130 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_2653 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_2320  hypothetical protein  98.83 
 
 		 855 aa  1756    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.121695  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2653  hypothetical protein  100 
 
 		 855 aa  1774    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.696195  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1535  hypothetical protein  87.09 
 
 		 860 aa  1533    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.324807 
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4178  hypothetical protein  37.29 
 
 		 874 aa  536  1e-151  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0161122 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6801  hypothetical protein  31.88 
 
 		 864 aa  419  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5371  Type-IV secretion system protein TraC  30.55 
 
 		 864 aa  375  1e-102  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.622531 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2162  ATPase  28.77 
 
 		 847 aa  350  5e-95  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.532567  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_4006  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  29.35 
 
 		 868 aa  340  5e-92  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.840318  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0095  type IV conjugative transfer system protein TraC  29 
 
 		 815 aa  324  4e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.124816 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0316  sex pilus assembly protein  26.93 
 
 		 815 aa  275  3e-72  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0371  F-pilin subunit assembly into extended F pili  27.11 
 
 		 809 aa  264  6e-69  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.221651  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0253  sex pilus assembly protein  26.11 
 
 		 815 aa  259  1e-67  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4226  hypothetical protein  26.75 
 
 		 827 aa  258  3e-67  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006366  plpl0020  hypothetical protein  24.44 
 
 		 865 aa  209  2e-52  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0029  conjugal transfer ATP-binding protein TraC  26.1 
 
 		 875 aa  201  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0936  putative pillus assembly protein  27.24 
 
 		 690 aa  193  9e-48  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1089  type-IV secretion system protein TraC  24.82 
 
 		 866 aa  192  2e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3777  sex pilus assembly protein  23.85 
 
 		 816 aa  192  2e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.899145  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4290  conjugal transfer ATP-binding protein TraC  22.97 
 
 		 866 aa  189  2e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0028  hypothetical protein  22.29 
 
 		 858 aa  171  8e-41  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.0798103  n/a   
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_08  conjugative transfer protein TraC  24.08 
 
 		 843 aa  166  1.0000000000000001e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4438  type-IV secretion system protein TraC  24.41 
 
 		 862 aa  162  2e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.314552  normal  1 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4627  type-IV secretion system protein TraC  24.48 
 
 		 862 aa  162  3e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.997489 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4442  Type-IV secretion system protein TraC  24.48 
 
 		 862 aa  161  5e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4535  type-IV secretion system protein TraC  24.35 
 
 		 862 aa  160  7e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.862751 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4378  type-IV secretion system protein TraC  24.35 
 
 		 862 aa  160  7e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4502  type-IV secretion system protein TraC  24.42 
 
 		 862 aa  154  5e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4218  Type IV secretory pathway VirB4 components-like protein  22.94 
 
 		 894 aa  132  2.0000000000000002e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.750787 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6709  hypothetical protein  25.21 
 
 		 845 aa  92.4  3e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.534859  normal  0.161214 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3004  Type IV secretory pathway VirB4 components-like protein  27.35 
 
 		 837 aa  91.3  8e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4357  Type IV secretory pathway VirB4 components-like protein  24.47 
 
 		 819 aa  88.2  5e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.471619  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1481  conjugative transposon protein TraG  28.05 
 
 		 841 aa  87.8  8e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.612602 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3545  Type IV secretory pathway VirB4 components-like protein  24.2 
 
 		 811 aa  87.8  8e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0653304  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3253  type IV secretory pathway VirB4 components-like  21.91 
 
 		 861 aa  80.5  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2948  Type IV secretory pathway VirB4 component, ATPase TRAC  21.69 
 
 		 841 aa  70.1  0.0000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6849  type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  24.94 
 
 		 608 aa  68.2  0.0000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0610151  normal  0.925039 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3830  conjugal transfer ATPase TrbE  26.17 
 
 		 818 aa  67  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2827  conjugal transfer ATPase TrbE  24.22 
 
 		 812 aa  65.5  0.000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.595122  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6224  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  21.99 
 
 		 860 aa  64.7  0.000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.628877  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2030  conjugal transfer ATPase TrbE  24.94 
 
 		 813 aa  64.7  0.000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1487  CagE TrbE VirB component of type IV transporter system  25.5 
 
 		 915 aa  64.7  0.000000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3629  Type IV secretory pathway VirB4 protein  25.14 
 
 		 866 aa  64.3  0.00000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5007  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  26.04 
 
 		 805 aa  63.5  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0207382  normal  0.0996879 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0108  TriC protein  25.16 
 
 		 916 aa  63.2  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3503  conjugal transfer ATPase TrbE  25.36 
 
 		 823 aa  62.4  0.00000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.584656  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0696  conjugal transfer ATPase TrbE  23.55 
 
 		 847 aa  61.6  0.00000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3089  conjugal transfer ATPase TrbE  26.9 
 
 		 812 aa  61.6  0.00000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0963  conjugal transfer ATPase TrbE  24.49 
 
 		 813 aa  60.5  0.0000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4376  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  24.18 
 
 		 785 aa  60.5  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.851787 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2696  conjugal transfer ATPase TrbE  24.95 
 
 		 823 aa  60.5  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0851108  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1626  hypothetical protein  24.12 
 
 		 949 aa  60.1  0.0000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0164  conjugal transfer ATPase TrbE  25.58 
 
 		 822 aa  59.7  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.627498  normal  0.339359 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3001  conjugal transfer ATPase TrbE  25.07 
 
 		 812 aa  59.7  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3854  conjugal transfer ATPase TrbE  26.1 
 
 		 830 aa  59.3  0.0000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0508748  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0598  conjugal transfer ATPase TrbE  24.04 
 
 		 809 aa  58.9  0.0000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.657344  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0179  membrane bound ATPase, putative  22.66 
 
 		 955 aa  58.9  0.0000004  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0315  conjugal transfer ATPase TrbE  22.66 
 
 		 821 aa  58.9  0.0000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1815  putative type IV secretory pathway VirB4 protein  21.65 
 
 		 747 aa  58.5  0.0000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1060  hypothetical protein  21.96 
 
 		 916 aa  58.5  0.0000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1022  hypothetical protein  21.96 
 
 		 916 aa  58.5  0.0000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1191  conjugal transfer ATPase TrbE  25.37 
 
 		 816 aa  58.5  0.0000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.192837  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3544  conjugal transfer ATPase TrbE  25.37 
 
 		 816 aa  58.5  0.0000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2271  conjugal transfer ATPase TrbE  23.11 
 
 		 812 aa  58.5  0.0000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0505  type IV secretory pathway VirB4 component, ATPase TraC  22.25 
 
 		 843 aa  58.2  0.0000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_2973  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  23.32 
 
 		 659 aa  58.2  0.0000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7443  conjugal transfer ATPase TrbE  24.18 
 
 		 809 aa  58.2  0.0000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0435  hypothetical protein  24.05 
 
 		 949 aa  58.2  0.0000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.544746  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2581  conjugal transfer ATPase TrbE  23.35 
 
 		 816 aa  57.4  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35690  conjugal transfer ATPase TrbE  23.09 
 
 		 816 aa  57.4  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2321  conjugal transfer ATPase TrbE  24.45 
 
 		 811 aa  57.8  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0714  Type IV secretory pathway VirB4 components-like protein  21.55 
 
 		 611 aa  57.4  0.000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3694  conjugal transfer ATPase TrbE  24.31 
 
 		 820 aa  56.6  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2548  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  24.53 
 
 		 629 aa  57  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0379852  normal  1 
 
 
-
 
NC_008770  CJJ81176_pVir0053  VirB4  22.52 
 
 		 822 aa  55.8  0.000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.111502  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0506  conjugal transfer ATPase TrbE  23.84 
 
 		 812 aa  55.5  0.000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.496331  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2503  CagE, TrbE, VirB component of type IV transporter system  25.66 
 
 		 814 aa  55.1  0.000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2483  conjugal transfer ATPase TrbE  22.44 
 
 		 814 aa  55.1  0.000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.260305 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0518  Type IV secretory pathway VirB4 protein  22.25 
 
 		 845 aa  54.7  0.000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.832849  normal  0.194578 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1344  conjugal transfer ATPase TrbE  23.8 
 
 		 819 aa  54.3  0.000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2528  AAA ATPase  23.15 
 
 		 621 aa  54.3  0.000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2611  conjugal transfer ATPase TrbE  23.75 
 
 		 829 aa  53.1  0.00002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1481  conjugal transfer ATPase TrbE  25.39 
 
 		 836 aa  52.8  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0386388  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7744  conjugal transfer ATPase TrbE  24.81 
 
 		 812 aa  53.1  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.110925 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0255  Type IV secretory pathway AvhB4 protein  22.89 
 
 		 788 aa  52.4  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.849698 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1503  conjugal transfer ATPase TrbE  23.77 
 
 		 813 aa  52.4  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.373275  normal  0.784639 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3997  conjugal transfer ATPase TrbE  25.21 
 
 		 812 aa  52  0.00004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.678924 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3367  conjugal transfer ATPase TrbE  23.59 
 
 		 814 aa  52  0.00005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3898  conjugal transfer ATPase TrbE  24.29 
 
 		 813 aa  51.6  0.00006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0153  conjugal transfer ATPase TrbE  24.4 
 
 		 872 aa  51.2  0.00007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2881  conjugal transfer ATPase TrbE  23.85 
 
 		 812 aa  51.6  0.00007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.244722  normal  0.034415 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0435  conjugal transfer ATPase TrbE  23.54 
 
 		 817 aa  51.2  0.00007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2007  conjugal transfer ATPase TrbE  23.62 
 
 		 816 aa  51.2  0.00008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.581672  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1898  conjugal transfer ATPase TrbE  23.8 
 
 		 817 aa  51.2  0.00009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1285  conjugal transfer ATPase TrbE  23.33 
 
 		 816 aa  51.2  0.00009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8579  type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  24.32 
 
 		 595 aa  51.2  0.00009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.161073  normal  0.268088 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0648  hypothetical protein  28.3 
 
 		 908 aa  50.4  0.0001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.685695  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1256  hypothetical protein  21.69 
 
 		 963 aa  50.4  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5086  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  20.97 
 
 		 790 aa  50.8  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3424  hypothetical protein  21.69 
 
 		 956 aa  50.4  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.38542 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0746  conjugal transfer ATPase TrbE  23.58 
 
 		 812 aa  50.4  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.369643  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>