152 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_2821 on replicon NC_013930
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013930  TK90_2821  type IV secretory pathway VirB4 components-like protein  100 
 
 		 827 aa  1727    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.901669 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4747  type IV secretory pathway VirB4 components-like protein  36.29 
 
 		 844 aa  517  1.0000000000000001e-145  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.290977 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6506  type IV secretory pathway VirB4 components-like protein  34.31 
 
 		 825 aa  428  1e-118  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5609  type IV secretory pathway VirB4 components-like protein  33.58 
 
 		 825 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.931017  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6305  Type IV secretory pathway VirB4-like protein  32.44 
 
 		 818 aa  393  1e-108  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4260  Type IV secretory pathway VirB4 components-like  30.39 
 
 		 831 aa  366  1e-100  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5229  Type IV secretory pathway VirB4 components-like  31.13 
 
 		 846 aa  364  4e-99  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.738503  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1522  type IV secretory pathway VirB4 components-like protein  33.21 
 
 		 815 aa  363  7.0000000000000005e-99  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5465  Type IV secretory pathway VirB4 components-like  29.13 
 
 		 850 aa  338  1.9999999999999998e-91  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.257739  decreased coverage  0.00704778 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4227  Type IV secretory pathway VirB4 components-like protein  28.43 
 
 		 821 aa  327  6e-88  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.267872  normal  1 
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5418  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  27.67 
 
 		 892 aa  325  1e-87  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_5013  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  27.67 
 
 		 892 aa  326  1e-87  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5372  conjugal transfer ATPase TrbE  28.9 
 
 		 824 aa  315  2.9999999999999996e-84  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.259729  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5221  conjugal transfer ATPase TrbE  28.33 
 
 		 819 aa  289  1e-76  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0884  CagE TrbE VirB component of type IV transporter system  24.72 
 
 		 843 aa  286  1.0000000000000001e-75  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2348  conjugal transfer ATPase TrbE  25.89 
 
 		 810 aa  286  2.0000000000000002e-75  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1838  conjugal transfer ATPase TrbE  27.18 
 
 		 808 aa  282  2e-74  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3997  conjugal transfer ATPase TrbE  28.64 
 
 		 812 aa  282  2e-74  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.678924 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3854  conjugal transfer ATPase TrbE  28.76 
 
 		 830 aa  281  5e-74  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0508748  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0598  conjugal transfer ATPase TrbE  28 
 
 		 809 aa  279  1e-73  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.657344  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1010  conjugal transfer ATPase TrbE  28.04 
 
 		 808 aa  277  5e-73  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.611754  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1503  conjugal transfer ATPase TrbE  26.89 
 
 		 813 aa  276  9e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.373275  normal  0.784639 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7443  conjugal transfer ATPase TrbE  27.37 
 
 		 809 aa  275  2.0000000000000002e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7744  conjugal transfer ATPase TrbE  28.41 
 
 		 812 aa  275  2.0000000000000002e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.110925 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1191  conjugal transfer ATPase TrbE  27.4 
 
 		 816 aa  275  2.0000000000000002e-72  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.192837  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3544  conjugal transfer ATPase TrbE  27.4 
 
 		 816 aa  275  2.0000000000000002e-72  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0164  conjugal transfer ATPase TrbE  27.34 
 
 		 822 aa  275  3e-72  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.627498  normal  0.339359 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2827  conjugal transfer ATPase TrbE  27.69 
 
 		 812 aa  274  4.0000000000000004e-72  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.595122  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3830  conjugal transfer ATPase TrbE  27.9 
 
 		 818 aa  274  5.000000000000001e-72  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2581  conjugal transfer ATPase TrbE  27.46 
 
 		 816 aa  273  7e-72  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3898  conjugal transfer ATPase TrbE  27.93 
 
 		 813 aa  273  8.000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2007  conjugal transfer ATPase TrbE  27.64 
 
 		 816 aa  273  1e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.581672  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3694  conjugal transfer ATPase TrbE  27.34 
 
 		 820 aa  273  1e-71  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1285  conjugal transfer ATPase TrbE  27.74 
 
 		 816 aa  272  2e-71  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1177  CagE TrbE VirB component of type IV transporter system  24.94 
 
 		 850 aa  272  2e-71  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0696  conjugal transfer ATPase TrbE  28.23 
 
 		 847 aa  271  4e-71  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3367  conjugal transfer ATPase TrbE  27.87 
 
 		 814 aa  270  5.9999999999999995e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4198  conjugal transfer ATPase TrbE  27.26 
 
 		 813 aa  269  1e-70  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.330213  normal  0.981224 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35690  conjugal transfer ATPase TrbE  27.34 
 
 		 816 aa  270  1e-70  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1319  conjugal transfer ATPase TrbE  27.32 
 
 		 819 aa  268  2e-70  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3710  Type IV secretory pathway VirB4 components-like protein  26.74 
 
 		 823 aa  269  2e-70  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.693344  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0435  conjugal transfer ATPase TrbE  27.88 
 
 		 817 aa  268  2e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3215  conjugal transfer ATPase TrbE  28.54 
 
 		 836 aa  268  2.9999999999999995e-70  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2353  conjugal transfer ATPase TrbE  26.86 
 
 		 816 aa  268  2.9999999999999995e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.233122  normal  0.344124 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2030  conjugal transfer ATPase TrbE  27.86 
 
 		 813 aa  268  2.9999999999999995e-70  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3001  conjugal transfer ATPase TrbE  27.23 
 
 		 812 aa  267  5e-70  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3538  conjugal transfer ATPase TrbE  27.67 
 
 		 813 aa  267  5.999999999999999e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0252817  normal  0.696341 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1344  conjugal transfer ATPase TrbE  27 
 
 		 819 aa  266  8.999999999999999e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2611  conjugal transfer ATPase TrbE  26.81 
 
 		 829 aa  266  1e-69  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2271  conjugal transfer ATPase TrbE  27.8 
 
 		 812 aa  266  1e-69  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2881  conjugal transfer ATPase TrbE  27.7 
 
 		 812 aa  265  2e-69  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.244722  normal  0.034415 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2321  conjugal transfer ATPase TrbE  27.88 
 
 		 811 aa  265  3e-69  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1553  conjugal transfer ATPase TrbE  28.45 
 
 		 809 aa  264  4e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.215631  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2483  conjugal transfer ATPase TrbE  27.47 
 
 		 814 aa  264  4.999999999999999e-69  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.260305 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0746  conjugal transfer ATPase TrbE  28.22 
 
 		 812 aa  264  6e-69  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.369643  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3197  conjugal transfer ATPase TrbE  27.73 
 
 		 877 aa  263  1e-68  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.468072  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2648  conjugal transfer ATPase TrbE  28.16 
 
 		 825 aa  262  2e-68  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.947837  normal  0.965174 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0153  conjugal transfer ATPase TrbE  27.74 
 
 		 872 aa  262  2e-68  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2908  conjugal transfer ATPase TrbE  27.52 
 
 		 811 aa  262  2e-68  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.380632  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1898  conjugal transfer ATPase TrbE  27.85 
 
 		 817 aa  261  4e-68  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2349  conjugal transfer ATPase TrbE  27.44 
 
 		 820 aa  261  5.0000000000000005e-68  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0315  conjugal transfer ATPase TrbE  26.86 
 
 		 821 aa  260  8e-68  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1481  conjugal transfer ATPase TrbE  27.54 
 
 		 836 aa  259  1e-67  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0386388  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3703  conjugal transfer ATPase TrbE  27.35 
 
 		 817 aa  259  2e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.165131  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2696  conjugal transfer ATPase TrbE  26.84 
 
 		 823 aa  257  5e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0851108  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0506  conjugal transfer ATPase TrbE  28.76 
 
 		 812 aa  256  9e-67  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.496331  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30910  conjugal transfer ATPase TrbE  27.56 
 
 		 817 aa  255  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.0000000414209  unclonable  1.71741e-21 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3503  conjugal transfer ATPase TrbE  26.59 
 
 		 823 aa  255  2.0000000000000002e-66  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.584656  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3089  conjugal transfer ATPase TrbE  26.99 
 
 		 812 aa  254  5.000000000000001e-66  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2228  conjugal transfer protein TrbE  25.64 
 
 		 854 aa  254  6e-66  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0444639  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0729  conjugal transfer ATPase TrbE  28.31 
 
 		 816 aa  252  2e-65  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0050  conjugal transfer protein TrbE  26.36 
 
 		 845 aa  248  4e-64  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0963  conjugal transfer ATPase TrbE  26.86 
 
 		 813 aa  247  6.999999999999999e-64  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2503  CagE, TrbE, VirB component of type IV transporter system  27.1 
 
 		 814 aa  246  1.9999999999999999e-63  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4271  conjugal transfer protein TrbE  25.22 
 
 		 852 aa  243  1e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.000528773  normal  0.467859 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6505  conjugal transfer protein TrbE  25.09 
 
 		 852 aa  240  6.999999999999999e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00158384  n/a   
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6632  conjugal transfer protein TrbE  25.09 
 
 		 852 aa  240  6.999999999999999e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0411416  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9265  conjugal transfer protein TrbE  24.48 
 
 		 822 aa  235  2.0000000000000002e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.502143  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5379  conjugal transfer protein TrbE  24.54 
 
 		 817 aa  232  2e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.325542 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1717  conjugal transfer ATPase TrbE  26.76 
 
 		 819 aa  229  1e-58  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.137188  normal  1 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4566  conjugal transfer protein TrbE  27.31 
 
 		 817 aa  227  7e-58  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9656  conjugal transfer protein TrbE  27.61 
 
 		 687 aa  227  8e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.419883  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1617  CagE, TrbE, VirB component of type IV transporter system, conserved region  27.39 
 
 		 819 aa  226  1e-57  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5485  conjugal transfer protein TrbE  26.06 
 
 		 815 aa  217  9e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00798845  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8331  conjugal transfer protein TrbE  23.17 
 
 		 820 aa  214  4.9999999999999996e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.359626  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0863  type IV secretion system ATPase VirB4  25.48 
 
 		 803 aa  211  3e-53  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1339  CagE TrbE VirB component of type IV transporter system  25.75 
 
 		 840 aa  208  3e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.18708 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0247  CagE TrbE VirB component of type IV transporter system  25.75 
 
 		 840 aa  208  3e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0858  type IV secretion system ATPase VirB4  24.91 
 
 		 801 aa  205  2e-51  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1638  conjugal transfer protein trbE, putative  25.71 
 
 		 840 aa  203  9.999999999999999e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0533  type IV secretion system ATPase VirB4  25.19 
 
 		 800 aa  199  2.0000000000000003e-49  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4562  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  23.23 
 
 		 805 aa  197  6e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.733697  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0495  type IV secretion system ATPase VirB4  24.68 
 
 		 800 aa  197  7e-49  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.97813  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4445  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  24.55 
 
 		 803 aa  195  3e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.346994  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5086  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  25.61 
 
 		 790 aa  192  2e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6405  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  23.24 
 
 		 819 aa  192  2.9999999999999997e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0682909  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4346  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  25.84 
 
 		 793 aa  187  6e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.677673  n/a   
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4692  CagE TrbE VirB component of type IV transporter system  23.88 
 
 		 808 aa  187  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0677  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  25.13 
 
 		 796 aa  182  2.9999999999999997e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4177  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  22.79 
 
 		 804 aa  179  2e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.162179  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>