211 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_0731 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013385  Adeg_0731  AAA ATPase  100 
 
 		 569 aa  1145    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0912969  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0714  Type IV secretory pathway VirB4 components-like protein  36.44 
 
 		 611 aa  374  1e-102  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2528  AAA ATPase  34.92 
 
 		 621 aa  358  9.999999999999999e-98  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0931  hypothetical protein  32.03 
 
 		 616 aa  324  3e-87  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_2973  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  30.02 
 
 		 659 aa  212  1e-53  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0177  hypothetical protein  27.21 
 
 		 696 aa  198  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6849  type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  28.89 
 
 		 608 aa  180  5.999999999999999e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0610151  normal  0.925039 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2548  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  28.37 
 
 		 629 aa  178  2e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0379852  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1693  Type IV secretory pathway VirB4 components-like  28.47 
 
 		 629 aa  175  1.9999999999999998e-42  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.000521447  normal  0.17897 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0025  hypothetical protein  25.21 
 
 		 699 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0132  hypothetical protein  25.21 
 
 		 699 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000387943 
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0226  hypothetical protein  25.21 
 
 		 699 aa  172  2e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2744  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  28.42 
 
 		 630 aa  170  7e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00908166  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4080  type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  28.29 
 
 		 631 aa  164  3e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.020005  normal  0.0495521 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8579  type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  27.24 
 
 		 595 aa  163  7e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.161073  normal  0.268088 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6728  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  27.02 
 
 		 657 aa  147  3e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.726364  normal  0.776114 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3127  hypothetical protein  21.23 
 
 		 610 aa  139  8.999999999999999e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4995  hypothetical protein  24.77 
 
 		 893 aa  122  1.9999999999999998e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.124549  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0914  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  24.59 
 
 		 1043 aa  111  3e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0167  hypothetical protein  27.15 
 
 		 322 aa  107  6e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0100015  hitchhiker  6.88403e-24 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1395  type IV secretory pathway VirB4 components-like protein  24.29 
 
 		 616 aa  102  2e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0290868  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0179  membrane bound ATPase, putative  20.84 
 
 		 955 aa  99.8  1e-19  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1815  putative type IV secretory pathway VirB4 protein  21.47 
 
 		 747 aa  99.4  2e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1056  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  22.58 
 
 		 566 aa  97.4  5e-19  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000236301  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2211  Type IV secretory pathway VirB4 components-like protein  23.52 
 
 		 618 aa  96.7  1e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.165062 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1816  truncated type IV secretory pathway VirB4 component protein  26.04 
 
 		 668 aa  90.9  6e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4226  hypothetical protein  22.42 
 
 		 827 aa  88.2  4e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_4006  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  25.81 
 
 		 868 aa  88.2  4e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.840318  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8941  hypothetical protein  28.3 
 
 		 505 aa  87.8  5e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.57395  normal  0.334134 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5371  Type-IV secretion system protein TraC  26.48 
 
 		 864 aa  87.8  5e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.622531 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0371  F-pilin subunit assembly into extended F pili  23.82 
 
 		 809 aa  87  9e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.221651  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5435  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  28.17 
 
 		 515 aa  86.3  0.000000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.62909  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2162  ATPase  25 
 
 		 847 aa  86.7  0.000000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.532567  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1287  Tn5252, Orf26  22.08 
 
 		 776 aa  85.1  0.000000000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0301  hypothetical protein  21.01 
 
 		 818 aa  85.5  0.000000000000003  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0733022  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1502  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  20.81 
 
 		 609 aa  85.1  0.000000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18940  hypothetical protein  23.18 
 
 		 908 aa  85.1  0.000000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0727779 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1505  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  23.79 
 
 		 836 aa  84.3  0.000000000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0609191  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4709  hypothetical protein  25.52 
 
 		 511 aa  83.2  0.00000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0831911  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0565  hypothetical protein  21.57 
 
 		 945 aa  81.6  0.00000000000003  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2753  hypothetical protein  20.39 
 
 		 610 aa  81.3  0.00000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0791  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  23.41 
 
 		 815 aa  80.5  0.00000000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0687  ATP-binding protein  25.98 
 
 		 502 aa  80.5  0.00000000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0163  hypothetical protein  24.9 
 
 		 323 aa  79.7  0.0000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.427999  hitchhiker  1.86977e-20 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1572  ATP-binding protein  25.4 
 
 		 496 aa  79.3  0.0000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.160192  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7298  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  27.1 
 
 		 696 aa  77  0.0000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.910736  normal  0.0433123 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0028  hypothetical protein  23.16 
 
 		 858 aa  77  0.0000000000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.0798103  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8298  hypothetical protein  26.52 
 
 		 575 aa  76.6  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.237745 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1688  transfer complex protein  22.14 
 
 		 663 aa  76.6  0.000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.330287  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6919  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  23.01 
 
 		 792 aa  74.7  0.000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06770  hypothetical protein  26.44 
 
 		 495 aa  72.8  0.00000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0805  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  29.08 
 
 		 495 aa  72.8  0.00000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0034  Type IV secretory pathway VirB4 components-like  27.52 
 
 		 711 aa  72  0.00000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.694512 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1342  ATP-binding protein  27.13 
 
 		 461 aa  71.2  0.00000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00150  hypothetical protein  25.75 
 
 		 495 aa  71.2  0.00000000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4178  hypothetical protein  24.09 
 
 		 874 aa  71.2  0.00000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0161122 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6206  type IV secretion/conjugal transfer ATPase, VirB4 family  25.65 
 
 		 839 aa  70.1  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.623322  normal  0.0559252 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1089  type-IV secretion system protein TraC  22.67 
 
 		 866 aa  69.3  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3253  type IV secretory pathway VirB4 components-like  26.4 
 
 		 861 aa  68.9  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3057  AAA ATPase  23.92 
 
 		 816 aa  69.3  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2243  ATP-binding protein  25.55 
 
 		 512 aa  68.9  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0095  type IV conjugative transfer system protein TraC  21.81 
 
 		 815 aa  67.8  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.124816 
 
 
-
 
NC_006366  plpl0020  hypothetical protein  25.13 
 
 		 865 aa  66.6  0.000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2964  transfer complex protein  22.7 
 
 		 711 aa  66.6  0.000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0505  type IV secretory pathway VirB4 component, ATPase TraC  26.27 
 
 		 843 aa  66.6  0.000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4376  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  23.39 
 
 		 785 aa  66.2  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.851787 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0255  Type IV secretory pathway AvhB4 protein  21.77 
 
 		 788 aa  64.3  0.000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.849698 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0963  conjugal transfer ATPase TrbE  23.87 
 
 		 813 aa  63.2  0.00000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0518  Type IV secretory pathway VirB4 protein  25.06 
 
 		 845 aa  62.4  0.00000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.832849  normal  0.194578 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0053  hypothetical protein  25.88 
 
 		 547 aa  62.4  0.00000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.594463 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3694  conjugal transfer ATPase TrbE  23.34 
 
 		 820 aa  61.6  0.00000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5240  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like  23.68 
 
 		 779 aa  61.2  0.00000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4943  hypothetical protein  26.99 
 
 		 624 aa  60.8  0.00000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2483  conjugal transfer ATPase TrbE  23.08 
 
 		 814 aa  60.1  0.0000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.260305 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3819  CagE, TrbE, VirB component of type IV transporter system  27.45 
 
 		 791 aa  58.9  0.0000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.321786  normal  0.020067 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0598  conjugal transfer ATPase TrbE  21.64 
 
 		 809 aa  59.3  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.657344  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1137  type IV secretion/conjugal transfer ATPase, VirB4 family  23.67 
 
 		 816 aa  59.3  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4198  conjugal transfer ATPase TrbE  24.26 
 
 		 813 aa  59.7  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.330213  normal  0.981224 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3997  conjugal transfer ATPase TrbE  23.58 
 
 		 812 aa  59.3  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.678924 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2827  conjugal transfer ATPase TrbE  22.88 
 
 		 812 aa  59.3  0.0000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.595122  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5522  hypothetical protein  27.03 
 
 		 516 aa  58.5  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.349353  normal  0.675999 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35690  conjugal transfer ATPase TrbE  23.94 
 
 		 816 aa  58.2  0.0000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2321  conjugal transfer ATPase TrbE  23.62 
 
 		 811 aa  58.5  0.0000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3830  conjugal transfer ATPase TrbE  22.52 
 
 		 818 aa  58.2  0.0000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3629  Type IV secretory pathway VirB4 protein  24.42 
 
 		 866 aa  58.5  0.0000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3976  CagE TrbE VirB component of type IV transporter system  27.45 
 
 		 787 aa  57.8  0.0000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006578  pBT9727_0008  ATPase  21.35 
 
 		 645 aa  57.4  0.0000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8472  hypothetical protein  22.89 
 
 		 830 aa  57.8  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.547779  normal  0.957952 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0936  putative pillus assembly protein  21.62 
 
 		 690 aa  57.4  0.0000008  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3538  conjugal transfer ATPase TrbE  21.61 
 
 		 813 aa  57  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0252817  normal  0.696341 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3641  CagE TrbE VirB component of type IV transporter system  27.1 
 
 		 791 aa  56.2  0.000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.227146 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2508  hypothetical protein  29.1 
 
 		 792 aa  57  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0860063 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0029  conjugal transfer ATP-binding protein TraC  23.64 
 
 		 875 aa  57  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2881  conjugal transfer ATPase TrbE  22.94 
 
 		 812 aa  56.6  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.244722  normal  0.034415 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3176  conjugation protein  20.38 
 
 		 1085 aa  56.2  0.000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6159  type IV secretion system protein VirB4  23.79 
 
 		 789 aa  56.6  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.0089682  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2353  conjugal transfer ATPase TrbE  23.85 
 
 		 816 aa  56.6  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.233122  normal  0.344124 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3854  conjugal transfer ATPase TrbE  22.05 
 
 		 830 aa  55.5  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0508748  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6801  hypothetical protein  23.25 
 
 		 864 aa  56.2  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2030  conjugal transfer ATPase TrbE  24.28 
 
 		 813 aa  56.2  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>