51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_67516 on replicon NC_009044
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009044  PICST_67516  GTP-binding protein  100 
 
 		 190 aa  389  1e-107  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00411  Small COPII coat GTPase sar1 (EC 3.6.5.-) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BGB9]  76.96 
 
 		 189 aa  299  2e-80  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.395555  normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB03430  SAR small monomeric GTPase, putative  77.49 
 
 		 189 aa  297  6e-80  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.000269904  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43732  predicted protein  65.62 
 
 		 193 aa  257  8e-68  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0105149  normal  0.152758 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_54420  predicted protein  62.18 
 
 		 192 aa  246  1e-64  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0877951  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_79956  predicted protein  34.71 
 
 		 181 aa  113  2.0000000000000002e-24  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.803161 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01126  ADP-ribosylation factor (Broad)  33.91 
 
 		 183 aa  110  9e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.529772  normal  0.310407 
 
 
-
 
NC_006692  CNG03220  ARF small monomeric GTPase, putative  35.09 
 
 		 182 aa  108  3e-23  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_62979  predicted protein  33.73 
 
 		 180 aa  109  3e-23  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.233166  normal  0.128067 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_15349  predicted protein  37.64 
 
 		 174 aa  108  5e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.225755  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_8244  predicted protein  32.42 
 
 		 175 aa  108  7.000000000000001e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.222929  normal  0.223128 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_8659  predicted protein  34.66 
 
 		 184 aa  107  1e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND04290  small monomeric GTPase, putative  32.97 
 
 		 186 aa  107  1e-22  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_51064  predicted protein  33.91 
 
 		 181 aa  106  2e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00000653634  normal  1 
 
 
-
 
NC_006681  CNL06630  put. CPS1 protein, putative  33.53 
 
 		 182 aa  105  4e-22  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.306978  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05912  ADP ribosylation factor A (Eurofung)  34.88 
 
 		 182 aa  105  5e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43251  predicted protein  32.95 
 
 		 184 aa  102  4e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.8255  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_69050  predicted protein  32.07 
 
 		 185 aa  96.7  2e-19  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.121793 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05020  ADP ribosylation factor (Eurofung)  33.14 
 
 		 185 aa  96.7  2e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_56002  predicted protein  37.04 
 
 		 162 aa  95.9  3e-19  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0254308  normal  1 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_13157  predicted protein  34.85 
 
 		 177 aa  89.7  2e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38412  predicted protein  28.82 
 
 		 184 aa  89.7  2e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43397  predicted protein  31.4 
 
 		 186 aa  89  3e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43276  predicted protein  31.4 
 
 		 186 aa  89  3e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.348621 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_51819  predicted protein  30.36 
 
 		 187 aa  89.7  3e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_37806  predicted protein  32.94 
 
 		 211 aa  87.4  1e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0163906  normal  0.029284 
 
 
-
 
NC_006694  CNI03960  ADP-ribosylation factor, putative  29.82 
 
 		 182 aa  86.7  2e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.710992  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03934  ADP-ribosylation factor family protein (AFU_orthologue; AFUA_6G08290)  30.32 
 
 		 179 aa  82.8  0.000000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006687  CNE04210  conserved hypothetical protein  27.81 
 
 		 182 aa  80.9  0.00000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_56609  predicted protein  32.76 
 
 		 185 aa  70.9  0.00000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.158476  normal  0.886863 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_52766  putative ADP-ribosylation factor in the carboxypeptidase Y pathway  28.18 
 
 		 242 aa  66.6  0.0000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.167275  normal  0.735667 
 
 
-
 
NC_006682  CNM00440  ADP-ribosylation-like factor, putative  26.9 
 
 		 195 aa  62  0.000000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1930  GTP-binding domain-containing protein  27.81 
 
 		 291 aa  57.8  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH02300  arf-related protein (arp), putative  28.79 
 
 		 223 aa  57.4  0.0000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.241389  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29284  predicted protein  27.66 
 
 		 200 aa  54.7  0.0000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00634  ADP-ribosylation factor family protein (AFU_orthologue; AFUA_1G16970)  31.82 
 
 		 276 aa  52.8  0.000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00256949  normal  0.850865 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1982  GTP-binding domain-containing protein  26.28 
 
 		 289 aa  48.1  0.00007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.079955  normal  0.121874 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0681  tRNA modification GTPase TrmE  26.21 
 
 		 450 aa  47.8  0.0001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.570227  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0657  tRNA modification GTPase TrmE  26.21 
 
 		 450 aa  47  0.0002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3279  tRNA modification GTPase TrmE  27.94 
 
 		 458 aa  45.1  0.0006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.768989 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0379  small GTP-binding protein  26.06 
 
 		 191 aa  43.9  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1087  small GTP-binding protein domain-containing protein  33.6 
 
 		 436 aa  43.5  0.002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.824642  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND00140  GTPase, putative  24.8 
 
 		 233 aa  43.5  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0177882  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07602  hypothetical protein similar to small GTP-binding protein (Eurofung)  27.21 
 
 		 184 aa  42.7  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.236475  normal  0.0559081 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2030  tRNA modification GTPase TrmE  27.64 
 
 		 460 aa  42.4  0.004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.312338  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_35327  predicted protein  22.54 
 
 		 431 aa  42.4  0.004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0758  GTPase ObgE  28.89 
 
 		 476 aa  42  0.005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.639245  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0383  translation initiation factor IF-2  27.4 
 
 		 943 aa  42  0.006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2067  small GTP-binding protein  33.9 
 
 		 387 aa  41.6  0.007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.66233  normal  1 
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_30139  predicted protein  22.95 
 
 		 207 aa  41.6  0.007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_88171  predicted protein  25.93 
 
 		 296 aa  41.2  0.01  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.31194 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>