59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_2812 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_2812  hypothetical protein  100 
 
 
305 aa  620  1e-176  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2315  hypothetical protein  45.1 
 
 
289 aa  258  9e-68  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000111137  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1908  hypothetical protein  45.25 
 
 
281 aa  254  1.0000000000000001e-66  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.102679 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1982  GTP-binding domain-containing protein  39.6 
 
 
289 aa  217  1e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.079955  normal  0.121874 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3124  MglA protein  46.63 
 
 
195 aa  194  2e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000166676  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0099  MglA protein  47.67 
 
 
195 aa  193  4e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3417  MglA protein  46.11 
 
 
195 aa  189  5e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4332  GTPase-like protein  45.6 
 
 
195 aa  189  5.999999999999999e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00853129  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1930  GTP-binding domain-containing protein  43.4 
 
 
291 aa  187  2e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3758  MglA protein  45.13 
 
 
195 aa  186  3e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.39742  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4048  GTPase-like protein  46.11 
 
 
195 aa  186  3e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0379  mutual gliding protein A, small GTPase  45.6 
 
 
196 aa  186  6e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.844729  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3962  GTPase-like protein  45.6 
 
 
195 aa  185  1.0000000000000001e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0107752  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6866  MglA protein  45.13 
 
 
195 aa  185  1.0000000000000001e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.318166 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1815  gliding motility protein  44.33 
 
 
196 aa  184  2.0000000000000003e-45  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3691  MglA protein  44.62 
 
 
195 aa  184  2.0000000000000003e-45  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.956582  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3774  MglA protein  44.62 
 
 
195 aa  184  2.0000000000000003e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.34274  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3633  MglA protein  44.62 
 
 
195 aa  184  2.0000000000000003e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2940  MglA protein  44.56 
 
 
195 aa  182  7e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.136868  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2006  gliding motility protein  44.79 
 
 
196 aa  179  4.999999999999999e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.142347  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1713  MglA protein  44.39 
 
 
196 aa  178  8e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.369936  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1201  GTPase-like protein  46.35 
 
 
335 aa  177  2e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.595525  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1214  GTPase-like protein  45.03 
 
 
352 aa  171  1e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.504628  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1154  GTPase-like  45.03 
 
 
356 aa  171  1e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1284  GTPase-like protein  45.03 
 
 
355 aa  171  2e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0708  MglA protein  43.75 
 
 
194 aa  166  5.9999999999999996e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4339  hypothetical protein  43.98 
 
 
191 aa  162  7e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.34683  normal  0.137501 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0200  hypothetical protein  43.98 
 
 
191 aa  162  9e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.423749 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0931  hypothetical protein  41.88 
 
 
191 aa  159  8e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.618949  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1356  MglA protein  43.23 
 
 
195 aa  158  1e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.734734  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2679  hypothetical protein  42.56 
 
 
195 aa  155  1e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000233464 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0659  GTP-binding domain-containing protein  40.93 
 
 
293 aa  154  2e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2372  gliding motility protein (MglA)  40.3 
 
 
204 aa  152  8.999999999999999e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0318  gliding motility protein (MglA)  40.49 
 
 
205 aa  147  2.0000000000000003e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.667045  normal  0.990393 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1654  gliding motility protein (MglA)  37.13 
 
 
205 aa  136  4e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.690375  normal  0.185219 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4477  MglA protein  36.24 
 
 
230 aa  136  5e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0711351  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4467  MglA protein  36.61 
 
 
271 aa  134  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.152863  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4322  MglA protein  34.93 
 
 
230 aa  133  3.9999999999999996e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4458  MglA protein  35.37 
 
 
230 aa  132  6.999999999999999e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.417222  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2556  hypothetical protein  38.59 
 
 
220 aa  130  3e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000851913 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2366  hypothetical protein  33.17 
 
 
223 aa  124  2e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3475  hypothetical protein  32.7 
 
 
225 aa  122  7e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0968  MglA protein  34.44 
 
 
214 aa  117  3e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1322  GTP-binding domain protein  35.05 
 
 
270 aa  114  3e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.886624  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1007  hypothetical protein  28.65 
 
 
174 aa  60.1  0.00000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2141  small GTP-binding protein  24.04 
 
 
176 aa  45.1  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2799  small GTP-binding protein  27.12 
 
 
176 aa  44.7  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0639382  normal  0.479363 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0683  hypothetical protein  37.5 
 
 
960 aa  44.3  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.439939  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1730  small GTP-binding protein  25.2 
 
 
176 aa  44.3  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006684  CNB03430  SAR small monomeric GTPase, putative  26.99 
 
 
189 aa  43.9  0.003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.000269904  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1398  hypothetical protein  35.71 
 
 
955 aa  43.5  0.004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1256  hypothetical protein  35.71 
 
 
963 aa  43.5  0.004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2353  hypothetical protein  35.71 
 
 
963 aa  43.5  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00000463521  unclonable  0.00000047318 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4179  hypothetical protein  35.71 
 
 
969 aa  43.5  0.005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0837304  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1184  hypothetical protein  35.71 
 
 
955 aa  43.5  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0948  hypothetical protein  37.5 
 
 
962 aa  42.4  0.009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.711504  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2394  hypothetical protein  37.5 
 
 
962 aa  42.4  0.009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2186  hypothetical protein  37.5 
 
 
962 aa  42.4  0.009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3915  protein of unknown function, ATP binding  23.77 
 
 
177 aa  42.4  0.01  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.397203  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>