182 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_a009 on replicon NC_012040
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008790  CJJ81176_pTet0028  cmgB3/4  66.52 
 
 
922 aa  1285    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012040  Cla_a009  secretion/conjugal transfer ATPase VirB3/4  100 
 
 
924 aa  1867    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0180  cmgb3/4  55.08 
 
 
561 aa  647    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010657  SbBS512_0037  triC protein  39.34 
 
 
915 aa  623  1e-177  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010509  Mrad2831_6325  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  37.24 
 
 
829 aa  541  9.999999999999999e-153  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0108  TriC protein  33.84 
 
 
916 aa  529  1e-148  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0066  type IV secretion system protein VirB4  37.16 
 
 
831 aa  520  1e-146  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0274973  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1487  CagE TrbE VirB component of type IV transporter system  32.18 
 
 
915 aa  522  1e-146  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0060  type IV secretion system protein VirB4  37.59 
 
 
831 aa  520  1e-146  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011204  SeD_B0102  pilx4 protein  36.37 
 
 
876 aa  514  1e-144  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.894843 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0450  putative Type IV secretion system protein VirB4/TraE  34.92 
 
 
823 aa  488  1e-136  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.228216  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1756  putative Type IV secretion system protein VirB4/TraE  34.07 
 
 
830 aa  479  1e-134  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.592919 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2655  putative Type IV secretion system protein VirB4/TraE  34.41 
 
 
822 aa  478  1e-133  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0163  type IV secretion/conjugal transfer ATPase, VirB4 family  34.68 
 
 
822 aa  476  1e-133  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4200  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  34.3 
 
 
826 aa  466  1e-129  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.985629 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6504  type IV secretion/conjugal transfer ATPase, VirB4 family  34.08 
 
 
821 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4851  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  33.92 
 
 
826 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3315  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  33.92 
 
 
826 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2441  type IV secretion/conjugal transfer ATPase, VirB4 family  34.11 
 
 
815 aa  457  1e-127  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.06702  normal  0.584537 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0870  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  32.25 
 
 
830 aa  435  1e-120  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5007  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  31.07 
 
 
805 aa  415  1e-114  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0207382  normal  0.0996879 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1137  type IV secretion/conjugal transfer ATPase, VirB4 family  32.12 
 
 
816 aa  403  1e-111  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0677  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  31.41 
 
 
796 aa  400  9.999999999999999e-111  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4346  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  30.65 
 
 
793 aa  394  1e-108  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.677673  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5086  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  30.16 
 
 
790 aa  390  1e-107  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0255  Type IV secretory pathway AvhB4 protein  29.8 
 
 
788 aa  387  1e-106  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.849698 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5816  type IV secretion/conjugal transfer ATPase, VirB4 family  27.62 
 
 
835 aa  345  2e-93  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0858  type IV secretion system ATPase VirB4  28.78 
 
 
801 aa  339  1.9999999999999998e-91  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4562  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  27.68 
 
 
805 aa  337  5.999999999999999e-91  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.733697  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6206  type IV secretion/conjugal transfer ATPase, VirB4 family  27.36 
 
 
839 aa  336  1e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.623322  normal  0.0559252 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6405  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  27.32 
 
 
819 aa  335  3e-90  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0682909  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0533  type IV secretion system ATPase VirB4  28.48 
 
 
800 aa  331  3e-89  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4445  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  27.49 
 
 
803 aa  331  4e-89  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.346994  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0495  type IV secretion system ATPase VirB4  28.61 
 
 
800 aa  329  1.0000000000000001e-88  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.97813  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4177  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  27.8 
 
 
804 aa  329  2.0000000000000001e-88  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.162179  n/a   
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4376  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  27.25 
 
 
785 aa  321  5e-86  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.851787 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0863  type IV secretion system ATPase VirB4  28.03 
 
 
803 aa  317  6e-85  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9821  type IV secretion protein AvhB4  27.01 
 
 
819 aa  311  2.9999999999999997e-83  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8224  type IV secretion system protein VirB4  26.67 
 
 
789 aa  298  2e-79  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3819  CagE, TrbE, VirB component of type IV transporter system  26.76 
 
 
791 aa  278  2e-73  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.321786  normal  0.020067 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3641  CagE TrbE VirB component of type IV transporter system  26.37 
 
 
791 aa  271  2.9999999999999997e-71  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.227146 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3976  CagE TrbE VirB component of type IV transporter system  26.34 
 
 
787 aa  270  8.999999999999999e-71  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5026  CagE, TrbE, VirB component of type IV transporter system  25.06 
 
 
804 aa  266  1e-69  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.451352  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6159  type IV secretion system protein VirB4  24.82 
 
 
789 aa  266  2e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.0089682  normal 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3523  type IV secretion system protein VirB4  25.06 
 
 
797 aa  264  4e-69  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0153  hypothetical protein  25.93 
 
 
826 aa  261  5.0000000000000005e-68  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0171  hypothetical protein  25.36 
 
 
826 aa  250  7e-65  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7347  CagE TrbE VirB component of type IV transporter system  26.81 
 
 
849 aa  250  7e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.327754 
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08213  conjugal transfer protein TraE  27.14 
 
 
752 aa  239  2e-61  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011351  ECH74115_A0012  conjugal transfer protein  26.64 
 
 
792 aa  235  4.0000000000000004e-60  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.829213 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7534  CagE TrbE VirB component of type IV transporter system  25.48 
 
 
857 aa  230  9e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0339872  normal  0.0463504 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4566  conjugal transfer protein TrbE  20.7 
 
 
817 aa  168  5e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5485  conjugal transfer protein TrbE  21.39 
 
 
815 aa  167  5.9999999999999996e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00798845  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5379  conjugal transfer protein TrbE  22.48 
 
 
817 aa  160  1e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.325542 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1617  CagE, TrbE, VirB component of type IV transporter system, conserved region  21.98 
 
 
819 aa  158  3e-37  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5372  conjugal transfer ATPase TrbE  21.19 
 
 
824 aa  158  4e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.259729  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1838  conjugal transfer ATPase TrbE  20.64 
 
 
808 aa  158  5.0000000000000005e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2030  conjugal transfer ATPase TrbE  21.96 
 
 
813 aa  152  2e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6506  type IV secretory pathway VirB4 components-like protein  21.52 
 
 
825 aa  152  3e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011148  SeAg_A0030  conjugal transfer protein  22.91 
 
 
841 aa  150  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9265  conjugal transfer protein TrbE  20.75 
 
 
822 aa  149  3e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.502143  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30910  conjugal transfer ATPase TrbE  19.74 
 
 
817 aa  147  1e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.0000000414209  unclonable  1.71741e-21 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8331  conjugal transfer protein TrbE  20.85 
 
 
820 aa  147  1e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.359626  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5609  type IV secretory pathway VirB4 components-like protein  20.71 
 
 
825 aa  146  2e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.931017  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1344  conjugal transfer ATPase TrbE  19.95 
 
 
819 aa  146  2e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2503  CagE, TrbE, VirB component of type IV transporter system  21.51 
 
 
814 aa  146  2e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1898  conjugal transfer ATPase TrbE  19.61 
 
 
817 aa  145  3e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2353  conjugal transfer ATPase TrbE  19.67 
 
 
816 aa  144  5e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.233122  normal  0.344124 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2349  conjugal transfer ATPase TrbE  20.85 
 
 
820 aa  144  8e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7443  conjugal transfer ATPase TrbE  19.49 
 
 
809 aa  144  9.999999999999999e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1553  conjugal transfer ATPase TrbE  19.51 
 
 
809 aa  142  1.9999999999999998e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.215631  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1522  type IV secretory pathway VirB4 components-like protein  21.54 
 
 
815 aa  142  3.9999999999999997e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6305  Type IV secretory pathway VirB4-like protein  20.65 
 
 
818 aa  140  1e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2007  conjugal transfer ATPase TrbE  19.54 
 
 
816 aa  139  2e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.581672  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4198  conjugal transfer ATPase TrbE  19.69 
 
 
813 aa  139  2e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.330213  normal  0.981224 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2271  conjugal transfer ATPase TrbE  20.72 
 
 
812 aa  138  4e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2908  conjugal transfer ATPase TrbE  19.51 
 
 
811 aa  137  7.000000000000001e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.380632  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2696  conjugal transfer ATPase TrbE  20.13 
 
 
823 aa  137  9.999999999999999e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0851108  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1319  conjugal transfer ATPase TrbE  19.48 
 
 
819 aa  136  1.9999999999999998e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3503  conjugal transfer ATPase TrbE  20.15 
 
 
823 aa  136  1.9999999999999998e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.584656  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2648  conjugal transfer ATPase TrbE  19.97 
 
 
825 aa  136  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.947837  normal  0.965174 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3898  conjugal transfer ATPase TrbE  21.03 
 
 
813 aa  135  3e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0435  conjugal transfer ATPase TrbE  19.35 
 
 
817 aa  135  3e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4747  type IV secretory pathway VirB4 components-like protein  21.66 
 
 
844 aa  135  5e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.290977 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2348  conjugal transfer ATPase TrbE  20.47 
 
 
810 aa  135  5e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9656  conjugal transfer protein TrbE  21.86 
 
 
687 aa  134  6.999999999999999e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.419883  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1173  type IV secretion system protein VirB4, putative  22.24 
 
 
788 aa  133  2.0000000000000002e-29  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1010  conjugal transfer ATPase TrbE  20.91 
 
 
808 aa  132  2.0000000000000002e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.611754  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2611  conjugal transfer ATPase TrbE  20.45 
 
 
829 aa  132  3e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0050  conjugal transfer protein TrbE  20.22 
 
 
845 aa  132  3e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4271  conjugal transfer protein TrbE  19.62 
 
 
852 aa  132  4.0000000000000003e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.000528773  normal  0.467859 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2581  conjugal transfer ATPase TrbE  19.59 
 
 
816 aa  131  5.0000000000000004e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2821  type IV secretory pathway VirB4 components-like protein  21.09 
 
 
827 aa  131  5.0000000000000004e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.901669 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7744  conjugal transfer ATPase TrbE  20.76 
 
 
812 aa  131  5.0000000000000004e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.110925 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0315  conjugal transfer ATPase TrbE  20.64 
 
 
821 aa  131  6e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2228  conjugal transfer protein TrbE  19.67 
 
 
854 aa  130  9.000000000000001e-29  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0444639  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3703  conjugal transfer ATPase TrbE  19.35 
 
 
817 aa  130  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.165131  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6505  conjugal transfer protein TrbE  19.62 
 
 
852 aa  129  2.0000000000000002e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00158384  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3854  conjugal transfer ATPase TrbE  20.2 
 
 
830 aa  129  2.0000000000000002e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0508748  n/a   
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6632  conjugal transfer protein TrbE  19.62 
 
 
852 aa  129  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0411416  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>