tRNA modification GTPase TrmE  42.95 
 
 
458 aa  370  1e-101  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000254143  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2930  tRNA modification GTPase TrmE  42.33 
 
 
458 aa  372  1e-101  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.137366  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2547  tRNA modification GTPase TrmE  43.39 
 
 
455 aa  370  1e-101  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0992  tRNA modification GTPase TrmE  43.05 
 
 
456 aa  370  1e-101  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00719085  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1895  tRNA modification GTPase TrmE  43.86 
 
 
461 aa  367  1e-100  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  1.51566e-21 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23560  tRNA modification GTPase TrmE  42.89 
 
 
463 aa  365  1e-99  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.690968  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3324  tRNA modification GTPase TrmE  41.81 
 
 
461 aa  363  3e-99  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3941  tRNA modification GTPase TrmE  43.56 
 
 
458 aa  362  8e-99  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2791  tRNA modification GTPase TrmE  41.59 
 
 
459 aa  361  1e-98  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2734  tRNA modification GTPase TrmE  41.59 
 
 
459 aa  361  1e-98  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4428  tRNA modification GTPase TrmE  41.89 
 
 
455 aa  356  3.9999999999999996e-97  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4365  tRNA modification GTPase TrmE  43.8 
 
 
461 aa  355  8.999999999999999e-97  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3486  tRNA modification GTPase TrmE  41.3 
 
 
460 aa  354  1e-96  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4148  tRNA modification GTPase TrmE  41.85 
 
 
455 aa  350  3e-95  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0097  tRNA modification GTPase TrmE  44.76 
 
 
455 aa  350  3e-95  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4058  tRNA modification GTPase TrmE  41.41 
 
 
455 aa  347  3e-94  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.239105  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2519  tRNA modification GTPase TrmE  38.63 
 
 
462 aa  344  2e-93  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00190608 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3465  tRNA modification GTPase TrmE  41 
 
 
456 aa  343  2.9999999999999997e-93  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1989  tRNA modification GTPase TrmE  39.43 
 
 
463 aa  343  2.9999999999999997e-93  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.858955 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3560  tRNA modification GTPase TrmE  41.58 
 
 
457 aa  338  9e-92  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2758  tRNA modification GTPase TrmE  43.53 
 
 
455 aa  337  1.9999999999999998e-91  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.294935  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2233  tRNA modification GTPase TrmE  39.35 
 
 
461 aa  332  1e-89  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4133  tRNA modification GTPase TrmE  46.61 
 
 
456 aa  329  7e-89  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1908  tRNA modification GTPase TrmE  38.34 
 
 
464 aa  326  5e-88  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.991823  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0657  tRNA modification GTPase TrmE  38.86 
 
 
450 aa  325  1e-87  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3441  tRNA modification GTPase TrmE  36.7 
 
 
454 aa  324  2e-87  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4164  tRNA modification GTPase TrmE  37.06 
 
 
460 aa  324  2e-87  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2945  tRNA modification GTPase TrmE  40 
 
 
465 aa  323  3e-87  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0139032  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4203  tRNA modification GTPase TrmE  37.06 
 
 
460 aa  323  4e-87  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2572  GTPase  39.12 
 
 
459 aa  322  9.999999999999999e-87  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.329632  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0569  tRNA modification GTPase TrmE  38.02 
 
 
458 aa  317  2e-85  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3142  tRNA modification GTPase TrmE  38.55 
 
 
461 aa  318  2e-85  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.108144  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4774  tRNA modification GTPase TrmE  36.88 
 
 
467 aa  317  2e-85  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.149576 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3622  tRNA modification GTPase TrmE  41.7 
 
 
456 aa  316  5e-85  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0681  tRNA modification GTPase TrmE  38.61 
 
 
450 aa  315  7e-85  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.570227  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3656  tRNA modification GTPase TrmE  36.52 
 
 
460 aa  312  9e-84  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0526  tRNA modification GTPase TrmE  39.61 
 
 
446 aa  312  9e-84  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2889  tRNA modification GTPase TrmE  36.94 
 
 
464 aa  307  3e-82  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1582  tRNA modification GTPase TrmE  36.82 
 
 
462 aa  306  5.0000000000000004e-82  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3161  tRNA modification GTPase TrmE  36.58 
 
 
471 aa  306  6e-82  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.258894  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4957  tRNA modification GTPase TrmE  35.73 
 
 
459 aa  304  2.0000000000000002e-81  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000028541  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0248  tRNA modification GTPase TrmE  36.93 
 
 
473 aa  303  5.000000000000001e-81  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4729  tRNA modification GTPase TrmE  37.17 
 
 
454 aa  301  2e-80  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.622363  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0977  tRNA modification GTPase TrmE  39.69 
 
 
447 aa  299  6e-80  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000239803  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2030  tRNA modification GTPase TrmE  36.42 
 
 
460 aa  296  4e-79  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.312338  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12578  putative tRNA modification GTPase  36.48 
 
 
469 aa  295  1e-78  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2137  tRNA modification GTPase TrmE  34.5 
 
 
461 aa  295  1e-78  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.075642 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1336  tRNA modification GTPase TrmE  38.75 
 
 
441 aa  294  2e-78  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2707  tRNA modification GTPase TrmE  36.4 
 
 
466 aa  294  2e-78  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.622975  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2254  tRNA modification GTPase TrmE  34.44 
 
 
436 aa  293  4e-78  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.9716  normal  0.222751 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2025  tRNA modification GTPase TrmE  36.44 
 
 
473 aa  291  2e-77  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.208875 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0217  tRNA modification GTPase TrmE  36.21 
 
 
476 aa  288  1e-76  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0500389  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0375  tRNA modification GTPase TrmE  38.05 
 
 
459 aa  288  1e-76  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1430  tRNA modification GTPase TrmE  35.01 
 
 
461 aa  287  2e-76  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.299442  normal 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl014  tRNA modification GTPase TrmE  37.28 
 
 
452 aa  286  4e-76  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2373  tRNA modification GTPase TrmE  36.05 
 
 
473 aa  284  2.0000000000000002e-75  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0643  tRNA modification GTPase TrmE  37.14 
 
 
452 aa  284  2.0000000000000002e-75  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.461676 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1409  tRNA modification GTPase TrmE  36.15 
 
 
452 aa  280  5e-74  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3641  tRNA modification GTPase TrmE  35.37 
 
 
460 aa  279  7e-74  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2779  tRNA modification GTPase TrmE  35.84 
 
 
473 aa  279  9e-74  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0819  tRNA modification GTPase TrmE  35.71 
 
 
452 aa  277  2e-73  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3279  tRNA modification GTPase TrmE  32.46 
 
 
458 aa  278  2e-73  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.768989 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1201  hypothetical protein  34.85 
 
 
455 aa  278  2e-73  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00128445 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0645  tRNA modification GTPase TrmE  37.04 
 
 
449 aa  276  6e-73  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0100  tRNA modification GTPase TrmE  33.33 
 
 
473 aa  275  1.0000000000000001e-72  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.651435  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1734  tRNA modification GTPase TrmE  32.81 
 
 
437 aa  275  1.0000000000000001e-72  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0089  tRNA modification GTPase TrmE  34.87 
 
 
455 aa  274  2.0000000000000002e-72  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0886  tRNA modification GTPase TrmE  32.64 
 
 
478 aa  274  3e-72  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00940326 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1904  tRNA modification GTPase TrmE  34.26 
 
 
472 aa  273  4.0000000000000004e-72  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0876  tRNA modification GTPase TrmE  35.04 
 
 
518 aa  273  7e-72  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.588217 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02091  tRNA modification GTPase TrmE  36.04 
 
 
460 aa  270  5e-71  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.146144  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02071  tRNA modification GTPase TrmE  35.82 
 
 
455 aa  270  5.9999999999999995e-71  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.828373  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2599  tRNA modification GTPase TrmE  34.47 
 
 
470 aa  269  1e-70  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.652843  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02071  tRNA modification GTPase TrmE  36.04 
 
 
460 aa  268  2e-70  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.214831  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0153  tRNA modification GTPase TrmE  36.21 
 
 
475 aa  268  2e-70  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2453  tRNA modification GTPase TrmE  33.18 
 
 
450 aa  266  8e-70  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3159  tRNA modification GTPase TrmE  32.89 
 
 
457 aa  264  2e-69  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0191  tRNA modification GTPase TrmE  36.26 
 
 
460 aa  262  6.999999999999999e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.377202  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0884  tRNA modification GTPase TrmE  34.91 
 
 
452 aa  263  6.999999999999999e-69  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02181  tRNA modification GTPase TrmE  33.55 
 
 
461 aa  261  2e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>