More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_0104 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_0104  tRNA modification GTPase TrmE  100 
 
 		 462 aa  914    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4058  tRNA modification GTPase TrmE  42.71 
 
 		 455 aa  313  3.9999999999999997e-84  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.239105  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4148  tRNA modification GTPase TrmE  42.07 
 
 		 455 aa  310  2.9999999999999997e-83  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2930  tRNA modification GTPase TrmE  37.34 
 
 		 458 aa  309  5.9999999999999995e-83  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.137366  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4365  tRNA modification GTPase TrmE  37.53 
 
 		 461 aa  306  7e-82  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2409  tRNA modification GTPase TrmE  37.15 
 
 		 460 aa  306  7e-82  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.605137  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2137  tRNA modification GTPase TrmE  40.22 
 
 		 461 aa  305  1.0000000000000001e-81  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.075642 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0569  tRNA modification GTPase TrmE  39.91 
 
 		 458 aa  304  2.0000000000000002e-81  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3941  tRNA modification GTPase TrmE  36.62 
 
 		 458 aa  303  3.0000000000000004e-81  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4203  tRNA modification GTPase TrmE  39.96 
 
 		 460 aa  301  1e-80  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4164  tRNA modification GTPase TrmE  39.96 
 
 		 460 aa  301  1e-80  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1989  tRNA modification GTPase TrmE  39.35 
 
 		 463 aa  302  1e-80  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.858955 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2519  tRNA modification GTPase TrmE  42.19 
 
 		 462 aa  300  3e-80  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00190608 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4428  tRNA modification GTPase TrmE  39.7 
 
 		 455 aa  300  3e-80  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0657  tRNA modification GTPase TrmE  36.09 
 
 		 450 aa  300  4e-80  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0992  tRNA modification GTPase TrmE  35.61 
 
 		 456 aa  300  4e-80  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00719085  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3324  tRNA modification GTPase TrmE  35.38 
 
 		 461 aa  298  9e-80  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0681  tRNA modification GTPase TrmE  36.64 
 
 		 450 aa  296  6e-79  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.570227  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23560  tRNA modification GTPase TrmE  35.33 
 
 		 463 aa  295  2e-78  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.690968  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1908  tRNA modification GTPase TrmE  38.84 
 
 		 464 aa  294  2e-78  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.991823  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2365  tRNA modification GTPase TrmE  34.47 
 
 		 459 aa  292  7e-78  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3486  tRNA modification GTPase TrmE  35.33 
 
 		 460 aa  290  4e-77  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2030  tRNA modification GTPase TrmE  37.17 
 
 		 460 aa  289  6e-77  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.312338  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3429  tRNA modification GTPase TrmE  37.92 
 
 		 461 aa  289  7e-77  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000224644  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1940  tRNA modification GTPase TrmE  35.17 
 
 		 462 aa  288  2e-76  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000114309  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3656  tRNA modification GTPase TrmE  40.13 
 
 		 460 aa  287  2.9999999999999996e-76  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2392  tRNA modification GTPase TrmE  42 
 
 		 468 aa  287  2.9999999999999996e-76  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0118764  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3641  tRNA modification GTPase TrmE  41.31 
 
 		 460 aa  285  8e-76  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0876  tRNA modification GTPase TrmE  35.53 
 
 		 458 aa  285  1.0000000000000001e-75  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000254143  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2758  tRNA modification GTPase TrmE  35.55 
 
 		 455 aa  285  2.0000000000000002e-75  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.294935  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4024  tRNA modification GTPase TrmE  35.81 
 
 		 458 aa  284  2.0000000000000002e-75  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0003  tRNA modification GTPase TrmE  35.44 
 
 		 459 aa  283  5.000000000000001e-75  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000387737  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0097  tRNA modification GTPase TrmE  34.27 
 
 		 455 aa  283  5.000000000000001e-75  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5324  tRNA modification GTPase TrmE  36.44 
 
 		 458 aa  282  8.000000000000001e-75  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0322996 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2547  tRNA modification GTPase TrmE  36.89 
 
 		 455 aa  282  1e-74  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3560  tRNA modification GTPase TrmE  39.66 
 
 		 457 aa  281  2e-74  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4729  tRNA modification GTPase TrmE  41.33 
 
 		 454 aa  281  2e-74  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.622363  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5611  tRNA modification GTPase TrmE  36.44 
 
 		 458 aa  281  2e-74  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.292564  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5277  tRNA modification GTPase TrmE  36.02 
 
 		 458 aa  280  5e-74  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1582  tRNA modification GTPase TrmE  40.38 
 
 		 462 aa  279  8e-74  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3142  tRNA modification GTPase TrmE  39.4 
 
 		 461 aa  279  9e-74  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.108144  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2233  tRNA modification GTPase TrmE  41.81 
 
 		 461 aa  278  1e-73  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0375  tRNA modification GTPase TrmE  33.19 
 
 		 459 aa  277  2e-73  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5635  tRNA modification GTPase TrmE  36.23 
 
 		 458 aa  278  2e-73  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5337  tRNA modification GTPase TrmE  36.44 
 
 		 458 aa  278  2e-73  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5165  tRNA modification GTPase TrmE  36.44 
 
 		 458 aa  278  2e-73  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5181  tRNA modification GTPase TrmE  36.44 
 
 		 458 aa  278  2e-73  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0853003  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5594  tRNA modification GTPase TrmE  36.44 
 
 		 458 aa  278  2e-73  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0320926 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5671  tRNA modification GTPase TrmE  36.44 
 
 		 458 aa  278  2e-73  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5734  tRNA modification GTPase TrmE  36.44 
 
 		 458 aa  278  2e-73  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2775  tRNA modification GTPase TrmE  38.84 
 
 		 452 aa  278  2e-73  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4774  tRNA modification GTPase TrmE  37.16 
 
 		 467 aa  277  3e-73  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.149576 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0977  tRNA modification GTPase TrmE  34.76 
 
 		 447 aa  275  9e-73  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000239803  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2599  tRNA modification GTPase TrmE  39.03 
 
 		 470 aa  275  1.0000000000000001e-72  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.652843  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2453  tRNA modification GTPase TrmE  39.91 
 
 		 450 aa  271  1e-71  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2734  tRNA modification GTPase TrmE  35.94 
 
 		 459 aa  271  2e-71  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2791  tRNA modification GTPase TrmE  35.94 
 
 		 459 aa  271  2e-71  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3159  tRNA modification GTPase TrmE  39.66 
 
 		 457 aa  271  2e-71  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3441  tRNA modification GTPase TrmE  38.17 
 
 		 454 aa  271  2e-71  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1336  tRNA modification GTPase TrmE  33.98 
 
 		 441 aa  271  2e-71  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02641  tRNA modification GTPase TrmE  33.62 
 
 		 464 aa  270  4e-71  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0089  tRNA modification GTPase TrmE  35.28 
 
 		 455 aa  269  8.999999999999999e-71  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1556  tRNA modification GTPase TrmE  33.19 
 
 		 464 aa  268  1e-70  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0886  tRNA modification GTPase TrmE  41.48 
 
 		 478 aa  268  1e-70  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00940326 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1409  tRNA modification GTPase TrmE  33.55 
 
 		 452 aa  268  1e-70  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0070  tRNA modification GTPase TrmE  36.19 
 
 		 444 aa  268  2e-70  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.868206  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3622  tRNA modification GTPase TrmE  41.54 
 
 		 456 aa  267  2e-70  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3465  tRNA modification GTPase TrmE  39.87 
 
 		 456 aa  267  2.9999999999999995e-70  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3161  tRNA modification GTPase TrmE  40.51 
 
 		 471 aa  266  5.999999999999999e-70  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.258894  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2889  tRNA modification GTPase TrmE  40 
 
 		 464 aa  265  1e-69  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3557  tRNA modification GTPase TrmE  38.4 
 
 		 462 aa  264  2e-69  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2669  tRNA modification GTPase TrmE  33.19 
 
 		 458 aa  264  3e-69  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1430  tRNA modification GTPase TrmE  34.33 
 
 		 461 aa  263  6e-69  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.299442  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2992  tRNA modification GTPase TrmE  33.19 
 
 		 458 aa  263  6e-69  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2025  tRNA modification GTPase TrmE  38.12 
 
 		 473 aa  262  6.999999999999999e-69  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.208875 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1733  tRNA modification GTPase TrmE  32.33 
 
 		 452 aa  261  2e-68  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000059641  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2136  tRNA modification GTPase TrmE  39.69 
 
 		 451 aa  260  4e-68  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02091  tRNA modification GTPase TrmE  30.18 
 
 		 460 aa  260  4e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.146144  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4133  tRNA modification GTPase TrmE  33.97 
 
 		 456 aa  259  7e-68  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3279  tRNA modification GTPase TrmE  35.93 
 
 		 458 aa  258  1e-67  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.768989 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3073  tRNA modification GTPase TrmE  36.38 
 
 		 446 aa  259  1e-67  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2760  tRNA modification GTPase TrmE  41.53 
 
 		 462 aa  258  2e-67  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.4484  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02181  tRNA modification GTPase TrmE  30.7 
 
 		 461 aa  257  3e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0153  tRNA modification GTPase TrmE  39.19 
 
 		 475 aa  257  3e-67  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2929  tRNA modification GTPase TrmE  36.6 
 
 		 446 aa  257  4e-67  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1895  tRNA modification GTPase TrmE  33.77 
 
 		 461 aa  256  7e-67  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.51566e-21 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02071  tRNA modification GTPase TrmE  30.18 
 
 		 460 aa  256  8e-67  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.214831  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4957  tRNA modification GTPase TrmE  36.97 
 
 		 459 aa  254  2.0000000000000002e-66  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000028541  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0117  tRNA modification GTPase TrmE  34.05 
 
 		 455 aa  254  2.0000000000000002e-66  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2316  tRNA modification GTPase TrmE  35.39 
 
 		 456 aa  254  3e-66  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.64098  normal  0.135497 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2707  tRNA modification GTPase TrmE  32.56 
 
 		 466 aa  254  3e-66  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.622975  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0248  tRNA modification GTPase TrmE  36.25 
 
 		 473 aa  254  3e-66  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1915  tRNA modification GTPase TrmE  40.86 
 
 		 457 aa  253  3e-66  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.410866  normal  0.314403 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02071  tRNA modification GTPase TrmE  34.9 
 
 		 455 aa  253  4.0000000000000004e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.828373  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1201  hypothetical protein  33.33 
 
 		 455 aa  253  6e-66  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00128445 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12578  putative tRNA modification GTPase  32.28 
 
 		 469 aa  252  8.000000000000001e-66  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6895  tRNA modification GTPase TrmE  37.22 
 
 		 474 aa  252  1e-65  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2254  tRNA modification GTPase TrmE  37.15 
 
 		 436 aa  252  1e-65  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.9716  normal  0.222751 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1904  tRNA modification GTPase TrmE  34.96 
 
 		 472 aa  251  2e-65  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1734  tRNA modification GTPase TrmE  36.7 
 
 		 437 aa  251  2e-65  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>