49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_4515 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_2948  Type IV secretory pathway VirB4 components-like protein  55.37 
 
 		 913 aa  1044    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1164  hypothetical protein  57.77 
 
 		 659 aa  741    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.146013  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1256  hypothetical protein  63.37 
 
 		 963 aa  1195    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1398  hypothetical protein  63.15 
 
 		 955 aa  1217    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2186  hypothetical protein  62.93 
 
 		 962 aa  1196    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2394  hypothetical protein  62.93 
 
 		 962 aa  1197    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2859  AAA ATPase  61.87 
 
 		 960 aa  1205    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0948  hypothetical protein  62.59 
 
 		 962 aa  1196    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.711504  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3330  hypothetical protein  55.47 
 
 		 913 aa  1048    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.543175  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0859  hypothetical protein  67.57 
 
 		 889 aa  1253    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4515  type IV secretory pathway, VirB4 component  100 
 
 		 983 aa  2038    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4179  hypothetical protein  61.59 
 
 		 969 aa  1174    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0837304  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3705  hypothetical protein  48.74 
 
 		 948 aa  884    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3424  hypothetical protein  62.93 
 
 		 956 aa  1194    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.38542 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0337  putative plasmid-related protein  49.03 
 
 		 952 aa  883    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.92337  normal  0.715711 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4086  putative plasmid-related protein  49.42 
 
 		 954 aa  882    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4169  putative plasmid-related protein  50.11 
 
 		 954 aa  880    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.660111  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0502  hypothetical protein  62.97 
 
 		 978 aa  1205    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.147471  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1626  hypothetical protein  62.94 
 
 		 949 aa  1230    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1442  hypothetical protein  68.04 
 
 		 1002 aa  1344    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.418268  normal  0.188514 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0662  hypothetical protein  48.52 
 
 		 941 aa  856    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0648  hypothetical protein  43.96 
 
 		 908 aa  790    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.685695  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3023  hypothetical protein  56.73 
 
 		 917 aa  1074    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0435  hypothetical protein  61.74 
 
 		 949 aa  1194    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.544746  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0683  hypothetical protein  62.49 
 
 		 960 aa  1183    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.439939  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1184  hypothetical protein  63.25 
 
 		 955 aa  1193    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2353  hypothetical protein  62.84 
 
 		 963 aa  1187    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00000463521  unclonable  0.00000047318 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1764  hypothetical protein  48.68 
 
 		 938 aa  915    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59940  hypothetical protein  96.88 
 
 		 980 aa  1884    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.163365  hitchhiker  0.00000000104179 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36280  lipoprotein  68.78 
 
 		 973 aa  1375    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3926  hypothetical protein  42.48 
 
 		 1042 aa  800    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2755  hypothetical protein  37.64 
 
 		 964 aa  618  1e-175  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.446038  normal  0.940253 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2392  hypothetical protein  28.12 
 
 		 924 aa  358  1.9999999999999998e-97  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1060  hypothetical protein  27.99 
 
 		 916 aa  347  6e-94  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1022  hypothetical protein  27.99 
 
 		 916 aa  347  6e-94  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0614  hypothetical protein  53.95 
 
 		 240 aa  272  2e-71  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4178  hypothetical protein  22.91 
 
 		 874 aa  73.9  0.00000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0161122 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_4006  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  22.72 
 
 		 868 aa  62.4  0.00000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.840318  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6801  hypothetical protein  23.12 
 
 		 864 aa  60.8  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0936  putative pillus assembly protein  20.48 
 
 		 690 aa  59.7  0.0000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2162  ATPase  21.91 
 
 		 847 aa  54.3  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.532567  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5371  Type-IV secretion system protein TraC  21.67 
 
 		 864 aa  49.7  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.622531 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0247  CagE TrbE VirB component of type IV transporter system  23.08 
 
 		 840 aa  49.3  0.0004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1339  CagE TrbE VirB component of type IV transporter system  23.08 
 
 		 840 aa  49.3  0.0004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.18708 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1638  conjugal transfer protein trbE, putative  22.65 
 
 		 840 aa  48.1  0.0007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1693  Type IV secretory pathway VirB4 components-like  24.79 
 
 		 629 aa  47.4  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.000521447  normal  0.17897 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2948  Type IV secretory pathway VirB4 component, ATPase TRAC  20.71 
 
 		 841 aa  46.6  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0016  hypothetical protein  22.9 
 
 		 938 aa  45.4  0.006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4376  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  24.19 
 
 		 785 aa  44.3  0.01  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.851787 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>