79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ent638_4290 on replicon NC_009425
Organism: Enterobacter sp. 638



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009425  Ent638_4290  conjugal transfer ATP-binding protein TraC  100 
 
 		 866 aa  1806    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0029  conjugal transfer ATP-binding protein TraC  44.02 
 
 		 875 aa  725    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0028  hypothetical protein  31.64 
 
 		 858 aa  417  9.999999999999999e-116  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.0798103  n/a   
 
 
-
 
NC_006366  plpl0020  hypothetical protein  31.38 
 
 		 865 aa  404  1e-111  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_08  conjugative transfer protein TraC  30.39 
 
 		 843 aa  392  1e-107  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4502  type-IV secretion system protein TraC  29.6 
 
 		 862 aa  365  1e-99  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4438  type-IV secretion system protein TraC  29.72 
 
 		 862 aa  360  8e-98  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.314552  normal  1 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4627  type-IV secretion system protein TraC  29.3 
 
 		 862 aa  359  9.999999999999999e-98  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.997489 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4442  Type-IV secretion system protein TraC  29.49 
 
 		 862 aa  358  1.9999999999999998e-97  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4535  type-IV secretion system protein TraC  29.07 
 
 		 862 aa  357  3.9999999999999996e-97  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.862751 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4378  type-IV secretion system protein TraC  29.07 
 
 		 862 aa  357  3.9999999999999996e-97  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4178  hypothetical protein  25.63 
 
 		 874 aa  241  2.9999999999999997e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0161122 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6801  hypothetical protein  24.82 
 
 		 864 aa  241  4e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5371  Type-IV secretion system protein TraC  25.23 
 
 		 864 aa  233  9e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.622531 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2162  ATPase  24.61 
 
 		 847 aa  231  3e-59  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.532567  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_4006  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  25.65 
 
 		 868 aa  223  8e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.840318  n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4226  hypothetical protein  24.76 
 
 		 827 aa  190  1e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0095  type IV conjugative transfer system protein TraC  24.15 
 
 		 815 aa  186  1.0000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.124816 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2320  hypothetical protein  23.09 
 
 		 855 aa  182  2e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.121695  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2653  hypothetical protein  22.97 
 
 		 855 aa  182  2.9999999999999997e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.696195  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1535  hypothetical protein  23.33 
 
 		 860 aa  181  8e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.324807 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0371  F-pilin subunit assembly into extended F pili  30.82 
 
 		 809 aa  155  2e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.221651  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0316  sex pilus assembly protein  23.17 
 
 		 815 aa  149  2.0000000000000003e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0253  sex pilus assembly protein  25.12 
 
 		 815 aa  121  6e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4218  Type IV secretory pathway VirB4 components-like protein  23.23 
 
 		 894 aa  120  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.750787 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1089  type-IV secretion system protein TraC  21.83 
 
 		 866 aa  118  3.9999999999999997e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0936  putative pillus assembly protein  26.74 
 
 		 690 aa  110  9.000000000000001e-23  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3777  sex pilus assembly protein  25.5 
 
 		 816 aa  85.1  0.000000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.899145  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3545  Type IV secretory pathway VirB4 components-like protein  25.59 
 
 		 811 aa  84.3  0.000000000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0653304  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6224  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  26.67 
 
 		 860 aa  82.4  0.00000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.628877  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4357  Type IV secretory pathway VirB4 components-like protein  25 
 
 		 819 aa  80.5  0.0000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.471619  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6709  hypothetical protein  25.23 
 
 		 845 aa  77.8  0.0000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.534859  normal  0.161214 
 
 
-
 
NC_002950  PG1481  conjugative transposon protein TraG  25.61 
 
 		 841 aa  75.9  0.000000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.612602 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3004  Type IV secretory pathway VirB4 components-like protein  24.76 
 
 		 837 aa  75.5  0.000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2548  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  25.58 
 
 		 629 aa  75.5  0.000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0379852  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1693  Type IV secretory pathway VirB4 components-like  25.19 
 
 		 629 aa  73.2  0.00000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.000521447  normal  0.17897 
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_2973  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  23.62 
 
 		 659 aa  71.2  0.00000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3253  type IV secretory pathway VirB4 components-like  23.42 
 
 		 861 aa  71.2  0.00000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6728  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  22.99 
 
 		 657 aa  70.1  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.726364  normal  0.776114 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0505  type IV secretory pathway VirB4 component, ATPase TraC  25.29 
 
 		 843 aa  68.9  0.0000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4080  type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  23.29 
 
 		 631 aa  68.9  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.020005  normal  0.0495521 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6849  type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  23.98 
 
 		 608 aa  68.2  0.0000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0610151  normal  0.925039 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2744  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  25.26 
 
 		 630 aa  67.8  0.0000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00908166  normal  1 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6919  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  22.46 
 
 		 792 aa  63.2  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2948  Type IV secretory pathway VirB4 component, ATPase TRAC  22.92 
 
 		 841 aa  62.4  0.00000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8579  type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  25.22 
 
 		 595 aa  61.6  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.161073  normal  0.268088 
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3629  Type IV secretory pathway VirB4 protein  26 
 
 		 866 aa  61.6  0.00000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0884  CagE TrbE VirB component of type IV transporter system  20.7 
 
 		 843 aa  59.3  0.0000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0518  Type IV secretory pathway VirB4 protein  24.51 
 
 		 845 aa  58.9  0.0000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.832849  normal  0.194578 
 
 
-
 
NC_012040  Cla_a009  secretion/conjugal transfer ATPase VirB3/4  26.13 
 
 		 924 aa  58.5  0.0000006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2190  AAA ATPase  30.83 
 
 		 622 aa  58.2  0.0000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.0020112  hitchhiker  0.0000768998 
 
 
-
 
NC_008790  CJJ81176_pTet0028  cmgB3/4  24.92 
 
 		 922 aa  57.8  0.000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0731  AAA ATPase  20.77 
 
 		 569 aa  55.8  0.000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0912969  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3089  conjugal transfer ATPase TrbE  23.84 
 
 		 812 aa  55.1  0.000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3001  conjugal transfer ATPase TrbE  21.75 
 
 		 812 aa  55.1  0.000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0301  hypothetical protein  21.58 
 
 		 818 aa  54.7  0.000008  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0733022  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0179  membrane bound ATPase, putative  22.64 
 
 		 955 aa  54.7  0.000008  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3544  conjugal transfer ATPase TrbE  21.03 
 
 		 816 aa  53.5  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1191  conjugal transfer ATPase TrbE  21.03 
 
 		 816 aa  53.5  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.192837  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3694  conjugal transfer ATPase TrbE  23.52 
 
 		 820 aa  53.1  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5007  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  22.94 
 
 		 805 aa  53.1  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0207382  normal  0.0996879 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3854  conjugal transfer ATPase TrbE  21.97 
 
 		 830 aa  52.8  0.00003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0508748  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1525  AAA ATPase  30.83 
 
 		 624 aa  51.6  0.00006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.368938  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1173  type IV secretion system protein VirB4, putative  21.56 
 
 		 788 aa  51.2  0.00008  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1177  CagE TrbE VirB component of type IV transporter system  19.44 
 
 		 850 aa  50.8  0.0001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3830  conjugal transfer ATPase TrbE  20 
 
 		 818 aa  50.8  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0180  cmgb3/4  25.97 
 
 		 561 aa  49.3  0.0003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2321  conjugal transfer ATPase TrbE  22.08 
 
 		 811 aa  48.9  0.0004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0963  conjugal transfer ATPase TrbE  22.53 
 
 		 813 aa  47.8  0.0008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2483  conjugal transfer ATPase TrbE  24.77 
 
 		 814 aa  47.8  0.0009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.260305 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9656  conjugal transfer protein TrbE  23.44 
 
 		 687 aa  47.4  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.419883  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7443  conjugal transfer ATPase TrbE  22.19 
 
 		 809 aa  47.4  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2611  conjugal transfer ATPase TrbE  22.99 
 
 		 829 aa  47.8  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9821  type IV secretion protein AvhB4  25.31 
 
 		 819 aa  47  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0714  Type IV secretory pathway VirB4 components-like protein  22.03 
 
 		 611 aa  46.6  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2827  conjugal transfer ATPase TrbE  21.63 
 
 		 812 aa  45.4  0.005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.595122  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0315  conjugal transfer ATPase TrbE  23.19 
 
 		 821 aa  45.4  0.005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1764  hypothetical protein  21.8 
 
 		 938 aa  44.7  0.007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0931  hypothetical protein  19.75 
 
 		 616 aa  44.7  0.009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>