49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_4995 on replicon NC_013746
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013746  Htur_4995  hypothetical protein  100 
 
 		 893 aa  1820    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.124549  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1688  transfer complex protein  30.61 
 
 		 663 aa  256  2.0000000000000002e-66  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.330287  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3176  conjugation protein  28.14 
 
 		 1085 aa  202  1.9999999999999998e-50  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2964  transfer complex protein  26.48 
 
 		 711 aa  172  3e-41  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2744  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  25.88 
 
 		 630 aa  154  5.9999999999999996e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00908166  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2548  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  25.7 
 
 		 629 aa  150  1.0000000000000001e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0379852  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1693  Type IV secretory pathway VirB4 components-like  25.88 
 
 		 629 aa  147  7.0000000000000006e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.000521447  normal  0.17897 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6849  type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  23.79 
 
 		 608 aa  130  9.000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0610151  normal  0.925039 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8579  type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  22.98 
 
 		 595 aa  130  9.000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.161073  normal  0.268088 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1056  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  22.97 
 
 		 566 aa  129  2.0000000000000002e-28  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000236301  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4080  type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  22.24 
 
 		 631 aa  128  5e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.020005  normal  0.0495521 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0731  AAA ATPase  24.77 
 
 		 569 aa  122  3.9999999999999996e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0912969  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0714  Type IV secretory pathway VirB4 components-like protein  23.8 
 
 		 611 aa  121  4.9999999999999996e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2528  AAA ATPase  22.99 
 
 		 621 aa  120  7.999999999999999e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0931  hypothetical protein  24.56 
 
 		 616 aa  116  2.0000000000000002e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18940  hypothetical protein  22.11 
 
 		 908 aa  108  4e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0727779 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1816  truncated type IV secretory pathway VirB4 component protein  23.81 
 
 		 668 aa  105  3e-21  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0179  membrane bound ATPase, putative  23.26 
 
 		 955 aa  100  2e-19  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1815  putative type IV secretory pathway VirB4 protein  20.69 
 
 		 747 aa  98.2  5e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1505  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  23.61 
 
 		 836 aa  98.2  7e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0609191  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0914  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  22.75 
 
 		 1043 aa  96.7  2e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0791  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  23.52 
 
 		 815 aa  94  1e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_2973  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  22.89 
 
 		 659 aa  89.4  3e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1287  Tn5252, Orf26  20.54 
 
 		 776 aa  89  4e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0177  hypothetical protein  22 
 
 		 696 aa  81.3  0.00000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6728  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  26.09 
 
 		 657 aa  80.9  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.726364  normal  0.776114 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2211  Type IV secretory pathway VirB4 components-like protein  23.19 
 
 		 618 aa  80.5  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.165062 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3127  hypothetical protein  19.92 
 
 		 610 aa  78.2  0.0000000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0565  hypothetical protein  19.68 
 
 		 945 aa  78.2  0.0000000000007  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0025  hypothetical protein  20.83 
 
 		 699 aa  76.3  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0132  hypothetical protein  20.83 
 
 		 699 aa  76.3  0.000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000387943 
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0226  hypothetical protein  20.59 
 
 		 699 aa  72.8  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3629  Type IV secretory pathway VirB4 protein  21.7 
 
 		 866 aa  70.9  0.00000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1395  type IV secretory pathway VirB4 components-like protein  22.85 
 
 		 616 aa  65.5  0.000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0290868  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1502  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  20.99 
 
 		 609 aa  59.7  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006578  pBT9727_0008  ATPase  23.5 
 
 		 645 aa  59.3  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0028  hypothetical protein  20.91 
 
 		 858 aa  58.2  0.0000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.0798103  n/a   
 
 
-
 
NC_007323  GBAA_pXO2_0008  hypothetical protein  24.17 
 
 		 644 aa  57.8  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.263896  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0301  hypothetical protein  21.21 
 
 		 818 aa  56.6  0.000002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0733022  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1577  hypothetical protein  27.4 
 
 		 335 aa  54.7  0.000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1342  ATP-binding protein  23.01 
 
 		 461 aa  52  0.00006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2753  hypothetical protein  19.49 
 
 		 610 aa  51.2  0.00009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1367  hypothetical protein  50.75 
 
 		 272 aa  50.8  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06770  hypothetical protein  24.88 
 
 		 495 aa  50.1  0.0002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00150  hypothetical protein  24.4 
 
 		 495 aa  49.3  0.0003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0805  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  23.54 
 
 		 495 aa  49.3  0.0004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3253  type IV secretory pathway VirB4 components-like  19.73 
 
 		 861 aa  48.1  0.0008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2455  poly(R)-hydroxyalkanoic acid synthase, class III, PhaC subunit  43.48 
 
 		 530 aa  47.4  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4357  Type IV secretory pathway VirB4 components-like protein  21.01 
 
 		 819 aa  45.4  0.005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.471619  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>