118 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aaci_2973 on replicon NC_013206
Organism: Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013206  Aaci_2973  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  100 
 
 		 659 aa  1355    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0714  Type IV secretory pathway VirB4 components-like protein  32.34 
 
 		 611 aa  285  2.0000000000000002e-75  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2528  AAA ATPase  28.83 
 
 		 621 aa  238  3e-61  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0931  hypothetical protein  30.07 
 
 		 616 aa  221  3e-56  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0731  AAA ATPase  29.67 
 
 		 569 aa  218  2.9999999999999998e-55  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0912969  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0025  hypothetical protein  26.32 
 
 		 699 aa  186  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0132  hypothetical protein  26.32 
 
 		 699 aa  186  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000387943 
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0226  hypothetical protein  26.32 
 
 		 699 aa  185  2.0000000000000003e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0177  hypothetical protein  25.45 
 
 		 696 aa  179  1e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6849  type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  25.4 
 
 		 608 aa  142  1.9999999999999998e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0610151  normal  0.925039 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2548  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  24.71 
 
 		 629 aa  136  9.999999999999999e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0379852  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4080  type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  26.21 
 
 		 631 aa  135  1.9999999999999998e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.020005  normal  0.0495521 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2744  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  24.96 
 
 		 630 aa  132  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00908166  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1693  Type IV secretory pathway VirB4 components-like  24.44 
 
 		 629 aa  131  4.0000000000000003e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.000521447  normal  0.17897 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6728  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  26.01 
 
 		 657 aa  128  3e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.726364  normal  0.776114 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0167  hypothetical protein  30.14 
 
 		 322 aa  123  9e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0100015  hitchhiker  6.88403e-24 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1395  type IV secretory pathway VirB4 components-like protein  24.39 
 
 		 616 aa  115  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0290868  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8579  type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  23.46 
 
 		 595 aa  114  5e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.161073  normal  0.268088 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0805  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  27.62 
 
 		 495 aa  111  4.0000000000000004e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1815  putative type IV secretory pathway VirB4 protein  21.86 
 
 		 747 aa  111  5e-23  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18940  hypothetical protein  24.6 
 
 		 908 aa  110  9.000000000000001e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0727779 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2211  Type IV secretory pathway VirB4 components-like protein  25.22 
 
 		 618 aa  108  3e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.165062 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1505  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  25.35 
 
 		 836 aa  104  5e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0609191  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0791  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  22.71 
 
 		 815 aa  103  1e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0179  membrane bound ATPase, putative  23.9 
 
 		 955 aa  102  2e-20  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0914  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  23.49 
 
 		 1043 aa  101  4e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6919  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  24.81 
 
 		 792 aa  97.8  5e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3176  conjugation protein  21.48 
 
 		 1085 aa  98.2  5e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0095  type IV conjugative transfer system protein TraC  27.06 
 
 		 815 aa  95.1  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.124816 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4995  hypothetical protein  22.89 
 
 		 893 aa  92.4  2e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.124549  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06770  hypothetical protein  25.7 
 
 		 495 aa  90.9  6e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00150  hypothetical protein  25.81 
 
 		 495 aa  90.5  8e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4226  hypothetical protein  24.06 
 
 		 827 aa  89.7  1e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3629  Type IV secretory pathway VirB4 protein  24.87 
 
 		 866 aa  90.1  1e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0301  hypothetical protein  22.99 
 
 		 818 aa  88.6  3e-16  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0733022  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3545  Type IV secretory pathway VirB4 components-like protein  24.67 
 
 		 811 aa  85.9  0.000000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0653304  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6709  hypothetical protein  25.85 
 
 		 845 aa  84  0.000000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.534859  normal  0.161214 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1502  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  23.17 
 
 		 609 aa  81.6  0.00000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0371  F-pilin subunit assembly into extended F pili  23.29 
 
 		 809 aa  81.3  0.00000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.221651  normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_4006  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  24.26 
 
 		 868 aa  81.3  0.00000000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.840318  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4357  Type IV secretory pathway VirB4 components-like protein  24.23 
 
 		 819 aa  78.6  0.0000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.471619  n/a   
 
 
-
 
NC_006366  plpl0020  hypothetical protein  23.51 
 
 		 865 aa  78.6  0.0000000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1056  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  21.62 
 
 		 566 aa  77.8  0.0000000000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000236301  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0518  Type IV secretory pathway VirB4 protein  26.57 
 
 		 845 aa  75.9  0.000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.832849  normal  0.194578 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3127  hypothetical protein  20.74 
 
 		 610 aa  75.5  0.000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1481  conjugative transposon protein TraG  24.74 
 
 		 841 aa  73.9  0.000000000009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.612602 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2964  transfer complex protein  23.65 
 
 		 711 aa  73.6  0.00000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2753  hypothetical protein  21.69 
 
 		 610 aa  72.8  0.00000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8298  hypothetical protein  23.65 
 
 		 575 aa  72.8  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.237745 
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4178  hypothetical protein  23.06 
 
 		 874 aa  71.2  0.00000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0161122 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4290  conjugal transfer ATP-binding protein TraC  23.62 
 
 		 866 aa  71.6  0.00000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1342  ATP-binding protein  23.53 
 
 		 461 aa  70.9  0.00000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1816  truncated type IV secretory pathway VirB4 component protein  20.23 
 
 		 668 aa  70.5  0.0000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0505  type IV secretory pathway VirB4 component, ATPase TraC  26.68 
 
 		 843 aa  70.5  0.0000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3253  type IV secretory pathway VirB4 components-like  23.19 
 
 		 861 aa  68.9  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0029  conjugal transfer ATP-binding protein TraC  24.01 
 
 		 875 aa  69.7  0.0000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06480  type IV secretory pathway VirB4 component-like protein  22.46 
 
 		 500 aa  69.7  0.0000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.132231  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2162  ATPase  22.05 
 
 		 847 aa  68.2  0.0000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.532567  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5371  Type-IV secretion system protein TraC  22.66 
 
 		 864 aa  68.2  0.0000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.622531 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5522  hypothetical protein  24.06 
 
 		 516 aa  67  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.349353  normal  0.675999 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1287  Tn5252, Orf26  23.74 
 
 		 776 aa  63.2  0.00000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0253  sex pilus assembly protein  24.55 
 
 		 815 aa  62.8  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5435  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  22.67 
 
 		 515 aa  62.4  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.62909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3004  Type IV secretory pathway VirB4 components-like protein  24.79 
 
 		 837 aa  60.8  0.00000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4502  type-IV secretion system protein TraC  21.47 
 
 		 862 aa  60.5  0.00000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1259  protein of unknown function DUF87  21.53 
 
 		 540 aa  60.1  0.0000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4438  type-IV secretion system protein TraC  21.35 
 
 		 862 aa  60.1  0.0000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.314552  normal  1 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4442  Type-IV secretion system protein TraC  21.35 
 
 		 862 aa  59.7  0.0000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4535  type-IV secretion system protein TraC  21.35 
 
 		 862 aa  59.7  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.862751 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4627  type-IV secretion system protein TraC  21.28 
 
 		 862 aa  59.7  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.997489 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0316  sex pilus assembly protein  22.97 
 
 		 815 aa  59.7  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4378  type-IV secretion system protein TraC  21.35 
 
 		 862 aa  59.7  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2653  hypothetical protein  23.32 
 
 		 855 aa  58.5  0.0000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.696195  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0163  type IV secretion/conjugal transfer ATPase, VirB4 family  24.78 
 
 		 822 aa  57.8  0.0000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0936  putative pillus assembly protein  27.81 
 
 		 690 aa  57.4  0.0000008  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2320  hypothetical protein  23.03 
 
 		 855 aa  57  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.121695  normal  1 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9821  type IV secretion protein AvhB4  22.28 
 
 		 819 aa  56.2  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0565  hypothetical protein  20.14 
 
 		 945 aa  55.1  0.000004  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6206  type IV secretion/conjugal transfer ATPase, VirB4 family  25.4 
 
 		 839 aa  55.1  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.623322  normal  0.0559252 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1535  hypothetical protein  22.45 
 
 		 860 aa  54.7  0.000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.324807 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3322  putative ATP-binding protein  20.59 
 
 		 480 aa  54.3  0.000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.540198 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0863  type IV secretion system ATPase VirB4  20.95 
 
 		 803 aa  53.9  0.000009  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0066  type IV secretion system protein VirB4  23.22 
 
 		 831 aa  53.5  0.00001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0274973  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0028  hypothetical protein  23.12 
 
 		 858 aa  53.5  0.00001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.0798103  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0450  putative Type IV secretion system protein VirB4/TraE  23.75 
 
 		 823 aa  53.9  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.228216  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0060  type IV secretion system protein VirB4  23.22 
 
 		 831 aa  53.5  0.00001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0180  cmgb3/4  21.83 
 
 		 561 aa  53.9  0.00001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6801  hypothetical protein  25.14 
 
 		 864 aa  52.4  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4376  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  24.2 
 
 		 785 aa  52.8  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.851787 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1137  type IV secretion/conjugal transfer ATPase, VirB4 family  29.09 
 
 		 816 aa  52.8  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8941  hypothetical protein  23.04 
 
 		 505 aa  53.1  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.57395  normal  0.334134 
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_08  conjugative transfer protein TraC  21.67 
 
 		 843 aa  52.4  0.00003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6405  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  21.62 
 
 		 819 aa  51.2  0.00007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0682909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2948  Type IV secretory pathway VirB4 component, ATPase TRAC  19.75 
 
 		 841 aa  50.8  0.00007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1756  putative Type IV secretion system protein VirB4/TraE  32.35 
 
 		 830 aa  50.8  0.00008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.592919 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4200  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  22.61 
 
 		 826 aa  50.8  0.00008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.985629 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2655  putative Type IV secretion system protein VirB4/TraE  33.33 
 
 		 822 aa  50.4  0.00009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4851  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  23.82 
 
 		 826 aa  50.4  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4177  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  21.3 
 
 		 804 aa  50.4  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.162179  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4502  hypothetical protein  32.43 
 
 		 528 aa  50.4  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.689738  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>