64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU1930 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU1930  GTP-binding domain-containing protein  100 
 
 		 291 aa  589  1e-167  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1982  GTP-binding domain-containing protein  49.33 
 
 		 289 aa  246  3e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.079955  normal  0.121874 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2315  hypothetical protein  41.78 
 
 		 289 aa  205  8e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000111137  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1908  hypothetical protein  41.18 
 
 		 281 aa  201  8e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.102679 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2812  hypothetical protein  47.32 
 
 		 305 aa  183  3e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1322  GTP-binding domain protein  42.19 
 
 		 270 aa  155  8e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.886624  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0659  GTP-binding domain-containing protein  41.24 
 
 		 293 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3124  MglA protein  40.1 
 
 		 195 aa  150  2e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000166676  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4332  GTPase-like protein  39.06 
 
 		 195 aa  148  1.0000000000000001e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00853129  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3417  MglA protein  39.06 
 
 		 195 aa  146  5e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4048  GTPase-like protein  39.18 
 
 		 195 aa  144  2e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0099  MglA protein  39.58 
 
 		 195 aa  144  2e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0379  mutual gliding protein A, small GTPase  38.54 
 
 		 196 aa  142  6e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.844729  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2940  MglA protein  38.02 
 
 		 195 aa  142  6e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.136868  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3962  GTPase-like protein  38.66 
 
 		 195 aa  142  8e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0107752  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3691  MglA protein  37.5 
 
 		 195 aa  139  7e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.956582  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3633  MglA protein  37.5 
 
 		 195 aa  139  7e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3774  MglA protein  37.5 
 
 		 195 aa  139  7e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.34274  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6866  MglA protein  38.02 
 
 		 195 aa  138  1e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.318166 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0708  MglA protein  35.94 
 
 		 194 aa  134  1.9999999999999998e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3758  MglA protein  36.46 
 
 		 195 aa  134  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.39742  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1713  MglA protein  36.32 
 
 		 196 aa  133  3e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.369936  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1201  GTPase-like protein  39.49 
 
 		 335 aa  132  5e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.595525  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1154  GTPase-like  38.46 
 
 		 356 aa  130  4.0000000000000003e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1815  gliding motility protein  35.42 
 
 		 196 aa  129  5.0000000000000004e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2006  gliding motility protein  35.45 
 
 		 196 aa  129  7.000000000000001e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.142347  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1214  GTPase-like protein  37.44 
 
 		 352 aa  128  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.504628  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1284  GTPase-like protein  37.44 
 
 		 355 aa  128  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4339  hypothetical protein  39.18 
 
 		 191 aa  125  6e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.34683  normal  0.137501 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0200  hypothetical protein  39.18 
 
 		 191 aa  125  1e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.423749 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1356  MglA protein  35.94 
 
 		 195 aa  124  2e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.734734  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2679  hypothetical protein  38.78 
 
 		 195 aa  123  3e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000233464 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0931  hypothetical protein  38.14 
 
 		 191 aa  122  6e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.618949  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2372  gliding motility protein (MglA)  32.66 
 
 		 204 aa  113  3e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0318  gliding motility protein (MglA)  33 
 
 		 205 aa  110  2.0000000000000002e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.667045  normal  0.990393 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1654  gliding motility protein (MglA)  31.66 
 
 		 205 aa  109  5e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.690375  normal  0.185219 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4477  MglA protein  34.72 
 
 		 230 aa  108  1e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0711351  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4467  MglA protein  34.5 
 
 		 271 aa  107  2e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.152863  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4458  MglA protein  34.72 
 
 		 230 aa  106  4e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.417222  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4322  MglA protein  33.97 
 
 		 230 aa  106  5e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2556  hypothetical protein  31.89 
 
 		 220 aa  101  1e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000851913 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3475  hypothetical protein  31.89 
 
 		 225 aa  97.1  3e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0968  MglA protein  32.24 
 
 		 214 aa  97.1  3e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2366  hypothetical protein  30.77 
 
 		 223 aa  97.1  3e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_67516  GTP-binding protein  27.81 
 
 		 190 aa  57.8  0.0000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB03430  SAR small monomeric GTPase, putative  27.15 
 
 		 189 aa  53.9  0.000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.000269904  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00411  Small COPII coat GTPase sar1 (EC 3.6.5.-) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BGB9]  27.61 
 
 		 189 aa  51.2  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.395555  normal  1 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43732  predicted protein  26.83 
 
 		 193 aa  50.1  0.00005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0105149  normal  0.152758 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_54420  predicted protein  23.84 
 
 		 192 aa  48.9  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0877951  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38412  predicted protein  24.62 
 
 		 184 aa  47.4  0.0003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1262  small GTP-binding protein  27.48 
 
 		 187 aa  47  0.0003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00000054589  decreased coverage  0.00000000022616 
 
 
-
 
NC_006681  CNL06630  put. CPS1 protein, putative  26.88 
 
 		 182 aa  47.4  0.0003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.306978  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_51810  predicted protein  28.73 
 
 		 213 aa  47  0.0004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01126  ADP-ribosylation factor (Broad)  24.87 
 
 		 183 aa  46.2  0.0006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.529772  normal  0.310407 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_52766  putative ADP-ribosylation factor in the carboxypeptidase Y pathway  26.19 
 
 		 242 aa  45.1  0.001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.167275  normal  0.735667 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43251  predicted protein  25.13 
 
 		 184 aa  45.4  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.8255  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2141  small GTP-binding protein  23.62 
 
 		 176 aa  44.7  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1730  small GTP-binding protein  22.83 
 
 		 176 aa  43.9  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_79956  predicted protein  25.29 
 
 		 181 aa  43.9  0.003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.803161 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05020  ADP ribosylation factor (Eurofung)  25.7 
 
 		 185 aa  42.7  0.006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_51819  predicted protein  24.38 
 
 		 187 aa  42.4  0.008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_62979  predicted protein  25.29 
 
 		 180 aa  42.4  0.008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.233166  normal  0.128067 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05106  secretion related GTPase SrgD (AFU_orthologue; AFUA_1G07680)  26.92 
 
 		 175 aa  42.4  0.008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00933055 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_51064  predicted protein  25 
 
 		 181 aa  42.4  0.009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00000653634  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>