More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aaci_2945 on replicon NC_013205
Organism: Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013205  Aaci_2945  tRNA modification GTPase TrmE  100 
 
 		 465 aa  914    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0139032  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3429  tRNA modification GTPase TrmE  48.69 
 
 		 461 aa  416  9.999999999999999e-116  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000224644  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0003  tRNA modification GTPase TrmE  43.33 
 
 		 459 aa  404  1e-111  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000387737  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2409  tRNA modification GTPase TrmE  45.1 
 
 		 460 aa  402  1e-111  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.605137  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3557  tRNA modification GTPase TrmE  50.44 
 
 		 462 aa  404  1e-111  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5277  tRNA modification GTPase TrmE  45.73 
 
 		 458 aa  396  1e-109  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5611  tRNA modification GTPase TrmE  46.39 
 
 		 458 aa  395  1e-109  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.292564  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4024  tRNA modification GTPase TrmE  46.17 
 
 		 458 aa  397  1e-109  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0876  tRNA modification GTPase TrmE  44.66 
 
 		 458 aa  394  1e-108  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000254143  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2365  tRNA modification GTPase TrmE  42.7 
 
 		 459 aa  393  1e-108  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5324  tRNA modification GTPase TrmE  46.17 
 
 		 458 aa  393  1e-108  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0322996 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5635  tRNA modification GTPase TrmE  46.39 
 
 		 458 aa  391  1e-107  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5337  tRNA modification GTPase TrmE  46.39 
 
 		 458 aa  392  1e-107  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5165  tRNA modification GTPase TrmE  46.39 
 
 		 458 aa  392  1e-107  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5181  tRNA modification GTPase TrmE  46.39 
 
 		 458 aa  392  1e-107  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0853003  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2734  tRNA modification GTPase TrmE  43.94 
 
 		 459 aa  389  1e-107  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2791  tRNA modification GTPase TrmE  43.94 
 
 		 459 aa  389  1e-107  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5671  tRNA modification GTPase TrmE  46.39 
 
 		 458 aa  391  1e-107  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5734  tRNA modification GTPase TrmE  46.39 
 
 		 458 aa  392  1e-107  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5594  tRNA modification GTPase TrmE  46.39 
 
 		 458 aa  392  1e-107  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0320926 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0992  tRNA modification GTPase TrmE  45.32 
 
 		 456 aa  389  1e-107  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00719085  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3324  tRNA modification GTPase TrmE  42.48 
 
 		 461 aa  383  1e-105  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2992  tRNA modification GTPase TrmE  45.92 
 
 		 458 aa  382  1e-105  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2669  tRNA modification GTPase TrmE  45.92 
 
 		 458 aa  382  1e-105  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23560  tRNA modification GTPase TrmE  41.7 
 
 		 463 aa  379  1e-104  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.690968  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1940  tRNA modification GTPase TrmE  43.26 
 
 		 462 aa  374  1e-102  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000114309  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1895  tRNA modification GTPase TrmE  41.56 
 
 		 461 aa  369  1e-101  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.51566e-21 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2758  tRNA modification GTPase TrmE  41.58 
 
 		 455 aa  367  1e-100  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.294935  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4365  tRNA modification GTPase TrmE  41.39 
 
 		 461 aa  364  2e-99  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3486  tRNA modification GTPase TrmE  40.74 
 
 		 460 aa  363  2e-99  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3465  tRNA modification GTPase TrmE  47.28 
 
 		 456 aa  363  3e-99  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2930  tRNA modification GTPase TrmE  42.01 
 
 		 458 aa  363  3e-99  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.137366  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2547  tRNA modification GTPase TrmE  42.67 
 
 		 455 aa  356  5.999999999999999e-97  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4428  tRNA modification GTPase TrmE  43.36 
 
 		 455 aa  352  7e-96  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3441  tRNA modification GTPase TrmE  44.54 
 
 		 454 aa  352  8e-96  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4058  tRNA modification GTPase TrmE  43.54 
 
 		 455 aa  350  3e-95  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.239105  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4148  tRNA modification GTPase TrmE  43.67 
 
 		 455 aa  350  4e-95  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3560  tRNA modification GTPase TrmE  45.04 
 
 		 457 aa  348  2e-94  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0097  tRNA modification GTPase TrmE  43.29 
 
 		 455 aa  347  3e-94  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2233  tRNA modification GTPase TrmE  43.62 
 
 		 461 aa  339  5.9999999999999996e-92  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1733  tRNA modification GTPase TrmE  40 
 
 		 452 aa  334  2e-90  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000059641  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0569  tRNA modification GTPase TrmE  41.92 
 
 		 458 aa  333  3e-90  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4164  tRNA modification GTPase TrmE  42.17 
 
 		 460 aa  333  4e-90  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3941  tRNA modification GTPase TrmE  41.34 
 
 		 458 aa  332  6e-90  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4203  tRNA modification GTPase TrmE  42.17 
 
 		 460 aa  333  6e-90  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1989  tRNA modification GTPase TrmE  42.39 
 
 		 463 aa  332  1e-89  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.858955 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2137  tRNA modification GTPase TrmE  41.65 
 
 		 461 aa  331  2e-89  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.075642 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52440  tRNA modification GTPase TrmE  43.63 
 
 		 455 aa  330  5.0000000000000004e-89  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3656  tRNA modification GTPase TrmE  42.33 
 
 		 460 aa  328  9e-89  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3161  tRNA modification GTPase TrmE  45.73 
 
 		 471 aa  328  1.0000000000000001e-88  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.258894  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1409  tRNA modification GTPase TrmE  38.63 
 
 		 452 aa  328  2.0000000000000001e-88  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1582  tRNA modification GTPase TrmE  43.17 
 
 		 462 aa  327  3e-88  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0643  tRNA modification GTPase TrmE  46.65 
 
 		 452 aa  325  8.000000000000001e-88  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.461676 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1908  tRNA modification GTPase TrmE  41.7 
 
 		 464 aa  323  3e-87  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.991823  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2519  tRNA modification GTPase TrmE  43.41 
 
 		 462 aa  323  4e-87  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00190608 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4619  tRNA modification GTPase TrmE  41.43 
 
 		 455 aa  322  9.999999999999999e-87  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2889  tRNA modification GTPase TrmE  43.74 
 
 		 464 aa  322  9.999999999999999e-87  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4133  tRNA modification GTPase TrmE  42.24 
 
 		 456 aa  320  3.9999999999999996e-86  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5133  tRNA modification GTPase TrmE  41.34 
 
 		 456 aa  319  7.999999999999999e-86  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4957  tRNA modification GTPase TrmE  40.04 
 
 		 459 aa  318  1e-85  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000028541  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4774  tRNA modification GTPase TrmE  39.32 
 
 		 467 aa  318  2e-85  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.149576 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5742  tRNA modification GTPase TrmE  41.38 
 
 		 456 aa  317  3e-85  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.206283  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3142  tRNA modification GTPase TrmE  41.87 
 
 		 461 aa  317  3e-85  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.108144  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4013  tRNA modification GTPase TrmE  39.06 
 
 		 456 aa  317  4e-85  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.205295  normal  0.289015 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3641  tRNA modification GTPase TrmE  42.08 
 
 		 460 aa  317  4e-85  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0657  tRNA modification GTPase TrmE  40.83 
 
 		 450 aa  317  4e-85  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3315  tRNA modification GTPase TrmE  40.64 
 
 		 458 aa  316  6e-85  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5611  tRNA modification GTPase TrmE  40.99 
 
 		 456 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3622  tRNA modification GTPase TrmE  44.25 
 
 		 456 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73400  tRNA modification GTPase TrmE  41.43 
 
 		 455 aa  313  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000503354  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0977  tRNA modification GTPase TrmE  37.47 
 
 		 447 aa  313  4.999999999999999e-84  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000239803  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0005  tRNA modification GTPase TrmE  41.81 
 
 		 456 aa  312  7.999999999999999e-84  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.273487  hitchhiker  0.00022418 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5308  tRNA modification GTPase TrmE  41.81 
 
 		 456 aa  312  7.999999999999999e-84  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.832252  normal  0.0803697 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5443  tRNA modification GTPase TrmE  41.68 
 
 		 456 aa  311  2e-83  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2572  GTPase  40.3 
 
 		 459 aa  311  2e-83  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.329632  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1336  tRNA modification GTPase TrmE  36.44 
 
 		 441 aa  310  2.9999999999999997e-83  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2775  tRNA modification GTPase TrmE  39.4 
 
 		 452 aa  309  5.9999999999999995e-83  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0681  tRNA modification GTPase TrmE  40.83 
 
 		 450 aa  308  2.0000000000000002e-82  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.570227  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2195  tRNA modification GTPase TrmE  39.82 
 
 		 475 aa  306  4.0000000000000004e-82  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0645  tRNA modification GTPase TrmE  40.43 
 
 		 449 aa  306  7e-82  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1430  tRNA modification GTPase TrmE  37.58 
 
 		 461 aa  305  1.0000000000000001e-81  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.299442  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3894  tRNA modification GTPase TrmE  40.48 
 
 		 456 aa  305  1.0000000000000001e-81  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0027  tRNA modification GTPase TrmE  40.3 
 
 		 454 aa  304  2.0000000000000002e-81  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.151422 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4070  tRNA modification GTPase TrmE  40.13 
 
 		 467 aa  303  4.0000000000000003e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.125734  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4177  tRNA modification GTPase TrmE  40.13 
 
 		 467 aa  303  4.0000000000000003e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.357651  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4234  tRNA modification GTPase TrmE  40.13 
 
 		 467 aa  303  4.0000000000000003e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5212  tRNA modification GTPase TrmE  40.69 
 
 		 456 aa  302  8.000000000000001e-81  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4260  tRNA modification GTPase TrmE  40.21 
 
 		 454 aa  301  2e-80  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4055  tRNA modification GTPase TrmE  40 
 
 		 454 aa  301  2e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.765231  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4219  tRNA modification GTPase TrmE  40.21 
 
 		 454 aa  301  2e-80  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.99545  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4288  tRNA modification GTPase TrmE  40.21 
 
 		 454 aa  301  2e-80  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4127  tRNA modification GTPase TrmE  40 
 
 		 454 aa  301  2e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.357729  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4073  tRNA modification GTPase TrmE  40.21 
 
 		 454 aa  301  2e-80  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.420944  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04098  tRNA modification GTPase  39.09 
 
 		 462 aa  301  2e-80  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2254  tRNA modification GTPase TrmE  40 
 
 		 436 aa  301  2e-80  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.9716  normal  0.222751 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4200  tRNA modification GTPase TrmE  41.99 
 
 		 448 aa  300  3e-80  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0153583 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5136  tRNA modification GTPase TrmE  40 
 
 		 454 aa  300  4e-80  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.041745  normal  0.0619684 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0089  tRNA modification GTPase TrmE  38.03 
 
 		 455 aa  300  4e-80  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0070  tRNA modification GTPase TrmE  40.17 
 
 		 444 aa  300  5e-80  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.868206  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3279  tRNA modification GTPase TrmE  38.26 
 
 		 458 aa  300  5e-80  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.768989 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>