52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_2315 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_2315  hypothetical protein  100 
 
 		 289 aa  580  1e-164  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000111137  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1908  hypothetical protein  89.97 
 
 		 281 aa  477  1e-133  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.102679 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2812  hypothetical protein  43.87 
 
 		 305 aa  255  6e-67  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1982  GTP-binding domain-containing protein  44.91 
 
 		 289 aa  232  5e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.079955  normal  0.121874 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1930  GTP-binding domain-containing protein  42.81 
 
 		 291 aa  208  1e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3124  MglA protein  46.35 
 
 		 195 aa  189  4e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000166676  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3417  MglA protein  46.35 
 
 		 195 aa  188  1e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6866  MglA protein  44.62 
 
 		 195 aa  182  4.0000000000000006e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.318166 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4332  GTPase-like protein  44.79 
 
 		 195 aa  182  5.0000000000000004e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00853129  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4048  GTPase-like protein  45.31 
 
 		 195 aa  181  2e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3774  MglA protein  46.15 
 
 		 195 aa  180  2.9999999999999997e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.34274  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3691  MglA protein  46.15 
 
 		 195 aa  180  2.9999999999999997e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.956582  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2940  MglA protein  44.79 
 
 		 195 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.136868  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3633  MglA protein  46.15 
 
 		 195 aa  180  2.9999999999999997e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0099  MglA protein  44.56 
 
 		 195 aa  180  2.9999999999999997e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3962  GTPase-like protein  44.79 
 
 		 195 aa  179  4.999999999999999e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0107752  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0379  mutual gliding protein A, small GTPase  43.75 
 
 		 196 aa  177  2e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.844729  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3758  MglA protein  44.62 
 
 		 195 aa  177  3e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.39742  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1815  gliding motility protein  46.88 
 
 		 196 aa  174  1.9999999999999998e-42  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1713  MglA protein  45.41 
 
 		 196 aa  168  8e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.369936  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0659  GTP-binding domain-containing protein  43.62 
 
 		 293 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2006  gliding motility protein  46.56 
 
 		 196 aa  164  2.0000000000000002e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.142347  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0708  MglA protein  42.19 
 
 		 194 aa  161  1e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2372  gliding motility protein (MglA)  42.13 
 
 		 204 aa  152  5e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1201  GTPase-like protein  41.97 
 
 		 335 aa  150  2e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.595525  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1356  MglA protein  39.06 
 
 		 195 aa  148  1.0000000000000001e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.734734  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0200  hypothetical protein  40.31 
 
 		 191 aa  148  1.0000000000000001e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.423749 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1322  GTP-binding domain protein  34.01 
 
 		 270 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.886624  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4339  hypothetical protein  39.79 
 
 		 191 aa  146  4.0000000000000006e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.34683  normal  0.137501 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1154  GTPase-like  41.97 
 
 		 356 aa  144  1e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1214  GTPase-like protein  41.45 
 
 		 352 aa  143  3e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.504628  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1284  GTPase-like protein  41.45 
 
 		 355 aa  143  3e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1654  gliding motility protein (MglA)  36.95 
 
 		 205 aa  135  7.000000000000001e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.690375  normal  0.185219 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0931  hypothetical protein  36.13 
 
 		 191 aa  132  5e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.618949  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2679  hypothetical protein  37.44 
 
 		 195 aa  131  1.0000000000000001e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000233464 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4477  MglA protein  35.96 
 
 		 230 aa  129  8.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0711351  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0318  gliding motility protein (MglA)  36.84 
 
 		 205 aa  127  2.0000000000000002e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.667045  normal  0.990393 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4322  MglA protein  34.62 
 
 		 230 aa  126  3e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4458  MglA protein  34.98 
 
 		 230 aa  124  1e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.417222  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4467  MglA protein  36.6 
 
 		 271 aa  125  1e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.152863  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2556  hypothetical protein  33.82 
 
 		 220 aa  121  1.9999999999999998e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000851913 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0968  MglA protein  33.86 
 
 		 214 aa  113  5e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2366  hypothetical protein  30.92 
 
 		 223 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3475  hypothetical protein  33.51 
 
 		 225 aa  105  1e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1007  hypothetical protein  25.41 
 
 		 174 aa  51.6  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43732  predicted protein  29.73 
 
 		 193 aa  49.3  0.00008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0105149  normal  0.152758 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2114  GTP-binding protein, HSR1-related  29.41 
 
 		 330 aa  48.1  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2206  small GTP-binding protein  27.41 
 
 		 188 aa  45.8  0.0007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.32077  normal  0.0744426 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2576  small GTP-binding protein  27.41 
 
 		 188 aa  45.8  0.0007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1842  TGS domain protein  28.88 
 
 		 330 aa  43.9  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.2616  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3637  hypothetical protein  25.94 
 
 		 218 aa  43.5  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2141  small GTP-binding protein  22.65 
 
 		 176 aa  42.4  0.01  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>