55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_0859 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_4179  hypothetical protein  67.27 
 
 		 969 aa  1202    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0837304  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1398  hypothetical protein  68.49 
 
 		 955 aa  1243    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2186  hypothetical protein  68.44 
 
 		 962 aa  1219    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2394  hypothetical protein  68.22 
 
 		 962 aa  1214    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0859  hypothetical protein  100 
 
 		 889 aa  1838    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4515  type IV secretory pathway, VirB4 component  67.57 
 
 		 983 aa  1237    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3705  hypothetical protein  50.57 
 
 		 948 aa  868    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3424  hypothetical protein  67.5 
 
 		 956 aa  1209    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.38542 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0337  putative plasmid-related protein  48.75 
 
 		 952 aa  845    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.92337  normal  0.715711 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4086  putative plasmid-related protein  49.43 
 
 		 954 aa  845    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4169  putative plasmid-related protein  49.32 
 
 		 954 aa  847    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.660111  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2948  Type IV secretory pathway VirB4 components-like protein  60.82 
 
 		 913 aa  1092    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3330  hypothetical protein  60.71 
 
 		 913 aa  1091    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.543175  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0948  hypothetical protein  68.22 
 
 		 962 aa  1214    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.711504  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2859  AAA ATPase  67.77 
 
 		 960 aa  1224    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1164  hypothetical protein  64.78 
 
 		 659 aa  736    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.146013  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36280  lipoprotein  69.78 
 
 		 973 aa  1271    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0683  hypothetical protein  68.1 
 
 		 960 aa  1212    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.439939  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0435  hypothetical protein  67.54 
 
 		 949 aa  1216    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.544746  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0662  hypothetical protein  49.55 
 
 		 941 aa  843    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1626  hypothetical protein  68 
 
 		 949 aa  1248    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1256  hypothetical protein  68.06 
 
 		 963 aa  1217    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0502  hypothetical protein  68.56 
 
 		 978 aa  1199    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.147471  normal  1 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3926  hypothetical protein  44.29 
 
 		 1042 aa  794    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1442  hypothetical protein  79.89 
 
 		 1002 aa  1468    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.418268  normal  0.188514 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0648  hypothetical protein  43.46 
 
 		 908 aa  756    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.685695  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3023  hypothetical protein  60.82 
 
 		 917 aa  1098    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59940  hypothetical protein  67.83 
 
 		 980 aa  1236    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.163365  hitchhiker  0.00000000104179 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1764  hypothetical protein  48.86 
 
 		 938 aa  852    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2353  hypothetical protein  67.49 
 
 		 963 aa  1209    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00000463521  unclonable  0.00000047318 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1184  hypothetical protein  68.38 
 
 		 955 aa  1212    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2755  hypothetical protein  38.18 
 
 		 964 aa  590  1e-167  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.446038  normal  0.940253 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2392  hypothetical protein  29 
 
 		 924 aa  334  5e-90  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1060  hypothetical protein  27.89 
 
 		 916 aa  322  3e-86  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1022  hypothetical protein  27.89 
 
 		 916 aa  322  3e-86  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0614  hypothetical protein  57.96 
 
 		 240 aa  284  4.0000000000000003e-75  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4178  hypothetical protein  23.58 
 
 		 874 aa  76.3  0.000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0161122 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_4006  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  23.88 
 
 		 868 aa  65.5  0.000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.840318  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2162  ATPase  21.94 
 
 		 847 aa  61.6  0.00000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.532567  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0095  type IV conjugative transfer system protein TraC  21.4 
 
 		 815 aa  59.3  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.124816 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5371  Type-IV secretion system protein TraC  23.14 
 
 		 864 aa  53.5  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.622531 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0936  putative pillus assembly protein  20.99 
 
 		 690 aa  52.8  0.00003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6801  hypothetical protein  27.16 
 
 		 864 aa  51.2  0.00009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0731  AAA ATPase  30.41 
 
 		 569 aa  49.3  0.0003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0912969  n/a   
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4627  type-IV secretion system protein TraC  23.82 
 
 		 862 aa  48.5  0.0006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.997489 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4378  type-IV secretion system protein TraC  23.82 
 
 		 862 aa  48.5  0.0006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4535  type-IV secretion system protein TraC  23.82 
 
 		 862 aa  48.1  0.0006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.862751 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4438  type-IV secretion system protein TraC  23.82 
 
 		 862 aa  48.1  0.0007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.314552  normal  1 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4442  Type-IV secretion system protein TraC  23.82 
 
 		 862 aa  48.1  0.0007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2653  hypothetical protein  22.32 
 
 		 855 aa  47  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.696195  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6206  type IV secretion/conjugal transfer ATPase, VirB4 family  24.89 
 
 		 839 aa  47  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.623322  normal  0.0559252 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1693  Type IV secretory pathway VirB4 components-like  21.6 
 
 		 629 aa  46.2  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.000521447  normal  0.17897 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0316  sex pilus assembly protein  31.62 
 
 		 815 aa  45.1  0.006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2948  Type IV secretory pathway VirB4 component, ATPase TRAC  21.7 
 
 		 841 aa  44.7  0.008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0863  type IV secretion system ATPase VirB4  24.89 
 
 		 803 aa  44.3  0.01  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>