146 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_3253 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007760  Adeh_3253  type IV secretory pathway VirB4 components-like  100 
 
 		 861 aa  1733    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0095  type IV conjugative transfer system protein TraC  23.63 
 
 		 815 aa  121  4.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.124816 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2948  Type IV secretory pathway VirB4 component, ATPase TRAC  23.8 
 
 		 841 aa  117  1.0000000000000001e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6801  hypothetical protein  24.13 
 
 		 864 aa  109  2e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0371  F-pilin subunit assembly into extended F pili  25.6 
 
 		 809 aa  103  2e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.221651  normal  1 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6919  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  23.17 
 
 		 792 aa  101  7e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4178  hypothetical protein  22.8 
 
 		 874 aa  100  1e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0161122 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0936  putative pillus assembly protein  21.51 
 
 		 690 aa  98.2  5e-19  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0028  hypothetical protein  22.76 
 
 		 858 aa  97.4  9e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.0798103  n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4226  hypothetical protein  24.48 
 
 		 827 aa  96.3  2e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3629  Type IV secretory pathway VirB4 protein  22.95 
 
 		 866 aa  96.3  2e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006366  plpl0020  hypothetical protein  25 
 
 		 865 aa  95.1  5e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3777  sex pilus assembly protein  23.81 
 
 		 816 aa  94.4  8e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.899145  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0518  Type IV secretory pathway VirB4 protein  23.46 
 
 		 845 aa  93.6  1e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.832849  normal  0.194578 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2162  ATPase  25.64 
 
 		 847 aa  85.1  0.000000000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.532567  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_4006  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  26.37 
 
 		 868 aa  84  0.00000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.840318  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0316  sex pilus assembly protein  22.1 
 
 		 815 aa  80.9  0.00000000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0029  conjugal transfer ATP-binding protein TraC  23.34 
 
 		 875 aa  80.5  0.0000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6224  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  22.52 
 
 		 860 aa  79.3  0.0000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.628877  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6849  type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  26.95 
 
 		 608 aa  77  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0610151  normal  0.925039 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0505  type IV secretory pathway VirB4 component, ATPase TraC  23.14 
 
 		 843 aa  77.4  0.000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1535  hypothetical protein  22.28 
 
 		 860 aa  75.5  0.000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.324807 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0253  sex pilus assembly protein  22.38 
 
 		 815 aa  75.1  0.000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5371  Type-IV secretion system protein TraC  23.35 
 
 		 864 aa  74.7  0.000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.622531 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2320  hypothetical protein  21.91 
 
 		 855 aa  74.7  0.000000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.121695  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2653  hypothetical protein  21.91 
 
 		 855 aa  74.3  0.000000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.696195  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1089  type-IV secretion system protein TraC  22.33 
 
 		 866 aa  73.2  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6709  hypothetical protein  19.27 
 
 		 845 aa  72.8  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.534859  normal  0.161214 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1395  type IV secretory pathway VirB4 components-like protein  26.43 
 
 		 616 aa  72  0.00000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0290868  normal  1 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4290  conjugal transfer ATP-binding protein TraC  23.42 
 
 		 866 aa  70.5  0.0000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4378  type-IV secretion system protein TraC  23.11 
 
 		 862 aa  70.1  0.0000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4438  type-IV secretion system protein TraC  23.11 
 
 		 862 aa  69.7  0.0000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.314552  normal  1 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4442  Type-IV secretion system protein TraC  23.11 
 
 		 862 aa  70.1  0.0000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4535  type-IV secretion system protein TraC  23.11 
 
 		 862 aa  70.1  0.0000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.862751 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4627  type-IV secretion system protein TraC  23.11 
 
 		 862 aa  70.1  0.0000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.997489 
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_2973  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  23.28 
 
 		 659 aa  68.9  0.0000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0731  AAA ATPase  26.4 
 
 		 569 aa  68.9  0.0000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0912969  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4566  conjugal transfer protein TrbE  29.22 
 
 		 817 aa  68.2  0.0000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5485  conjugal transfer protein TrbE  27.17 
 
 		 815 aa  67.8  0.0000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00798845  normal  1 
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4502  type-IV secretion system protein TraC  24.44 
 
 		 862 aa  67.4  0.000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_08  conjugative transfer protein TraC  22.66 
 
 		 843 aa  66.2  0.000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3545  Type IV secretory pathway VirB4 components-like protein  20.38 
 
 		 811 aa  65.5  0.000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0653304  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9265  conjugal transfer protein TrbE  26.62 
 
 		 822 aa  63.9  0.00000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.502143  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4080  type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  24.3 
 
 		 631 aa  63.9  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.020005  normal  0.0495521 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1693  Type IV secretory pathway VirB4 components-like  25.26 
 
 		 629 aa  63.2  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.000521447  normal  0.17897 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8331  conjugal transfer protein TrbE  28.31 
 
 		 820 aa  63.2  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.359626  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1191  conjugal transfer ATPase TrbE  25.44 
 
 		 816 aa  62.4  0.00000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.192837  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3544  conjugal transfer ATPase TrbE  25.44 
 
 		 816 aa  62.4  0.00000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0050  conjugal transfer protein TrbE  23.14 
 
 		 845 aa  62  0.00000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2211  Type IV secretory pathway VirB4 components-like protein  25.54 
 
 		 618 aa  61.6  0.00000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.165062 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0179  membrane bound ATPase, putative  22.93 
 
 		 955 aa  61.6  0.00000007  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6206  type IV secretion/conjugal transfer ATPase, VirB4 family  20.99 
 
 		 839 aa  61.2  0.00000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.623322  normal  0.0559252 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3538  conjugal transfer ATPase TrbE  25.43 
 
 		 813 aa  60.5  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0252817  normal  0.696341 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0963  conjugal transfer ATPase TrbE  25.62 
 
 		 813 aa  60.1  0.0000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2881  conjugal transfer ATPase TrbE  25.94 
 
 		 812 aa  59.3  0.0000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.244722  normal  0.034415 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2548  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  25.46 
 
 		 629 aa  58.9  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0379852  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0255  Type IV secretory pathway AvhB4 protein  21.8 
 
 		 788 aa  58.5  0.0000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.849698 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2321  conjugal transfer ATPase TrbE  25.74 
 
 		 811 aa  57  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1764  hypothetical protein  21.51 
 
 		 938 aa  57  0.000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1481  conjugal transfer ATPase TrbE  23.89 
 
 		 836 aa  57  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0386388  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1638  conjugal transfer protein trbE, putative  28.71 
 
 		 840 aa  57  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3367  conjugal transfer ATPase TrbE  25.56 
 
 		 814 aa  57.4  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4357  Type IV secretory pathway VirB4 components-like protein  19.41 
 
 		 819 aa  56.2  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.471619  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1503  conjugal transfer ATPase TrbE  26.42 
 
 		 813 aa  56.6  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.373275  normal  0.784639 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7744  conjugal transfer ATPase TrbE  24.46 
 
 		 812 aa  56.6  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.110925 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3830  conjugal transfer ATPase TrbE  25.06 
 
 		 818 aa  56.6  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4346  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  21.09 
 
 		 793 aa  55.8  0.000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.677673  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5086  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  21.49 
 
 		 790 aa  55.8  0.000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2503  CagE, TrbE, VirB component of type IV transporter system  29.26 
 
 		 814 aa  55.5  0.000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0565  hypothetical protein  21.55 
 
 		 945 aa  55.1  0.000005  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1339  CagE TrbE VirB component of type IV transporter system  28.71 
 
 		 840 aa  55.1  0.000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.18708 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0247  CagE TrbE VirB component of type IV transporter system  28.71 
 
 		 840 aa  55.1  0.000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0746  conjugal transfer ATPase TrbE  25.55 
 
 		 812 aa  55.1  0.000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.369643  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3001  conjugal transfer ATPase TrbE  25.06 
 
 		 812 aa  55.5  0.000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3997  conjugal transfer ATPase TrbE  23.74 
 
 		 812 aa  55.1  0.000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.678924 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0506  conjugal transfer ATPase TrbE  25.51 
 
 		 812 aa  55.1  0.000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.496331  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0153  conjugal transfer ATPase TrbE  24.87 
 
 		 872 aa  55.1  0.000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5372  conjugal transfer ATPase TrbE  31.21 
 
 		 824 aa  55.1  0.000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.259729  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4218  Type IV secretory pathway VirB4 components-like protein  20.51 
 
 		 894 aa  54.7  0.000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.750787 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3854  conjugal transfer ATPase TrbE  23.13 
 
 		 830 aa  54.7  0.000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0508748  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3089  conjugal transfer ATPase TrbE  24.87 
 
 		 812 aa  53.5  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1442  hypothetical protein  21.94 
 
 		 1002 aa  53.9  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.418268  normal  0.188514 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1502  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  21.4 
 
 		 609 aa  53.9  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2348  conjugal transfer ATPase TrbE  28.09 
 
 		 810 aa  53.5  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3197  conjugal transfer ATPase TrbE  23.08 
 
 		 877 aa  53.5  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.468072  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1056  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  27.84 
 
 		 566 aa  53.5  0.00002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000236301  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0714  Type IV secretory pathway VirB4 components-like protein  20.48 
 
 		 611 aa  53.5  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6505  conjugal transfer protein TrbE  23.53 
 
 		 852 aa  52.4  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00158384  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5221  conjugal transfer ATPase TrbE  33.33 
 
 		 819 aa  52.8  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6632  conjugal transfer protein TrbE  23.53 
 
 		 852 aa  52.4  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0411416  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4198  conjugal transfer ATPase TrbE  33.33 
 
 		 813 aa  52.4  0.00003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.330213  normal  0.981224 
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4271  conjugal transfer protein TrbE  30.99 
 
 		 852 aa  52.4  0.00003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.000528773  normal  0.467859 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3976  CagE TrbE VirB component of type IV transporter system  28.72 
 
 		 787 aa  52.8  0.00003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2655  putative Type IV secretion system protein VirB4/TraE  23.29 
 
 		 822 aa  52  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3641  CagE TrbE VirB component of type IV transporter system  28.49 
 
 		 791 aa  52.4  0.00004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.227146 
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2228  conjugal transfer protein TrbE  21.57 
 
 		 854 aa  52  0.00005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0444639  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2827  conjugal transfer ATPase TrbE  26 
 
 		 812 aa  52  0.00005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.595122  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8579  type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  24.66 
 
 		 595 aa  51.6  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.161073  normal  0.268088 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5379  conjugal transfer protein TrbE  26.05 
 
 		 817 aa  51.6  0.00006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.325542 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1838  conjugal transfer ATPase TrbE  32.06 
 
 		 808 aa  51.2  0.00009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>