197 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_4080 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_2744  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  59.46 
 
 
630 aa  652    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00908166  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1693  Type IV secretory pathway VirB4 components-like  60.81 
 
 
629 aa  674    Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.000521447  normal  0.17897 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6849  type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  60.27 
 
 
608 aa  694    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0610151  normal  0.925039 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2548  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  58.82 
 
 
629 aa  685    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0379852  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4080  type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  100 
 
 
631 aa  1253    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.020005  normal  0.0495521 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8579  type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  57.02 
 
 
595 aa  621  1e-177  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.161073  normal  0.268088 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6728  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  54.34 
 
 
657 aa  533  1e-150  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.726364  normal  0.776114 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0714  Type IV secretory pathway VirB4 components-like protein  28.3 
 
 
611 aa  241  2e-62  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1815  putative type IV secretory pathway VirB4 protein  26.72 
 
 
747 aa  191  4e-47  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2528  AAA ATPase  26.22 
 
 
621 aa  185  2.0000000000000003e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0731  AAA ATPase  28.47 
 
 
569 aa  181  4e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0912969  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0931  hypothetical protein  24.52 
 
 
616 aa  163  1e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1287  Tn5252, Orf26  23.21 
 
 
776 aa  159  2e-37  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0914  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  26.61 
 
 
1043 aa  153  1e-35  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4995  hypothetical protein  22.49 
 
 
893 aa  144  5e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.124549  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1505  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  25.7 
 
 
836 aa  142  3e-32  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0609191  normal 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0177  hypothetical protein  23.33 
 
 
696 aa  141  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0791  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  26.46 
 
 
815 aa  140  4.999999999999999e-32  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18940  hypothetical protein  26.03 
 
 
908 aa  137  5e-31  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0727779 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3127  hypothetical protein  25.04 
 
 
610 aa  135  1.9999999999999998e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_2973  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  26.35 
 
 
659 aa  135  3e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2211  Type IV secretory pathway VirB4 components-like protein  27.15 
 
 
618 aa  130  1.0000000000000001e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.165062 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0371  F-pilin subunit assembly into extended F pili  26.54 
 
 
809 aa  128  4.0000000000000003e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.221651  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1395  type IV secretory pathway VirB4 components-like protein  26.68 
 
 
616 aa  120  9e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0290868  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1056  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  23.92 
 
 
566 aa  119  1.9999999999999998e-25  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000236301  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0025  hypothetical protein  22.51 
 
 
699 aa  118  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0132  hypothetical protein  22.51 
 
 
699 aa  118  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000387943 
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0226  hypothetical protein  22.35 
 
 
699 aa  114  5e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1816  truncated type IV secretory pathway VirB4 component protein  25.71 
 
 
668 aa  110  9.000000000000001e-23  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0095  type IV conjugative transfer system protein TraC  24.38 
 
 
815 aa  110  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.124816 
 
 
-
 
NC_006366  plpl0020  hypothetical protein  28.52 
 
 
865 aa  108  4e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1688  transfer complex protein  24.83 
 
 
663 aa  102  2e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.330287  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0034  Type IV secretory pathway VirB4 components-like  27.39 
 
 
711 aa  97.8  6e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.694512 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06770  hypothetical protein  27.18 
 
 
495 aa  96.7  1e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00150  hypothetical protein  27.11 
 
 
495 aa  94.4  6e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0028  hypothetical protein  27.09 
 
 
858 aa  94  7e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.0798103  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2162  ATPase  24.11 
 
 
847 aa  94  8e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.532567  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6919  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  24.94 
 
 
792 aa  92.8  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5371  Type-IV secretion system protein TraC  29.67 
 
 
864 aa  92.4  2e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.622531 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0936  putative pillus assembly protein  23.33 
 
 
690 aa  92.4  2e-17  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7298  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  27.34 
 
 
696 aa  91.7  3e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.910736  normal  0.0433123 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0805  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  27.11 
 
 
495 aa  91.7  4e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0518  Type IV secretory pathway VirB4 protein  26 
 
 
845 aa  90.5  8e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.832849  normal  0.194578 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_4006  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  26.23 
 
 
868 aa  89.4  2e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.840318  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0505  type IV secretory pathway VirB4 component, ATPase TraC  26.65 
 
 
843 aa  89.4  2e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0253  sex pilus assembly protein  26.16 
 
 
815 aa  88.6  3e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0316  sex pilus assembly protein  26 
 
 
815 aa  85.9  0.000000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4178  hypothetical protein  24.42 
 
 
874 aa  85.5  0.000000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0161122 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1502  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  20.79 
 
 
609 aa  84.3  0.000000000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4226  hypothetical protein  23.37 
 
 
827 aa  82  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_08  conjugative transfer protein TraC  22.25 
 
 
843 aa  82  0.00000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6801  hypothetical protein  26.28 
 
 
864 aa  82  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2948  Type IV secretory pathway VirB4 component, ATPase TRAC  22.96 
 
 
841 aa  81.6  0.00000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4627  type-IV secretion system protein TraC  21.52 
 
 
862 aa  81.3  0.00000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.997489 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4438  type-IV secretion system protein TraC  21.52 
 
 
862 aa  81.3  0.00000000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.314552  normal 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4442  Type-IV secretion system protein TraC  21.52 
 
 
862 aa  80.9  0.00000000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4535  type-IV secretion system protein TraC  21.52 
 
 
862 aa  80.9  0.00000000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.862751 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4378  type-IV secretion system protein TraC  21.52 
 
 
862 aa  80.9  0.00000000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2964  transfer complex protein  24.09 
 
 
711 aa  80.5  0.00000000000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0167  hypothetical protein  24.09 
 
 
322 aa  80.5  0.0000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0100015  hitchhiker  6.88403e-24 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3545  Type IV secretory pathway VirB4 components-like protein  23.38 
 
 
811 aa  80.1  0.0000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0653304  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4357  Type IV secretory pathway VirB4 components-like protein  23.2 
 
 
819 aa  80.1  0.0000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.471619  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06480  type IV secretory pathway VirB4 component-like protein  23.35 
 
 
500 aa  79.7  0.0000000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.132231  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6709  hypothetical protein  24.62 
 
 
845 aa  77.8  0.0000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.534859  normal  0.161214 
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4502  type-IV secretion system protein TraC  21.69 
 
 
862 aa  77.4  0.0000000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0598  conjugal transfer ATPase TrbE  23.1 
 
 
809 aa  77  0.0000000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.657344  normal 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0179  membrane bound ATPase, putative  20.59 
 
 
955 aa  77  0.0000000000009  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8298  hypothetical protein  28.75 
 
 
575 aa  76.6  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.237745 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0565  hypothetical protein  22.5 
 
 
945 aa  75.9  0.000000000002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4290  conjugal transfer ATP-binding protein TraC  22.98 
 
 
866 aa  76.3  0.000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3694  conjugal transfer ATPase TrbE  23.91 
 
 
820 aa  75.9  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3176  conjugation protein  20.66 
 
 
1085 aa  75.5  0.000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5435  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  30.91 
 
 
515 aa  73.9  0.000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.62909  normal 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6224  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  25 
 
 
860 aa  73.9  0.000000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.628877  normal 
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3629  Type IV secretory pathway VirB4 protein  24.07 
 
 
866 aa  73.2  0.00000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8941  hypothetical protein  27.68 
 
 
505 aa  73.2  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.57395  normal  0.334134 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3253  type IV secretory pathway VirB4 components-like  25.62 
 
 
861 aa  72.8  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0315  conjugal transfer ATPase TrbE  24.13 
 
 
821 aa  73.2  0.00000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1089  type-IV secretion system protein TraC  23.59 
 
 
866 aa  72  0.00000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35690  conjugal transfer ATPase TrbE  23.42 
 
 
816 aa  71.2  0.00000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1481  conjugative transposon protein TraG  23.3 
 
 
841 aa  71.2  0.00000000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.612602 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2753  hypothetical protein  19.61 
 
 
610 aa  70.9  0.00000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0029  conjugal transfer ATP-binding protein TraC  23.33 
 
 
875 aa  70.1  0.0000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5240  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like  26.96 
 
 
779 aa  69.7  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4709  hypothetical protein  24.88 
 
 
511 aa  68.9  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0831911  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2483  conjugal transfer ATPase TrbE  23.44 
 
 
814 aa  68.9  0.0000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.260305 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1285  conjugal transfer ATPase TrbE  23.05 
 
 
816 aa  68.6  0.0000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2321  conjugal transfer ATPase TrbE  22.64 
 
 
811 aa  68.2  0.0000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3854  conjugal transfer ATPase TrbE  24.53 
 
 
830 aa  68.2  0.0000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0508748  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2353  conjugal transfer ATPase TrbE  23.23 
 
 
816 aa  68.2  0.0000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.233122  normal  0.344124 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3004  Type IV secretory pathway VirB4 components-like protein  22.16 
 
 
837 aa  67.8  0.0000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2007  conjugal transfer ATPase TrbE  23.05 
 
 
816 aa  67.4  0.0000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.581672  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3322  putative ATP-binding protein  23.5 
 
 
480 aa  67  0.0000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.540198 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2827  conjugal transfer ATPase TrbE  21.81 
 
 
812 aa  66.6  0.000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.595122  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2908  conjugal transfer ATPase TrbE  22.66 
 
 
811 aa  67  0.000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.380632  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7443  conjugal transfer ATPase TrbE  24.51 
 
 
809 aa  66.6  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3830  conjugal transfer ATPase TrbE  22.44 
 
 
818 aa  65.9  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1617  CagE, TrbE, VirB component of type IV transporter system, conserved region  22.55 
 
 
819 aa  65.5  0.000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0153  conjugal transfer ATPase TrbE  23.55 
 
 
872 aa  64.3  0.000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2581  conjugal transfer ATPase TrbE  23.19 
 
 
816 aa  63.9  0.000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>