More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_3756 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_3756  tRNA modification GTPase TrmE  100 
 
 		 468 aa  952    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.043106 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2195  tRNA modification GTPase TrmE  38.56 
 
 		 475 aa  310  2.9999999999999997e-83  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0002  tRNA modification GTPase TrmE  38.76 
 
 		 455 aa  307  2.0000000000000002e-82  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0657  tRNA modification GTPase TrmE  38.18 
 
 		 450 aa  300  4e-80  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4263  tRNA modification GTPase TrmE  38.88 
 
 		 454 aa  299  8e-80  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.226045  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0027  tRNA modification GTPase TrmE  39.22 
 
 		 454 aa  297  3e-79  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.151422 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00435  tRNA modification GTPase TrmE  38.06 
 
 		 453 aa  296  4e-79  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4148  tRNA modification GTPase TrmE  38.56 
 
 		 454 aa  296  6e-79  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.421634  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4158  tRNA modification GTPase TrmE  38.58 
 
 		 454 aa  295  2e-78  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000196641  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4013  tRNA modification GTPase TrmE  38.49 
 
 		 456 aa  295  2e-78  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.205295  normal  0.289015 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04098  tRNA modification GTPase  37.12 
 
 		 462 aa  294  3e-78  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4245  tRNA modification GTPase TrmE  38.58 
 
 		 454 aa  293  3e-78  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00411948  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4484  tRNA modification GTPase TrmE  38 
 
 		 459 aa  293  3e-78  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000179125 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4292  tRNA modification GTPase TrmE  38.25 
 
 		 454 aa  294  3e-78  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.10556  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4183  tRNA modification GTPase TrmE  38.58 
 
 		 454 aa  293  5e-78  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000380111  normal  0.0649437 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2515  tRNA modification GTPase TrmE  37.66 
 
 		 464 aa  293  5e-78  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000310293  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4034  tRNA modification GTPase TrmE  38.46 
 
 		 453 aa  293  6e-78  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.461545  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03590  tRNA modification GTPase  39.16 
 
 		 454 aa  292  8e-78  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3920  tRNA modification GTPase TrmE  39.16 
 
 		 454 aa  292  8e-78  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.189642  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03534  hypothetical protein  39.16 
 
 		 454 aa  292  8e-78  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.948294  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4615  tRNA modification GTPase TrmE  38.03 
 
 		 454 aa  291  1e-77  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.394021  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002017  GTPase and tRNA-U34 5-formylation enzyme TrmE  37.28 
 
 		 453 aa  292  1e-77  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0189213  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4260  tRNA modification GTPase TrmE  38.95 
 
 		 454 aa  291  2e-77  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2930  tRNA modification GTPase TrmE  34.99 
 
 		 458 aa  291  2e-77  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.137366  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4288  tRNA modification GTPase TrmE  38.95 
 
 		 454 aa  291  2e-77  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2929  tRNA modification GTPase TrmE  36.89 
 
 		 446 aa  291  2e-77  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4219  tRNA modification GTPase TrmE  38.95 
 
 		 454 aa  291  2e-77  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.99545  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4073  tRNA modification GTPase TrmE  38.95 
 
 		 454 aa  291  2e-77  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.420944  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5136  tRNA modification GTPase TrmE  38.95 
 
 		 454 aa  291  2e-77  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.041745  normal  0.0619684 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3152  tRNA modification GTPase TrmE  37.71 
 
 		 464 aa  291  2e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000246642 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3073  tRNA modification GTPase TrmE  36.93 
 
 		 446 aa  290  3e-77  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0681  tRNA modification GTPase TrmE  37.96 
 
 		 450 aa  290  3e-77  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.570227  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4216  tRNA modification GTPase TrmE  38.95 
 
 		 454 aa  289  6e-77  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.021791  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2547  tRNA modification GTPase TrmE  37.08 
 
 		 464 aa  289  6e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0461446  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3161  tRNA modification GTPase TrmE  37.08 
 
 		 464 aa  289  6e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.399046  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4177  tRNA modification GTPase TrmE  38.96 
 
 		 467 aa  289  8e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.357651  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4234  tRNA modification GTPase TrmE  38.96 
 
 		 467 aa  289  8e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4070  tRNA modification GTPase TrmE  38.96 
 
 		 467 aa  289  8e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.125734  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4619  tRNA modification GTPase TrmE  39.02 
 
 		 455 aa  289  8e-77  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3179  tRNA modification GTPase TrmE  37.08 
 
 		 464 aa  288  1e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0373252  hitchhiker  0.000409063 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4127  tRNA modification GTPase TrmE  38.74 
 
 		 454 aa  288  2e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.357729  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4055  tRNA modification GTPase TrmE  38.74 
 
 		 454 aa  288  2e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.765231  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3486  tRNA modification GTPase TrmE  35.12 
 
 		 460 aa  287  2e-76  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2410  tRNA modification GTPase TrmE  38.48 
 
 		 448 aa  287  2.9999999999999996e-76  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.749558  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3317  tRNA modification GTPase TrmE  40.65 
 
 		 446 aa  286  4e-76  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2409  tRNA modification GTPase TrmE  34.2 
 
 		 460 aa  286  4e-76  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.605137  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6518  tRNA modification GTPase TrmE  36.67 
 
 		 464 aa  285  2.0000000000000002e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4200  tRNA modification GTPase TrmE  37.98 
 
 		 448 aa  283  4.0000000000000003e-75  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0153583 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0645  tRNA modification GTPase TrmE  39.42 
 
 		 449 aa  283  4.0000000000000003e-75  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6055  tRNA modification GTPase TrmE  38.37 
 
 		 473 aa  283  5.000000000000001e-75  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3086  tRNA modification GTPase TrmE  37.53 
 
 		 458 aa  283  7.000000000000001e-75  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.924716  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4729  tRNA modification GTPase TrmE  36.58 
 
 		 454 aa  282  7.000000000000001e-75  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.622363  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0132  tRNA modification GTPase TrmE  36.91 
 
 		 452 aa  282  7.000000000000001e-75  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.849325  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3213  tRNA modification GTPase TrmE  36.23 
 
 		 489 aa  282  8.000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3097  tRNA modification GTPase TrmE  36.23 
 
 		 464 aa  282  1e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.151562  normal  0.0117151 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4089  tRNA modification GTPase TrmE  38.91 
 
 		 448 aa  281  1e-74  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3315  tRNA modification GTPase TrmE  37.63 
 
 		 458 aa  281  1e-74  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2758  tRNA modification GTPase TrmE  33.62 
 
 		 455 aa  281  2e-74  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.294935  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52440  tRNA modification GTPase TrmE  38.36 
 
 		 455 aa  281  2e-74  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3865  tRNA modification GTPase TrmE  36.67 
 
 		 453 aa  280  3e-74  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000363316 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3096  tRNA modification GTPase TrmE  37.15 
 
 		 466 aa  280  4e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000134747 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4791  tRNA modification GTPase TrmE  36.53 
 
 		 482 aa  280  4e-74  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2084  tRNA modification GTPase TrmE  38.33 
 
 		 457 aa  278  2e-73  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.103263  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3495  tRNA modification GTPase TrmE  37.47 
 
 		 467 aa  277  3e-73  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2775  tRNA modification GTPase TrmE  36.07 
 
 		 452 aa  277  3e-73  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4148  tRNA modification GTPase TrmE  35.11 
 
 		 455 aa  277  3e-73  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3984  tRNA modification GTPase TrmE  36.12 
 
 		 464 aa  277  3e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4928  tRNA modification GTPase TrmE  36.19 
 
 		 453 aa  277  4e-73  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0035842  hitchhiker  0.00000248868 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4138  tRNA modification GTPase TrmE  37.01 
 
 		 486 aa  276  4e-73  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.619376  normal  0.415942 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3038  tRNA modification GTPase TrmE  38.03 
 
 		 448 aa  276  5e-73  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.38062  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2669  tRNA modification GTPase TrmE  33.84 
 
 		 458 aa  276  6e-73  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2365  tRNA modification GTPase TrmE  32.4 
 
 		 459 aa  276  8e-73  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4469  tRNA modification GTPase TrmE  36.12 
 
 		 464 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0533201 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2992  tRNA modification GTPase TrmE  33.84 
 
 		 458 aa  275  1.0000000000000001e-72  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3612  tRNA modification GTPase TrmE  37.42 
 
 		 455 aa  275  2.0000000000000002e-72  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73400  tRNA modification GTPase TrmE  37.98 
 
 		 455 aa  275  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000503354  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0096  tRNA modification GTPase TrmE  36.29 
 
 		 467 aa  274  3e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3894  tRNA modification GTPase TrmE  36.86 
 
 		 456 aa  274  3e-72  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3395  tRNA modification GTPase TrmE  36.29 
 
 		 467 aa  274  3e-72  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.408647  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0111  tRNA modification GTPase TrmE  36.29 
 
 		 467 aa  274  3e-72  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4058  tRNA modification GTPase TrmE  35.12 
 
 		 455 aa  274  3e-72  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.239105  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5298  tRNA modification GTPase TrmE  37.78 
 
 		 471 aa  273  4.0000000000000004e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.414752  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0977  tRNA modification GTPase TrmE  35.71 
 
 		 447 aa  273  4.0000000000000004e-72  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000239803  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0001  tRNA modification GTPase TrmE  35.55 
 
 		 453 aa  273  4.0000000000000004e-72  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.201746  hitchhiker  0.00000000323985 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2124  tRNA modification GTPase TrmE  35.93 
 
 		 452 aa  273  5.000000000000001e-72  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0199  tRNA modification GTPase TrmE  36.15 
 
 		 473 aa  273  6e-72  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2243  tRNA modification GTPase TrmE  36.29 
 
 		 488 aa  273  6e-72  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2842  tRNA modification GTPase TrmE  36.29 
 
 		 488 aa  273  6e-72  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00155334  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3547  tRNA modification GTPase TrmE  36.29 
 
 		 488 aa  273  6e-72  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2472  tRNA modification GTPase TrmE  38 
 
 		 487 aa  272  8.000000000000001e-72  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000689916 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3233  tRNA modification GTPase TrmE  35.52 
 
 		 467 aa  271  1e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2757  tRNA modification GTPase TrmE  37.04 
 
 		 446 aa  272  1e-71  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4310  tRNA modification GTPase TrmE  37.63 
 
 		 460 aa  271  1e-71  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.671502  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5133  tRNA modification GTPase TrmE  37.77 
 
 		 456 aa  271  2e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5742  tRNA modification GTPase TrmE  36.64 
 
 		 456 aa  271  2e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.206283  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1336  tRNA modification GTPase TrmE  33.98 
 
 		 441 aa  270  2.9999999999999997e-71  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23560  tRNA modification GTPase TrmE  32.62 
 
 		 463 aa  270  2.9999999999999997e-71  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.690968  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0375  tRNA modification GTPase TrmE  34.42 
 
 		 459 aa  271  2.9999999999999997e-71  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2143  tRNA modification GTPase TrmE  37.76 
 
 		 478 aa  270  4e-71  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0104732  hitchhiker  0.000152188 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0008  tRNA modification GTPase TrmE  36.83 
 
 		 453 aa  270  5e-71  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.185087  hitchhiker  0.000721309 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>