232 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_4006 on replicon NC_009426
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_2162  ATPase  56.19 
 
 		 847 aa  976    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.532567  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_4006  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  100 
 
 		 868 aa  1782    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.840318  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5371  Type-IV secretion system protein TraC  60.37 
 
 		 864 aa  1080    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.622531 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4226  hypothetical protein  30.99 
 
 		 827 aa  370  1e-101  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1535  hypothetical protein  28.97 
 
 		 860 aa  334  5e-90  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.324807 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2320  hypothetical protein  29.11 
 
 		 855 aa  332  2e-89  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.121695  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2653  hypothetical protein  29.35 
 
 		 855 aa  331  3e-89  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.696195  normal  1 
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4178  hypothetical protein  27.68 
 
 		 874 aa  331  3e-89  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0161122 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6801  hypothetical protein  28.85 
 
 		 864 aa  310  5e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0095  type IV conjugative transfer system protein TraC  24.79 
 
 		 815 aa  258  5e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.124816 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4290  conjugal transfer ATP-binding protein TraC  25.65 
 
 		 866 aa  223  9.999999999999999e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0029  conjugal transfer ATP-binding protein TraC  25.43 
 
 		 875 aa  221  7e-56  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_08  conjugative transfer protein TraC  24.88 
 
 		 843 aa  218  4e-55  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0316  sex pilus assembly protein  24.38 
 
 		 815 aa  216  9.999999999999999e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0371  F-pilin subunit assembly into extended F pili  26.15 
 
 		 809 aa  215  1.9999999999999998e-54  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.221651  normal  1 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4438  type-IV secretion system protein TraC  24.38 
 
 		 862 aa  214  5.999999999999999e-54  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.314552  normal  1 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4442  Type-IV secretion system protein TraC  24.47 
 
 		 862 aa  214  7.999999999999999e-54  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4627  type-IV secretion system protein TraC  24.27 
 
 		 862 aa  213  1e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.997489 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4378  type-IV secretion system protein TraC  24.36 
 
 		 862 aa  213  1e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4535  type-IV secretion system protein TraC  24.36 
 
 		 862 aa  213  1e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.862751 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0253  sex pilus assembly protein  24.26 
 
 		 815 aa  208  3e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4502  type-IV secretion system protein TraC  23.59 
 
 		 862 aa  204  5e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0028  hypothetical protein  23.41 
 
 		 858 aa  199  2.0000000000000003e-49  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.0798103  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0936  putative pillus assembly protein  27.63 
 
 		 690 aa  174  5e-42  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006366  plpl0020  hypothetical protein  24.36 
 
 		 865 aa  174  6.999999999999999e-42  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1089  type-IV secretion system protein TraC  27.07 
 
 		 866 aa  164  6e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3777  sex pilus assembly protein  26.19 
 
 		 816 aa  159  3e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.899145  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6224  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  24.74 
 
 		 860 aa  128  4.0000000000000003e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.628877  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4218  Type IV secretory pathway VirB4 components-like protein  26.45 
 
 		 894 aa  127  1e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.750787 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6206  type IV secretion/conjugal transfer ATPase, VirB4 family  25.77 
 
 		 839 aa  100  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.623322  normal  0.0559252 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0518  Type IV secretory pathway VirB4 protein  27.18 
 
 		 845 aa  94.7  7e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.832849  normal  0.194578 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2528  AAA ATPase  22.86 
 
 		 621 aa  94.4  8e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0505  type IV secretory pathway VirB4 component, ATPase TraC  27.43 
 
 		 843 aa  92.8  3e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0714  Type IV secretory pathway VirB4 components-like protein  25.08 
 
 		 611 aa  89.7  2e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3545  Type IV secretory pathway VirB4 components-like protein  24.75 
 
 		 811 aa  88.6  5e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0653304  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0731  AAA ATPase  25.81 
 
 		 569 aa  88.2  6e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0912969  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2548  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  26.23 
 
 		 629 aa  88.2  7e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0379852  normal  1 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6709  hypothetical protein  24.17 
 
 		 845 aa  87.8  7e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.534859  normal  0.161214 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6919  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  24.35 
 
 		 792 aa  87.4  9e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4357  Type IV secretory pathway VirB4 components-like protein  23.41 
 
 		 819 aa  87  0.000000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.471619  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6849  type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  25.18 
 
 		 608 aa  86.3  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0610151  normal  0.925039 
 
 
-
 
NC_002950  PG1481  conjugative transposon protein TraG  24.76 
 
 		 841 aa  85.9  0.000000000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.612602 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8579  type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  24.94 
 
 		 595 aa  86.3  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.161073  normal  0.268088 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3253  type IV secretory pathway VirB4 components-like  26.37 
 
 		 861 aa  84.3  0.000000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2581  conjugal transfer ATPase TrbE  23.97 
 
 		 816 aa  83.2  0.00000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1693  Type IV secretory pathway VirB4 components-like  25.25 
 
 		 629 aa  82.4  0.00000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.000521447  normal  0.17897 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4080  type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  26.64 
 
 		 631 aa  82.4  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.020005  normal  0.0495521 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3503  conjugal transfer ATPase TrbE  23.7 
 
 		 823 aa  82  0.00000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.584656  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3004  Type IV secretory pathway VirB4 components-like protein  23.75 
 
 		 837 aa  82  0.00000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1442  hypothetical protein  24.09 
 
 		 1002 aa  79.3  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.418268  normal  0.188514 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1344  conjugal transfer ATPase TrbE  23.75 
 
 		 819 aa  79.3  0.0000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2908  conjugal transfer ATPase TrbE  22.54 
 
 		 811 aa  79.3  0.0000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.380632  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1898  conjugal transfer ATPase TrbE  23.06 
 
 		 817 aa  79  0.0000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2271  conjugal transfer ATPase TrbE  25.53 
 
 		 812 aa  79  0.0000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2744  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  26.58 
 
 		 630 aa  79  0.0000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00908166  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2007  conjugal transfer ATPase TrbE  24.02 
 
 		 816 aa  78.2  0.0000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.581672  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2353  conjugal transfer ATPase TrbE  23.96 
 
 		 816 aa  77.8  0.0000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.233122  normal  0.344124 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1285  conjugal transfer ATPase TrbE  23.5 
 
 		 816 aa  78.2  0.0000000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4376  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  25.47 
 
 		 785 aa  77.8  0.0000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.851787 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35690  conjugal transfer ATPase TrbE  23.5 
 
 		 816 aa  77.8  0.0000000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0435  conjugal transfer ATPase TrbE  22.92 
 
 		 817 aa  77  0.000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30910  conjugal transfer ATPase TrbE  22.92 
 
 		 817 aa  77  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.0000000414209  unclonable  1.71741e-21 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2441  type IV secretion/conjugal transfer ATPase, VirB4 family  23.69 
 
 		 815 aa  77  0.000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.06702  normal  0.584537 
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_2973  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  24.1 
 
 		 659 aa  76.6  0.000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2696  conjugal transfer ATPase TrbE  23.18 
 
 		 823 aa  76.3  0.000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0851108  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1553  conjugal transfer ATPase TrbE  22.92 
 
 		 809 aa  77  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.215631  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0255  Type IV secretory pathway AvhB4 protein  25.51 
 
 		 788 aa  76.3  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.849698 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1319  conjugal transfer ATPase TrbE  23.44 
 
 		 819 aa  76.6  0.000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2648  conjugal transfer ATPase TrbE  23.42 
 
 		 825 aa  75.5  0.000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.947837  normal  0.965174 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0729  conjugal transfer ATPase TrbE  22.69 
 
 		 816 aa  74.7  0.000000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0495  type IV secretion system ATPase VirB4  24.67 
 
 		 800 aa  74.3  0.000000000008  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.97813  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0914  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  25.09 
 
 		 1043 aa  74.7  0.000000000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3703  conjugal transfer ATPase TrbE  23.3 
 
 		 817 aa  74.3  0.000000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.165131  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1191  conjugal transfer ATPase TrbE  26.22 
 
 		 816 aa  73.6  0.00000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.192837  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3544  conjugal transfer ATPase TrbE  26.22 
 
 		 816 aa  73.6  0.00000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9656  conjugal transfer protein TrbE  25.35 
 
 		 687 aa  73.6  0.00000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.419883  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0179  membrane bound ATPase, putative  22.29 
 
 		 955 aa  72  0.00000000004  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0858  type IV secretion system ATPase VirB4  23.51 
 
 		 801 aa  71.6  0.00000000005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0247  CagE TrbE VirB component of type IV transporter system  26.67 
 
 		 840 aa  72  0.00000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1816  truncated type IV secretory pathway VirB4 component protein  27.11 
 
 		 668 aa  72  0.00000000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1339  CagE TrbE VirB component of type IV transporter system  26.67 
 
 		 840 aa  72  0.00000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.18708 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0533  type IV secretion system ATPase VirB4  24.34 
 
 		 800 aa  71.2  0.00000000007  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0963  conjugal transfer ATPase TrbE  25.96 
 
 		 813 aa  71.2  0.00000000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2881  conjugal transfer ATPase TrbE  25.46 
 
 		 812 aa  70.9  0.0000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.244722  normal  0.034415 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0863  type IV secretion system ATPase VirB4  24.92 
 
 		 803 aa  69.7  0.0000000002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1638  conjugal transfer protein trbE, putative  26.36 
 
 		 840 aa  70.1  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6728  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  23.76 
 
 		 657 aa  69.7  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.726364  normal  0.776114 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0746  conjugal transfer ATPase TrbE  25.2 
 
 		 812 aa  69.3  0.0000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.369643  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0683  hypothetical protein  23.72 
 
 		 960 aa  68.9  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.439939  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4198  conjugal transfer ATPase TrbE  22.39 
 
 		 813 aa  69.3  0.0000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.330213  normal  0.981224 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3830  conjugal transfer ATPase TrbE  24.82 
 
 		 818 aa  68.9  0.0000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2321  conjugal transfer ATPase TrbE  24.59 
 
 		 811 aa  68.9  0.0000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1717  conjugal transfer ATPase TrbE  23.1 
 
 		 819 aa  68.9  0.0000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.137188  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3023  hypothetical protein  23.44 
 
 		 917 aa  68.6  0.0000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2186  hypothetical protein  23.61 
 
 		 962 aa  68.6  0.0000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0931  hypothetical protein  24.69 
 
 		 616 aa  68.6  0.0000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9821  type IV secretion protein AvhB4  25.47 
 
 		 819 aa  68.6  0.0000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0948  hypothetical protein  23.61 
 
 		 962 aa  68.2  0.0000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.711504  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2859  AAA ATPase  22.84 
 
 		 960 aa  67  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2394  hypothetical protein  23.61 
 
 		 962 aa  67  0.000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>