69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CND04290 on replicon NC_006686
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006686  CND04290  small monomeric GTPase, putative  100 
 
 		 186 aa  375  1e-103  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05912  ADP ribosylation factor A (Eurofung)  62.7 
 
 		 182 aa  237  5.999999999999999e-62  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_8244  predicted protein  62.64 
 
 		 175 aa  233  9e-61  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.222929  normal  0.223128 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01126  ADP-ribosylation factor (Broad)  58.6 
 
 		 183 aa  228  3e-59  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.529772  normal  0.310407 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43251  predicted protein  59.36 
 
 		 184 aa  228  5e-59  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.8255  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_8659  predicted protein  59.36 
 
 		 184 aa  224  6e-58  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_79956  predicted protein  56.99 
 
 		 181 aa  223  1e-57  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.803161 
 
 
-
 
NC_006692  CNG03220  ARF small monomeric GTPase, putative  58.06 
 
 		 182 aa  223  2e-57  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_51064  predicted protein  55.91 
 
 		 181 aa  223  2e-57  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00000653634  normal  1 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_62979  predicted protein  57.3 
 
 		 180 aa  220  8e-57  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.233166  normal  0.128067 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_69050  predicted protein  55.98 
 
 		 185 aa  219  9.999999999999999e-57  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.121793 
 
 
-
 
NC_006681  CNL06630  put. CPS1 protein, putative  55.15 
 
 		 182 aa  200  8e-51  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.306978  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05020  ADP ribosylation factor (Eurofung)  51.61 
 
 		 185 aa  189  1e-47  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_37806  predicted protein  46.24 
 
 		 211 aa  184  5e-46  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0163906  normal  0.029284 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_56002  predicted protein  51.59 
 
 		 162 aa  174  9.999999999999999e-43  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0254308  normal  1 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_51819  predicted protein  45.83 
 
 		 187 aa  158  3e-38  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI03960  ADP-ribosylation factor, putative  42.7 
 
 		 182 aa  154  6e-37  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.710992  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38412  predicted protein  44.51 
 
 		 184 aa  151  5.9999999999999996e-36  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_54420  predicted protein  34.62 
 
 		 192 aa  113  2.0000000000000002e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0877951  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM00440  ADP-ribosylation-like factor, putative  37.04 
 
 		 195 aa  111  7.000000000000001e-24  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03934  ADP-ribosylation factor family protein (AFU_orthologue; AFUA_6G08290)  34.55 
 
 		 179 aa  108  3e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43732  predicted protein  33.51 
 
 		 193 aa  108  6e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0105149  normal  0.152758 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_67516  GTP-binding protein  32.97 
 
 		 190 aa  107  1e-22  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB03430  SAR small monomeric GTPase, putative  34.1 
 
 		 189 aa  105  4e-22  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.000269904  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_13157  predicted protein  31.25 
 
 		 177 aa  104  9e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_56609  predicted protein  37.28 
 
 		 185 aa  104  9e-22  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.158476  normal  0.886863 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00411  Small COPII coat GTPase sar1 (EC 3.6.5.-) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BGB9]  33.15 
 
 		 189 aa  99  3e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.395555  normal  1 
 
 
-
 
NC_006687  CNE04210  conserved hypothetical protein  36.53 
 
 		 182 aa  97.4  1e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43397  predicted protein  31.52 
 
 		 186 aa  94.7  7e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43276  predicted protein  31.52 
 
 		 186 aa  94.7  7e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.348621 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_15349  predicted protein  32.91 
 
 		 174 aa  94  1e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.225755  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_52766  putative ADP-ribosylation factor in the carboxypeptidase Y pathway  29.22 
 
 		 242 aa  90.1  2e-17  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.167275  normal  0.735667 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00634  ADP-ribosylation factor family protein (AFU_orthologue; AFUA_1G16970)  37.38 
 
 		 276 aa  79  0.00000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00256949  normal  0.850865 
 
 
-
 
NC_006693  CNH02300  arf-related protein (arp), putative  34.85 
 
 		 223 aa  69.7  0.00000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.241389  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29284  predicted protein  29.77 
 
 		 200 aa  68.6  0.00000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38767  predicted protein  28.93 
 
 		 205 aa  50.8  0.00001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0208811 
 
 
-
 
NC_006682  CNM01190  GTPase, putative  27.66 
 
 		 252 aa  48.9  0.00004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_30139  predicted protein  28.93 
 
 		 207 aa  48.5  0.00005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1493  small GTP-binding protein domain-containing protein  30.51 
 
 		 1107 aa  48.1  0.00007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2067  small GTP-binding protein  24.06 
 
 		 387 aa  47.4  0.0001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.66233  normal  1 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_63641  Rab5-like GTPase  25 
 
 		 215 aa  47  0.0002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.38675  normal  0.213062 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_41856  predicted protein  28 
 
 		 220 aa  47  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00446099  hitchhiker  0.00310862 
 
 
-
 
NC_006685  CNC04340  Rab/GTPase, putative  28.57 
 
 		 211 aa  46.2  0.0003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.260268  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04915  RAB GTPase Vps21/Ypt51, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G10740)  26.76 
 
 		 258 aa  46.2  0.0003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.222182 
 
 
-
 
NC_006681  CNL05520  ras-related protein ypt1, putative  29.06 
 
 		 205 aa  45.8  0.0004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_22713  predicted protein  28.47 
 
 		 203 aa  45.8  0.0004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.517638  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_12689  predicted protein  28.69 
 
 		 203 aa  44.7  0.0007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.166155  normal  0.0578353 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_06974  Rab GTPase SrgA (Eurofung)  26.89 
 
 		 206 aa  45.1  0.0007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00000000778226 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04281  GTP-binding protein ypt1 (Broad)  27.01 
 
 		 201 aa  44.7  0.0008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_89948  GTP-binding protein  28.69 
 
 		 207 aa  44.7  0.0008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  decreased coverage  0.0054767 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_15391  predicted protein  26.6 
 
 		 203 aa  44.3  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.591039  normal  0.0150385 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_51810  predicted protein  26.92 
 
 		 213 aa  43.1  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND00140  GTPase, putative  27.56 
 
 		 233 aa  42.7  0.003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0177882  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_71522  GTP-binding protein of the rab family  30.68 
 
 		 208 aa  42.4  0.003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.203181 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02285  hypothetical protein  28.1 
 
 		 161 aa  42.7  0.003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4467  MglA protein  24.32 
 
 		 271 aa  42.4  0.004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.152863  normal  1 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_51727  predicted protein  29.76 
 
 		 208 aa  42.4  0.004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05482  Small GTPase RanA [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q6T4V9]  28.33 
 
 		 215 aa  42.4  0.004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.337207  normal  0.914788 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_52636  GTP-binding protein of the rab family  21.35 
 
 		 230 aa  42.4  0.004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006687  CNE02560  conserved hypothetical protein  28.91 
 
 		 240 aa  42  0.005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00920  Rab family GTP-binding protein, putative  28.18 
 
 		 885 aa  42  0.005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_24119  predicted protein  28.06 
 
 		 202 aa  42  0.005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_51169  predicted protein  26.19 
 
 		 213 aa  41.6  0.007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3999  small GTP-binding protein  27.5 
 
 		 937 aa  41.6  0.007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4041  small GTP-binding protein  27.5 
 
 		 937 aa  41.6  0.007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.668162  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_84260  predicted protein  27.5 
 
 		 214 aa  41.2  0.008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.514091 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_36721  predicted protein  22.95 
 
 		 323 aa  41.2  0.008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3253  small GTP-binding protein  23.73 
 
 		 867 aa  41.2  0.008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2306  leucine-rich repeat-containing protein  33.33 
 
 		 863 aa  41.2  0.01  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.98495 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>