More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_0884 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_0884  tRNA modification GTPase TrmE  100 
 
 		 452 aa  902    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2930  tRNA modification GTPase TrmE  40.48 
 
 		 458 aa  323  3e-87  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.137366  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0645  tRNA modification GTPase TrmE  43.2 
 
 		 449 aa  304  2.0000000000000002e-81  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2373  tRNA modification GTPase TrmE  38.05 
 
 		 473 aa  301  1e-80  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3324  tRNA modification GTPase TrmE  37.61 
 
 		 461 aa  300  5e-80  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4428  tRNA modification GTPase TrmE  41.05 
 
 		 455 aa  299  7e-80  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3317  tRNA modification GTPase TrmE  42 
 
 		 446 aa  294  2e-78  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2124  tRNA modification GTPase TrmE  37.92 
 
 		 452 aa  293  3e-78  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4148  tRNA modification GTPase TrmE  39.12 
 
 		 455 aa  293  4e-78  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0248  tRNA modification GTPase TrmE  38.09 
 
 		 473 aa  293  5e-78  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0199  tRNA modification GTPase TrmE  37.92 
 
 		 473 aa  293  5e-78  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2030  tRNA modification GTPase TrmE  37.33 
 
 		 460 aa  292  8e-78  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.312338  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0005  tRNA modification GTPase TrmE  40.04 
 
 		 456 aa  291  1e-77  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.273487  hitchhiker  0.00022418 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5308  tRNA modification GTPase TrmE  40.04 
 
 		 456 aa  291  1e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.832252  normal  0.0803697 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0217  tRNA modification GTPase TrmE  38.48 
 
 		 476 aa  292  1e-77  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0500389  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3315  tRNA modification GTPase TrmE  39.96 
 
 		 458 aa  291  2e-77  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4058  tRNA modification GTPase TrmE  39.22 
 
 		 455 aa  290  3e-77  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.239105  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3441  tRNA modification GTPase TrmE  40.52 
 
 		 454 aa  290  4e-77  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2409  tRNA modification GTPase TrmE  37.47 
 
 		 460 aa  290  4e-77  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.605137  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2992  tRNA modification GTPase TrmE  38.91 
 
 		 458 aa  288  1e-76  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12578  putative tRNA modification GTPase  36.6 
 
 		 469 aa  288  1e-76  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4365  tRNA modification GTPase TrmE  35.65 
 
 		 461 aa  288  2e-76  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2669  tRNA modification GTPase TrmE  38.91 
 
 		 458 aa  288  2e-76  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5212  tRNA modification GTPase TrmE  39.87 
 
 		 456 aa  287  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4484  tRNA modification GTPase TrmE  37.77 
 
 		 459 aa  286  4e-76  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000179125 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3038  tRNA modification GTPase TrmE  39.82 
 
 		 448 aa  286  5e-76  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.38062  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5133  tRNA modification GTPase TrmE  39.07 
 
 		 456 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5443  tRNA modification GTPase TrmE  39.39 
 
 		 456 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5611  tRNA modification GTPase TrmE  38.63 
 
 		 456 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2365  tRNA modification GTPase TrmE  34.43 
 
 		 459 aa  284  2.0000000000000002e-75  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3465  tRNA modification GTPase TrmE  39.05 
 
 		 456 aa  283  4.0000000000000003e-75  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3086  tRNA modification GTPase TrmE  39.82 
 
 		 458 aa  283  4.0000000000000003e-75  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.924716  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0100  tRNA modification GTPase TrmE  37.55 
 
 		 473 aa  283  5.000000000000001e-75  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.651435  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3429  tRNA modification GTPase TrmE  37.17 
 
 		 461 aa  281  1e-74  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000224644  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0977  tRNA modification GTPase TrmE  37.31 
 
 		 447 aa  281  2e-74  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000239803  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0657  tRNA modification GTPase TrmE  37.97 
 
 		 450 aa  281  2e-74  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3894  tRNA modification GTPase TrmE  37.04 
 
 		 456 aa  281  2e-74  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2519  tRNA modification GTPase TrmE  40.6 
 
 		 462 aa  280  4e-74  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00190608 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1231  tRNA modification GTPase TrmE  41.01 
 
 		 469 aa  280  4e-74  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  unclonable  0.0000000119996  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2779  tRNA modification GTPase TrmE  37.39 
 
 		 473 aa  279  7e-74  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5742  tRNA modification GTPase TrmE  38.65 
 
 		 456 aa  278  1e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.206283  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4013  tRNA modification GTPase TrmE  36.76 
 
 		 456 aa  278  1e-73  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.205295  normal  0.289015 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2025  tRNA modification GTPase TrmE  37.31 
 
 		 473 aa  277  2e-73  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.208875 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1430  tRNA modification GTPase TrmE  36.03 
 
 		 461 aa  277  3e-73  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.299442  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1201  hypothetical protein  38.9 
 
 		 455 aa  277  3e-73  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00128445 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4024  tRNA modification GTPase TrmE  36.3 
 
 		 458 aa  276  5e-73  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4957  tRNA modification GTPase TrmE  37.66 
 
 		 459 aa  276  7e-73  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000028541  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3279  tRNA modification GTPase TrmE  38.73 
 
 		 458 aa  275  9e-73  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.768989 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23560  tRNA modification GTPase TrmE  35 
 
 		 463 aa  275  1.0000000000000001e-72  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.690968  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4615  tRNA modification GTPase TrmE  38.11 
 
 		 454 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.394021  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2195  tRNA modification GTPase TrmE  37.25 
 
 		 475 aa  274  2.0000000000000002e-72  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3486  tRNA modification GTPase TrmE  34.2 
 
 		 460 aa  274  2.0000000000000002e-72  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3560  tRNA modification GTPase TrmE  38.15 
 
 		 457 aa  273  3e-72  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0027  tRNA modification GTPase TrmE  37.77 
 
 		 454 aa  274  3e-72  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.151422 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73400  tRNA modification GTPase TrmE  38.07 
 
 		 455 aa  273  3e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000503354  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52440  tRNA modification GTPase TrmE  38.51 
 
 		 455 aa  273  5.000000000000001e-72  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0681  tRNA modification GTPase TrmE  37.97 
 
 		 450 aa  273  7e-72  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.570227  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2775  tRNA modification GTPase TrmE  37.96 
 
 		 452 aa  272  9e-72  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4729  tRNA modification GTPase TrmE  39.26 
 
 		 454 aa  272  9e-72  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.622363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4148  tRNA modification GTPase TrmE  37.75 
 
 		 454 aa  271  1e-71  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.421634  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3161  tRNA modification GTPase TrmE  40.3 
 
 		 471 aa  271  1e-71  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.258894  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5324  tRNA modification GTPase TrmE  36.23 
 
 		 458 aa  271  1e-71  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0322996 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5337  tRNA modification GTPase TrmE  36.23 
 
 		 458 aa  271  2e-71  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5165  tRNA modification GTPase TrmE  36.23 
 
 		 458 aa  271  2e-71  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5181  tRNA modification GTPase TrmE  36.23 
 
 		 458 aa  271  2e-71  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0853003  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4158  tRNA modification GTPase TrmE  37.53 
 
 		 454 aa  271  2e-71  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000196641  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5734  tRNA modification GTPase TrmE  36.23 
 
 		 458 aa  271  2e-71  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3939  tRNA modification GTPase TrmE  36.78 
 
 		 453 aa  271  2e-71  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000114268 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5594  tRNA modification GTPase TrmE  36.23 
 
 		 458 aa  271  2e-71  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0320926 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4245  tRNA modification GTPase TrmE  37.53 
 
 		 454 aa  270  2.9999999999999997e-71  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00411948  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4183  tRNA modification GTPase TrmE  37.53 
 
 		 454 aa  270  2.9999999999999997e-71  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000380111  normal  0.0649437 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5277  tRNA modification GTPase TrmE  36.03 
 
 		 458 aa  270  2.9999999999999997e-71  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4031  tRNA modification GTPase TrmE  36.56 
 
 		 453 aa  270  2.9999999999999997e-71  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.608873  hitchhiker  0.001302 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4292  tRNA modification GTPase TrmE  37.96 
 
 		 454 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.10556  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0008  tRNA modification GTPase TrmE  37.44 
 
 		 453 aa  270  4e-71  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.185087  hitchhiker  0.000721309 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0005  tRNA modification GTPase TrmE  36.56 
 
 		 453 aa  270  4e-71  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.135343  hitchhiker  0.00000014804 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3557  tRNA modification GTPase TrmE  37.83 
 
 		 462 aa  270  5e-71  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5136  tRNA modification GTPase TrmE  37.55 
 
 		 454 aa  270  5e-71  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.041745  normal  0.0619684 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4619  tRNA modification GTPase TrmE  37.86 
 
 		 455 aa  270  5e-71  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5635  tRNA modification GTPase TrmE  36.01 
 
 		 458 aa  269  5.9999999999999995e-71  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1733  tRNA modification GTPase TrmE  34.91 
 
 		 452 aa  269  5.9999999999999995e-71  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000059641  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5671  tRNA modification GTPase TrmE  36.01 
 
 		 458 aa  269  7e-71  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2945  tRNA modification GTPase TrmE  38.43 
 
 		 465 aa  269  8e-71  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0139032  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4378  tRNA modification GTPase TrmE  36.7 
 
 		 453 aa  269  8e-71  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0292979  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4520  tRNA modification GTPase TrmE  36.7 
 
 		 453 aa  269  8.999999999999999e-71  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.30842  hitchhiker  0.000795549 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4324  tRNA modification GTPase TrmE  36.7 
 
 		 453 aa  269  8.999999999999999e-71  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0616134  unclonable  0.00000000000430527 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4260  tRNA modification GTPase TrmE  37.34 
 
 		 454 aa  268  1e-70  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5611  tRNA modification GTPase TrmE  36.01 
 
 		 458 aa  269  1e-70  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.292564  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0680  tRNA modification GTPase TrmE  36.64 
 
 		 438 aa  268  1e-70  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.00000000000180906  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4288  tRNA modification GTPase TrmE  37.34 
 
 		 454 aa  268  1e-70  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4073  tRNA modification GTPase TrmE  37.34 
 
 		 454 aa  268  1e-70  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.420944  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0003  tRNA modification GTPase TrmE  37.12 
 
 		 457 aa  268  1e-70  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0001  tRNA modification GTPase TrmE  36.2 
 
 		 453 aa  268  1e-70  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.201746  hitchhiker  0.00000000323985 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2758  tRNA modification GTPase TrmE  36.18 
 
 		 455 aa  268  1e-70  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.294935  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1940  tRNA modification GTPase TrmE  36.6 
 
 		 462 aa  268  1e-70  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000114309  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4219  tRNA modification GTPase TrmE  37.34 
 
 		 454 aa  268  1e-70  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.99545  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0858  tRNA modification GTPase TrmE  37.44 
 
 		 442 aa  268  2e-70  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0526  tRNA modification GTPase TrmE  35.32 
 
 		 446 aa  268  2e-70  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4379  tRNA modification GTPase TrmE  36.48 
 
 		 479 aa  268  2e-70  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000434128  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4234  tRNA modification GTPase TrmE  37.47 
 
 		 467 aa  267  2e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>