54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_0200 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_0200  hypothetical protein  100 
 
 		 191 aa  395  1e-109  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.423749 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4339  hypothetical protein  98.95 
 
 		 191 aa  391  1e-108  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.34683  normal  0.137501 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0931  hypothetical protein  83.77 
 
 		 191 aa  344  4e-94  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.618949  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2679  hypothetical protein  79.49 
 
 		 195 aa  318  3e-86  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000233464 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6866  MglA protein  59.16 
 
 		 195 aa  249  1e-65  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.318166 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0099  MglA protein  59.16 
 
 		 195 aa  246  1e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4332  GTPase-like protein  57.07 
 
 		 195 aa  239  1e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00853129  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4048  GTPase-like protein  56.54 
 
 		 195 aa  237  5.999999999999999e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3417  MglA protein  57.07 
 
 		 195 aa  237  6.999999999999999e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3633  MglA protein  56.54 
 
 		 195 aa  237  8e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3691  MglA protein  56.54 
 
 		 195 aa  237  8e-62  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.956582  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3774  MglA protein  56.54 
 
 		 195 aa  237  8e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.34274  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1815  gliding motility protein  58.85 
 
 		 196 aa  236  1e-61  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3758  MglA protein  56.02 
 
 		 195 aa  235  2e-61  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.39742  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2940  MglA protein  56.02 
 
 		 195 aa  236  2e-61  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.136868  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3962  GTPase-like protein  56.02 
 
 		 195 aa  236  2e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0107752  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3124  MglA protein  56.54 
 
 		 195 aa  235  3e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000166676  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2006  gliding motility protein  57.81 
 
 		 196 aa  231  4.0000000000000004e-60  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.142347  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1713  MglA protein  56.77 
 
 		 196 aa  230  1e-59  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.369936  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0379  mutual gliding protein A, small GTPase  56.02 
 
 		 196 aa  228  4e-59  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.844729  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0708  MglA protein  54.97 
 
 		 194 aa  224  5.0000000000000005e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1356  MglA protein  56.77 
 
 		 195 aa  217  7.999999999999999e-56  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.734734  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1154  GTPase-like  54.45 
 
 		 356 aa  211  5.999999999999999e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1214  GTPase-like protein  53.93 
 
 		 352 aa  210  1e-53  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.504628  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1284  GTPase-like protein  53.93 
 
 		 355 aa  210  1e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1201  GTPase-like protein  52.36 
 
 		 335 aa  202  3e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.595525  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2372  gliding motility protein (MglA)  48.98 
 
 		 204 aa  191  7e-48  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0318  gliding motility protein (MglA)  48.7 
 
 		 205 aa  180  1e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.667045  normal  0.990393 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1654  gliding motility protein (MglA)  44.9 
 
 		 205 aa  171  6.999999999999999e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.690375  normal  0.185219 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2812  hypothetical protein  43.98 
 
 		 305 aa  162  3e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2315  hypothetical protein  40.31 
 
 		 289 aa  148  4e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000111137  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2366  hypothetical protein  39.33 
 
 		 223 aa  147  1.0000000000000001e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0968  MglA protein  42.35 
 
 		 214 aa  147  1.0000000000000001e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1908  hypothetical protein  40.21 
 
 		 281 aa  146  2.0000000000000003e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.102679 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1982  GTP-binding domain-containing protein  36.65 
 
 		 289 aa  143  1e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.079955  normal  0.121874 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4467  MglA protein  38.22 
 
 		 271 aa  139  3e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.152863  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2556  hypothetical protein  39.44 
 
 		 220 aa  139  3e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000851913 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4477  MglA protein  38.89 
 
 		 230 aa  137  1e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0711351  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4322  MglA protein  38.33 
 
 		 230 aa  135  4e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4458  MglA protein  38.33 
 
 		 230 aa  135  4e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.417222  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3475  hypothetical protein  40 
 
 		 225 aa  135  4e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0659  GTP-binding domain-containing protein  38.22 
 
 		 293 aa  132  3e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1930  GTP-binding domain-containing protein  39.18 
 
 		 291 aa  125  5e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1322  GTP-binding domain protein  29.02 
 
 		 270 aa  90.5  1e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.886624  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1007  hypothetical protein  32.14 
 
 		 174 aa  88.6  5e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2070  GTP-binding protein LepA  24.29 
 
 		 595 aa  51.6  0.000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.282271  normal  0.186175 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_67584  predicted protein  26.74 
 
 		 215 aa  50.4  0.00001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.185544  normal  0.0163736 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5632  GTP-binding protein LepA  24.29 
 
 		 595 aa  47  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.374671  normal  0.559874 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0929  GTP-binding protein LepA  26.89 
 
 		 595 aa  44.3  0.001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0259799 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0457  small GTP-binding protein  25.85 
 
 		 168 aa  43.1  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0486938 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3278  response regulator receiver domain-containing protein  25.6 
 
 		 582 aa  42.7  0.003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0042414  hitchhiker  0.00718988 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2365  peptide chain release factor 3  27.81 
 
 		 556 aa  42.7  0.003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.100255  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1717  GTP-binding protein LepA  24.11 
 
 		 596 aa  42  0.005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.0000391378  normal  0.794394 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2190  small GTP-binding protein  28.32 
 
 		 161 aa  41.6  0.006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>