49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_4179 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009719  Plav_3424  hypothetical protein  92.78 
 
 
956 aa  1810    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.38542 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1256  hypothetical protein  93.7 
 
 
963 aa  1843    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2186  hypothetical protein  80.09 
 
 
962 aa  1509    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2394  hypothetical protein  80.51 
 
 
962 aa  1519    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0859  hypothetical protein  67.27 
 
 
889 aa  1202    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0683  hypothetical protein  79.73 
 
 
960 aa  1535    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.439939  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2948  Type IV secretory pathway VirB4 components-like protein  63.18 
 
 
913 aa  1170    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4515  type IV secretory pathway, VirB4 component  60.86 
 
 
983 aa  1167    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36280  lipoprotein  64.28 
 
 
973 aa  1218    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3705  hypothetical protein  51.65 
 
 
948 aa  947    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1398  hypothetical protein  93.59 
 
 
955 aa  1855    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0337  putative plasmid-related protein  50.64 
 
 
952 aa  913    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.92337  normal  0.715711 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4086  putative plasmid-related protein  49.74 
 
 
954 aa  914    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4169  putative plasmid-related protein  50.86 
 
 
954 aa  912    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.660111  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1164  hypothetical protein  93.09 
 
 
659 aa  1217    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.146013  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4179  hypothetical protein  100 
 
 
969 aa  1986    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0837304  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3330  hypothetical protein  63.4 
 
 
913 aa  1169    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.543175  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0948  hypothetical protein  78.74 
 
 
962 aa  1523    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.711504  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2859  AAA ATPase  78.09 
 
 
960 aa  1522    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0502  hypothetical protein  78.06 
 
 
978 aa  1486    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.147471  normal 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3926  hypothetical protein  44.31 
 
 
1042 aa  842    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0435  hypothetical protein  80.31 
 
 
949 aa  1560    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.544746  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59940  hypothetical protein  60.73 
 
 
980 aa  1155    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.163365  hitchhiker  0.00000000104179 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1764  hypothetical protein  50.61 
 
 
938 aa  918    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2353  hypothetical protein  93.7 
 
 
963 aa  1841    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00000463521  unclonable  0.00000047318 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1184  hypothetical protein  94.21 
 
 
955 aa  1828    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0662  hypothetical protein  51.56 
 
 
941 aa  925    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1442  hypothetical protein  65.73 
 
 
1002 aa  1261    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.418268  normal  0.188514 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3023  hypothetical protein  64.32 
 
 
917 aa  1188    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0648  hypothetical protein  45.05 
 
 
908 aa  820    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.685695  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1626  hypothetical protein  82.08 
 
 
949 aa  1623    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2755  hypothetical protein  38.26 
 
 
964 aa  620  1e-176  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.446038  normal  0.940253 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2392  hypothetical protein  28.85 
 
 
924 aa  350  7e-95  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1060  hypothetical protein  27.9 
 
 
916 aa  318  2e-85  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1022  hypothetical protein  27.9 
 
 
916 aa  318  2e-85  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0614  hypothetical protein  58.08 
 
 
240 aa  295  3e-78  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4178  hypothetical protein  24.3 
 
 
874 aa  82.8  0.00000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0161122 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2162  ATPase  22.64 
 
 
847 aa  65.9  0.000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.532567  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0095  type IV conjugative transfer system protein TraC  21.28 
 
 
815 aa  65.9  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.124816 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_4006  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  21.39 
 
 
868 aa  62.4  0.00000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.840318  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5371  Type-IV secretion system protein TraC  22.48 
 
 
864 aa  60.1  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.622531 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0936  putative pillus assembly protein  22.3 
 
 
690 aa  57  0.000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6801  hypothetical protein  22.65 
 
 
864 aa  56.6  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2948  Type IV secretory pathway VirB4 component, ATPase TRAC  22.43 
 
 
841 aa  50.8  0.0001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0731  AAA ATPase  30.52 
 
 
569 aa  47.4  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0912969  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2528  AAA ATPase  22.16 
 
 
621 aa  46.6  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0863  type IV secretion system ATPase VirB4  26.63 
 
 
803 aa  46.6  0.002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3629  Type IV secretory pathway VirB4 protein  24.31 
 
 
866 aa  47  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0016  hypothetical protein  23.78 
 
 
938 aa  45.8  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>