68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_69050 on replicon NC_009068
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009068  PICST_69050  predicted protein  100 
 
 		 185 aa  377  1e-104  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.121793 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05912  ADP ribosylation factor A (Eurofung)  68 
 
 		 182 aa  252  3e-66  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_8659  predicted protein  61.67 
 
 		 184 aa  228  4e-59  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_8244  predicted protein  60.34 
 
 		 175 aa  227  6e-59  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.222929  normal  0.223128 
 
 
-
 
NC_006686  CND04290  small monomeric GTPase, putative  55.98 
 
 		 186 aa  219  9.999999999999999e-57  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_51064  predicted protein  59.65 
 
 		 181 aa  220  9.999999999999999e-57  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00000653634  normal  1 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_79956  predicted protein  57.07 
 
 		 181 aa  218  3e-56  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.803161 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_62979  predicted protein  56.98 
 
 		 180 aa  216  2e-55  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.233166  normal  0.128067 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43251  predicted protein  59.43 
 
 		 184 aa  215  2.9999999999999998e-55  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.8255  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01126  ADP-ribosylation factor (Broad)  57.46 
 
 		 183 aa  215  2.9999999999999998e-55  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.529772  normal  0.310407 
 
 
-
 
NC_006692  CNG03220  ARF small monomeric GTPase, putative  57.8 
 
 		 182 aa  211  7e-54  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL06630  put. CPS1 protein, putative  56.04 
 
 		 182 aa  207  5e-53  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.306978  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05020  ADP ribosylation factor (Eurofung)  53.89 
 
 		 185 aa  199  9.999999999999999e-51  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_37806  predicted protein  50.28 
 
 		 211 aa  188  2.9999999999999997e-47  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0163906  normal  0.029284 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_51819  predicted protein  47.7 
 
 		 187 aa  168  4e-41  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI03960  ADP-ribosylation factor, putative  46.29 
 
 		 182 aa  166  2e-40  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.710992  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_56002  predicted protein  48.41 
 
 		 162 aa  162  4.0000000000000004e-39  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0254308  normal  1 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38412  predicted protein  45.14 
 
 		 184 aa  160  1e-38  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006682  CNM00440  ADP-ribosylation-like factor, putative  40.62 
 
 		 195 aa  125  3e-28  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_13157  predicted protein  33.9 
 
 		 177 aa  108  4.0000000000000004e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_54420  predicted protein  37.06 
 
 		 192 aa  107  9.000000000000001e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0877951  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03934  ADP-ribosylation factor family protein (AFU_orthologue; AFUA_6G08290)  33.12 
 
 		 179 aa  103  1e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_56609  predicted protein  35.15 
 
 		 185 aa  100  1e-20  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.158476  normal  0.886863 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43732  predicted protein  31.18 
 
 		 193 aa  98.2  5e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0105149  normal  0.152758 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00411  Small COPII coat GTPase sar1 (EC 3.6.5.-) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BGB9]  31.84 
 
 		 189 aa  97.8  7e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.395555  normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB03430  SAR small monomeric GTPase, putative  31.69 
 
 		 189 aa  97.4  9e-20  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.000269904  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE04210  conserved hypothetical protein  34.97 
 
 		 182 aa  96.7  2e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_67516  GTP-binding protein  32.07 
 
 		 190 aa  96.7  2e-19  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43276  predicted protein  33.54 
 
 		 186 aa  94.7  7e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.348621 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43397  predicted protein  33.54 
 
 		 186 aa  94.7  7e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_15349  predicted protein  30.38 
 
 		 174 aa  89.4  2e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.225755  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_52766  putative ADP-ribosylation factor in the carboxypeptidase Y pathway  28.32 
 
 		 242 aa  87.4  1e-16  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.167275  normal  0.735667 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00634  ADP-ribosylation factor family protein (AFU_orthologue; AFUA_1G16970)  43.88 
 
 		 276 aa  80.1  0.00000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00256949  normal  0.850865 
 
 
-
 
NC_006693  CNH02300  arf-related protein (arp), putative  36.36 
 
 		 223 aa  72.8  0.000000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.241389  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29284  predicted protein  23.76 
 
 		 200 aa  63.9  0.000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND00140  GTPase, putative  26.47 
 
 		 233 aa  52  0.000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0177882  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_15391  predicted protein  28.68 
 
 		 203 aa  52  0.000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.591039  normal  0.0150385 
 
 
-
 
NC_006687  CNE02560  conserved hypothetical protein  31.76 
 
 		 240 aa  48.9  0.00004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_22713  predicted protein  27.35 
 
 		 203 aa  46.2  0.0003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.517638  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32150  predicted protein  28.48 
 
 		 214 aa  45.4  0.0004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.495831 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_52636  GTP-binding protein of the rab family  24.86 
 
 		 230 aa  45.1  0.0005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_24119  predicted protein  29.06 
 
 		 202 aa  45.1  0.0007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2067  small GTP-binding protein  24.62 
 
 		 387 aa  44.7  0.0007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.66233  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1428  Miro-like  28.46 
 
 		 748 aa  45.1  0.0007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006681  CNL05520  ras-related protein ypt1, putative  31.4 
 
 		 205 aa  44.7  0.0009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_89948  GTP-binding protein  23.31 
 
 		 207 aa  43.9  0.001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  decreased coverage  0.0054767 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02474  ras-like GTP-binding protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G03100)  29.25 
 
 		 307 aa  44.3  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00920  Rab family GTP-binding protein, putative  29.67 
 
 		 885 aa  44.3  0.001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2306  leucine-rich repeat-containing protein  30.63 
 
 		 863 aa  44.3  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.98495 
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_31160  predicted protein  22.42 
 
 		 214 aa  43.9  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_12688  predicted protein  29.21 
 
 		 212 aa  44.3  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0669113  normal  0.123552 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_51727  predicted protein  26.81 
 
 		 208 aa  44.3  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM01190  GTPase, putative  29 
 
 		 252 aa  43.9  0.001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38767  predicted protein  29.41 
 
 		 205 aa  43.5  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0208811 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44216  predicted protein  24.28 
 
 		 229 aa  43.1  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1262  small GTP-binding protein  28.46 
 
 		 187 aa  43.5  0.002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00000054589  decreased coverage  0.00000000022616 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1493  small GTP-binding protein domain-containing protein  27.87 
 
 		 1107 aa  43.1  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_06974  Rab GTPase SrgA (Eurofung)  30.59 
 
 		 206 aa  43.1  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00000000778226 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00347  Ras GTPase similar to RAB11B (Eurofung)  25.64 
 
 		 210 aa  42.7  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.521067  normal  1 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_51810  predicted protein  29.21 
 
 		 213 aa  42.4  0.004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_12689  predicted protein  29.91 
 
 		 203 aa  42.4  0.004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.166155  normal  0.0578353 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_22095  predicted protein  28.68 
 
 		 210 aa  42.4  0.004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02285  hypothetical protein  29.06 
 
 		 161 aa  42  0.005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC04340  Rab/GTPase, putative  30.59 
 
 		 211 aa  42  0.005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.260268  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_71522  GTP-binding protein of the rab family  31.52 
 
 		 208 aa  41.2  0.008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.203181 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_51511  predicted protein  31.03 
 
 		 201 aa  41.2  0.009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.471468  n/a   
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_30139  predicted protein  27.91 
 
 		 207 aa  41.2  0.009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04281  GTP-binding protein ypt1 (Broad)  28.09 
 
 		 201 aa  40.8  0.01  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>