More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHAB381_0654 on replicon NC_009714
Organism: Campylobacter hominis ATCC BAA-381



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009714  CHAB381_0654  tRNA modification GTPase TrmE  100 
 
 		 466 aa  927    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1625  tRNA modification GTPase TrmE  58.15 
 
 		 441 aa  514  1e-144  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.834042  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1036  tRNA modification GTPase TrmE  54.51 
 
 		 442 aa  488  1e-137  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.788526  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1833  tRNA modification GTPase TrmE  56.49 
 
 		 444 aa  487  1e-136  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0979  tRNA modification GTPase TrmE  54.51 
 
 		 442 aa  488  1e-136  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.523955  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0548  tRNA modification GTPase TrmE  54.72 
 
 		 442 aa  478  1e-133  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0825  tRNA modification GTPase TrmE  54.72 
 
 		 442 aa  473  1e-132  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0555  tRNA modification GTPase TrmE  56.37 
 
 		 438 aa  466  9.999999999999999e-131  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0526  tRNA modification GTPase TrmE  47.76 
 
 		 446 aa  423  1e-117  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0657  tRNA modification GTPase TrmE  35.95 
 
 		 450 aa  267  4e-70  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2929  tRNA modification GTPase TrmE  35.81 
 
 		 446 aa  266  5e-70  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2669  tRNA modification GTPase TrmE  35.56 
 
 		 458 aa  266  5.999999999999999e-70  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2992  tRNA modification GTPase TrmE  35.56 
 
 		 458 aa  266  7e-70  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3073  tRNA modification GTPase TrmE  35.59 
 
 		 446 aa  265  2e-69  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73400  tRNA modification GTPase TrmE  35.15 
 
 		 455 aa  263  3e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000503354  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2547  tRNA modification GTPase TrmE  37.32 
 
 		 455 aa  261  2e-68  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0248  tRNA modification GTPase TrmE  34.16 
 
 		 473 aa  260  3e-68  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2758  tRNA modification GTPase TrmE  34.6 
 
 		 455 aa  260  4e-68  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.294935  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2195  tRNA modification GTPase TrmE  32.36 
 
 		 475 aa  259  7e-68  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4263  tRNA modification GTPase TrmE  34.1 
 
 		 454 aa  259  8e-68  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.226045  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4058  tRNA modification GTPase TrmE  35.01 
 
 		 455 aa  256  5e-67  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.239105  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0681  tRNA modification GTPase TrmE  36.16 
 
 		 450 aa  256  5e-67  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.570227  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2124  tRNA modification GTPase TrmE  35.56 
 
 		 452 aa  256  8e-67  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03590  tRNA modification GTPase  35 
 
 		 454 aa  255  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0199  tRNA modification GTPase TrmE  35.56 
 
 		 473 aa  255  1.0000000000000001e-66  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03534  hypothetical protein  35 
 
 		 454 aa  255  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.948294  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5136  tRNA modification GTPase TrmE  35.21 
 
 		 454 aa  255  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.041745  normal  0.0619684 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4073  tRNA modification GTPase TrmE  35 
 
 		 454 aa  255  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.420944  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3920  tRNA modification GTPase TrmE  35 
 
 		 454 aa  255  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.189642  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4260  tRNA modification GTPase TrmE  35 
 
 		 454 aa  254  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4219  tRNA modification GTPase TrmE  35 
 
 		 454 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.99545  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4288  tRNA modification GTPase TrmE  35 
 
 		 454 aa  254  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04098  tRNA modification GTPase  34.76 
 
 		 462 aa  253  4.0000000000000004e-66  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4070  tRNA modification GTPase TrmE  35 
 
 		 467 aa  253  4.0000000000000004e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.125734  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4234  tRNA modification GTPase TrmE  35 
 
 		 467 aa  253  4.0000000000000004e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4177  tRNA modification GTPase TrmE  35 
 
 		 467 aa  253  4.0000000000000004e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.357651  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4055  tRNA modification GTPase TrmE  35 
 
 		 454 aa  253  5.000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.765231  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4127  tRNA modification GTPase TrmE  35 
 
 		 454 aa  253  5.000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.357729  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0027  tRNA modification GTPase TrmE  33.89 
 
 		 454 aa  253  6e-66  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.151422 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4216  tRNA modification GTPase TrmE  34.79 
 
 		 454 aa  252  9.000000000000001e-66  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.021791  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4148  tRNA modification GTPase TrmE  35.34 
 
 		 455 aa  252  1e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4619  tRNA modification GTPase TrmE  33.54 
 
 		 455 aa  252  1e-65  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1409  tRNA modification GTPase TrmE  33.19 
 
 		 452 aa  251  2e-65  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4245  tRNA modification GTPase TrmE  33.68 
 
 		 454 aa  251  2e-65  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00411948  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4183  tRNA modification GTPase TrmE  33.68 
 
 		 454 aa  251  2e-65  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000380111  normal  0.0649437 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4158  tRNA modification GTPase TrmE  33.68 
 
 		 454 aa  251  2e-65  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000196641  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3984  tRNA modification GTPase TrmE  33.13 
 
 		 464 aa  251  2e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5133  tRNA modification GTPase TrmE  32.58 
 
 		 456 aa  250  3e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3894  tRNA modification GTPase TrmE  32.99 
 
 		 456 aa  250  3e-65  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4292  tRNA modification GTPase TrmE  33.61 
 
 		 454 aa  250  3e-65  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.10556  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5443  tRNA modification GTPase TrmE  33.68 
 
 		 456 aa  250  3e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4200  tRNA modification GTPase TrmE  33.76 
 
 		 448 aa  250  4e-65  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0153583 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5611  tRNA modification GTPase TrmE  33.26 
 
 		 456 aa  250  5e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3324  tRNA modification GTPase TrmE  34.58 
 
 		 461 aa  249  8e-65  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4034  tRNA modification GTPase TrmE  33.68 
 
 		 453 aa  249  9e-65  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.461545  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4013  tRNA modification GTPase TrmE  35.06 
 
 		 456 aa  249  9e-65  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.205295  normal  0.289015 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0569  tRNA modification GTPase TrmE  33.54 
 
 		 458 aa  249  9e-65  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0008  tRNA modification GTPase TrmE  35.33 
 
 		 453 aa  249  1e-64  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.185087  hitchhiker  0.000721309 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4957  tRNA modification GTPase TrmE  33.13 
 
 		 459 aa  248  1e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000028541  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0005  tRNA modification GTPase TrmE  33.47 
 
 		 456 aa  248  2e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.273487  hitchhiker  0.00022418 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5308  tRNA modification GTPase TrmE  33.47 
 
 		 456 aa  248  2e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.832252  normal  0.0803697 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5742  tRNA modification GTPase TrmE  33.95 
 
 		 456 aa  248  2e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.206283  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4148  tRNA modification GTPase TrmE  33.96 
 
 		 454 aa  248  2e-64  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.421634  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4615  tRNA modification GTPase TrmE  33.19 
 
 		 454 aa  248  2e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.394021  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0001  tRNA modification GTPase TrmE  35 
 
 		 453 aa  248  2e-64  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.201746  hitchhiker  0.00000000323985 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0992  tRNA modification GTPase TrmE  36.12 
 
 		 456 aa  248  2e-64  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00719085  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23560  tRNA modification GTPase TrmE  33.12 
 
 		 463 aa  247  3e-64  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.690968  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6368  tRNA modification GTPase TrmE  33.62 
 
 		 455 aa  247  3e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3086  tRNA modification GTPase TrmE  32.92 
 
 		 458 aa  247  3e-64  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.924716  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0132  tRNA modification GTPase TrmE  34.74 
 
 		 452 aa  247  4e-64  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.849325  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1940  tRNA modification GTPase TrmE  34.98 
 
 		 462 aa  246  4.9999999999999997e-64  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000114309  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52440  tRNA modification GTPase TrmE  33.26 
 
 		 455 aa  246  4.9999999999999997e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3429  tRNA modification GTPase TrmE  33.81 
 
 		 461 aa  246  6e-64  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000224644  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4164  tRNA modification GTPase TrmE  31.7 
 
 		 460 aa  245  9.999999999999999e-64  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2824  tRNA modification GTPase TrmE  35.11 
 
 		 446 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2945  tRNA modification GTPase TrmE  32.36 
 
 		 465 aa  244  1.9999999999999999e-63  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0139032  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5212  tRNA modification GTPase TrmE  32.71 
 
 		 456 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4031  tRNA modification GTPase TrmE  35 
 
 		 453 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.608873  hitchhiker  0.001302 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3038  tRNA modification GTPase TrmE  33.97 
 
 		 448 aa  244  3e-63  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.38062  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3865  tRNA modification GTPase TrmE  34.86 
 
 		 453 aa  244  3e-63  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000363316 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3142  tRNA modification GTPase TrmE  34.6 
 
 		 461 aa  244  3e-63  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.108144  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3096  tRNA modification GTPase TrmE  32.12 
 
 		 466 aa  244  3e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000134747 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4203  tRNA modification GTPase TrmE  31.7 
 
 		 460 aa  243  3.9999999999999997e-63  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1989  tRNA modification GTPase TrmE  31.9 
 
 		 463 aa  243  3.9999999999999997e-63  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.858955 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2757  tRNA modification GTPase TrmE  32.2 
 
 		 446 aa  243  3.9999999999999997e-63  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2409  tRNA modification GTPase TrmE  35.92 
 
 		 460 aa  243  3.9999999999999997e-63  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.605137  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0876  tRNA modification GTPase TrmE  34.59 
 
 		 458 aa  243  5e-63  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000254143  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1908  tRNA modification GTPase TrmE  32.92 
 
 		 464 aa  243  5e-63  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.991823  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2365  tRNA modification GTPase TrmE  35.33 
 
 		 459 aa  243  5e-63  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3315  tRNA modification GTPase TrmE  31.66 
 
 		 458 aa  243  6e-63  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0005  tRNA modification GTPase TrmE  34.79 
 
 		 453 aa  243  6e-63  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.135343  hitchhiker  0.00000014804 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0003  tRNA modification GTPase TrmE  33.75 
 
 		 459 aa  242  7.999999999999999e-63  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000387737  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4928  tRNA modification GTPase TrmE  35.21 
 
 		 453 aa  242  7.999999999999999e-63  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0035842  hitchhiker  0.00000248868 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1895  tRNA modification GTPase TrmE  33.82 
 
 		 461 aa  243  7.999999999999999e-63  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.51566e-21 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0003  tRNA modification GTPase TrmE  34.73 
 
 		 457 aa  241  1e-62  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3610  tRNA modification GTPase TrmE  33 
 
 		 475 aa  242  1e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3939  tRNA modification GTPase TrmE  34.79 
 
 		 453 aa  242  1e-62  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000114268 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3213  tRNA modification GTPase TrmE  32.31 
 
 		 489 aa  242  1e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3441  tRNA modification GTPase TrmE  32.03 
 
 		 454 aa  241  2e-62  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0680  tRNA modification GTPase TrmE  33.61 
 
 		 438 aa  241  2e-62  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.00000000000180906  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>