14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_B0016 on replicon NC_007410
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007410  Ava_B0016  hypothetical protein  100 
 
 		 938 aa  1929    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0035  hypothetical protein  69.69 
 
 		 935 aa  1388    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.981613 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2885  hypothetical protein  54.66 
 
 		 885 aa  969    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0417447 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2460  hypothetical protein  46.97 
 
 		 940 aa  825    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.133962 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3184  hypothetical protein  53.62 
 
 		 884 aa  952    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3900  hypothetical protein  47.03 
 
 		 931 aa  822    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5678  hypothetical protein  41.43 
 
 		 906 aa  689    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5415  hypothetical protein  28.78 
 
 		 967 aa  379  1e-103  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1164  hypothetical protein  23.37 
 
 		 659 aa  47  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.146013  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4179  hypothetical protein  23.78 
 
 		 969 aa  45.8  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0837304  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1184  hypothetical protein  23.37 
 
 		 955 aa  45.4  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2353  hypothetical protein  23.37 
 
 		 963 aa  45.4  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00000463521  unclonable  0.00000047318 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4515  type IV secretory pathway, VirB4 component  22.9 
 
 		 983 aa  45.4  0.005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1256  hypothetical protein  23.37 
 
 		 963 aa  45.1  0.006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>