67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_51819 on replicon NC_011674
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011674  PHATRDRAFT_51819  predicted protein  100 
 
 
187 aa  381  1e-105  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38412  predicted protein  59.14 
 
 
184 aa  238  5.999999999999999e-62  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006682  CNM00440  ADP-ribosylation-like factor, putative  50.88 
 
 
195 aa  175  4e-43  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_69050  predicted protein  47.7 
 
 
185 aa  168  4e-41  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.121793 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_51064  predicted protein  47.06 
 
 
181 aa  162  2.0000000000000002e-39  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00000653634  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_8659  predicted protein  48.78 
 
 
184 aa  160  1e-38  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05912  ADP ribosylation factor A (Eurofung)  48.04 
 
 
182 aa  160  1e-38  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006686  CND04290  small monomeric GTPase, putative  45.83 
 
 
186 aa  158  3e-38  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_8244  predicted protein  46.34 
 
 
175 aa  158  6e-38  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.222929  normal  0.223128 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_79956  predicted protein  45.24 
 
 
181 aa  154  8e-37  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.803161 
 
 
-
 
NC_006692  CNG03220  ARF small monomeric GTPase, putative  46.01 
 
 
182 aa  154  1e-36  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43251  predicted protein  46.01 
 
 
184 aa  152  2e-36  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.8255  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_62979  predicted protein  45.24 
 
 
180 aa  153  2e-36  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.233166  normal  0.128067 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01126  ADP-ribosylation factor (Broad)  43.71 
 
 
183 aa  146  1.0000000000000001e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.529772  normal  0.310407 
 
 
-
 
NC_006681  CNL06630  put. CPS1 protein, putative  42.51 
 
 
182 aa  146  2.0000000000000003e-34  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.306978  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_56609  predicted protein  42.54 
 
 
185 aa  144  1e-33  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.158476  normal  0.886863 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_37806  predicted protein  42.24 
 
 
211 aa  142  3e-33  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0163906  normal  0.029284 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05020  ADP ribosylation factor (Eurofung)  40.72 
 
 
185 aa  141  6e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_56002  predicted protein  42.77 
 
 
162 aa  138  3.9999999999999997e-32  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0254308  normal 
 
 
-
 
NC_006694  CNI03960  ADP-ribosylation factor, putative  42.26 
 
 
182 aa  133  1.9999999999999998e-30  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.710992  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB03430  SAR small monomeric GTPase, putative  35.23 
 
 
189 aa  97.8  8e-20  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.000269904  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43397  predicted protein  34.35 
 
 
186 aa  95.1  6e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43276  predicted protein  34.35 
 
 
186 aa  95.1  6e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.348621 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03934  ADP-ribosylation factor family protein (AFU_orthologue; AFUA_6G08290)  32.3 
 
 
179 aa  94.4  8e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_67516  GTP-binding protein  30.36 
 
 
190 aa  89.7  2e-17  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_54420  predicted protein  31.76 
 
 
192 aa  89.4  3e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0877951  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE04210  conserved hypothetical protein  29.01 
 
 
182 aa  85.5  4e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43732  predicted protein  30.86 
 
 
193 aa  85.5  4e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0105149  normal  0.152758 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00411  Small COPII coat GTPase sar1 (EC 3.6.5.-) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BGB9]  30.68 
 
 
189 aa  84.7  6e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.395555  normal 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_13157  predicted protein  27.78 
 
 
177 aa  84.3  0.000000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_52766  putative ADP-ribosylation factor in the carboxypeptidase Y pathway  25.23 
 
 
242 aa  79.3  0.00000000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.167275  normal  0.735667 
 
 
-
 
NC_006693  CNH02300  arf-related protein (arp), putative  35.86 
 
 
223 aa  76.3  0.0000000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.241389  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00634  ADP-ribosylation factor family protein (AFU_orthologue; AFUA_1G16970)  40.86 
 
 
276 aa  71.2  0.000000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00256949  normal  0.850865 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29284  predicted protein  26.7 
 
 
200 aa  66.2  0.0000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_15349  predicted protein  26.62 
 
 
174 aa  62  0.000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.225755  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND00140  GTPase, putative  30.16 
 
 
233 aa  56.6  0.0000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0177882  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_15391  predicted protein  29.03 
 
 
203 aa  54.3  0.000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.591039  normal  0.0150385 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_71522  GTP-binding protein of the rab family  31.47 
 
 
208 aa  52.4  0.000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.203181 
 
 
-
 
NC_006681  CNL05520  ras-related protein ypt1, putative  30.51 
 
 
205 aa  51.6  0.000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_51244  GTP-binding protein of the rab/ypt family  25.57 
 
 
212 aa  51.2  0.000009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_51810  predicted protein  31.67 
 
 
213 aa  50.8  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_30139  predicted protein  28.46 
 
 
207 aa  50.8  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04281  GTP-binding protein ypt1 (Broad)  30.43 
 
 
201 aa  48.1  0.00007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_89948  GTP-binding protein  28.33 
 
 
207 aa  47  0.0001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  decreased coverage  0.0054767 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07602  hypothetical protein similar to small GTP-binding protein (Eurofung)  27.5 
 
 
184 aa  47  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.236475  normal  0.0559081 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_22713  predicted protein  28.26 
 
 
203 aa  47  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.517638  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32150  predicted protein  30.58 
 
 
214 aa  47  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.495831 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_12689  predicted protein  29.75 
 
 
203 aa  46.6  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.166155  normal  0.0578353 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32675  predicted protein  28.57 
 
 
205 aa  46.2  0.0003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0848585 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_21535  predicted protein  28.57 
 
 
236 aa  46.2  0.0003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC04340  Rab/GTPase, putative  28.21 
 
 
211 aa  45.8  0.0004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.260268  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2306  leucine-rich repeat-containing protein  32.95 
 
 
863 aa  45.1  0.0005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.98495 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0881  small GTP-binding protein domain-containing protein  25.32 
 
 
165 aa  43.9  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.334755  hitchhiker  0.000103971 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05106  secretion related GTPase SrgD (AFU_orthologue; AFUA_1G07680)  29.01 
 
 
175 aa  43.9  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00933055 
 
 
-
 
NC_006682  CNM01190  GTPase, putative  28.46 
 
 
252 aa  44.3  0.001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02285  hypothetical protein  23.39 
 
 
161 aa  43.5  0.002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2203  small GTP-binding protein  25.73 
 
 
176 aa  43.5  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03625  small GTP-binding protein  29.11 
 
 
161 aa  43.1  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_63552  hypothetical protein  25.71 
 
 
290 aa  43.5  0.002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.495223 
 
 
-
 
NC_006682  CNM00590  conserved hypothetical protein  27.5 
 
 
213 aa  43.5  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0238603  n/a   
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_31160  predicted protein  26.27 
 
 
214 aa  42.4  0.004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1930  GTP-binding domain-containing protein  24.38 
 
 
291 aa  42.4  0.004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_36721  predicted protein  30.53 
 
 
323 aa  42  0.005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38767  predicted protein  25.42 
 
 
205 aa  42  0.005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0208811 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1982  GTP-binding domain-containing protein  21.67 
 
 
289 aa  41.6  0.006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.079955  normal  0.121874 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1493  small GTP-binding protein domain-containing protein  32.1 
 
 
1107 aa  41.2  0.008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_51727  predicted protein  25 
 
 
208 aa  41.2  0.009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>