91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_3629 on replicon NC_014214
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014214  Mesil_3629  Type IV secretory pathway VirB4 protein  100 
 
 		 866 aa  1759    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0518  Type IV secretory pathway VirB4 protein  32.57 
 
 		 845 aa  364  4e-99  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.832849  normal  0.194578 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0505  type IV secretory pathway VirB4 component, ATPase TraC  32.45 
 
 		 843 aa  354  5e-96  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2948  Type IV secretory pathway VirB4 component, ATPase TRAC  29.56 
 
 		 841 aa  262  3e-68  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3253  type IV secretory pathway VirB4 components-like  22.95 
 
 		 861 aa  96.7  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0253  sex pilus assembly protein  26.02 
 
 		 815 aa  88.2  7e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0931  hypothetical protein  22.79 
 
 		 616 aa  87  0.000000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1395  type IV secretory pathway VirB4 components-like protein  27.05 
 
 		 616 aa  86.7  0.000000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0290868  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0301  hypothetical protein  22.2 
 
 		 818 aa  86.7  0.000000000000002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0733022  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0371  F-pilin subunit assembly into extended F pili  26.25 
 
 		 809 aa  85.9  0.000000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.221651  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0936  putative pillus assembly protein  24.15 
 
 		 690 aa  85.5  0.000000000000004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_2973  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  24.07 
 
 		 659 aa  85.5  0.000000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0714  Type IV secretory pathway VirB4 components-like protein  22.3 
 
 		 611 aa  85.5  0.000000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0316  sex pilus assembly protein  25.06 
 
 		 815 aa  82  0.00000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0095  type IV conjugative transfer system protein TraC  23.61 
 
 		 815 aa  79.3  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.124816 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2211  Type IV secretory pathway VirB4 components-like protein  26.61 
 
 		 618 aa  79.3  0.0000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.165062 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1815  putative type IV secretory pathway VirB4 protein  22.83 
 
 		 747 aa  77.8  0.0000000000007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5371  Type-IV secretion system protein TraC  25.19 
 
 		 864 aa  74.7  0.000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.622531 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1535  hypothetical protein  26.3 
 
 		 860 aa  73.9  0.00000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.324807 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2162  ATPase  23.76 
 
 		 847 aa  73.2  0.00000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.532567  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6801  hypothetical protein  26.89 
 
 		 864 aa  72.4  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4995  hypothetical protein  21.7 
 
 		 893 aa  71.2  0.00000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.124549  n/a   
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4178  hypothetical protein  24.82 
 
 		 874 aa  70.9  0.00000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0161122 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6919  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  23.37 
 
 		 792 aa  70.1  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2528  AAA ATPase  22.57 
 
 		 621 aa  69.3  0.0000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006366  plpl0020  hypothetical protein  23.86 
 
 		 865 aa  68.6  0.0000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0028  hypothetical protein  24.92 
 
 		 858 aa  68.6  0.0000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.0798103  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3777  sex pilus assembly protein  23.33 
 
 		 816 aa  68.2  0.0000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.899145  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6849  type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  25.3 
 
 		 608 aa  67.8  0.0000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0610151  normal  0.925039 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7298  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  24.17 
 
 		 696 aa  67.4  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.910736  normal  0.0433123 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0029  conjugal transfer ATP-binding protein TraC  26.49 
 
 		 875 aa  67.8  0.000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4226  hypothetical protein  24.94 
 
 		 827 aa  66.2  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2744  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  25.07 
 
 		 630 aa  64.3  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00908166  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2653  hypothetical protein  25.14 
 
 		 855 aa  63.9  0.00000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.696195  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2320  hypothetical protein  25 
 
 		 855 aa  64.3  0.00000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.121695  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0034  Type IV secretory pathway VirB4 components-like  23.58 
 
 		 711 aa  63.9  0.00000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.694512 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0179  membrane bound ATPase, putative  23.25 
 
 		 955 aa  62.8  0.00000003  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2548  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  23.1 
 
 		 629 aa  62.4  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0379852  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1688  transfer complex protein  20.64 
 
 		 663 aa  62  0.00000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.330287  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4290  conjugal transfer ATP-binding protein TraC  26 
 
 		 866 aa  61.6  0.00000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_4006  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  24.55 
 
 		 868 aa  61.2  0.00000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.840318  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8579  type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  23.14 
 
 		 595 aa  61.2  0.00000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.161073  normal  0.268088 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1056  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  28.28 
 
 		 566 aa  60.8  0.0000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000236301  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18940  hypothetical protein  25 
 
 		 908 aa  60.5  0.0000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0727779 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1525  AAA ATPase  32.11 
 
 		 624 aa  59.7  0.0000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.368938  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4080  type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  23.77 
 
 		 631 aa  58.9  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.020005  normal  0.0495521 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0731  AAA ATPase  24.42 
 
 		 569 aa  58.2  0.0000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0912969  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1287  Tn5252, Orf26  24.82 
 
 		 776 aa  58.2  0.0000008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3545  Type IV secretory pathway VirB4 components-like protein  19.59 
 
 		 811 aa  57  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0653304  n/a   
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5240  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like  24.48 
 
 		 779 aa  56.6  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2190  AAA ATPase  25.74 
 
 		 622 aa  55.8  0.000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.0020112  hitchhiker  0.0000768998 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1693  Type IV secretory pathway VirB4 components-like  23.46 
 
 		 629 aa  55.8  0.000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.000521447  normal  0.17897 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4357  Type IV secretory pathway VirB4 components-like protein  19.33 
 
 		 819 aa  55.1  0.000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.471619  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1342  ATP-binding protein  23.3 
 
 		 461 aa  54.3  0.000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6224  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  21.73 
 
 		 860 aa  53.9  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.628877  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1505  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  34.18 
 
 		 836 aa  53.9  0.00001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0609191  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5435  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  23.62 
 
 		 515 aa  53.5  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.62909  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8941  hypothetical protein  23.51 
 
 		 505 aa  52.4  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.57395  normal  0.334134 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0791  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  22.14 
 
 		 815 aa  52  0.00005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5109  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like  26.1 
 
 		 695 aa  50.4  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4627  type-IV secretion system protein TraC  23.42 
 
 		 862 aa  49.7  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.997489 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0025  hypothetical protein  29.17 
 
 		 699 aa  49.7  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0226  hypothetical protein  29.17 
 
 		 699 aa  50.1  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6709  hypothetical protein  19.86 
 
 		 845 aa  50.4  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.534859  normal  0.161214 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4442  Type-IV secretion system protein TraC  23.42 
 
 		 862 aa  49.7  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2503  CagE, TrbE, VirB component of type IV transporter system  24.15 
 
 		 814 aa  50.1  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0132  hypothetical protein  29.17 
 
 		 699 aa  49.7  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000387943 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4535  type-IV secretion system protein TraC  23.42 
 
 		 862 aa  49.7  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.862751 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4438  type-IV secretion system protein TraC  23.42 
 
 		 862 aa  49.7  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.314552  normal  1 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4378  type-IV secretion system protein TraC  23.42 
 
 		 862 aa  49.7  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1199  hypothetical protein  23.28 
 
 		 898 aa  50.1  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_08  conjugative transfer protein TraC  24.68 
 
 		 843 aa  49.3  0.0003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4502  type-IV secretion system protein TraC  23.69 
 
 		 862 aa  48.5  0.0005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3424  hypothetical protein  24.62 
 
 		 956 aa  48.1  0.0007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.38542 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1256  hypothetical protein  24 
 
 		 963 aa  47.8  0.0009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2392  hypothetical protein  23.18 
 
 		 924 aa  47.8  0.0009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1398  hypothetical protein  24 
 
 		 955 aa  47.4  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4851  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  24.94 
 
 		 826 aa  47.8  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3315  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  24.94 
 
 		 826 aa  47.8  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6728  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  23.43 
 
 		 657 aa  47.4  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.726364  normal  0.776114 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1022  hypothetical protein  22.27 
 
 		 916 aa  47  0.002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4179  hypothetical protein  24.31 
 
 		 969 aa  47  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0837304  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1060  hypothetical protein  22.27 
 
 		 916 aa  47  0.002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4485  hypothetical protein  22.84 
 
 		 897 aa  45.8  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2353  hypothetical protein  22.37 
 
 		 963 aa  46.2  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00000463521  unclonable  0.00000047318 
 
 
-
 
NC_010509  Mrad2831_6325  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  30.14 
 
 		 829 aa  45.4  0.004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1184  hypothetical protein  23.69 
 
 		 955 aa  45.4  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4562  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  22.84 
 
 		 805 aa  45.1  0.005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.733697  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3057  AAA ATPase  24.6 
 
 		 816 aa  44.7  0.007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0066  traU protein  26.63 
 
 		 1018 aa  44.7  0.008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.865  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0911  ATPase-like protein  23.46 
 
 		 989 aa  44.3  0.009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>