56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_52766 on replicon NC_009068
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009068  PICST_52766  putative ADP-ribosylation factor in the carboxypeptidase Y pathway  100 
 
 		 242 aa  501  1e-141  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.167275  normal  0.735667 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00634  ADP-ribosylation factor family protein (AFU_orthologue; AFUA_1G16970)  42.03 
 
 		 276 aa  118  9.999999999999999e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00256949  normal  0.850865 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05912  ADP ribosylation factor A (Eurofung)  28 
 
 		 182 aa  93.6  2e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006686  CND04290  small monomeric GTPase, putative  29.22 
 
 		 186 aa  90.1  3e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_62979  predicted protein  27.51 
 
 		 180 aa  89.4  4e-17  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.233166  normal  0.128067 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_8659  predicted protein  29.82 
 
 		 184 aa  89.4  4e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_79956  predicted protein  27.07 
 
 		 181 aa  87.4  2e-16  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.803161 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_69050  predicted protein  28.32 
 
 		 185 aa  87.4  2e-16  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.121793 
 
 
-
 
NC_006694  CNI03960  ADP-ribosylation factor, putative  28.95 
 
 		 182 aa  87.4  2e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.710992  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG03220  ARF small monomeric GTPase, putative  27.31 
 
 		 182 aa  85.5  8e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05020  ADP ribosylation factor (Eurofung)  30 
 
 		 185 aa  84.7  0.000000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38412  predicted protein  26.51 
 
 		 184 aa  84.7  0.000000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_8244  predicted protein  29.28 
 
 		 175 aa  85.1  0.000000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.222929  normal  0.223128 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01126  ADP-ribosylation factor (Broad)  27.11 
 
 		 183 aa  84.7  0.000000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.529772  normal  0.310407 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29284  predicted protein  26.29 
 
 		 200 aa  83.6  0.000000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_56002  predicted protein  28.99 
 
 		 162 aa  82.8  0.000000000000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0254308  normal  1 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_51064  predicted protein  26.94 
 
 		 181 aa  82.4  0.000000000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00000653634  normal  1 
 
 
-
 
NC_006693  CNH02300  arf-related protein (arp), putative  29.78 
 
 		 223 aa  82  0.000000000000008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.241389  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL06630  put. CPS1 protein, putative  30.99 
 
 		 182 aa  80.9  0.00000000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.306978  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43251  predicted protein  27.65 
 
 		 184 aa  80.5  0.00000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.8255  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_51819  predicted protein  25.23 
 
 		 187 aa  79.3  0.00000000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_37806  predicted protein  27.43 
 
 		 211 aa  79  0.00000000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0163906  normal  0.029284 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_13157  predicted protein  27.52 
 
 		 177 aa  77  0.0000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03934  ADP-ribosylation factor family protein (AFU_orthologue; AFUA_6G08290)  25.82 
 
 		 179 aa  73.2  0.000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006682  CNM00440  ADP-ribosylation-like factor, putative  26.7 
 
 		 195 aa  70.5  0.00000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_54420  predicted protein  26.98 
 
 		 192 aa  69.3  0.00000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0877951  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43732  predicted protein  27.78 
 
 		 193 aa  67.4  0.0000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0105149  normal  0.152758 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_67516  GTP-binding protein  28.18 
 
 		 190 aa  66.6  0.0000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_56609  predicted protein  26.72 
 
 		 185 aa  62  0.000000009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.158476  normal  0.886863 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00411  Small COPII coat GTPase sar1 (EC 3.6.5.-) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BGB9]  27.1 
 
 		 189 aa  60.1  0.00000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.395555  normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB03430  SAR small monomeric GTPase, putative  28.5 
 
 		 189 aa  60.1  0.00000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.000269904  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43397  predicted protein  26.47 
 
 		 186 aa  58.9  0.00000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43276  predicted protein  26.47 
 
 		 186 aa  58.9  0.00000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.348621 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_15349  predicted protein  25.19 
 
 		 174 aa  53.5  0.000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.225755  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE04210  conserved hypothetical protein  30.77 
 
 		 182 aa  52  0.000008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_22713  predicted protein  35.79 
 
 		 203 aa  51.2  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.517638  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_51810  predicted protein  27.89 
 
 		 213 aa  50.8  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_12689  predicted protein  33.68 
 
 		 203 aa  49.3  0.00006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.166155  normal  0.0578353 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_71522  GTP-binding protein of the rab family  34.52 
 
 		 208 aa  48.5  0.0001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.203181 
 
 
-
 
NC_006681  CNL05520  ras-related protein ypt1, putative  35.71 
 
 		 205 aa  47.8  0.0002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04281  GTP-binding protein ypt1 (Broad)  34.94 
 
 		 201 aa  46.6  0.0003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1688  GTP-binding protein LepA  27.44 
 
 		 602 aa  47  0.0003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_51727  predicted protein  37.8 
 
 		 208 aa  47  0.0003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3064  GTP-binding protein LepA  29.94 
 
 		 603 aa  47  0.0003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.128095  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1168  GTP-binding protein LepA  22.54 
 
 		 605 aa  45.4  0.0009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1930  GTP-binding domain-containing protein  26.19 
 
 		 291 aa  45.1  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_15391  predicted protein  33.33 
 
 		 203 aa  43.9  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.591039  normal  0.0150385 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3638  GTP-binding protein LepA  28.3 
 
 		 603 aa  44.3  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0492611  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1287  GTP-binding protein LepA  22.07 
 
 		 605 aa  43.9  0.002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2255  GTP-binding protein LepA  24.65 
 
 		 597 aa  43.9  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.357862  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1193  GTP-binding protein LepA  26.74 
 
 		 602 aa  44.3  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.417452  decreased coverage  0.00711169 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_89948  GTP-binding protein  24.53 
 
 		 207 aa  42.7  0.005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  decreased coverage  0.0054767 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_88171  predicted protein  23.08 
 
 		 296 aa  42.7  0.006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.31194 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0479  GTP-binding protein LepA  26.98 
 
 		 614 aa  42.4  0.007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2421  GTP-binding protein LepA  27.22 
 
 		 597 aa  42  0.008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.417593  normal  0.344469 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1740  GTP-binding protein LepA  28.4 
 
 		 603 aa  42  0.009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0723803  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>