46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_2366 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012918  GM21_2366  hypothetical protein  100 
 
 
223 aa  457  9.999999999999999e-129  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3475  hypothetical protein  67.59 
 
 
225 aa  313  1.9999999999999998e-84  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0968  MglA protein  49.52 
 
 
214 aa  214  9.999999999999999e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4322  MglA protein  42.92 
 
 
230 aa  191  8e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4467  MglA protein  42.79 
 
 
271 aa  189  4e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.152863  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4458  MglA protein  41.98 
 
 
230 aa  188  5e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.417222  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4477  MglA protein  41.51 
 
 
230 aa  188  5.999999999999999e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0711351  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2556  hypothetical protein  46.41 
 
 
220 aa  185  5e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000851913 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1214  GTPase-like protein  46.96 
 
 
352 aa  173  9.999999999999999e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.504628  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1284  GTPase-like protein  46.96 
 
 
355 aa  173  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1154  GTPase-like  46.41 
 
 
356 aa  172  3.9999999999999995e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3417  MglA protein  43.68 
 
 
195 aa  161  6e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1201  GTPase-like protein  38.57 
 
 
335 aa  161  7e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.595525  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6866  MglA protein  40.41 
 
 
195 aa  160  1e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.318166 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2940  MglA protein  43.68 
 
 
195 aa  160  2e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.136868  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3124  MglA protein  42.29 
 
 
195 aa  157  8e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000166676  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0099  MglA protein  41.95 
 
 
195 aa  156  2e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0318  gliding motility protein (MglA)  40.8 
 
 
205 aa  155  5.0000000000000005e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.667045  normal  0.990393 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4048  GTPase-like protein  41.81 
 
 
195 aa  154  1e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3774  MglA protein  38.86 
 
 
195 aa  153  2e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.34274  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0708  MglA protein  42.53 
 
 
194 aa  153  2e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3633  MglA protein  38.86 
 
 
195 aa  153  2e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3758  MglA protein  38.86 
 
 
195 aa  153  2e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.39742  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3691  MglA protein  38.86 
 
 
195 aa  153  2e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.956582  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3962  GTPase-like protein  41.81 
 
 
195 aa  153  2.9999999999999998e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0107752  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4332  GTPase-like protein  40.8 
 
 
195 aa  151  8.999999999999999e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00853129  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1815  gliding motility protein  42.31 
 
 
196 aa  149  2e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1713  MglA protein  42.54 
 
 
196 aa  150  2e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.369936  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1654  gliding motility protein (MglA)  41 
 
 
205 aa  148  7e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.690375  normal  0.185219 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0379  mutual gliding protein A, small GTPase  40.8 
 
 
196 aa  148  8e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.844729  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0200  hypothetical protein  39.33 
 
 
191 aa  147  2.0000000000000003e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.423749 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2006  gliding motility protein  42.78 
 
 
196 aa  146  3e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.142347  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1356  MglA protein  40.91 
 
 
195 aa  145  3e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.734734  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4339  hypothetical protein  39.33 
 
 
191 aa  145  3e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.34683  normal  0.137501 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2372  gliding motility protein (MglA)  37.38 
 
 
204 aa  145  5e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0931  hypothetical protein  37.64 
 
 
191 aa  140  1.9999999999999998e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.618949  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2679  hypothetical protein  36.81 
 
 
195 aa  134  9.999999999999999e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000233464 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2812  hypothetical protein  33.17 
 
 
305 aa  124  1e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1982  GTP-binding domain-containing protein  31.86 
 
 
289 aa  121  7e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.079955  normal  0.121874 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2315  hypothetical protein  30.18 
 
 
289 aa  112  5e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000111137  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1908  hypothetical protein  31.4 
 
 
281 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.102679 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0659  GTP-binding domain-containing protein  32.47 
 
 
293 aa  105  5e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1930  GTP-binding domain-containing protein  30.77 
 
 
291 aa  97.1  2e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1322  GTP-binding domain protein  24.88 
 
 
270 aa  61.2  0.00000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.886624  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1007  hypothetical protein  30.34 
 
 
174 aa  56.6  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1867  hypothetical protein  27.21 
 
 
254 aa  43.1  0.003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.381737  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>