61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_3962 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_3962  GTPase-like protein  100 
 
 		 195 aa  400  1e-111  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0107752  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4048  GTPase-like protein  99.49 
 
 		 195 aa  398  9.999999999999999e-111  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4332  GTPase-like protein  93.33 
 
 		 195 aa  384  1e-106  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00853129  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3417  MglA protein  92.82 
 
 		 195 aa  377  1e-104  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2940  MglA protein  90.77 
 
 		 195 aa  371  1e-102  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.136868  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3124  MglA protein  91.28 
 
 		 195 aa  373  1e-102  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000166676  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0099  MglA protein  90.26 
 
 		 195 aa  367  1e-101  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3758  MglA protein  86.6 
 
 		 195 aa  349  1e-95  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.39742  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3774  MglA protein  86.08 
 
 		 195 aa  347  5e-95  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.34274  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3691  MglA protein  86.08 
 
 		 195 aa  347  5e-95  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.956582  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3633  MglA protein  86.08 
 
 		 195 aa  347  5e-95  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0379  mutual gliding protein A, small GTPase  84.62 
 
 		 196 aa  347  7e-95  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.844729  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6866  MglA protein  81.96 
 
 		 195 aa  335  1.9999999999999998e-91  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.318166 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0708  MglA protein  74.23 
 
 		 194 aa  301  3.0000000000000004e-81  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1815  gliding motility protein  63.27 
 
 		 196 aa  253  1.0000000000000001e-66  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1713  MglA protein  64.55 
 
 		 196 aa  252  3e-66  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.369936  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2006  gliding motility protein  63.49 
 
 		 196 aa  249  3e-65  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.142347  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1356  MglA protein  60.51 
 
 		 195 aa  246  1e-64  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.734734  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1214  GTPase-like protein  56.54 
 
 		 352 aa  237  1e-61  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.504628  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1284  GTPase-like protein  56.54 
 
 		 355 aa  236  1e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1154  GTPase-like  56.54 
 
 		 356 aa  236  2e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0200  hypothetical protein  56.02 
 
 		 191 aa  236  2e-61  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.423749 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4339  hypothetical protein  55.5 
 
 		 191 aa  235  3e-61  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.34683  normal  0.137501 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1201  GTPase-like protein  56.25 
 
 		 335 aa  233  9e-61  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.595525  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0931  hypothetical protein  54.97 
 
 		 191 aa  233  1.0000000000000001e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.618949  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2679  hypothetical protein  53.85 
 
 		 195 aa  224  6e-58  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000233464 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0318  gliding motility protein (MglA)  53.68 
 
 		 205 aa  200  8e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.667045  normal  0.990393 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2372  gliding motility protein (MglA)  51.52 
 
 		 204 aa  200  9e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2812  hypothetical protein  45.6 
 
 		 305 aa  185  4e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1982  GTP-binding domain-containing protein  45.31 
 
 		 289 aa  182  3e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.079955  normal  0.121874 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2315  hypothetical protein  44.79 
 
 		 289 aa  179  2e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000111137  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1654  gliding motility protein (MglA)  45.96 
 
 		 205 aa  178  4.999999999999999e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.690375  normal  0.185219 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1908  hypothetical protein  43.75 
 
 		 281 aa  175  3e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.102679 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4477  MglA protein  44.81 
 
 		 230 aa  161  6e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0711351  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2556  hypothetical protein  46.11 
 
 		 220 aa  161  7e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000851913 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4322  MglA protein  42.13 
 
 		 230 aa  159  2e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3475  hypothetical protein  45.56 
 
 		 225 aa  159  2e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4458  MglA protein  44.26 
 
 		 230 aa  159  2e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.417222  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4467  MglA protein  43.92 
 
 		 271 aa  157  8e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.152863  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2366  hypothetical protein  41.81 
 
 		 223 aa  153  2e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0968  MglA protein  41.04 
 
 		 214 aa  144  7.0000000000000006e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1930  GTP-binding domain-containing protein  38.66 
 
 		 291 aa  142  4e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0659  GTP-binding domain-containing protein  40.43 
 
 		 293 aa  140  9e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1322  GTP-binding domain protein  34.72 
 
 		 270 aa  115  6e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.886624  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1007  hypothetical protein  33.91 
 
 		 174 aa  76.6  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1730  small GTP-binding protein  28.99 
 
 		 176 aa  50.1  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01126  ADP-ribosylation factor (Broad)  31.67 
 
 		 183 aa  49.7  0.00003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.529772  normal  0.310407 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2141  small GTP-binding protein  28.99 
 
 		 176 aa  49.3  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0457  small GTP-binding protein  34.11 
 
 		 168 aa  48.5  0.00006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0486938 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2190  small GTP-binding protein  28.74 
 
 		 161 aa  47.4  0.0001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0379  small GTP-binding protein  26.19 
 
 		 191 aa  47  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2799  small GTP-binding protein  31.75 
 
 		 176 aa  45.8  0.0004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0639382  normal  0.479363 
 
 
-
 
NC_006681  CNL06630  put. CPS1 protein, putative  28.81 
 
 		 182 aa  45.8  0.0004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.306978  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2067  small GTP-binding protein  24.31 
 
 		 387 aa  45.4  0.0005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.66233  normal  1 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_79956  predicted protein  29.31 
 
 		 181 aa  44.7  0.0008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.803161 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_62979  predicted protein  29.31 
 
 		 180 aa  43.9  0.001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.233166  normal  0.128067 
 
 
-
 
NC_006692  CNG03220  ARF small monomeric GTPase, putative  29.06 
 
 		 182 aa  43.1  0.003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0080  small GTP-binding protein  24.18 
 
 		 177 aa  42.4  0.004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0120715  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43251  predicted protein  27.64 
 
 		 184 aa  42.4  0.004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.8255  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_51064  predicted protein  28.57 
 
 		 181 aa  42  0.006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00000653634  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1262  small GTP-binding protein  24.86 
 
 		 187 aa  41.2  0.009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00000054589  decreased coverage  0.00000000022616 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>