49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpp2392 on replicon NC_006368
Organism: Legionella pneumophila str. Paris



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006368  lpp1060  hypothetical protein  76.98 
 
 		 916 aa  1428    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2392  hypothetical protein  100 
 
 		 924 aa  1911    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1022  hypothetical protein  76.98 
 
 		 916 aa  1428    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0648  hypothetical protein  28.96 
 
 		 908 aa  403  9.999999999999999e-111  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.685695  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1764  hypothetical protein  29.45 
 
 		 938 aa  394  1e-108  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3023  hypothetical protein  30.29 
 
 		 917 aa  393  1e-108  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3330  hypothetical protein  30.12 
 
 		 913 aa  391  1e-107  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.543175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2948  Type IV secretory pathway VirB4 components-like protein  29.88 
 
 		 913 aa  385  1e-105  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36280  lipoprotein  29.84 
 
 		 973 aa  381  1e-104  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3705  hypothetical protein  29.01 
 
 		 948 aa  376  1e-103  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0337  putative plasmid-related protein  28.2 
 
 		 952 aa  373  1e-102  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.92337  normal  0.715711 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4169  putative plasmid-related protein  27.76 
 
 		 954 aa  370  1e-101  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.660111  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1398  hypothetical protein  29.53 
 
 		 955 aa  372  1e-101  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2859  AAA ATPase  30.53 
 
 		 960 aa  370  1e-100  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4086  putative plasmid-related protein  28.03 
 
 		 954 aa  369  1e-100  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1626  hypothetical protein  28.68 
 
 		 949 aa  356  1e-96  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4515  type IV secretory pathway, VirB4 component  28.12 
 
 		 983 aa  353  5.9999999999999994e-96  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1442  hypothetical protein  29.31 
 
 		 1002 aa  351  3e-95  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.418268  normal  0.188514 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59940  hypothetical protein  28.23 
 
 		 980 aa  349  1e-94  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.163365  hitchhiker  0.00000000104179 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3424  hypothetical protein  29.41 
 
 		 956 aa  348  3e-94  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.38542 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1256  hypothetical protein  29.48 
 
 		 963 aa  347  4e-94  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4179  hypothetical protein  29.4 
 
 		 969 aa  347  6e-94  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0837304  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1184  hypothetical protein  29.53 
 
 		 955 aa  346  1e-93  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2186  hypothetical protein  29.4 
 
 		 962 aa  345  2e-93  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2394  hypothetical protein  29.4 
 
 		 962 aa  345  2.9999999999999997e-93  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0662  hypothetical protein  27.56 
 
 		 941 aa  345  2.9999999999999997e-93  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0683  hypothetical protein  29.26 
 
 		 960 aa  343  7e-93  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.439939  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0502  hypothetical protein  28.08 
 
 		 978 aa  343  8e-93  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.147471  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2353  hypothetical protein  29.15 
 
 		 963 aa  338  2.9999999999999997e-91  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00000463521  unclonable  0.00000047318 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0948  hypothetical protein  29.18 
 
 		 962 aa  338  3.9999999999999995e-91  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.711504  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0859  hypothetical protein  29.34 
 
 		 889 aa  333  9e-90  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0435  hypothetical protein  27.77 
 
 		 949 aa  332  2e-89  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.544746  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2755  hypothetical protein  25.5 
 
 		 964 aa  323  7e-87  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.446038  normal  0.940253 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3926  hypothetical protein  24.47 
 
 		 1042 aa  299  2e-79  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1164  hypothetical protein  29.53 
 
 		 659 aa  237  9e-61  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.146013  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0614  hypothetical protein  30.34 
 
 		 240 aa  114  6e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0371  F-pilin subunit assembly into extended F pili  20.49 
 
 		 809 aa  65.9  0.000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.221651  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2162  ATPase  21.86 
 
 		 847 aa  60.5  0.0000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.532567  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6224  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  20.88 
 
 		 860 aa  58.2  0.0000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.628877  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0518  Type IV secretory pathway VirB4 protein  24.58 
 
 		 845 aa  56.2  0.000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.832849  normal  0.194578 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5371  Type-IV secretion system protein TraC  26.24 
 
 		 864 aa  53.5  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.622531 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_4006  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  20.34 
 
 		 868 aa  53.5  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.840318  n/a   
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_08  conjugative transfer protein TraC  21.2 
 
 		 843 aa  50.1  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0505  type IV secretory pathway VirB4 component, ATPase TraC  25.29 
 
 		 843 aa  49.3  0.0003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0253  sex pilus assembly protein  24.19 
 
 		 815 aa  48.1  0.0007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3629  Type IV secretory pathway VirB4 protein  23.18 
 
 		 866 aa  47.8  0.0009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4226  hypothetical protein  25.29 
 
 		 827 aa  45.4  0.005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2948  Type IV secretory pathway VirB4 component, ATPase TRAC  20.63 
 
 		 841 aa  44.3  0.009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4218  Type IV secretory pathway VirB4 components-like protein  30.48 
 
 		 894 aa  44.7  0.009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.750787 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>