More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_1915 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_1915  tRNA modification GTPase TrmE  100 
 
 		 457 aa  906    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.410866  normal  0.314403 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0886  tRNA modification GTPase TrmE  66.32 
 
 		 478 aa  554  1e-156  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00940326 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2392  tRNA modification GTPase TrmE  61.7 
 
 		 468 aa  525  1e-147  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0118764  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3159  tRNA modification GTPase TrmE  55.19 
 
 		 457 aa  459  9.999999999999999e-129  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2137  tRNA modification GTPase TrmE  53.16 
 
 		 461 aa  455  1e-127  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.075642 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1965  tRNA modification GTPase TrmE  52.87 
 
 		 468 aa  420  1e-116  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2365  tRNA modification GTPase TrmE  38.15 
 
 		 459 aa  335  7e-91  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4058  tRNA modification GTPase TrmE  41.87 
 
 		 455 aa  329  8e-89  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.239105  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4148  tRNA modification GTPase TrmE  41.77 
 
 		 455 aa  325  1e-87  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4428  tRNA modification GTPase TrmE  39.22 
 
 		 455 aa  319  6e-86  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3560  tRNA modification GTPase TrmE  41.77 
 
 		 457 aa  317  2e-85  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3486  tRNA modification GTPase TrmE  37.58 
 
 		 460 aa  317  4e-85  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2930  tRNA modification GTPase TrmE  38.79 
 
 		 458 aa  316  6e-85  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.137366  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3465  tRNA modification GTPase TrmE  40.52 
 
 		 456 aa  314  1.9999999999999998e-84  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4957  tRNA modification GTPase TrmE  39.05 
 
 		 459 aa  314  2.9999999999999996e-84  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000028541  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2409  tRNA modification GTPase TrmE  38.13 
 
 		 460 aa  313  3.9999999999999997e-84  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.605137  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4365  tRNA modification GTPase TrmE  38.06 
 
 		 461 aa  311  1e-83  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3324  tRNA modification GTPase TrmE  38.41 
 
 		 461 aa  311  2e-83  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3641  tRNA modification GTPase TrmE  42.98 
 
 		 460 aa  310  2.9999999999999997e-83  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2992  tRNA modification GTPase TrmE  38.92 
 
 		 458 aa  308  2.0000000000000002e-82  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2669  tRNA modification GTPase TrmE  38.92 
 
 		 458 aa  307  3e-82  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23560  tRNA modification GTPase TrmE  36.3 
 
 		 463 aa  306  4.0000000000000004e-82  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.690968  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2519  tRNA modification GTPase TrmE  42.43 
 
 		 462 aa  298  1e-79  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00190608 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3429  tRNA modification GTPase TrmE  37.23 
 
 		 461 aa  297  3e-79  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000224644  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0097  tRNA modification GTPase TrmE  36.11 
 
 		 455 aa  296  4e-79  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3142  tRNA modification GTPase TrmE  41.21 
 
 		 461 aa  294  3e-78  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.108144  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2889  tRNA modification GTPase TrmE  42.62 
 
 		 464 aa  293  5e-78  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1989  tRNA modification GTPase TrmE  39.61 
 
 		 463 aa  291  1e-77  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.858955 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2758  tRNA modification GTPase TrmE  36.6 
 
 		 455 aa  291  2e-77  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.294935  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1908  tRNA modification GTPase TrmE  40.26 
 
 		 464 aa  290  4e-77  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.991823  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3441  tRNA modification GTPase TrmE  39.83 
 
 		 454 aa  287  2.9999999999999996e-76  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3557  tRNA modification GTPase TrmE  38.84 
 
 		 462 aa  285  1.0000000000000001e-75  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0569  tRNA modification GTPase TrmE  39.39 
 
 		 458 aa  285  2.0000000000000002e-75  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0876  tRNA modification GTPase TrmE  36.62 
 
 		 458 aa  284  2.0000000000000002e-75  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000254143  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4133  tRNA modification GTPase TrmE  37.18 
 
 		 456 aa  283  3.0000000000000004e-75  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4024  tRNA modification GTPase TrmE  36.09 
 
 		 458 aa  283  4.0000000000000003e-75  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0992  tRNA modification GTPase TrmE  35.24 
 
 		 456 aa  283  5.000000000000001e-75  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00719085  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4203  tRNA modification GTPase TrmE  39.35 
 
 		 460 aa  281  2e-74  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3315  tRNA modification GTPase TrmE  39.7 
 
 		 458 aa  281  2e-74  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5277  tRNA modification GTPase TrmE  35.29 
 
 		 458 aa  281  2e-74  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4164  tRNA modification GTPase TrmE  39.35 
 
 		 460 aa  280  3e-74  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2547  tRNA modification GTPase TrmE  36.4 
 
 		 455 aa  280  4e-74  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4619  tRNA modification GTPase TrmE  39.7 
 
 		 455 aa  279  6e-74  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5635  tRNA modification GTPase TrmE  35.43 
 
 		 458 aa  278  1e-73  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5671  tRNA modification GTPase TrmE  35.43 
 
 		 458 aa  278  1e-73  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5337  tRNA modification GTPase TrmE  35.43 
 
 		 458 aa  278  2e-73  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5165  tRNA modification GTPase TrmE  35.43 
 
 		 458 aa  278  2e-73  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5181  tRNA modification GTPase TrmE  35.43 
 
 		 458 aa  278  2e-73  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0853003  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5734  tRNA modification GTPase TrmE  35.43 
 
 		 458 aa  278  2e-73  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5594  tRNA modification GTPase TrmE  35.43 
 
 		 458 aa  278  2e-73  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0320926 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5611  tRNA modification GTPase TrmE  35.08 
 
 		 458 aa  278  2e-73  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.292564  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0977  tRNA modification GTPase TrmE  34.92 
 
 		 447 aa  277  3e-73  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000239803  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0657  tRNA modification GTPase TrmE  36.24 
 
 		 450 aa  276  5e-73  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1582  tRNA modification GTPase TrmE  40.47 
 
 		 462 aa  276  7e-73  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2572  GTPase  37.39 
 
 		 459 aa  275  9e-73  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.329632  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5324  tRNA modification GTPase TrmE  34.86 
 
 		 458 aa  275  2.0000000000000002e-72  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0322996 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2233  tRNA modification GTPase TrmE  43.23 
 
 		 461 aa  273  4.0000000000000004e-72  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3622  tRNA modification GTPase TrmE  41.52 
 
 		 456 aa  273  7e-72  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0248  tRNA modification GTPase TrmE  37.93 
 
 		 473 aa  271  2e-71  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3941  tRNA modification GTPase TrmE  36.54 
 
 		 458 aa  271  2e-71  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02641  tRNA modification GTPase TrmE  35.68 
 
 		 464 aa  271  2e-71  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0681  tRNA modification GTPase TrmE  36.8 
 
 		 450 aa  270  2.9999999999999997e-71  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.570227  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1556  tRNA modification GTPase TrmE  35.47 
 
 		 464 aa  269  7e-71  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1940  tRNA modification GTPase TrmE  34.99 
 
 		 462 aa  269  7e-71  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000114309  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4484  tRNA modification GTPase TrmE  37.09 
 
 		 459 aa  268  1e-70  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000179125 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2136  tRNA modification GTPase TrmE  41.61 
 
 		 451 aa  268  1e-70  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2030  tRNA modification GTPase TrmE  35.31 
 
 		 460 aa  268  1e-70  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.312338  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3161  tRNA modification GTPase TrmE  41.83 
 
 		 471 aa  268  2e-70  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.258894  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2945  tRNA modification GTPase TrmE  39.28 
 
 		 465 aa  267  2.9999999999999995e-70  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0139032  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4729  tRNA modification GTPase TrmE  36.88 
 
 		 454 aa  267  2.9999999999999995e-70  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.622363  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0003  tRNA modification GTPase TrmE  32.61 
 
 		 459 aa  266  4e-70  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000387737  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2791  tRNA modification GTPase TrmE  33.33 
 
 		 459 aa  266  4e-70  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2734  tRNA modification GTPase TrmE  33.33 
 
 		 459 aa  266  4e-70  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73400  tRNA modification GTPase TrmE  38.61 
 
 		 455 aa  265  8.999999999999999e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000503354  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5611  tRNA modification GTPase TrmE  38.31 
 
 		 456 aa  265  1e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0100  tRNA modification GTPase TrmE  38.25 
 
 		 473 aa  265  2e-69  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.651435  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4774  tRNA modification GTPase TrmE  37.23 
 
 		 467 aa  265  2e-69  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.149576 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2124  tRNA modification GTPase TrmE  36.15 
 
 		 452 aa  264  3e-69  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0070  tRNA modification GTPase TrmE  35.73 
 
 		 444 aa  263  4e-69  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.868206  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0104  tRNA modification GTPase TrmE  40.09 
 
 		 462 aa  263  4e-69  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0153  tRNA modification GTPase TrmE  38.3 
 
 		 475 aa  263  4e-69  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0199  tRNA modification GTPase TrmE  36.15 
 
 		 473 aa  263  4.999999999999999e-69  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1734  tRNA modification GTPase TrmE  39.18 
 
 		 437 aa  263  6.999999999999999e-69  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5133  tRNA modification GTPase TrmE  38.31 
 
 		 456 aa  262  8e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5742  tRNA modification GTPase TrmE  38.1 
 
 		 456 aa  261  2e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.206283  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0005  tRNA modification GTPase TrmE  38.36 
 
 		 456 aa  259  6e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.273487  hitchhiker  0.00022418 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0117  tRNA modification GTPase TrmE  35.51 
 
 		 455 aa  259  6e-68  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5308  tRNA modification GTPase TrmE  38.36 
 
 		 456 aa  259  6e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.832252  normal  0.0803697 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1733  tRNA modification GTPase TrmE  33.33 
 
 		 452 aa  259  6e-68  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000059641  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2025  tRNA modification GTPase TrmE  38.17 
 
 		 473 aa  259  7e-68  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.208875 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12578  putative tRNA modification GTPase  32.98 
 
 		 469 aa  259  7e-68  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2453  tRNA modification GTPase TrmE  42.28 
 
 		 450 aa  259  9e-68  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1895  tRNA modification GTPase TrmE  33.84 
 
 		 461 aa  258  1e-67  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.51566e-21 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4041  tRNA modification GTPase TrmE  39.34 
 
 		 449 aa  258  2e-67  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.934487  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2195  tRNA modification GTPase TrmE  35.45 
 
 		 475 aa  256  4e-67  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3894  tRNA modification GTPase TrmE  36.56 
 
 		 456 aa  256  7e-67  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52440  tRNA modification GTPase TrmE  38.18 
 
 		 455 aa  255  9e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3073  tRNA modification GTPase TrmE  35.81 
 
 		 446 aa  255  1.0000000000000001e-66  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3317  tRNA modification GTPase TrmE  40.48 
 
 		 446 aa  254  2.0000000000000002e-66  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5443  tRNA modification GTPase TrmE  38.15 
 
 		 456 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>