53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_p840_08 on replicon NC_011311
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011668  Sbal223_4438  type-IV secretion system protein TraC  55.31 
 
 		 862 aa  949    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.314552  normal  1 
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4502  type-IV secretion system protein TraC  55.07 
 
 		 862 aa  950    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4378  type-IV secretion system protein TraC  55.19 
 
 		 862 aa  949    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_08  conjugative transfer protein TraC  100 
 
 		 843 aa  1762    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4627  type-IV secretion system protein TraC  55.31 
 
 		 862 aa  951    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.997489 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4535  type-IV secretion system protein TraC  55.31 
 
 		 862 aa  950    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.862751 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4442  Type-IV secretion system protein TraC  55.31 
 
 		 862 aa  950    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4290  conjugal transfer ATP-binding protein TraC  30.39 
 
 		 866 aa  392  1e-107  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0029  conjugal transfer ATP-binding protein TraC  29.25 
 
 		 875 aa  340  5.9999999999999996e-92  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0028  hypothetical protein  28.61 
 
 		 858 aa  329  1.0000000000000001e-88  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.0798103  n/a   
 
 
-
 
NC_006366  plpl0020  hypothetical protein  28.38 
 
 		 865 aa  321  3.9999999999999996e-86  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4178  hypothetical protein  28.31 
 
 		 874 aa  275  3e-72  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0161122 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_4006  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  24.88 
 
 		 868 aa  218  4e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.840318  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5371  Type-IV secretion system protein TraC  23.82 
 
 		 864 aa  213  1e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.622531 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2162  ATPase  23.4 
 
 		 847 aa  210  1e-52  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.532567  n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4226  hypothetical protein  26.25 
 
 		 827 aa  207  6e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6801  hypothetical protein  24.46 
 
 		 864 aa  203  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1535  hypothetical protein  24.47 
 
 		 860 aa  168  4e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.324807 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0371  F-pilin subunit assembly into extended F pili  26.09 
 
 		 809 aa  163  1e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.221651  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2653  hypothetical protein  23.96 
 
 		 855 aa  162  3e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.696195  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2320  hypothetical protein  23.9 
 
 		 855 aa  161  5e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.121695  normal  1 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0095  type IV conjugative transfer system protein TraC  24.39 
 
 		 815 aa  159  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.124816 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0316  sex pilus assembly protein  22.46 
 
 		 815 aa  139  3.0000000000000003e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0936  putative pillus assembly protein  27.16 
 
 		 690 aa  135  1.9999999999999998e-30  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0253  sex pilus assembly protein  22.04 
 
 		 815 aa  129  2.0000000000000002e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1089  type-IV secretion system protein TraC  24.72 
 
 		 866 aa  112  3e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4218  Type IV secretory pathway VirB4 components-like protein  25.33 
 
 		 894 aa  100  9e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.750787 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6224  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  24.56 
 
 		 860 aa  88.2  6e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.628877  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3777  sex pilus assembly protein  22.2 
 
 		 816 aa  81.3  0.00000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.899145  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4080  type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  22.78 
 
 		 631 aa  74.3  0.000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.020005  normal  0.0495521 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1693  Type IV secretory pathway VirB4 components-like  24.67 
 
 		 629 aa  72  0.00000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.000521447  normal  0.17897 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6709  hypothetical protein  26.84 
 
 		 845 aa  72  0.00000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.534859  normal  0.161214 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3545  Type IV secretory pathway VirB4 components-like protein  27.02 
 
 		 811 aa  71.6  0.00000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0653304  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2548  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  23.47 
 
 		 629 aa  70.1  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0379852  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4357  Type IV secretory pathway VirB4 components-like protein  27.56 
 
 		 819 aa  70.5  0.0000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.471619  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1481  conjugative transposon protein TraG  25.98 
 
 		 841 aa  67.8  0.0000000008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.612602 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3004  Type IV secretory pathway VirB4 components-like protein  27.38 
 
 		 837 aa  67.8  0.0000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3253  type IV secretory pathway VirB4 components-like  22.66 
 
 		 861 aa  67  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6849  type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  23.65 
 
 		 608 aa  65.9  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0610151  normal  0.925039 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2744  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  24.67 
 
 		 630 aa  57  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00908166  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6728  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  23.17 
 
 		 657 aa  56.2  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.726364  normal  0.776114 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0518  Type IV secretory pathway VirB4 protein  23.06 
 
 		 845 aa  56.2  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.832849  normal  0.194578 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1177  CagE TrbE VirB component of type IV transporter system  24.74 
 
 		 850 aa  55.5  0.000005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8579  type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  23.84 
 
 		 595 aa  51.2  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.161073  normal  0.268088 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2392  hypothetical protein  21.2 
 
 		 924 aa  49.7  0.0002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_2973  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  22.28 
 
 		 659 aa  49.7  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3629  Type IV secretory pathway VirB4 protein  24.68 
 
 		 866 aa  49.7  0.0003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0505  type IV secretory pathway VirB4 component, ATPase TraC  23.27 
 
 		 843 aa  48.5  0.0005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0884  CagE TrbE VirB component of type IV transporter system  24.14 
 
 		 843 aa  47.8  0.0009  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6919  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  26.03 
 
 		 792 aa  47  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3023  hypothetical protein  22.12 
 
 		 917 aa  46.6  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0177  hypothetical protein  19.69 
 
 		 696 aa  45.8  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0226  hypothetical protein  18.29 
 
 		 699 aa  45.1  0.006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>