174 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smon_1177 on replicon NC_013515
Organism: Streptobacillus moniliformis DSM 12112



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013515  Smon_1177  CagE TrbE VirB component of type IV transporter system  100 
 
 
850 aa  1713    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0884  CagE TrbE VirB component of type IV transporter system  81.73 
 
 
843 aa  1456    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2348  conjugal transfer ATPase TrbE  32.68 
 
 
810 aa  462  9.999999999999999e-129  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2271  conjugal transfer ATPase TrbE  31.19 
 
 
812 aa  456  1e-127  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3001  conjugal transfer ATPase TrbE  31.99 
 
 
812 aa  458  1e-127  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3089  conjugal transfer ATPase TrbE  32.37 
 
 
812 aa  455  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0315  conjugal transfer ATPase TrbE  31.74 
 
 
821 aa  449  1e-125  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3367  conjugal transfer ATPase TrbE  31.22 
 
 
814 aa  450  1e-125  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0598  conjugal transfer ATPase TrbE  31.14 
 
 
809 aa  451  1e-125  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.657344  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3854  conjugal transfer ATPase TrbE  31.81 
 
 
830 aa  446  1.0000000000000001e-124  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0508748  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1503  conjugal transfer ATPase TrbE  31.84 
 
 
813 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.373275  normal  0.784639 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1191  conjugal transfer ATPase TrbE  32.07 
 
 
816 aa  447  1.0000000000000001e-124  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.192837  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3544  conjugal transfer ATPase TrbE  32.07 
 
 
816 aa  447  1.0000000000000001e-124  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2881  conjugal transfer ATPase TrbE  32.66 
 
 
812 aa  449  1.0000000000000001e-124  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.244722  normal  0.034415 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3997  conjugal transfer ATPase TrbE  31.72 
 
 
812 aa  448  1.0000000000000001e-124  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.678924 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3898  conjugal transfer ATPase TrbE  32.74 
 
 
813 aa  443  1e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2321  conjugal transfer ATPase TrbE  31.82 
 
 
811 aa  444  1e-123  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0153  conjugal transfer ATPase TrbE  32.58 
 
 
872 aa  444  1e-123  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0746  conjugal transfer ATPase TrbE  32.53 
 
 
812 aa  444  1e-123  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.369643  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7443  conjugal transfer ATPase TrbE  30.85 
 
 
809 aa  439  9.999999999999999e-123  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7744  conjugal transfer ATPase TrbE  32.32 
 
 
812 aa  439  9.999999999999999e-123  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.110925 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3538  conjugal transfer ATPase TrbE  30.97 
 
 
813 aa  434  1e-120  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0252817  normal  0.696341 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2611  conjugal transfer ATPase TrbE  32.29 
 
 
829 aa  435  1e-120  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3197  conjugal transfer ATPase TrbE  31.84 
 
 
877 aa  436  1e-120  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.468072  normal 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4198  conjugal transfer ATPase TrbE  31.63 
 
 
813 aa  433  1e-120  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.330213  normal  0.981224 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3694  conjugal transfer ATPase TrbE  30.73 
 
 
820 aa  430  1e-119  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0963  conjugal transfer ATPase TrbE  32.41 
 
 
813 aa  427  1e-118  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1481  conjugal transfer ATPase TrbE  31.49 
 
 
836 aa  428  1e-118  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0386388  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2030  conjugal transfer ATPase TrbE  31.85 
 
 
813 aa  429  1e-118  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0696  conjugal transfer ATPase TrbE  32.37 
 
 
847 aa  428  1e-118  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1010  conjugal transfer ATPase TrbE  30.7 
 
 
808 aa  425  1e-117  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.611754  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2483  conjugal transfer ATPase TrbE  32.63 
 
 
814 aa  424  1e-117  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.260305 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2007  conjugal transfer ATPase TrbE  31.63 
 
 
816 aa  424  1e-117  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.581672  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3830  conjugal transfer ATPase TrbE  31.49 
 
 
818 aa  425  1e-117  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2353  conjugal transfer ATPase TrbE  31.76 
 
 
816 aa  425  1e-117  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.233122  normal  0.344124 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2827  conjugal transfer ATPase TrbE  31.03 
 
 
812 aa  424  1e-117  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.595122  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35690  conjugal transfer ATPase TrbE  31.81 
 
 
816 aa  426  1e-117  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2581  conjugal transfer ATPase TrbE  31.64 
 
 
816 aa  419  1e-116  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2648  conjugal transfer ATPase TrbE  31.64 
 
 
825 aa  421  1e-116  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.947837  normal  0.965174 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1344  conjugal transfer ATPase TrbE  31.38 
 
 
819 aa  419  1e-116  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1285  conjugal transfer ATPase TrbE  31.42 
 
 
816 aa  421  1e-116  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0435  conjugal transfer ATPase TrbE  31.51 
 
 
817 aa  421  1e-116  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0164  conjugal transfer ATPase TrbE  31.57 
 
 
822 aa  422  1e-116  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.627498  normal  0.339359 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3215  conjugal transfer ATPase TrbE  31.5 
 
 
836 aa  421  1e-116  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2696  conjugal transfer ATPase TrbE  30.67 
 
 
823 aa  416  9.999999999999999e-116  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0851108  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3503  conjugal transfer ATPase TrbE  30.92 
 
 
823 aa  418  9.999999999999999e-116  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.584656  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0506  conjugal transfer ATPase TrbE  31.34 
 
 
812 aa  418  9.999999999999999e-116  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.496331  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1838  conjugal transfer ATPase TrbE  30.71 
 
 
808 aa  417  9.999999999999999e-116  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1553  conjugal transfer ATPase TrbE  31.89 
 
 
809 aa  414  1e-114  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.215631  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3703  conjugal transfer ATPase TrbE  32.02 
 
 
817 aa  413  1e-114  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.165131  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1319  conjugal transfer ATPase TrbE  31.25 
 
 
819 aa  415  1e-114  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30910  conjugal transfer ATPase TrbE  32.14 
 
 
817 aa  411  1e-113  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.0000000414209  unclonable  1.71741e-21 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2349  conjugal transfer ATPase TrbE  30.6 
 
 
820 aa  411  1e-113  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2908  conjugal transfer ATPase TrbE  30.18 
 
 
811 aa  411  1e-113  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.380632  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1898  conjugal transfer ATPase TrbE  32.27 
 
 
817 aa  409  1.0000000000000001e-112  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5372  conjugal transfer ATPase TrbE  29.95 
 
 
824 aa  405  1e-111  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.259729  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0729  conjugal transfer ATPase TrbE  31.51 
 
 
816 aa  397  1e-109  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1717  conjugal transfer ATPase TrbE  30.59 
 
 
819 aa  393  1e-108  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.137188  normal 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5221  conjugal transfer ATPase TrbE  30.71 
 
 
819 aa  390  1e-107  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2503  CagE, TrbE, VirB component of type IV transporter system  30.43 
 
 
814 aa  365  2e-99  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5485  conjugal transfer protein TrbE  28.9 
 
 
815 aa  362  1e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00798845  normal 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4566  conjugal transfer protein TrbE  28.34 
 
 
817 aa  357  5e-97  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5379  conjugal transfer protein TrbE  29.65 
 
 
817 aa  356  8.999999999999999e-97  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.325542 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9265  conjugal transfer protein TrbE  27.77 
 
 
822 aa  346  1e-93  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.502143  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1617  CagE, TrbE, VirB component of type IV transporter system, conserved region  28.52 
 
 
819 aa  345  2.9999999999999997e-93  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4271  conjugal transfer protein TrbE  29.46 
 
 
852 aa  338  1.9999999999999998e-91  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.000528773  normal  0.467859 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6505  conjugal transfer protein TrbE  29.46 
 
 
852 aa  337  3.9999999999999995e-91  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00158384  n/a   
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6632  conjugal transfer protein TrbE  29.46 
 
 
852 aa  337  3.9999999999999995e-91  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0411416  n/a   
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0050  conjugal transfer protein TrbE  29.31 
 
 
845 aa  335  1e-90  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9656  conjugal transfer protein TrbE  30.83 
 
 
687 aa  327  6e-88  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.419883  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8331  conjugal transfer protein TrbE  27.96 
 
 
820 aa  325  2e-87  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.359626  n/a   
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2228  conjugal transfer protein TrbE  28.21 
 
 
854 aa  312  2e-83  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0444639  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0247  CagE TrbE VirB component of type IV transporter system  27.33 
 
 
840 aa  311  4e-83  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1339  CagE TrbE VirB component of type IV transporter system  27.33 
 
 
840 aa  311  4e-83  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.18708 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1638  conjugal transfer protein trbE, putative  27.08 
 
 
840 aa  311  4e-83  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4692  CagE TrbE VirB component of type IV transporter system  27.66 
 
 
808 aa  286  1.0000000000000001e-75  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2821  type IV secretory pathway VirB4 components-like protein  24.94 
 
 
827 aa  284  4.0000000000000003e-75  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.901669 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0495  type IV secretion system ATPase VirB4  24.43 
 
 
800 aa  232  2e-59  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.97813  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0858  type IV secretion system ATPase VirB4  24.67 
 
 
801 aa  230  9e-59  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0533  type IV secretion system ATPase VirB4  24.3 
 
 
800 aa  229  1e-58  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4747  type IV secretory pathway VirB4 components-like protein  26.37 
 
 
844 aa  222  1.9999999999999999e-56  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.290977 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0863  type IV secretion system ATPase VirB4  25.85 
 
 
803 aa  222  3e-56  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5086  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  24.08 
 
 
790 aa  204  7e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5229  Type IV secretory pathway VirB4 components-like  22.88 
 
 
846 aa  203  9.999999999999999e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.738503  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2098  conjugal transfer protein trbE  31.89 
 
 
401 aa  196  1e-48  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4346  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  23.79 
 
 
793 aa  197  1e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.677673  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0677  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  23.35 
 
 
796 aa  187  8e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5007  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  23.68 
 
 
805 aa  185  4.0000000000000006e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0207382  normal  0.0996879 
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4376  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  23.73 
 
 
785 aa  174  3.9999999999999995e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.851787 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0255  Type IV secretory pathway AvhB4 protein  24.9 
 
 
788 aa  175  3.9999999999999995e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.849698 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2441  type IV secretion/conjugal transfer ATPase, VirB4 family  22.94 
 
 
815 aa  172  2e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.06702  normal  0.584537 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6206  type IV secretion/conjugal transfer ATPase, VirB4 family  22.04 
 
 
839 aa  169  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.623322  normal  0.0559252 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4260  Type IV secretory pathway VirB4 components-like  22.11 
 
 
831 aa  166  1.0000000000000001e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5465  Type IV secretory pathway VirB4 components-like  21.96 
 
 
850 aa  166  2.0000000000000002e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.257739  decreased coverage  0.00704778 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4177  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  23.12 
 
 
804 aa  165  3e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.162179  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4227  Type IV secretory pathway VirB4 components-like protein  22.25 
 
 
821 aa  162  2e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.267872  normal 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4562  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  22.63 
 
 
805 aa  162  2e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.733697  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6405  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  23.77 
 
 
819 aa  160  7e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0682909  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1522  type IV secretory pathway VirB4 components-like protein  24.28 
 
 
815 aa  160  1e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5609  type IV secretory pathway VirB4 components-like protein  22.42 
 
 
825 aa  154  8.999999999999999e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.931017  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>