More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_03489 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_03489  tRNA modification GTPase TrmE  100 
 
 		 446 aa  865    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4041  tRNA modification GTPase TrmE  76.75 
 
 		 449 aa  619  1e-176  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.934487  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2312  tRNA modification GTPase TrmE  67.06 
 
 		 451 aa  533  1e-150  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00480658  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2222  tRNA modification GTPase TrmE  67.06 
 
 		 451 aa  531  1e-150  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.0000000418588  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73400  tRNA modification GTPase TrmE  54.11 
 
 		 455 aa  414  1e-114  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000503354  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52440  tRNA modification GTPase TrmE  53.25 
 
 		 455 aa  409  1e-113  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4619  tRNA modification GTPase TrmE  51.73 
 
 		 455 aa  396  1e-109  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5611  tRNA modification GTPase TrmE  51.84 
 
 		 456 aa  392  1e-108  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6368  tRNA modification GTPase TrmE  53.69 
 
 		 455 aa  395  1e-108  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4484  tRNA modification GTPase TrmE  46.93 
 
 		 459 aa  393  1e-108  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000179125 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0002  tRNA modification GTPase TrmE  47.83 
 
 		 455 aa  394  1e-108  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5133  tRNA modification GTPase TrmE  51.62 
 
 		 456 aa  391  1e-107  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5742  tRNA modification GTPase TrmE  50.97 
 
 		 456 aa  385  1e-106  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.206283  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3894  tRNA modification GTPase TrmE  50.22 
 
 		 456 aa  385  1e-106  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2929  tRNA modification GTPase TrmE  47.9 
 
 		 446 aa  382  1e-105  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2387  tRNA modification GTPase TrmE  50.96 
 
 		 465 aa  382  1e-105  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.188748  hitchhiker  0.000106684 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0132  tRNA modification GTPase TrmE  48.12 
 
 		 452 aa  382  1e-105  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.849325  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0005  tRNA modification GTPase TrmE  50 
 
 		 456 aa  382  1e-104  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.273487  hitchhiker  0.00022418 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4292  tRNA modification GTPase TrmE  48.94 
 
 		 454 aa  379  1e-104  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.10556  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002017  GTPase and tRNA-U34 5-formylation enzyme TrmE  47.84 
 
 		 453 aa  380  1e-104  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0189213  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4148  tRNA modification GTPase TrmE  50.44 
 
 		 454 aa  379  1e-104  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.421634  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3073  tRNA modification GTPase TrmE  47.46 
 
 		 446 aa  380  1e-104  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2195  tRNA modification GTPase TrmE  49.23 
 
 		 475 aa  379  1e-104  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5443  tRNA modification GTPase TrmE  51.29 
 
 		 456 aa  379  1e-104  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5212  tRNA modification GTPase TrmE  51.4 
 
 		 456 aa  379  1e-104  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00435  tRNA modification GTPase TrmE  47.4 
 
 		 453 aa  380  1e-104  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2515  tRNA modification GTPase TrmE  48.16 
 
 		 464 aa  380  1e-104  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000310293  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5308  tRNA modification GTPase TrmE  50 
 
 		 456 aa  382  1e-104  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.832252  normal  0.0803697 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4263  tRNA modification GTPase TrmE  51.08 
 
 		 454 aa  377  1e-103  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.226045  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4928  tRNA modification GTPase TrmE  48.27 
 
 		 453 aa  375  1e-103  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0035842  hitchhiker  0.00000248868 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0027  tRNA modification GTPase TrmE  49.78 
 
 		 454 aa  375  1e-103  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.151422 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0001  tRNA modification GTPase TrmE  48.81 
 
 		 453 aa  377  1e-103  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.201746  hitchhiker  0.00000000323985 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3315  tRNA modification GTPase TrmE  50.22 
 
 		 458 aa  375  1e-103  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2472  tRNA modification GTPase TrmE  50.11 
 
 		 487 aa  375  1e-103  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000689916 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03590  tRNA modification GTPase  49.45 
 
 		 454 aa  373  1e-102  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4070  tRNA modification GTPase TrmE  49.23 
 
 		 467 aa  374  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.125734  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4127  tRNA modification GTPase TrmE  49.23 
 
 		 454 aa  373  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.357729  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5136  tRNA modification GTPase TrmE  49.23 
 
 		 454 aa  372  1e-102  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.041745  normal  0.0619684 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4615  tRNA modification GTPase TrmE  48.3 
 
 		 454 aa  374  1e-102  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.394021  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4234  tRNA modification GTPase TrmE  49.23 
 
 		 467 aa  374  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03534  hypothetical protein  49.45 
 
 		 454 aa  373  1e-102  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.948294  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3612  tRNA modification GTPase TrmE  47.93 
 
 		 455 aa  374  1e-102  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4055  tRNA modification GTPase TrmE  49.23 
 
 		 454 aa  373  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.765231  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4177  tRNA modification GTPase TrmE  49.23 
 
 		 467 aa  374  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.357651  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3920  tRNA modification GTPase TrmE  49.45 
 
 		 454 aa  373  1e-102  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.189642  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4260  tRNA modification GTPase TrmE  49.23 
 
 		 454 aa  372  1e-101  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4288  tRNA modification GTPase TrmE  49.23 
 
 		 454 aa  372  1e-101  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4073  tRNA modification GTPase TrmE  49.23 
 
 		 454 aa  371  1e-101  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.420944  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0003  tRNA modification GTPase TrmE  47.42 
 
 		 457 aa  370  1e-101  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4183  tRNA modification GTPase TrmE  49.13 
 
 		 454 aa  369  1e-101  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000380111  normal  0.0649437 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2124  tRNA modification GTPase TrmE  45.45 
 
 		 452 aa  369  1e-101  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4216  tRNA modification GTPase TrmE  49.23 
 
 		 454 aa  370  1e-101  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.021791  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2757  tRNA modification GTPase TrmE  47.98 
 
 		 446 aa  369  1e-101  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4245  tRNA modification GTPase TrmE  49.13 
 
 		 454 aa  370  1e-101  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00411948  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4219  tRNA modification GTPase TrmE  49.23 
 
 		 454 aa  372  1e-101  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.99545  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3939  tRNA modification GTPase TrmE  47.73 
 
 		 453 aa  370  1e-101  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000114268 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4031  tRNA modification GTPase TrmE  47.52 
 
 		 453 aa  369  1e-101  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.608873  hitchhiker  0.001302 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4158  tRNA modification GTPase TrmE  48.91 
 
 		 454 aa  369  1e-101  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000196641  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0005  tRNA modification GTPase TrmE  47.52 
 
 		 453 aa  368  1e-101  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.135343  hitchhiker  0.00000014804 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3865  tRNA modification GTPase TrmE  48.39 
 
 		 453 aa  368  1e-100  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000363316 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2143  tRNA modification GTPase TrmE  49.03 
 
 		 478 aa  366  1e-100  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0104732  hitchhiker  0.000152188 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_4001  tRNA modification GTPase TrmE  47.3 
 
 		 453 aa  367  1e-100  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.73411  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0199  tRNA modification GTPase TrmE  45.45 
 
 		 473 aa  368  1e-100  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3774  tRNA modification GTPase TrmE  48.16 
 
 		 466 aa  368  1e-100  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0161001  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4034  tRNA modification GTPase TrmE  49.24 
 
 		 453 aa  365  1e-100  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.461545  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4379  tRNA modification GTPase TrmE  47.42 
 
 		 479 aa  367  1e-100  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000434128  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4324  tRNA modification GTPase TrmE  47.52 
 
 		 453 aa  365  1e-100  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0616134  unclonable  0.00000000000430527 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4520  tRNA modification GTPase TrmE  47.3 
 
 		 453 aa  365  1e-99  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.30842  hitchhiker  0.000795549 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4310  tRNA modification GTPase TrmE  48.91 
 
 		 460 aa  364  1e-99  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.671502  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4378  tRNA modification GTPase TrmE  47.3 
 
 		 453 aa  364  1e-99  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0292979  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3317  tRNA modification GTPase TrmE  51.23 
 
 		 446 aa  364  2e-99  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3086  tRNA modification GTPase TrmE  49.67 
 
 		 458 aa  363  2e-99  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.924716  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4013  tRNA modification GTPase TrmE  46.84 
 
 		 456 aa  364  2e-99  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.205295  normal  0.289015 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4062  tRNA modification GTPase TrmE  47.61 
 
 		 453 aa  363  2e-99  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.112278  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0008  tRNA modification GTPase TrmE  47.62 
 
 		 453 aa  363  4e-99  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.185087  hitchhiker  0.000721309 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04098  tRNA modification GTPase  45.86 
 
 		 462 aa  363  4e-99  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3038  tRNA modification GTPase TrmE  50.79 
 
 		 448 aa  360  2e-98  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.38062  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0005  tRNA modification GTPase TrmE  50.54 
 
 		 481 aa  360  3e-98  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.75194  normal  0.209412 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2410  tRNA modification GTPase TrmE  49.57 
 
 		 448 aa  359  5e-98  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.749558  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4200  tRNA modification GTPase TrmE  48.12 
 
 		 448 aa  359  6e-98  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0153583 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2775  tRNA modification GTPase TrmE  45.59 
 
 		 452 aa  359  7e-98  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3755  tRNA modification GTPase TrmE  49.89 
 
 		 481 aa  357  1.9999999999999998e-97  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4256  tRNA modification GTPase TrmE  47.73 
 
 		 453 aa  357  1.9999999999999998e-97  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.257081  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3456  tRNA modification GTPase TrmE  49.67 
 
 		 481 aa  355  1e-96  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2824  tRNA modification GTPase TrmE  51.69 
 
 		 446 aa  353  2.9999999999999997e-96  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3984  tRNA modification GTPase TrmE  47.75 
 
 		 464 aa  352  5e-96  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2881  tRNA modification GTPase TrmE  51.66 
 
 		 444 aa  352  8e-96  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.470737  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3152  tRNA modification GTPase TrmE  47.25 
 
 		 464 aa  352  1e-95  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000246642 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2547  tRNA modification GTPase TrmE  46.57 
 
 		 464 aa  348  1e-94  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0461446  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3213  tRNA modification GTPase TrmE  47 
 
 		 489 aa  348  1e-94  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3179  tRNA modification GTPase TrmE  47.03 
 
 		 464 aa  348  1e-94  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0373252  hitchhiker  0.000409063 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3161  tRNA modification GTPase TrmE  46.57 
 
 		 464 aa  348  1e-94  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.399046  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6518  tRNA modification GTPase TrmE  46.57 
 
 		 464 aa  347  2e-94  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3097  tRNA modification GTPase TrmE  46.9 
 
 		 464 aa  345  7e-94  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.151562  normal  0.0117151 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4241  tRNA modification GTPase TrmE  47.75 
 
 		 469 aa  344  2e-93  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.207719  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4469  tRNA modification GTPase TrmE  47 
 
 		 464 aa  342  9e-93  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0533201 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4089  tRNA modification GTPase TrmE  49.34 
 
 		 448 aa  341  1e-92  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3495  tRNA modification GTPase TrmE  46.19 
 
 		 467 aa  342  1e-92  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4138  tRNA modification GTPase TrmE  46.07 
 
 		 486 aa  341  1e-92  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.619376  normal  0.415942 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3610  tRNA modification GTPase TrmE  44.89 
 
 		 475 aa  339  5e-92  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>