More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_0526 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007575  Suden_0526  tRNA modification GTPase TrmE  100 
 
 		 446 aa  893    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0979  tRNA modification GTPase TrmE  51.69 
 
 		 442 aa  438  9.999999999999999e-123  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.523955  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1036  tRNA modification GTPase TrmE  51.69 
 
 		 442 aa  437  1e-121  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.788526  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1833  tRNA modification GTPase TrmE  53.5 
 
 		 444 aa  430  1e-119  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0825  tRNA modification GTPase TrmE  51.24 
 
 		 442 aa  421  1e-116  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1625  tRNA modification GTPase TrmE  51.34 
 
 		 441 aa  421  1e-116  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.834042  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0548  tRNA modification GTPase TrmE  52.36 
 
 		 442 aa  407  1.0000000000000001e-112  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0654  tRNA modification GTPase TrmE  47.76 
 
 		 466 aa  407  1.0000000000000001e-112  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0555  tRNA modification GTPase TrmE  51.9 
 
 		 438 aa  404  1e-111  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2669  tRNA modification GTPase TrmE  40.56 
 
 		 458 aa  315  9.999999999999999e-85  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2992  tRNA modification GTPase TrmE  40.35 
 
 		 458 aa  312  5.999999999999999e-84  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1733  tRNA modification GTPase TrmE  39.61 
 
 		 452 aa  312  9e-84  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000059641  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0657  tRNA modification GTPase TrmE  41.3 
 
 		 450 aa  300  3e-80  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2365  tRNA modification GTPase TrmE  38.49 
 
 		 459 aa  297  2e-79  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3324  tRNA modification GTPase TrmE  38.54 
 
 		 461 aa  295  1e-78  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0681  tRNA modification GTPase TrmE  40.22 
 
 		 450 aa  291  2e-77  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.570227  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2195  tRNA modification GTPase TrmE  36.84 
 
 		 475 aa  291  2e-77  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1904  tRNA modification GTPase TrmE  38.03 
 
 		 472 aa  289  9e-77  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5635  tRNA modification GTPase TrmE  36.99 
 
 		 458 aa  288  1e-76  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5337  tRNA modification GTPase TrmE  36.99 
 
 		 458 aa  288  1e-76  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5165  tRNA modification GTPase TrmE  36.99 
 
 		 458 aa  288  1e-76  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5734  tRNA modification GTPase TrmE  36.99 
 
 		 458 aa  288  1e-76  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5594  tRNA modification GTPase TrmE  36.99 
 
 		 458 aa  288  1e-76  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0320926 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5181  tRNA modification GTPase TrmE  36.99 
 
 		 458 aa  288  2e-76  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0853003  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5671  tRNA modification GTPase TrmE  36.99 
 
 		 458 aa  288  2e-76  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1940  tRNA modification GTPase TrmE  36.15 
 
 		 462 aa  287  2.9999999999999996e-76  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000114309  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1989  tRNA modification GTPase TrmE  37.39 
 
 		 463 aa  286  5e-76  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.858955 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1336  tRNA modification GTPase TrmE  38.6 
 
 		 441 aa  285  8e-76  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5324  tRNA modification GTPase TrmE  36.36 
 
 		 458 aa  285  1.0000000000000001e-75  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0322996 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0645  tRNA modification GTPase TrmE  37.27 
 
 		 449 aa  284  2.0000000000000002e-75  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5277  tRNA modification GTPase TrmE  36.34 
 
 		 458 aa  285  2.0000000000000002e-75  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2409  tRNA modification GTPase TrmE  38.58 
 
 		 460 aa  284  2.0000000000000002e-75  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.605137  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2547  tRNA modification GTPase TrmE  41.19 
 
 		 455 aa  284  2.0000000000000002e-75  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0977  tRNA modification GTPase TrmE  38.88 
 
 		 447 aa  284  3.0000000000000004e-75  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000239803  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4484  tRNA modification GTPase TrmE  36.26 
 
 		 459 aa  283  4.0000000000000003e-75  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000179125 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4024  tRNA modification GTPase TrmE  37.04 
 
 		 458 aa  283  5.000000000000001e-75  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0248  tRNA modification GTPase TrmE  36.89 
 
 		 473 aa  283  5.000000000000001e-75  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1895  tRNA modification GTPase TrmE  37.12 
 
 		 461 aa  283  5.000000000000001e-75  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.51566e-21 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5611  tRNA modification GTPase TrmE  36.36 
 
 		 458 aa  283  6.000000000000001e-75  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.292564  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2930  tRNA modification GTPase TrmE  32.97 
 
 		 458 aa  282  8.000000000000001e-75  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.137366  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04098  tRNA modification GTPase  36.9 
 
 		 462 aa  282  9e-75  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3441  tRNA modification GTPase TrmE  35.23 
 
 		 454 aa  282  9e-75  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3429  tRNA modification GTPase TrmE  35.18 
 
 		 461 aa  281  1e-74  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000224644  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2519  tRNA modification GTPase TrmE  36.86 
 
 		 462 aa  281  2e-74  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00190608 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4013  tRNA modification GTPase TrmE  37.04 
 
 		 456 aa  279  6e-74  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.205295  normal  0.289015 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0569  tRNA modification GTPase TrmE  36.88 
 
 		 458 aa  279  6e-74  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0097  tRNA modification GTPase TrmE  37.5 
 
 		 455 aa  279  9e-74  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4133  tRNA modification GTPase TrmE  38.95 
 
 		 456 aa  279  9e-74  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1582  tRNA modification GTPase TrmE  39.14 
 
 		 462 aa  278  1e-73  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1908  tRNA modification GTPase TrmE  37.93 
 
 		 464 aa  278  1e-73  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.991823  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3557  tRNA modification GTPase TrmE  35.76 
 
 		 462 aa  277  3e-73  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3894  tRNA modification GTPase TrmE  36.4 
 
 		 456 aa  277  3e-73  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4089  tRNA modification GTPase TrmE  38.46 
 
 		 448 aa  276  4e-73  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2030  tRNA modification GTPase TrmE  36.95 
 
 		 460 aa  276  4e-73  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.312338  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4619  tRNA modification GTPase TrmE  36.34 
 
 		 455 aa  276  6e-73  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3612  tRNA modification GTPase TrmE  37.97 
 
 		 455 aa  275  9e-73  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0375  tRNA modification GTPase TrmE  41.42 
 
 		 459 aa  275  1.0000000000000001e-72  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0876  tRNA modification GTPase TrmE  38.02 
 
 		 458 aa  275  1.0000000000000001e-72  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000254143  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4148  tRNA modification GTPase TrmE  38.38 
 
 		 455 aa  275  1.0000000000000001e-72  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0003  tRNA modification GTPase TrmE  33.76 
 
 		 459 aa  275  2.0000000000000002e-72  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000387737  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4164  tRNA modification GTPase TrmE  38.12 
 
 		 460 aa  273  5.000000000000001e-72  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4203  tRNA modification GTPase TrmE  38.12 
 
 		 460 aa  273  5.000000000000001e-72  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2143  tRNA modification GTPase TrmE  37.85 
 
 		 478 aa  273  6e-72  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0104732  hitchhiker  0.000152188 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2734  tRNA modification GTPase TrmE  33.69 
 
 		 459 aa  272  7e-72  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2758  tRNA modification GTPase TrmE  37.82 
 
 		 455 aa  272  7e-72  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.294935  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2791  tRNA modification GTPase TrmE  33.69 
 
 		 459 aa  272  7e-72  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4428  tRNA modification GTPase TrmE  38.18 
 
 		 455 aa  272  9e-72  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0002  tRNA modification GTPase TrmE  35.87 
 
 		 455 aa  271  1e-71  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52440  tRNA modification GTPase TrmE  36.68 
 
 		 455 aa  272  1e-71  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1409  tRNA modification GTPase TrmE  35.5 
 
 		 452 aa  271  1e-71  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2472  tRNA modification GTPase TrmE  37.63 
 
 		 487 aa  272  1e-71  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000689916 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5133  tRNA modification GTPase TrmE  36.3 
 
 		 456 aa  271  2e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0217  tRNA modification GTPase TrmE  37.39 
 
 		 476 aa  271  2e-71  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0500389  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4148  tRNA modification GTPase TrmE  37.31 
 
 		 454 aa  271  2e-71  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.421634  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0100  tRNA modification GTPase TrmE  36.03 
 
 		 473 aa  271  2e-71  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.651435  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4774  tRNA modification GTPase TrmE  36.29 
 
 		 467 aa  271  2e-71  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.149576 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5742  tRNA modification GTPase TrmE  36.54 
 
 		 456 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.206283  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4058  tRNA modification GTPase TrmE  37.94 
 
 		 455 aa  270  2.9999999999999997e-71  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.239105  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5611  tRNA modification GTPase TrmE  35.75 
 
 		 456 aa  270  4e-71  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2387  tRNA modification GTPase TrmE  37.15 
 
 		 465 aa  270  5e-71  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.188748  hitchhiker  0.000106684 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4031  tRNA modification GTPase TrmE  37.63 
 
 		 453 aa  269  5.9999999999999995e-71  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.608873  hitchhiker  0.001302 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3939  tRNA modification GTPase TrmE  37.42 
 
 		 453 aa  269  8e-71  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000114268 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2572  GTPase  36.76 
 
 		 459 aa  269  8e-71  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.329632  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0992  tRNA modification GTPase TrmE  36.66 
 
 		 456 aa  269  8e-71  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00719085  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4365  tRNA modification GTPase TrmE  35.59 
 
 		 461 aa  268  1e-70  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00435  tRNA modification GTPase TrmE  35.79 
 
 		 453 aa  268  1e-70  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12578  putative tRNA modification GTPase  36.21 
 
 		 469 aa  268  1e-70  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0005  tRNA modification GTPase TrmE  36.72 
 
 		 453 aa  269  1e-70  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.135343  hitchhiker  0.00000014804 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23560  tRNA modification GTPase TrmE  35.04 
 
 		 463 aa  267  2e-70  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.690968  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4957  tRNA modification GTPase TrmE  37.08 
 
 		 459 aa  268  2e-70  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000028541  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3486  tRNA modification GTPase TrmE  37.28 
 
 		 460 aa  267  2.9999999999999995e-70  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002017  GTPase and tRNA-U34 5-formylation enzyme TrmE  36.01 
 
 		 453 aa  266  4e-70  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0189213  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1430  tRNA modification GTPase TrmE  35.36 
 
 		 461 aa  266  5e-70  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.299442  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0876  tRNA modification GTPase TrmE  36.38 
 
 		 518 aa  266  5.999999999999999e-70  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.588217 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0027  tRNA modification GTPase TrmE  36.48 
 
 		 454 aa  266  5.999999999999999e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.151422 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03590  tRNA modification GTPase  36.87 
 
 		 454 aa  266  7e-70  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03534  hypothetical protein  36.87 
 
 		 454 aa  266  7e-70  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.948294  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4200  tRNA modification GTPase TrmE  37.36 
 
 		 448 aa  266  7e-70  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0153583 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3920  tRNA modification GTPase TrmE  36.87 
 
 		 454 aa  266  7e-70  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.189642  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0132  tRNA modification GTPase TrmE  36.68 
 
 		 452 aa  266  7e-70  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.849325  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>