39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_15349 on replicon NC_011687
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011687  PHATRDRAFT_15349  predicted protein  100 
 
 		 174 aa  361  3e-99  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.225755  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_54420  predicted protein  41.08 
 
 		 192 aa  135  2e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0877951  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00411  Small COPII coat GTPase sar1 (EC 3.6.5.-) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BGB9]  39.78 
 
 		 189 aa  126  2.0000000000000002e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.395555  normal  1 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43732  predicted protein  38.67 
 
 		 193 aa  124  8.000000000000001e-28  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0105149  normal  0.152758 
 
 
-
 
NC_006684  CNB03430  SAR small monomeric GTPase, putative  38.67 
 
 		 189 aa  122  4e-27  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.000269904  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_67516  GTP-binding protein  37.64 
 
 		 190 aa  121  4e-27  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006686  CND04290  small monomeric GTPase, putative  33.14 
 
 		 186 aa  102  2e-21  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_69050  predicted protein  31.36 
 
 		 185 aa  99.4  2e-20  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.121793 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_8244  predicted protein  31.95 
 
 		 175 aa  96.7  2e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.222929  normal  0.223128 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05912  ADP ribosylation factor A (Eurofung)  34.34 
 
 		 182 aa  96.3  2e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_56002  predicted protein  33.13 
 
 		 162 aa  95.1  5e-19  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0254308  normal  1 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_51064  predicted protein  32.54 
 
 		 181 aa  94  1e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00000653634  normal  1 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_79956  predicted protein  31.36 
 
 		 181 aa  92.4  3e-18  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.803161 
 
 
-
 
NC_006692  CNG03220  ARF small monomeric GTPase, putative  32.12 
 
 		 182 aa  92  4e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_8659  predicted protein  33.14 
 
 		 184 aa  89.4  2e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_62979  predicted protein  30.95 
 
 		 180 aa  89.7  2e-17  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.233166  normal  0.128067 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01126  ADP-ribosylation factor (Broad)  29.59 
 
 		 183 aa  87.8  7e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.529772  normal  0.310407 
 
 
-
 
NC_006681  CNL06630  put. CPS1 protein, putative  30.18 
 
 		 182 aa  85.1  4e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.306978  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43251  predicted protein  28.49 
 
 		 184 aa  84.7  6e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.8255  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05020  ADP ribosylation factor (Eurofung)  33.33 
 
 		 185 aa  82.8  0.000000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_37806  predicted protein  29.07 
 
 		 211 aa  82.8  0.000000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0163906  normal  0.029284 
 
 
-
 
NC_006694  CNI03960  ADP-ribosylation factor, putative  30.36 
 
 		 182 aa  80.5  0.00000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.710992  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38412  predicted protein  27.11 
 
 		 184 aa  75.9  0.0000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_56609  predicted protein  29.52 
 
 		 185 aa  75.1  0.0000000000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.158476  normal  0.886863 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_13157  predicted protein  27.11 
 
 		 177 aa  73.2  0.000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_51819  predicted protein  28.66 
 
 		 187 aa  72.8  0.000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43276  predicted protein  28.92 
 
 		 186 aa  70.1  0.00000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.348621 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43397  predicted protein  28.92 
 
 		 186 aa  70.1  0.00000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03934  ADP-ribosylation factor family protein (AFU_orthologue; AFUA_6G08290)  34.86 
 
 		 179 aa  65.1  0.0000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00634  ADP-ribosylation factor family protein (AFU_orthologue; AFUA_1G16970)  38.38 
 
 		 276 aa  62  0.000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00256949  normal  0.850865 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_52766  putative ADP-ribosylation factor in the carboxypeptidase Y pathway  24.65 
 
 		 242 aa  60.5  0.00000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.167275  normal  0.735667 
 
 
-
 
NC_006687  CNE04210  conserved hypothetical protein  30.17 
 
 		 182 aa  60.1  0.00000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29284  predicted protein  25.13 
 
 		 200 aa  55.8  0.0000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH02300  arf-related protein (arp), putative  32.38 
 
 		 223 aa  48.1  0.00007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.241389  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM00440  ADP-ribosylation-like factor, putative  23.33 
 
 		 195 aa  42.7  0.003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1098  GTP-binding protein EngA  28.57 
 
 		 441 aa  42.4  0.004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_88308  predicted protein  31.82 
 
 		 183 aa  41.6  0.005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.359872 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0657  tRNA modification GTPase TrmE  28.25 
 
 		 450 aa  40.8  0.009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0681  tRNA modification GTPase TrmE  28.25 
 
 		 450 aa  40.8  0.009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.570227  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>