More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene JJD26997_0825 on replicon NC_009707
Organism: Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009707  JJD26997_0825  tRNA modification GTPase TrmE  100 
 
 		 442 aa  882    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1036  tRNA modification GTPase TrmE  97.29 
 
 		 442 aa  860    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.788526  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0979  tRNA modification GTPase TrmE  97.29 
 
 		 442 aa  860    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.523955  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0548  tRNA modification GTPase TrmE  66.29 
 
 		 442 aa  579  1e-164  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1625  tRNA modification GTPase TrmE  58.37 
 
 		 441 aa  488  1e-137  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.834042  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1833  tRNA modification GTPase TrmE  58.73 
 
 		 444 aa  478  1e-133  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0654  tRNA modification GTPase TrmE  54.72 
 
 		 466 aa  469  1.0000000000000001e-131  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0555  tRNA modification GTPase TrmE  54.67 
 
 		 438 aa  441  9.999999999999999e-123  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0526  tRNA modification GTPase TrmE  51.24 
 
 		 446 aa  433  1e-120  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2992  tRNA modification GTPase TrmE  36.62 
 
 		 458 aa  271  2e-71  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2669  tRNA modification GTPase TrmE  36.62 
 
 		 458 aa  271  2e-71  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4957  tRNA modification GTPase TrmE  35.67 
 
 		 459 aa  262  8.999999999999999e-69  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000028541  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2547  tRNA modification GTPase TrmE  38.63 
 
 		 455 aa  261  1e-68  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0977  tRNA modification GTPase TrmE  39.74 
 
 		 447 aa  261  2e-68  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000239803  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0992  tRNA modification GTPase TrmE  36.68 
 
 		 456 aa  260  3e-68  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00719085  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4200  tRNA modification GTPase TrmE  36.89 
 
 		 448 aa  259  5.0000000000000005e-68  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0153583 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0645  tRNA modification GTPase TrmE  38.08 
 
 		 449 aa  259  6e-68  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2945  tRNA modification GTPase TrmE  37.42 
 
 		 465 aa  259  7e-68  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0139032  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3894  tRNA modification GTPase TrmE  37.28 
 
 		 456 aa  258  2e-67  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2930  tRNA modification GTPase TrmE  35.51 
 
 		 458 aa  258  2e-67  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.137366  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2195  tRNA modification GTPase TrmE  35.48 
 
 		 475 aa  257  3e-67  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3324  tRNA modification GTPase TrmE  36 
 
 		 461 aa  257  3e-67  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3086  tRNA modification GTPase TrmE  36.06 
 
 		 458 aa  256  5e-67  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.924716  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2365  tRNA modification GTPase TrmE  35.76 
 
 		 459 aa  256  7e-67  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3429  tRNA modification GTPase TrmE  36.21 
 
 		 461 aa  256  8e-67  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000224644  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23560  tRNA modification GTPase TrmE  35.42 
 
 		 463 aa  256  8e-67  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.690968  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0876  tRNA modification GTPase TrmE  36.3 
 
 		 458 aa  255  9e-67  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000254143  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0657  tRNA modification GTPase TrmE  36.84 
 
 		 450 aa  255  9e-67  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3315  tRNA modification GTPase TrmE  35.1 
 
 		 458 aa  255  1.0000000000000001e-66  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2757  tRNA modification GTPase TrmE  36.02 
 
 		 446 aa  253  4.0000000000000004e-66  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5594  tRNA modification GTPase TrmE  36.8 
 
 		 458 aa  252  1e-65  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0320926 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5635  tRNA modification GTPase TrmE  37.01 
 
 		 458 aa  252  1e-65  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5337  tRNA modification GTPase TrmE  36.8 
 
 		 458 aa  252  1e-65  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5165  tRNA modification GTPase TrmE  36.8 
 
 		 458 aa  252  1e-65  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5181  tRNA modification GTPase TrmE  36.8 
 
 		 458 aa  251  1e-65  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0853003  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5734  tRNA modification GTPase TrmE  36.8 
 
 		 458 aa  252  1e-65  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1409  tRNA modification GTPase TrmE  34.7 
 
 		 452 aa  252  1e-65  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2124  tRNA modification GTPase TrmE  36.76 
 
 		 452 aa  251  1e-65  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4089  tRNA modification GTPase TrmE  37.5 
 
 		 448 aa  251  1e-65  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3073  tRNA modification GTPase TrmE  35.02 
 
 		 446 aa  251  2e-65  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0199  tRNA modification GTPase TrmE  36.76 
 
 		 473 aa  251  2e-65  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5671  tRNA modification GTPase TrmE  36.8 
 
 		 458 aa  251  2e-65  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1895  tRNA modification GTPase TrmE  35.51 
 
 		 461 aa  251  2e-65  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.51566e-21 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2409  tRNA modification GTPase TrmE  37.2 
 
 		 460 aa  250  3e-65  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.605137  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4024  tRNA modification GTPase TrmE  36.72 
 
 		 458 aa  250  4e-65  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4013  tRNA modification GTPase TrmE  36.84 
 
 		 456 aa  249  9e-65  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.205295  normal  0.289015 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2929  tRNA modification GTPase TrmE  35.63 
 
 		 446 aa  249  1e-64  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5324  tRNA modification GTPase TrmE  36.17 
 
 		 458 aa  249  1e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0322996 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1940  tRNA modification GTPase TrmE  35.28 
 
 		 462 aa  249  1e-64  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000114309  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0681  tRNA modification GTPase TrmE  36.82 
 
 		 450 aa  248  2e-64  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.570227  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04098  tRNA modification GTPase  35.87 
 
 		 462 aa  248  2e-64  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2472  tRNA modification GTPase TrmE  34.76 
 
 		 487 aa  246  4.9999999999999997e-64  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000689916 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5611  tRNA modification GTPase TrmE  36.17 
 
 		 458 aa  246  6.999999999999999e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.292564  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3441  tRNA modification GTPase TrmE  33.98 
 
 		 454 aa  245  9.999999999999999e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3038  tRNA modification GTPase TrmE  37.31 
 
 		 448 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.38062  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0248  tRNA modification GTPase TrmE  35.62 
 
 		 473 aa  244  1.9999999999999999e-63  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3152  tRNA modification GTPase TrmE  34.34 
 
 		 464 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000246642 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1904  tRNA modification GTPase TrmE  35.11 
 
 		 472 aa  244  1.9999999999999999e-63  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2758  tRNA modification GTPase TrmE  36.01 
 
 		 455 aa  244  3e-63  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.294935  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4292  tRNA modification GTPase TrmE  34.58 
 
 		 454 aa  243  3.9999999999999997e-63  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.10556  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3984  tRNA modification GTPase TrmE  33.12 
 
 		 464 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3213  tRNA modification GTPase TrmE  33.91 
 
 		 489 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5277  tRNA modification GTPase TrmE  35.87 
 
 		 458 aa  243  6e-63  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2824  tRNA modification GTPase TrmE  35.28 
 
 		 446 aa  243  6e-63  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6518  tRNA modification GTPase TrmE  34.13 
 
 		 464 aa  243  6e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1733  tRNA modification GTPase TrmE  37.91 
 
 		 452 aa  243  6e-63  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000059641  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1336  tRNA modification GTPase TrmE  36.05 
 
 		 441 aa  242  9e-63  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3465  tRNA modification GTPase TrmE  33.62 
 
 		 456 aa  241  1e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3097  tRNA modification GTPase TrmE  33.69 
 
 		 464 aa  241  1e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.151562  normal  0.0117151 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3179  tRNA modification GTPase TrmE  34.13 
 
 		 464 aa  242  1e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0373252  hitchhiker  0.000409063 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4615  tRNA modification GTPase TrmE  34.36 
 
 		 454 aa  242  1e-62  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.394021  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4041  tRNA modification GTPase TrmE  36.73 
 
 		 449 aa  241  2e-62  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.934487  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2547  tRNA modification GTPase TrmE  34.13 
 
 		 464 aa  241  2e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0461446  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3161  tRNA modification GTPase TrmE  34.13 
 
 		 464 aa  241  2e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.399046  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4619  tRNA modification GTPase TrmE  34.34 
 
 		 455 aa  241  2e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2143  tRNA modification GTPase TrmE  34.13 
 
 		 478 aa  240  2.9999999999999997e-62  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0104732  hitchhiker  0.000152188 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4484  tRNA modification GTPase TrmE  36.32 
 
 		 459 aa  241  2.9999999999999997e-62  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000179125 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4469  tRNA modification GTPase TrmE  33.48 
 
 		 464 aa  240  4e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0533201 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73400  tRNA modification GTPase TrmE  35.36 
 
 		 455 aa  240  4e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000503354  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5742  tRNA modification GTPase TrmE  34.79 
 
 		 456 aa  239  5e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.206283  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0005  tRNA modification GTPase TrmE  34.65 
 
 		 456 aa  239  5.999999999999999e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.273487  hitchhiker  0.00022418 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5308  tRNA modification GTPase TrmE  34.65 
 
 		 456 aa  239  5.999999999999999e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.832252  normal  0.0803697 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3612  tRNA modification GTPase TrmE  36.29 
 
 		 455 aa  239  8e-62  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3557  tRNA modification GTPase TrmE  36.64 
 
 		 462 aa  238  1e-61  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3279  tRNA modification GTPase TrmE  32.75 
 
 		 458 aa  239  1e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.768989 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4245  tRNA modification GTPase TrmE  34.8 
 
 		 454 aa  238  2e-61  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00411948  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4183  tRNA modification GTPase TrmE  34.8 
 
 		 454 aa  238  2e-61  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000380111  normal  0.0649437 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2775  tRNA modification GTPase TrmE  33.33 
 
 		 452 aa  238  2e-61  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4158  tRNA modification GTPase TrmE  34.8 
 
 		 454 aa  238  2e-61  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000196641  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4310  tRNA modification GTPase TrmE  36.34 
 
 		 460 aa  237  3e-61  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.671502  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5133  tRNA modification GTPase TrmE  34.93 
 
 		 456 aa  237  4e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1908  tRNA modification GTPase TrmE  33.4 
 
 		 464 aa  237  4e-61  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.991823  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0680  tRNA modification GTPase TrmE  34.38 
 
 		 438 aa  236  4e-61  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.00000000000180906  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3096  tRNA modification GTPase TrmE  32.76 
 
 		 466 aa  236  4e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000134747 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0003  tRNA modification GTPase TrmE  33.76 
 
 		 459 aa  236  6e-61  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000387737  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52440  tRNA modification GTPase TrmE  35.42 
 
 		 455 aa  236  7e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3560  tRNA modification GTPase TrmE  33.7 
 
 		 457 aa  236  7e-61  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03489  tRNA modification GTPase TrmE  35.73 
 
 		 446 aa  236  8e-61  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0132  tRNA modification GTPase TrmE  36.4 
 
 		 452 aa  236  8e-61  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.849325  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5611  tRNA modification GTPase TrmE  34.5 
 
 		 456 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>